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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-12-05 |
Human neural stem cell-derived exosomes promote functional recovery in subarachnoid hemorrhage via bdnf/trkb pathway activation and astrocyte modulation
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02155-0
PMID:41327445
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研究论文 | 本研究探讨了人神经干细胞来源的外泌体通过激活BDNF/TRKB通路和调节星形胶质细胞功能,在蛛网膜下腔出血大鼠模型中促进神经功能恢复的神经保护作用 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组分析,系统揭示了hNSC-exo通过BDNF/TRKB信号通路激活和星形胶质细胞调节发挥神经保护作用的分子机制 | 研究基于大鼠模型,临床转化仍需进一步验证;未探讨外泌体的最佳给药剂量和时机 | 探究人神经干细胞来源的外泌体对蛛网膜下腔出血后继发性脑损伤的神经保护作用及其分子机制 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型、人神经干细胞来源的外泌体、星形胶质细胞、BDNF/TRKB信号通路 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、行为学评估、组织病理学分析 | 动物模型(大鼠) | RNA测序数据、行为学数据、组织病理学图像 | 未明确说明具体样本数量,使用大鼠SAH模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-12-05 |
Brain-derived neurotrophic factor supports pericyte and vascular homeostasis in the aging brain
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02181-y
PMID:41327464
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研究论文 | 本研究揭示了脑源性神经营养因子通过激活Akt信号通路调控周细胞PDGFRβ表达,从而维持衰老大脑中周细胞和微血管稳态的机制 | 首次发现BDNF通过激活Akt信号通路直接调控周细胞PDGFRβ表达,并证实神经元或星形胶质细胞中BDNF缺失足以导致脑血管减少 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;体外细胞实验可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究BDNF在衰老大脑中维持周细胞和微血管稳态的作用机制 | 不同年龄段的C57BL/6J小鼠、条件性敲除Bdnf基因的C57BL/6小鼠、脑组织周细胞 | 神经生物学 | 老年性疾病 | 免疫染色、Western blot、流式细胞术、单细胞测序、转录组分析 | NA | 图像数据、蛋白质表达数据、测序数据 | 使用不同年龄段小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-12-05 |
Mega-scale single-cell profiling reveals novel biomarkers associated with acute GvHD after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-Dec-01, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00868-x
PMID:41327488
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研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序,揭示了与急性移植物抗宿主病相关的新型生物标志物MDGA1和ADGRG1 | 首次利用组合条形码大规模单细胞RNA测序技术,在AML患者移植后鉴定出MDGA1和ADGRG1作为与aGvHD相关的互补生物标志物 | 样本量较小(仅10名AML患者),且仅分析了移植后特定时间点的血液样本 | 研究与异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病相关的生物标志物 | AML患者移植后的CD45+白细胞,包括T细胞和NK细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10名AML患者的移植物样本和移植后第30天及第100天的血液样本,总计超过777,000个CD45+白细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于组合条形码的大规模单细胞RNA测序 |
| 64 | 2025-12-05 |
Integration of single-cell and RNA-seq analysis reveals sepsis heterogeneity and prognostic significance of FCGR3A+ Macrophage subtypes
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102352
PMID:41332909
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示了脓毒症的免疫微环境异质性,并开发了一个基于FCGR3A+巨噬细胞亚型的预后特征模型 | 首次整合单细胞和批量转录组数据,识别出FCGR3A+巨噬细胞亚型在脓毒症预后中的关键作用,并构建了包含13个关键基因的预后模型 | 样本量相对有限,单细胞数据仅来自53个样本,且预后模型在验证集中的AUC为0.69,性能有待进一步提升 | 分析脓毒症的免疫微环境异质性并开发预后特征 | 脓毒症患者 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | scVI算法, StepCox + Ridge模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 单细胞数据53个样本, 批量转录组数据479名脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-12-05 |
Materiobiology in the omics era
