单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-06-14	Grape-Derived Exosome-Like Nanovesicles Effectively Ameliorate Skin Photoaging by Protecting Epithelial Cells 2025-Jun, Journal of food science IF:3.2Q2 DOI:10.1111/1750-3841.70309 PMID:40504599	研究论文	本研究探讨了葡萄来源的外泌体样纳米颗粒（GENs）对光老化皮肤的效果及其初步作用机制	首次发现葡萄来源的外泌体样纳米颗粒（GENs）能有效减少紫外线对皮肤的损伤并促进皮肤修复与再生	研究尚未深入探讨GENs的具体分子机制及其长期使用的安全性	探索新型抗光老化治疗方法	光老化皮肤及上皮细胞	皮肤医学	皮肤光老化	单细胞测序	NA	体外和体内实验数据	未明确说明样本数量
62	2025-06-14	Novel PAP-targeted CAR-T therapy enhances antitumor efficacy through CoupledCAR approach 2025-May-31, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011238 PMID:40449956	research paper	本研究提出了一种新型的PAP靶向CAR-T疗法，通过CoupledCAR方法增强抗肿瘤效果	首次证明PAP是前列腺癌CAR-T治疗的特定靶点，并开发了CoupledCAR平台技术，无需肿瘤抗原即可扩增肿瘤靶向CAR-T细胞	研究主要集中在前列腺癌，未涉及其他类型实体瘤的验证	开发针对前列腺癌的新型CAR-T疗法，解决现有疗法靶点不特异和CAR-T细胞扩增不足的问题	前列腺癌细胞和CAR-T细胞	肿瘤免疫治疗	前列腺癌	scRNA-Seq, 免疫组织化学染色	CAR-T	基因表达数据, 免疫组织化学图像	NA
63	2025-06-14	RNA binding proteins PCBP1 and PCBP2 regulate pancreatic β cell translation 2025-May-30, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102175 PMID:40451383	研究论文	本研究探讨了RNA结合蛋白PCBP1和PCBP2在调节胰腺β细胞翻译中的作用及其对葡萄糖稳态的影响	揭示了PCBP1和PCBP2在维持β细胞mRNA翻译中的协同作用及其对葡萄糖稳态的关键调控机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类β细胞中的适用性尚需进一步验证	探究PCBP1和PCBP2在β细胞稳态和翻译调控中的作用	小鼠β细胞	分子生物学	糖尿病	单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、RNA免疫沉淀、CRISPR-Cas9、shRNA、嘌呤霉素标记	基因敲除小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质印迹数据	基因修饰小鼠的β细胞
64	2025-06-14	scDown: A Pipeline for Single-Cell RNA-Seq Downstream Analysis 2025-May-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26115297 PMID:40508102	研究论文	开发了一个名为scDown的单细胞RNA测序下游分析流程，用于自动化细胞分化和通讯分析	整合了多种分析工具，自动化单细胞RNA测序数据的下游分析，并在一个罕见遗传性神经发育障碍数据集中发现了新的神经元炎症信号特征	未提及具体的技术限制或适用范围限制	开发一个自动化单细胞RNA测序下游分析流程，以促进生物学发现	单细胞RNA测序数据	生物信息学	神经发育障碍	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但应用于一个已发表的数据集
65	2025-06-14	Modeling the Transitional Phase of Epithelial Cells Reveals Prognostic and Therapeutic Targets in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 2025-May-29, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17111813 PMID:40507294	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了胰腺导管腺癌（PDAC）进展过程中处于过渡期的高增殖上皮细胞亚群，并构建了基于基因的风险评分模型	发现了PDAC进展中过渡期上皮细胞亚群，构建了基因风险评分模型，揭示了肿瘤微环境中成纤维细胞亚群与过渡期上皮细胞间的相互作用及免疫浸润模式变化	研究样本量未明确说明，且模型验证主要依赖qPCR，可能需要更多独立队列验证	寻找PDAC从早期向侵袭期转变的生物标志物，以改善临床管理	胰腺导管腺癌（PDAC）患者样本	肿瘤生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），qPCR	Lasso Cox回归模型	单细胞转录组数据，临床数据	NA
66	2025-06-14	Insulin-Degrading Enzyme Regulates mRNA Processing and May Interact with the CCR4-NOT Complex 2025-May-28, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110792 PMID:40497968	研究论文	该研究探讨了胰岛素降解酶（Ide）在mRNA处理和蛋白质稳态中的潜在作用	发现Ide可能与CCR4-NOT复合物相互作用，共同调控基因表达和蛋白质稳态	研究提出的模型是推测性的，需要进一步实验验证	阐明Ide在细胞生理学和蛋白质稳态中的更广泛功能	人类和小鼠Ide蛋白及CCR4-NOT复合物	分子生物学	NA	蛋白质组学、转录组学、邻近生物素化技术	NA	蛋白质组数据、单细胞转录组数据	NA
67	2025-06-14	Identification of an Immune-Related Gene Signature for Prognostic Prediction in Glioblastoma: Insights from Integrated Bulk and Single-Cell RNA Sequencing 2025-May-28, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17111799 PMID:40507280	研究论文	本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别并表征了与胶质母细胞瘤预后和免疫调节相关的免疫相关基因特征	提出了一个与巨噬细胞相关的五基因预后特征(MAPS)，为胶质母细胞瘤的免疫生物学提供了新见解，并识别了潜在的生物标志物和治疗靶点	研究结果需要进一步的实验验证	识别与胶质母细胞瘤预后相关的免疫相关基因特征	胶质母细胞瘤	数字病理学	胶质母细胞瘤	批量RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
68	2025-06-14	Single-Cell Sequencing: An Emerging Tool for Biomarker Development in Nuclear Emergencies and Radiation Oncology 2025-May-28, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17111801 PMID:40507282	综述	本文综述了单细胞测序技术在核应急和放射肿瘤学中生物标志物开发的应用	强调了单细胞测序技术在识别辐射暴露相关生物标志物中的高分辨率和细胞特异性优势	单细胞RNA测序技术在辐射研究中的应用仍处于新兴阶段	探讨辐射剂量测定方法和与辐射暴露相关的生物标志物	辐射暴露后的细胞和生物标志物	生物医学工程	放射肿瘤学	NGS, scRNA-seq	NA	基因表达和基因组数据	NA
69	2025-06-14	Potential Role of SESN3 in Linking Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Chronic Obstructive Pulmonary Disease via Autophagy Dysregulation 2025-May-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26115174 PMID:40507985	研究论文	本研究探讨了SESN3通过自噬失调在射血分数保留的心力衰竭（HFpEF）和慢性阻塞性肺疾病（COPD）之间的潜在联系	首次发现SESN3介导的自噬可能是HFpEF和COPD的共同机制，并验证了其在实验性HFpEF模型中的作用	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足	识别HFpEF和COPD的共同致病机制	HFpEF心脏组织和COPD肺组织	分子病理学	心血管疾病和慢性阻塞性肺疾病	转录组分析、WGCNA、LASSO回归、免疫细胞浸润分析、scRNA-seq、qPCR、WB、免疫荧光、透射电镜	高脂饮食和L-NAME诱导的HFpEF小鼠模型	基因表达数据和蛋白质数据	未明确说明样本数量，但使用了小鼠模型和人类转录组数据集
70	2025-06-14	Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization 2025-May-27, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110788 PMID:40497964	研究论文	通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了小鼠下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子指纹	首次描述了PVN中2-AG和AEA信号传导的时空图谱，特别是在神经元发育过程中的表达模式	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种	探索下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子机制	小鼠下丘脑室旁核的神经元和星形胶质细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序、原位杂交、免疫组织化学	NA	RNA-seq数据、图像数据	小鼠胎儿和出生后发育阶段的样本
71	2025-06-14	Huangqi decoction ameliorated intestinal barrier dysfunction via regulating NF-κB signaling pathway in slow transit constipation model mice 2025-May-27, World journal of gastrointestinal surgery IF:1.8Q2 DOI:10.4240/wjgs.v17.i5.106000 PMID:40502512	研究论文	研究黄芪汤通过调节NF-κB信号通路改善慢传输型便秘模型小鼠的肠道屏障功能障碍	首次通过单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了黄芪汤通过抑制NF-κB信号通路恢复肠道屏障功能的分子机制	研究仅在小鼠模型和LS174T细胞系中进行，尚未在人体临床试验中验证	探究黄芪汤是否通过下调NF-κB信号通路和恢复肠道屏障功能来缓解慢传输型便秘	KM小鼠和LS174T细胞系	消化系统疾病研究	慢传输型便秘	单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, Western blot	动物模型	基因表达数据, 蛋白质表达数据	KM小鼠分组（对照组、模型组和黄芪汤治疗组）和LS174T细胞系
72	2025-06-14	Molecular Characterization of Atypical Fibroxanthoma and Pleomorphic Dermal Sarcoma 2025-May-27, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17111785 PMID:40507266	综述	本文综述了非典型纤维黄色瘤（AFX）和多形性皮肤肉瘤（PDS）的分子特征及其分子驱动因素和预后生物标志物的研究现状	首次整合了包括单细胞RNA测序在内的多种测序数据，讨论了AFX和PDS的分子驱动因素和新型生物标志物	由于这些肿瘤的罕见性，相关研究较少，分子组成和基因表达的理解仍有限	探讨AFX和PDS的分子特征及其预后生物标志物	非典型纤维黄色瘤（AFX）和多形性皮肤肉瘤（PDS）	分子病理学	皮肤肉瘤	外显子测序、批量RNA测序、靶向DNA测序、DNA甲基化分析、拷贝数分析、scRNA-seq	NA	基因测序数据	NA
73	2025-06-14	Efficacy, safety and exploratory analysis of neoadjuvant tislelizumab (a PD-1 inhibitor) plus nab-paclitaxel followed by epirubicin/cyclophosphamide for triple-negative breast cancer: a phase 2 TREND trial 2025-May-26, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02254-3 PMID:40414961	研究论文	评估tislelizumab联合nab-paclitaxel和表柔比星/环磷酰胺作为三阴性乳腺癌新辅助治疗的有效性和安全性	首次在II期TREND试验中评估tislelizumab联合化疗作为三阴性乳腺癌新辅助治疗的疗效，并进行了单细胞RNA测序等多种组学分析	单臂研究设计，缺乏对照组，样本量较小（53例患者）	确定三阴性乳腺癌患者从新辅助免疫治疗中获益的最佳化疗方案和特定人群	三阴性乳腺癌患者	肿瘤学	三阴性乳腺癌	scRNA-seq, bulk RNA-seq, TCR-seq, cyTOF, WES	NA	临床数据，组学数据	53例三阴性乳腺癌患者（44例完成治疗）
74	2025-06-14	The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy 2025-May-25, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110778 PMID:40497954	review	该论文综述了cGAS/STING信号通路在心肌病炎症中的作用，并探讨了其调节机制及潜在治疗靶点	整合了人类单细胞RNA测序数据和系统文献综述，识别了现有分子干预措施并突出了有前景的治疗靶点	cGAS/STING通路在心肌病相关炎症中的确切分子机制仍不清楚且存在争议，未来研究需验证这些发现并促进其临床转化	探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症中的作用及其调节机制	心肌病相关的炎症反应及cGAS/STING信号通路	心血管疾病研究	心肌病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	NA
75	2025-06-14	Dissecting PTPN7-driven aggressiveness in IDH-wildtype astrocytomas: multi-omics, clinical validation, and spatial transcriptomics for prognostic insights 2025-May-24, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02662-5 PMID:40413344	研究论文	本研究探讨了PTPN7在IDH野生型星形细胞瘤中的预后意义、空间分布及免疫相关功能，旨在阐明其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	首次全面评估PTPN7在胶质瘤中的预后价值和免疫调节作用，并利用空间转录组学揭示其分布特征	研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证PTPN7的具体作用机制	探索PTPN7作为胶质瘤预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力	IDH野生型星形细胞瘤	数字病理学	胶质瘤	单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组化	Cox生存分析、CIBERSORT免疫去卷积	mRNA表达数据、蛋白质表达数据	TCGA和CGGA数据库样本、70例免疫组化验证病例
76	2025-06-14	Dynamic Expression and Functional Implications of the Cell Polarity Gene, Dchs1, During Cardiac Development 2025-May-24, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110774 PMID:40497950	研究论文	研究细胞极性基因Dchs1在心脏发育过程中的动态表达及其功能意义	首次生成Dchs1-HA敲入小鼠模型，揭示了Dchs1在非心肌细胞谱系中的动态表达和亚细胞定位，并发现其与FAT4的结合关系	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类心脏发育中验证	阐明Dchs1在心脏发育中的分子机制及其在细胞间通讯中的作用	小鼠心脏发育过程中的Dchs1基因表达	发育生物学	心血管疾病	免疫组织化学、Western blotting、单细胞转录组学	Dchs1-HA敲入小鼠模型	基因表达数据、蛋白质定位数据	多个发育阶段的小鼠心脏组织样本
77	2025-06-14	Functional heterogeneity and clinical implications of CD4+ T cell subtypes in high-grade serous ovarian carcinoma 2025-May-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3 DOI:10.5306/wjco.v16.i5.104138 PMID:40503412	research paper	该研究通过单细胞RNA测序分析了高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞亚型的功能异质性及其临床意义	首次在高级别浆液性卵巢癌中系统描述了CD4+ T细胞亚型的空间分布特征，并鉴定出与不良预后相关的Treg3亚型	样本量相对有限（42例患者），且仅分析了附件组织和腹水样本	阐明CD4+ T细胞亚型在高级别浆液性卵巢癌中的功能异质性和组织特异性分布，寻找治疗靶点	42例高级别浆液性卵巢癌患者的附件组织和腹水样本	肿瘤免疫学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	无监督聚类分析	单细胞转录组数据	42例高级别浆液性卵巢癌患者
78	2025-06-14	Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-Cell Treatment Efficacy 2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.13.653878 PMID:40463198	research paper	该研究探讨了低强度I型干扰素信号如何提高CAR T细胞治疗在复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效	研究发现低强度I型干扰素信号能增强CAR T细胞的细胞毒性和体内疗效，而高强度信号则相反，并提出了一种新的制造工艺改进策略	研究样本量较小（仅8名患者），且仅限于r/r DLBCL患者	提高CD19导向的CAR T细胞治疗在r/r DLBCL中的疗效	复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤（r/r DLBCL）患者	免疫治疗	弥漫大B细胞淋巴瘤	单细胞转录组学	NA	转录组数据	8名r/r DLBCL患者
79	2025-06-14	Study on Liver Sinusoidal Endothelial Cell Fenestrations Based on Cellular Omics-Structure Integration Technology and Its Application in Metabolic Diseases 2025-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.16.653525 PMID:40475559	研究论文	本研究开发了一种新的细胞组学-结构整合技术平台（COSI），用于在单细胞水平同时获取基因表达谱和超分辨率细胞结构信息	开发了能够同时获取单细胞基因表达谱和超分辨率荧光图像的整合技术平台，填补了现有空间组学和细胞生物学研究的空白	未明确说明技术平台在临床应用中的具体限制条件	研究肝窦内皮细胞窗孔形成的分子机制及其在代谢疾病中的应用	原代肝窦内皮细胞	细胞生物学	代谢疾病	单细胞转录组学、超分辨率荧光显微镜、电子显微镜、深度学习分辨率增强	深度学习	基因表达数据、超分辨率图像数据	未明确说明具体样本数量，但包括原代肝窦内皮细胞以及NASH和糖尿病小鼠模型
80	2025-06-14	Single-cell RNA sequencing reveals SLC31A1-mediated M2 polarization of macrophages promotes malignant progression in triple-negative breast cancer 2025-May-14, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-025-06191-0 PMID:40360897	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示SLC31A1介导的巨噬细胞M2极化促进三阴性乳腺癌恶性进展的机制	首次发现SLC31A1在三阴性乳腺癌髓系细胞（特别是巨噬细胞亚群）中的过表达，并阐明其通过诱导巨噬细胞M2极化促进肿瘤恶性表型的新机制	研究主要基于体外实验，需要进一步体内实验验证；临床样本量有限	探究三阴性乳腺癌免疫微环境中的关键调控因子及其作用机制	三阴性乳腺癌组织样本和细胞系	肿瘤免疫学	三阴性乳腺癌	scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, Transwell实验, 划痕实验, 铜离子和H2O2检测	NA	单细胞转录组数据, 分子生物学实验数据	未明确说明样本数量（三阴性乳腺癌组织）