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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-03-17
Senescence-Linked Fibrosis in the Aging Human Ovary Revealed by p16-Based Histological Profiling and Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, Research square
研究论文 本研究通过p16INK4a蛋白表达的空间解析,结合空间转录组学和AI引导的数字病理学,揭示了人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布及其与纤维化的关联 首次在人类绝经后卵巢中利用p16INK4a作为衰老标志物进行空间定位,并整合多组学技术识别衰老微环境,开发了BuckSenOvary基因签名 研究主要聚焦于绝经后卵巢,样本可能有限,且衰老细胞的动态变化和功能验证需进一步探索 探究衰老细胞在人类卵巢衰老中的作用及其微环境特征 人类绝经后卵巢组织 数字病理学 老年疾病 空间转录组学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, AI引导的数字病理学 AI 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
62 2026-03-17
Molecular architecture of human dermal sleeping nociceptors
2026-Feb-04, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过Patch-seq方法结合单细胞转录组学、电生理学表征以及跨物种数据整合,鉴定了人类皮肤中机械不敏感的C纤维(CMis)的分子标记物OSMR和SST,并验证了其配体oncostatin M对CMis的调节作用 首次在人类皮肤中识别出CMis的分子标记物OSMR和SST,并通过跨物种整合和功能验证,为神经病理性疼痛的靶向治疗提供了新框架 研究主要基于猪模型和人类志愿者注射实验,样本规模有限,且人类皮肤组织的直接分子验证仍需进一步扩展 揭示人类皮肤中休眠伤害感受器(CMis)的分子结构,以促进对神经病理性疼痛机制的理解和靶向治疗策略的开发 人类皮肤中的机械不敏感C纤维(CMis)、猪感觉神经元以及健康人类志愿者 神经科学 神经病理性疼痛 Patch-seq、单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、电生理学(膜片钳)、跨物种数据整合 NA 转录组数据、电生理数据、空间数据 涉及猪感觉神经元和健康人类志愿者,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq、单核RNA-seq、空间转录组学 NA NA
63 2026-03-17
Cell Subtypes and Gene Dysfunction in Ovarian Endometriosis Before and After GnRHa Treatment Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢子宫内膜异位症中异位与在位子宫内膜的细胞亚型差异、基因功能障碍,以及GnRHa治疗前后的变化 首次在单细胞水平上系统比较了卵巢子宫内膜异位症患者异位与在位子宫内膜的细胞组成差异,并明确了GnRHa治疗对特定细胞亚群(如ECM1+基质细胞)的影响,提出了ECM1表达降低可能启动纤维化过程的新机制 样本量较小(仅3名患者),缺乏长期随访数据,且未进行功能验证实验 探究子宫内膜异位症相关纤维化的病理特征,分析异位与在位子宫内膜的细胞异质性及GnRHa治疗的影响 卵巢子宫内膜异位症患者的异位病灶和在位子宫内膜组织 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3名患者的6个样本(包括在位子宫内膜和异位病灶),共计约73,531个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-03-17
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-Feb, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 通过多组学数据分析,识别PDGFRA作为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 结合DEGs、WGCNA和机器学习方法,利用bulk RNA-seq和scRNA-seq数据识别核心基因PDGFRA,并通过空间转录组分析和虚拟敲除验证其功能 未明确说明样本来源的具体数据库细节或实验验证的局限性 探索子宫内膜异位症的致病机制并识别潜在生物标志物 子宫内膜异位症组织及基质细胞 生物信息学 子宫内膜异位症 bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组分析 机器学习 RNA-seq数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
65 2026-03-17
Integrated Stress Response and Drug-Induced Acute Kidney Injury: Involvement of Activating ATF4-STAT1-GBP2 Signaling
2026-Jan-20, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了整合应激反应通过激活ATF4-STAT1-GBP2信号通路促进药物诱导的急性肾损伤的机制 首次发现ATF4作为整合应激反应的关键调控因子,通过激活STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡,从而驱动药物诱导的急性肾损伤 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人类患者中进行大规模临床验证 阐明药物诱导急性肾损伤中细胞焦亡的分子机制,为开发新的治疗策略提供理论基础 肾小管上皮细胞、转基因小鼠模型、人类和小鼠的急性肾损伤样本 分子生物学与病理生理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序、RNA测序、转录组分析、免疫组织化学、免疫荧光、荧光素酶报告基因检测、免疫共沉淀、Western blotting NA 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 NA NA 单细胞RNA测序、RNA测序 NA NA
66 2026-03-17
[Recent Advances in the Interorgan Regulatory Roles of Adipose Tissue]
2026-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
综述 本文综述了脂肪组织作为关键信号枢纽,在肝脏、肠道、大脑、骨骼等器官间通讯中的作用及其与肿瘤进展的关联,并强调了单细胞测序和人工智能等前沿技术在脂肪组织研究中的应用 系统性地回顾了以脂肪组织为中心的调控网络,克服了单器官研究的局限,并突出了单细胞测序和人工智能等新技术在该领域的应用潜力 NA 探讨脂肪组织在器官间通讯中的调控作用及其在疾病发生发展中的角色 脂肪组织及其与肝脏、肠道、大脑、骨骼等器官的相互作用 NA NA 单细胞测序,人工智能 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
67 2026-03-17
Natural progression of glioma enhances functional connection with the cerebral cortex through synaptogenesis
2026, NeuroImage. Clinical
研究论文 本研究通过结合多灶性胶质瘤患者的功能磁共振成像分析和胶质瘤小鼠单细胞RNA测序数据,系统探索了胶质瘤的自然进展轨迹 首次通过多模态、跨尺度方法揭示胶质瘤自然进展中与大脑皮层的功能超连接性及其背后的突触发生分子机制 研究样本量有限(24例患者),且依赖于小鼠模型数据,可能无法完全反映人类胶质瘤的复杂性 理解胶质瘤的自然进展机制以改善临床管理 多灶性胶质瘤患者和胶质瘤小鼠模型 数字病理学 胶质瘤 功能磁共振成像(fMRI),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 图像,基因表达数据 24例多灶性胶质瘤患者,胶质瘤小鼠模型(早期、中期和终点病变样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
68 2026-03-17
Single-Cell Profiling Identifies JUNB/SPI1-Driven Inflammatory Programs and Novel Communication Axes in Myeloid Cells of Sepsis
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了脓毒症中髓系细胞的促炎通路、关键转录调控因子及细胞间相互作用模式 识别了JUNB/SPI1驱动的炎症程序及髓系细胞中新的通讯轴,如MPZL1-MPZL1和FASL-FAS相互作用 样本量较小(仅4名脓毒症患者和5名健康对照),且数据来源于公共数据库,可能缺乏临床验证 表征脓毒症中浸润细胞的特性,为脓毒症治疗提供新见解 脓毒症患者和健康对照者的全血单细胞RNA测序样本 单细胞组学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Seurat, clusterProfiler, SCENIC, CellChat 单细胞RNA测序数据 4名脓毒症患者和5名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
69 2026-03-17
CCL5-Mediated Immune Interactions Drive Osteosarcoma Progression: Insights from Mendelian Randomization, Single-Cell Analysis, and Functional Validation
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和功能实验,揭示了趋化因子CCL5在骨肉瘤免疫微环境中的核心促癌作用 首次通过孟德尔随机化方法确立了CCL5与骨肉瘤风险的因果关联,并结合单细胞测序解析了其细胞来源及与特定免疫细胞表型的空间关联 研究主要基于观察性数据和体外实验,体内功能验证及临床转化潜力仍需进一步探索 探究炎症因子和免疫细胞在骨肉瘤进展中的因果作用和分子机制 骨肉瘤组织、免疫细胞(单核/巨噬细胞、T细胞等) 生物信息学 骨肉瘤 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、qPCR、CCK-8、EdU、集落形成实验 NA 基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据 未明确说明具体样本数量,使用了TARGET数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-03-17
Inhibition of Airway Epithelial CTSC Attenuates Type 2 Inflammation: Implications for Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis with Nasal Polyps
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了组织蛋白酶C(CTSC)在嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉(eNP)中的表达、定位及功能,发现CTSC在鼻上皮杯状细胞和基底细胞中特异性上调,并通过siRNA敲低实验证实其抑制可减轻2型炎症反应 首次通过单细胞RNA测序揭示了CTSC在鼻上皮细胞中的特异性定位(杯状细胞和基底细胞),并证实其在eNP患者中显著上调,且与2型细胞因子表达正相关,为气道疾病的治疗提供了新的潜在靶点 样本量相对较小(eNP 34例,neNP 32例,对照16例),且体外实验基于IL-4/IL-13刺激的16HBE细胞系模型,可能无法完全模拟体内复杂环境 探究CTSC在慢性鼻窦炎,特别是嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉(eNP)中的具体功能、亚细胞定位及其在2型炎症中的作用 患者鼻黏膜组织(包括eNP、neNP患者及对照)以及IL-4/IL-13刺激的16HBE人支气管上皮细胞系 NA 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学、实时定量PCR、Western印迹、siRNA介导的敲低、扫描电子显微镜 NA RNA测序数据、蛋白质表达数据、图像数据 82例样本(34例eNP患者,32例neNP患者,16例对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
71 2026-03-17
gLeiden: accelerated community detection algorithms using directed and undirected graphs on GPUs
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文介绍了一种名为gLeiden的GPU加速社区检测算法,支持有向和无向图,用于单细胞RNA测序和质谱流式数据中的细胞类型识别 gLeiden是首个支持有向图的GPU实现Leiden算法,相比现有工具在大型数据集上实现了显著加速 有向图处理需要近两倍的计算时间和内存资源,且未在更广泛的数据集上验证 开发高性能社区检测工具以应对单细胞测序数据规模增长的计算挑战 单细胞RNA测序和质谱流式数据中的图结构 机器学习 NA 单细胞RNA测序,质谱流式技术 Leiden算法 图数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-03-17
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-Dec-04, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究建立了一个包含352个公开可用的神经发育障碍患者来源iPSC的生物库,并通过对35名代表性患者的6000多个脑类器官进行分析,揭示了不同疾病类别的特异性细胞表型 创建了首个大规模、遗传多样性的神经发育障碍iPSC生物库,并系统性地将脑类器官表型与临床疾病类别相关联,构建了基因型与表型之间的桥梁 研究仅基于35名代表性患者的类器官进行分析,样本代表性可能有限;类器官模型仍不能完全模拟人脑发育的复杂性 建立神经发育障碍的生物库和脑类器官图谱,以揭示疾病机制并支持未来的疾病建模和治疗开发 神经发育障碍患者来源的诱导多能干细胞及其衍生的脑类器官 数字病理学 神经发育障碍 单细胞转录组测序,组织学分析 脑类器官模型 单细胞转录组数据,组织学图像,临床数据,脑成像数据,基因组数据 352个患者来源iPSC系(来自公开生物库),35名代表性患者(超过6000个脑类器官),10名神经典型对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-03-17
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-12, Basic research in cardiology IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌中与脂肪生成、脂肪酸代谢和氧化磷酸化相关的基因表达上调,为冠状动脉微血管疾病的机制提供了新见解 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面分析2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌的转录组差异,识别出新的基因表达特征和关键调控因子 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且未进行功能验证实验以确认这些基因表达变化在疾病进展中的具体作用 探究2型糖尿病中冠状动脉微血管疾病的转录组差异,识别潜在的治疗靶点 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和心肌组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及2型糖尿病小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
74 2026-03-17
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal ITGA5-driven epithelial-mesenchymal transition and metabolic adaptation in thyroid cancer
2025-10-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本文通过单细胞和批量转录组分析揭示了ITGA5驱动的上皮-间质转化和代谢适应在甲状腺癌中的作用 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统性地研究了ITGA5在甲状腺癌中的功能,并揭示了其通过激活上皮-间质转化和肿瘤微环境重塑促进肿瘤侵袭性的新机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本来源有限,可能无法完全反映肿瘤异质性 探究ITGA5在甲状腺癌进展中的分子机制及其与患者预后的关联 甲状腺癌组织样本、BCPAP和8505C甲状腺癌细胞系 数字病理学 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, GO分析, 通路分析 NA 转录组数据, 单细胞数据 TCGA数据库中的甲状腺癌样本及体外培养的细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
75 2026-03-17
Single-cell mapping of TMZ-resistant glioma reveals CXCL2/3-CXCR2-associated neutrophil communication
2025-10-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了替莫唑胺耐药胶质瘤中CXCL2/3-CXCR2信号轴介导的肿瘤细胞与中性粒细胞通讯机制 首次在单细胞水平上绘制了TMZ耐药胶质瘤的微环境图谱,并发现了一个独特的CXCL2/3-CXCR2趋化轴介导的肿瘤-中性粒细胞通讯回路 研究主要基于转录组数据分析,功能验证实验相对有限,且未在体内模型中充分验证CXCR2抑制的治疗效果 探究胶质母细胞瘤中替莫唑胺耐药的微环境机制 胶质瘤细胞(包括TMZ耐药和对照细胞)及肿瘤微环境中的免疫细胞(特别是中性粒细胞) 单细胞转录组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 基于已发表的大规模单细胞RNA-seq数据集进行分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-03-17
Mechanistic insights into iguratimod action in asthma-COPD overlap through multi-omics and in-silico modelling
2025-10-10, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,分析哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO)的基因表达数据,结合分子对接和动力学模拟,探讨了艾拉莫德(IGU)在ACO中的作用机制 首次将多组学(批量与单细胞RNA测序)与计算机模拟(分子对接和动力学模拟)相结合,系统研究了艾拉莫德在ACO中的潜在治疗靶点和作用机制 研究主要基于公共数据库的基因表达数据,缺乏实验验证,且分子动力学模拟时间较短(200纳秒),可能无法完全反映长期动态行为 探究艾拉莫德在哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO)中的分子作用机制,识别关键靶点基因 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO)相关的基因表达数据,以及艾拉莫德(IGU)小分子药物 生物信息学 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠(ACO) 批量RNA测序,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 NA 基因表达数据 NA NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
77 2026-03-17
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-09-30, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究系统探索了色氨酸代谢异常在骨关节炎发病机制中的潜在作用,整合转录组学和单细胞RNA测序数据 首次系统揭示色氨酸代谢失调驱动骨关节炎免疫激活和软骨降解的代谢机制,提出犬尿氨酸通路作为潜在治疗靶点 研究主要基于体外细胞模型和测序数据,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 阐明色氨酸代谢在骨关节炎发病中的作用机制 骨关节炎软骨组织、IL-1β刺激的软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
78 2026-03-17
Single-cell transcriptomic analysis of interactions of peritoneal mesenchymal stem cells with macrophages in prevention of peritoneal membrane injury
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析探讨了腹膜间充质干细胞与巨噬细胞的相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜损伤中的作用 首次在腹膜损伤模型中应用单细胞RNA测序技术解析pMSCs通过调控巨噬细胞亚群发挥保护作用的分子机制 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性仍需验证;单细胞测序样本量有限 探究腹膜间充质干细胞(pMSCs)与巨噬细胞相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜膜损伤中的机制 Sprague-Dawley大鼠的腹膜组织、腹膜间充质干细胞、巨噬细胞 单细胞转录组学 腹膜损伤 单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据 大鼠模型(具体数量未明确说明) Illumina 单细胞RNA-seq HiSeq X Ten HiSeq X Ten平台进行单细胞RNA测序,使用Cell Ranger软件和Mouse_ref_Immgen数据集进行分析
79 2026-03-17
Rutaecarpine alleviates liver fibrosis by modulating the TRPV1/Connexin 43 axis: A study based on transcriptome data, single-cell sequencing data, and cell experiments
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究基于转录组数据、单细胞测序数据和细胞实验,探讨了吴茱萸碱通过调节TRPV1/Connexin 43轴缓解肝纤维化的潜在机制 结合转录组、单细胞测序和细胞实验,首次揭示了吴茱萸碱通过调控TRPV1/Cx43轴缓解肝纤维化的新机制 研究主要基于体外细胞模型和公开数据集,缺乏体内动物模型的验证 探索吴茱萸碱缓解肝纤维化的潜在分子机制 肝纤维化相关的分子通路(TRPV1/Cx43轴)及吴茱萸碱的药理作用 生物信息学与分子生物学 肝纤维化 转录组分析、单细胞测序、分子对接、细胞模型实验 逻辑回归模型、ROC曲线分析、分子对接模型 基因表达数据、单细胞测序数据、体外细胞实验数据 基于公开数据集GSE84044,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
80 2026-03-17
Role of Defense/Immunity Proteins in Non-Obstructive Azoospermia: Insights from Gene Expression and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2025-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本研究通过基因表达和单细胞RNA测序分析,探讨了防御/免疫蛋白在非梗阻性无精子症中的作用 首次结合多数据集基因表达分析和单细胞RNA测序技术,系统揭示了免疫相关基因在非梗阻性无精子症不同睾丸细胞群体中的差异表达模式 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认这些免疫相关基因在NOA发病机制中的具体功能 探究免疫失调在非梗阻性无精子症发病机制中的作用,并识别关键的免疫相关基因 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织和相关基因表达数据 单细胞组学 男性不育症 单细胞RNA测序, 基因表达分析 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 多个数据集(具体样本数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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