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102539
PMID:41332940
|
综述 | 本文综述了多组学技术在材料生物学领域的应用,探讨了如何利用这些技术揭示细胞与生物材料相互作用的复杂机制 | 系统性地总结了单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多种组学技术在材料生物学中的整合应用,并强调了多组学策略在构建骨类器官等生理相关模型中的作用 | NA | 为再生医学中具有改进功能和精度的下一代生物材料的合理设计提供理论基础和方法论 | 细胞与生物材料的相互作用 | 材料生物学 | NA | 单细胞转录组学、转录组学、RNA组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、糖组学、免疫组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a peripheral monocyte subpopulation and its interaction with atrial macrophages via the CCL3-CCR1 axis during atrial remodeling
2025-Dec, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3023-9
PMID:40833709
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2025-12-05 |
Single-Cell Transcriptomics Unravels Growth Factor Erv1-Like Mediated Ferroptosis as a Key Driver of Intestinal Epithelial Dysfunction in Ulcerative Colitis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502014
PMID:41098076
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了生长因子Erv1样蛋白(GFER)通过调节铁死亡在溃疡性结肠炎肠上皮功能障碍中的关键作用 | 首次证明GFER在UC中调控铁死亡的关键作用,并揭示其通过与PCBP1相互作用维持铁稳态及激活PGC-1α/PPARγ通路抑制脂质过氧化的新机制 | NA | 探究溃疡性结肠炎中肠上皮功能障碍的分子机制,特别是铁稳态和细胞死亡调控 | 溃疡性结肠炎患者的肠上皮细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、LPS诱导的体外肠上皮细胞炎症模型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-12-05 |
Effect of Dipyridamole on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Pathogenicity
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.16
PMID:41334959
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研究论文 | 本研究探讨了双嘧达莫通过cAMP-STAT3-PIM1信号轴调节Th17/Treg平衡,从而减轻实验性自身免疫性葡萄膜炎的炎症反应 | 首次在葡萄膜炎模型中应用双嘧达莫,并利用单细胞RNA测序揭示了其通过cAMP-STAT3-PIM1轴重编程免疫细胞景观、降低Th17致病性的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体疗效仍需进一步临床试验验证 | 评估双嘧达莫对自身免疫性葡萄膜炎的治疗效果并探索其免疫调节机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型及葡萄膜炎患者样本 | 单细胞组学 | 自身免疫性眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-12-05 |
Targeting MCM6 Enhances Melphalan Chemosensitivity in Retinoblastoma by Modulating DNA Damage Response
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.14
PMID:41334961
|
研究论文 | 本研究探讨了MCM6在视网膜母细胞瘤进展中的作用及其对美法仑化疗敏感性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示MCM6在视网膜母细胞瘤中的高表达模式,并证明靶向MCM6可增强美法仑的化疗敏感性 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究MCM6在视网膜母细胞瘤中的作用机制及对化疗敏感性的调控 | 视网膜母细胞瘤细胞系、患者肿瘤样本、小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因敲低细胞系、小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | 患者肿瘤样本(包括美法仑治疗失败标本)、细胞系、动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-12-05 |
Transcriptomic Analysis of Skeletal Muscle Systems Comparing Bovines, Humans, and Mice Using scRNA-Seq
2025-Dec, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70035
PMID:41335100
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,构建了牛从产前到产后骨骼肌发育的完整单细胞图谱,并与人类和小鼠的转录组特征进行比较,揭示了物种间骨骼肌系统的进化保守性和特异性差异 | 首次构建了牛骨骼肌发育的全周期单细胞转录组图谱,并进行了跨物种(牛、人、小鼠)的系统性比较分析,识别了发育协调性、细胞异质性和基因调控网络的进化模式 | 研究主要基于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平或表观遗传调控的物种差异;样本覆盖的发育阶段和细胞类型可能仍有未探索的空白 | 探究哺乳动物骨骼肌系统的发育协调性、细胞异质性及进化保守性,通过跨物种比较揭示基因表达和调控网络的物种特异性差异 | 牛、人类和小鼠的骨骼肌组织,涵盖产前到产后的发育阶段 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及牛、人类和小鼠的骨骼肌发育多个阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-12-05 |
Bacillus amyloliquefaciens orchestrates cell type-specific responses underlying drought tolerance in Arabidopsis
2025-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70612
PMID:41338235
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了芽孢杆菌Ba13介导的拟南芥叶片细胞类型特异性干旱耐受响应机制 | 首次在单细胞分辨率下解析PGPR介导的植物干旱耐受机制,发现叶片细胞亚群的功能异质性响应 | 研究仅针对拟南芥模型植物,田间实际干旱环境的验证尚需进一步研究 | 探究植物根际促生菌(PGPR)在单细胞水平上增强植物干旱耐受性的分子机制 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)叶片细胞 | 植物生物学 | 非疾病研究(植物胁迫响应) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及接种与未接种Ba13的拟南芥植株在干旱胁迫下的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-12-05 |
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2025-Dec-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.013
PMID:41338334
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿在肿瘤微环境上的关键差异 | 首次在皮肤T细胞淋巴瘤中应用空间转录组学,直接比较了滤泡性和经典型亚型在特定解剖区域(毛囊周围与真皮)的肿瘤微环境差异,并发现了与临床侵袭性相关的独特分子特征 | 样本量有限,研究结果需要在更大队列中验证;空间转录组学分辨率可能不足以解析所有细胞亚群间的精细相互作用 | 探究滤泡性蕈样肉芽肿比经典型更具临床侵袭性的肿瘤微环境机制 | 滤泡性蕈样肉芽肿和经典型蕈样肉芽肿患者的皮肤组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 73 | 2025-12-05 |
Pericyte-myofibroblast transition: a novel mechanism in peritoneal fibrosis and the effect of Asiaticoside
2025-Dec-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.072
PMID:41338386
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研究论文 | 本研究揭示了周细胞-肌成纤维细胞转化(PMT)是腹膜纤维化的关键机制,并评估了天然三萜类化合物积雪草苷(ASI)通过抑制PDGFRβ信号通路治疗纤维化的潜力 | 首次在腹膜纤维化中明确周细胞作为肌成纤维细胞来源,并发现ASI通过靶向PDGFRβ信号通路抑制PMT,为抗纤维化治疗提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明PMT在腹膜纤维化中的作用机制,并评估ASI作为治疗药物的潜力 | 氯己定葡糖酸盐诱导的腹膜纤维化小鼠模型及小鼠腹膜微血管周细胞 | 数字病理学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-12-05 |
Elucidating cardiac fibroblasts heterogeneity and activation during experimental autoimmune myocarditis using spatial transcriptomics
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102344
PMID:41341993
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,在实验性自身免疫性心肌炎(EAM)模型中,探索了急性炎症期心脏成纤维细胞的转录模式变化及其异质性 | 首次在EAM模型中应用空间转录组学分析心脏成纤维细胞的转录变化,揭示了六个不同的成纤维细胞亚群及其在急性炎症期的频率变化,并观察到免疫细胞浸润与成纤维细胞激活的空间共定位关系 | 研究基于动物模型(EAM),可能无法完全反映人类疾病情况;样本量相对有限(1545个富集成纤维细胞区域) | 探究实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期心脏成纤维细胞的转录模式变化及其异质性 | 实验性自身免疫性心肌炎(EAM)模型中的心脏成纤维细胞 | 空间转录组学 | 心肌炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1545个富集成纤维细胞区域(其中657个以成纤维细胞为主) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2025-12-05 |
Dysregulated B Cell Responses in Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70741
PMID:41342291
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和BCR谱分析,揭示了严重发热伴血小板减少综合征患者中B细胞功能失调的免疫代谢机制 | 首次在SFTS患者中整合单细胞RNA测序和BCR谱分析,鉴定出七种转录不同的B细胞亚群,并发现致命病例中CXCR3+Ki-67+CXCR5-卵泡外浆母细胞的扩增与代谢重编程 | 研究样本可能有限,且机制验证主要在体外进行,需要进一步在体实验确认 | 探究SFTSV感染导致B细胞功能失调的免疫代谢机制 | SFTS患者的周围B细胞 | 数字病理学 | 病毒感染相关疾病 | 单细胞RNA测序,BCR谱分析,代谢流分析 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-12-05 |
Spatial Transcriptomics of Patients With Kaposi Sarcoma Identifies Mechanisms of Immune Evasion
2025-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70728
PMID:41342328
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析卡波西肉瘤患者的皮肤肿瘤,以识别KSHV感染的细胞类型和肿瘤微环境中的免疫相互作用 | 首次在卡波西肉瘤中应用空间转录组学,并结合单细胞RNA测序参考数据集进行空间信息化的细胞类型反卷积分析,同时使用针对KSHV基因的自定义探针同步检测人类和病毒表达模式 | 样本量较小(7个KS肿瘤和6个正常皮肤样本),且为观察性研究,需要进一步的功能验证 | 揭示KSHV感染如何重塑皮肤组织、抑制针对KSHV感染的免疫应答并赋予抗癌疗法耐药性的潜在机制 | 卡波西肉瘤患者的皮肤肿瘤组织和正常皮肤组织 | 空间转录组学 | 卡波西肉瘤 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 空间信息化的细胞类型反卷积方法 | 空间基因表达数据 | 7个卡波西肉瘤皮肤肿瘤样本和6个正常皮肤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-12-05 |
The PIK3C3/MAPK14 axis drives M1 polarization via autophagy Inhibition to exacerbate Sepsis-Induced acute lung injury
2025-Nov-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27088-5
PMID:41318541
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研究论文 | 本研究揭示了PIK3C3/MAPK14信号轴通过抑制自噬驱动巨噬细胞M1极化,从而加剧脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 | 首次通过机器学习转录组分析和多组学整合,鉴定出MAPK14是ALI的核心基因,并揭示了PIK3C3与MAPK14之间的高亲和力相互作用及其通过调控自噬影响巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于体外实验和计算模拟,缺乏体内动物模型的直接验证,且临床样本量有限 | 阐明脓毒症诱导的急性肺损伤中巨噬细胞自噬失调的分子机制 | 巨噬细胞、急性肺损伤组织 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 机器学习转录组分析、单细胞测序、多组学整合、分子对接、动力学模拟、Western Blot、RT-qPCR、流式细胞术、ELISA、RNA pull-down | 机器学习模型(具体类型未指定) | 转录组数据、单细胞测序数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals a cellular atlas of the sheep testis
2025-Nov-29, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111159
PMID:41325971
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了绵羊睾丸的高分辨率细胞图谱,揭示了精子发生过程中的细胞异质性和分化轨迹 | 首次在绵羊睾丸中应用单细胞RNA测序技术,识别了六种体细胞亚型和五种生殖细胞亚型,并通过伪时间分析提出Leydig细胞和管周肌样细胞可能起源于共同的祖细胞谱系 | 研究仅基于三只6月龄性成熟绵羊的样本,样本量较小,且未涉及不同年龄或生理状态的比较 | 解析绵羊睾丸的细胞组成和精子发生过程 | 绵羊睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15,826个睾丸细胞,来自三只6月龄性成熟绵羊 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium™ scRNA-seq |
| 79 | 2025-12-05 |
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046084
PMID:41327651
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研究论文 | 本研究通过整合结直肠癌肿瘤组织和肌少症肌肉组织的单细胞转录组数据,揭示了两种疾病共享细胞类型在跨组织微环境中的功能异质性及其相互作用机制 | 首次整合结直肠癌和肌少症的单细胞转录组数据进行跨组织微环境分析,揭示了共享细胞类型在不同组织中的转录和功能分化,并识别了潜在的跨组织调控网络 | 样本量相对有限(16例CRC和17例SP),且为观察性研究,需要进一步功能实验验证发现的调控通路 | 阐明结直肠癌与肌少症共存的微环境相互作用机制 | 结直肠癌肿瘤组织和肌少症肌肉组织 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌, 肌少症 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | Harmony批次校正, CellChat细胞通讯建模 | 单细胞转录组数据 | 16例结直肠癌肿瘤组织(scRNA-seq)和17例肌少症肌肉组织(snRNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-12-05 |
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045975
PMID:41327739
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统探索了主动脉夹层中铁死亡相关基因的表达模式、细胞特异性及与肠道微生物、血清代谢物的因果关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏独立队列的实验验证,且孟德尔随机化分析结果需进一步功能实验证实 | 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用,并识别潜在的治疗靶点与风险因素 | 主动脉夹层患者与对照的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组与血清代谢组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 全基因组关联研究 | LASSO回归, ROC分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联统计数据 | 未明确具体样本数量,数据来源于GEO数据库及GWAS汇总统计 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA |