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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-21 |
Inflammation-Driven Lymphoid Structures: Organization, Function, and Clinical Impact Across Autoimmunity, Cancer, and Checkpoint Toxicity
2026-May, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70127
PMID:42144723
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综述 | 本文提出一个框架区分炎症驱动淋巴样结构与成熟三级淋巴样结构,探讨它们在自身免疫、癌症和检查点毒性中的组织、功能及临床影响 | 提出了炎症性淋巴样结构与成熟三级淋巴样结构的区分框架,强调淋巴样结构作为异质性免疫微环境而非二元分类的新视角 | 未提及具体局限性 | 阐明淋巴样结构在不同疾病背景下的形成机制、功能异质性和临床意义 | 自身免疫性疾病、癌症、移植、免疫相关不良事件及衰老过程中的淋巴样结构 | 机器学习 | 自身免疫性疾病, 癌症, 移植排斥, 老年病 | NA | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-21 |
Tumour-derived SAA1 reprogrammes macrophages to promote CXCL1-mediated metastasis in Ovarian Cancer
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70698
PMID:42145073
|
研究论文 | 揭示肿瘤来源的SAA1通过重新编程巨噬细胞促进CXCL1介导的卵巢癌转移机制 | 首次识别出SAA1-TAM-CXCL1免疫炎症信号轴在卵巢癌转移中的关键作用,并为开发新型抗转移治疗策略提供了理论基础 | 未提及具体局限性,可能包括样本量或体外模型局限性 | 阐明SAA1在高级别浆液性卵巢癌腹膜转移中的驱动机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者及肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床标本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-05-21 |
Transcriptional Profiling at Single-Cell Resolution Reveals Diversity and Regulatory Networks of Primary and Secondary Senescent Cells
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70540
PMID:42148795
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析原代和次代衰老细胞的转录多样性及调控网络 | 首次在单细胞分辨率下系统比较原代和次代衰老细胞的转录谱差异,揭示其不同的终末簇及共享的应激反应模块,并鉴定亚型特异性基因和候选转录调控因子 | 仅以人类肾上皮细胞为模型,可能无法完全代表其他组织类型中衰老细胞的异质性;依赖体外培养体系,体内衰老过程的复杂性未涉及 | 探究原代和次代衰老细胞在单细胞水平的转录组异质性及调控机制 | 人类肾上皮细胞的原代和次代衰老模型 | 单细胞转录组学 | 肾脏衰老及相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类肾上皮细胞的原代和次代衰老模型样本,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium(推断) | NA |
| 64 | 2026-05-21 |
Corrigendum to: Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf159
PMID:40719554
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2026-05-21 |
TNFAIP3 in M2 Macrophage Attenuates Subretinal Fibrosis in Laser-Induced Murine Model
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.25
PMID:42126158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2026-05-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals extensive fibrotic remodeling and pathogenic chondrocyte subpopulations in developmental dysplasia of the hip
2026-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-1-891
PMID:42158655
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的纤维化重塑和致病性软骨细胞亚群 | 首次在发育性髋关节发育不良的髋臼软骨中通过单细胞RNA测序识别出四个此前未知的软骨细胞亚群,并揭示其向纤维软骨样表型的显著转变及相关的分子机制 | 样本量较小(3例患者和2例对照),且研究仅聚焦于转录组层面,缺乏功能验证实验 | 探究发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的细胞异质性和纤维化重塑机制 | 发育性髋关节发育不良患儿的髋臼软骨细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序,PCR,免疫组化,组织学染色 | NA | 基因表达数据 | 3例发育性髋关节发育不良患儿和2例年龄匹配对照的髋臼软骨,共10550个软骨细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-05-21 |
Shaping the microvascular network: insights into skeletal muscle angiogenesis
2026-Apr-29, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.250183
PMID:42156063
|
综述 | 本文综述了骨骼肌血管生成的细胞事件和分子机制,包括与细胞外基质的相互作用以及多种驻留和浸润细胞类型的关键作用 | 重点介绍了新兴高分辨率技术(如单细胞RNA测序)在揭示骨骼肌血管生成中细胞类型特异性作用及细胞间相互作用方面的应用潜力 | 骨骼肌血管生成的确切机制仍然只有部分被理解 | 探讨骨骼肌血管生成的调控机制及其在生理和病理条件下的变化 | 骨骼肌血管生成过程中的细胞事件和分子机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-05-21 |
Multi-Omics reveals SPP1 + malignant and CXCR4+ TAM crosstalk predicts immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05095-w
PMID:42045760
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示SPP1+恶性细胞与CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用预测肺腺癌免疫治疗反应 | 首次发现SPP1+恶性细胞和CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用是驱动CD8T细胞耗竭并导致免疫治疗反应不良的新机制,并提供了潜在的生物标志物 | NA | 识别肺腺癌免疫治疗反应的预测性生物标志物 | 肺腺癌的肿瘤微环境中的细胞异质性和动态变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,Illumina NovaSeq测序平台用于空间转录组分析 |
| 69 | 2026-05-21 |
SIV infection disrupts the spatial cellular and communication networks of pulmonary granulomas during SIV/Mtb co-infection
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.24.720743
PMID:42079194
|
研究论文 | 通过空间转录组学比较SIV/Mtb共感染猕猴肺部肉芽肿的细胞和通讯网络,发现SIV感染破坏了肉芽肿的空间免疫功能,且抗逆转录病毒治疗未能完全恢复 | 首次在SIV/Mtb共感染模型中揭示了肉芽肿内空间转录组学特征的变化,并评估了抗逆转录病毒治疗对空间免疫网络的影响 | 未详细说明ART治疗的持续时间对结果的影响,且样本量有限 | 探究HIV/Mtb共感染中肺部肉芽肿的免疫相互作用及ART对空间转录组学的影响 | 与SIV/Mtb共感染的猕猴 | 空间转录组学 | 结核病,艾滋病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猕猴样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-21 |
Single-cell profiling of ANKRD26 thrombocytopenia reveals progenitor expansion and polyploid apoptosis via JUNB-p21
2026-Apr-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030017
PMID:41538704
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和体外功能分析,揭示ANKRD26相关性血小板减少症中祖细胞扩增和通过JUNB-p21通路诱导多倍体巨核细胞凋亡的机制 | 首次在多个患者中整合单细胞转录组和体外功能分析,发现ANKRD26通过JUNB介导的CDKN1A转录激活独立于经典p53-PIDDosome轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,并定位ANKRD26到中心体参与有丝分裂调控 | 样本量有限(仅4名患者),未提及可能的批次效应或技术复制的详细评估 | 阐明ANKRD26基因5'UTR变异导致的血小板减少症的细胞和分子机制 | 4名THC2患者的骨髓CD34+造血干细胞和祖细胞以及原代巨核细胞 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞转录组学,共聚焦成像 | NA | 序列数据 | 4名患者,包含47,281个THC2 HSPC细胞与51,907个对照细胞,以及7,309个THC2 pMK细胞与5,077个对照细胞 | 10x Genomics,Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium,Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3'测序,Illumina NovaSeq测序平台 |
| 71 | 2026-05-21 |
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03084-6
PMID:42020848
|
研究论文 | 介绍sc-SPLASH方法用于无参考的条形码单细胞测序数据发现 | 首次提出统计优先、无参考的发现方法,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍 | 文章中未提及具体局限性 | 开发一种无参考的统计优先方法,用于发现条形码单细胞测序和空间转录组学中的转录组变异 | 海绵(Spongilla,缺少参考序列)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | NA | 序列数据 | 海绵和海鞘的免疫样细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-05-21 |
scVIP: personalized modeling of single-cell transcriptomes for developmental and disease phenotypes
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.717759
PMID:42079230
|
研究论文 | 提出scVIP生成框架,将单细胞转录组与个体表型关联,实现发育与疾病表型的个性化建模 | 首次将生成模型与细胞类型感知的多实例学习结合,从单细胞数据中学习个体层面的嵌入表示,并能整合不同表型定义的数据集 | 仅基于摘要,未提及局限性;可能需大量训练数据、可解释性有限或对罕见细胞类型敏感性不足 | 开发能够将单细胞转录组与个体表型(如发育年龄、疾病进展和神经病理)关联的个性化建模方法 | 单细胞转录数据及对应的个体表型标记 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 生成模型(如变分自编码器)与多实例学习 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-05-21 |
The transcription factor E4F1 is crucial for spermatogonial differentiation and meiosis progression in mice
2026-Apr-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12649-3
PMID:41981464
|
研究论文 | 揭示了转录因子E4F1在小鼠精原细胞分化和减数分裂进程中的关键作用 | 首次发现E4F1通过调控精原细胞分化和减数分裂相关基因表达,影响小鼠精子发生过程 | 需要进一步验证以完全阐明E4F1依赖的转录调控机制 | 探究E4F1在精原细胞分化和减数分裂进程中的功能及分子机制 | 小鼠精原细胞和精母细胞 | 分子生物学 | NA | Cre-loxP基因敲除、单细胞转录组分析、CUT&Tag分析 | NA | 基因表达数据 | E4f1条件性敲除小鼠和HIS-Tag敲入小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-05-21 |
scDEBGCL: a deep embedding approach based on bipartite graph contrastive learning for single-cell RNA-seq data
2026-Apr-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02598-4
PMID:41981652
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研究论文 | 提出一种基于二分图对比学习的深度嵌入方法scDEBGCL,用于单细胞RNA测序数据的低维表示学习与下游分析 | 利用奇异值分解增强二分图并结合对比学习、图重建和数据重建联合学习细胞低维嵌入,有效保留全局细胞-基因相互作用并捕获判别性细胞表示 | 实验结果仅展示scDEBGCL作为有用框架,未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA-seq数据高维稀疏性对下游分析(如细胞聚类、轨迹推断)的影响,学习有效的嵌入表示 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞和基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-05-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals HMGA2 involvement in neoplastic aggressiveness and endothelial cell senescence in chondrosarcoma
2026-Apr-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10188-x
PMID:41964890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HMGA2在软骨肉瘤肿瘤侵袭性和内皮细胞衰老中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序解析高低级别软骨肉瘤与良性软骨肿瘤的细胞异质性,并发现HMGA2作为恶性表型调节因子和独立预后预测因子,以及SPP1-EGF信号通路介导的肿瘤细胞与内皮细胞间通讯在肿瘤进展中的关键作用 | 样本量有限,且单细胞RNA测序结果需在更大规模队列中验证;功能实验主要基于体外和体内模型,临床相关性仍需进一步确认 | 探索软骨肉瘤不同恶性程度下的肿瘤微环境细胞异质性,并寻找潜在治疗靶点 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤及瘤旁组织的临床标本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤及瘤旁组织的临床标本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-05-21 |
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02970-x
PMID:41965789
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研究论文 | 结合机器学习和高通量筛选平台发现靶向MDM2的小分子抑制剂,以克服葡萄膜黑色素瘤的放射治疗耐药性 | 首次将机器学习模型与高通量筛选平台整合,识别靶向MDM2的新型小分子抑制剂SAR405838,并验证其通过p53激活增强放射敏感性 | 未提及临床验证和体内实验的长期效果评估 | 开发克服葡萄膜黑色素瘤放射治疗耐药性的新治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤细胞及其放射治疗耐药机制 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-05-21 |
DUSP5 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by counteracting macrophage-derived AREG-ERK1/2 signaling and disrupting an oncogenic ERK1/2-ELK1-DUSP5 feedback circuitry
2026-Apr-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08641-0
PMID:41956999
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与体内外模型,揭示了DUSP5通过抑制巨噬细胞来源的AREG-ERK1/2信号并破坏致癌性ERK1/2-ELK1-DUSP5反馈回路,从而抑制食管鳞状细胞癌的作用机制 | 首次阐明了DUSP5在食管鳞癌中的肿瘤抑制作用,并揭示了肿瘤浸润性髓系细胞通过AREG-EGFR轴调控DUSP5-ERK1/2-ELK1信号回路的新机制 | NA | 探究DUSP5在食管鳞状细胞癌中的功能及其分子机制 | 食管鳞状细胞癌组织样本、肿瘤浸润性髓系细胞(特别是APOC⁺巨噬细胞) | 机器学习, 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管鳞癌组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-05-21 |
Functional analysis of the human miRNome in non-small cell lung cancer unveils a novel miR-92b-3p/NOTCH3 axis that drives tumor progression
2026-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08709-x
PMID:41951596
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研究论文 | 通过功能性miRNA筛选发现miR-92b-3p/NOTCH3轴驱动非小细胞肺癌进展 | 首次对人类miRNome在肺腺癌中进行系统性功能筛选,并发现新的miR-92b-3p/NOTCH3调控轴驱动肿瘤进展 | 未提及明显局限性 | 揭示人类miRNome在非小细胞肺癌中的功能,并识别驱动肿瘤进展的关键miRNA和调控机制 | 肺腺癌细胞系和临床LUAD患者队列 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | 慢病毒miRNA筛选、转录组测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据和空间转录组学数据 | TCGA-LUAD患者队列及内部LUAD样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-05-21 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
|
研究论文 | 本研究揭示了SIRT1通过KU70去乙酰化调控NHEJ修复通路,以维持精原干细胞基因组稳定性 | 首次在精原干细胞中发现SIRT1-KU70轴通过NHEJ修复通路维持基因组稳定性,并鉴定SIRT1为应对DNA损伤的关键应激响应调节因子 | 样本量有限,基于动物模型和体外实验,临床转化需进一步验证 | 阐明SIRT1在精原干细胞中维持基因组稳定性的分子机制 | 人类睾丸样本及小鼠精原干细胞系 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、蛋白质免疫印迹、免疫共沉淀、NHEJ报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、临床组织切片图像、细胞功能实验数据 | 人类睾丸单细胞RNA-seq数据集(非梗阻性无精子症患者)及临床睾丸组织切片(梗阻性无精子症对照和患者) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 80 | 2026-05-21 |
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.002
PMID:41435889
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示MDA5-MAVS和干扰素-λ信号在肠道上皮细胞中限制小鼠星状病毒感染的作用机制 | 首次在体内通过单细胞RNA测序明确小鼠星状病毒感染的细胞嗜性,并证明肠上皮细胞是干扰素-λ的主要来源,MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导,且IFN-λ信号主要在分泌细胞(包括杯状细胞)中发挥抗病毒作用 | 未发现特定肠上皮细胞类型对MAVS在控制病毒感染中的需求差异,提示可能需要多种肠上皮细胞的协同作用 | 阐明小鼠星状病毒感染时干扰素-λ诱导的病毒感知通路及其在病毒控制和细胞嗜性调节中的具体作用 | 小鼠星状病毒感染的小鼠肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞类型) | 机器学习和单细胞组学 | 肠道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本量信息 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |