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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-04 |
Macrophages expressing macrophage receptor with collagen structure attenuate liver fibrosis through a tissue restoration phenotype
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193172
PMID:41869728
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了MARCO+巨噬细胞在肝脏纤维化中通过促进组织修复表型来减轻纤维化的作用机制 | 首次在肝脏纤维化模型中识别出MARCOhi巨噬细胞亚群,并证明其通过增强吞噬作用和抗炎基因表达,直接与肝星状细胞相互作用减少胶原沉积,为肝脏纤维化治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证;MARCO+巨噬细胞的具体分子调控机制仍需进一步探索 | 探究巨噬细胞在肝脏纤维化中的作用,特别是MARCO+巨噬细胞对纤维化进程的影响 | 小鼠肝脏纤维化模型中的巨噬细胞和肝星状细胞 | 单细胞组学 | 肝脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏纤维化模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-04-04 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03070-6
PMID:41872134
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌患者单细胞RNA测序数据并结合体外体内实验,揭示了新辅助化疗后前列腺素介导的免疫抑制微环境形成是化疗耐药的关键机制 | 首次系统揭示前列腺素介导的免疫抑制微环境在卵巢癌新辅助化疗后化疗耐药中的核心作用,并提出联合治疗新策略 | 研究主要基于已发表的单细胞测序数据,临床样本验证和前瞻性研究有待加强 | 探索卵巢癌新辅助化疗后肿瘤免疫微环境的动态变化及化疗耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本、体外培养的卵巢癌细胞、动物模型 | 单细胞组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表数据集中的高级别浆液性卵巢癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-04-04 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2026-Mar-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117144
PMID:41875135
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,探索了1型糖尿病自然病程中胰腺和胰腺淋巴结的炎症反应特征 | 首次在人类1型糖尿病中,通过多细胞和亚细胞分辨率空间转录组学,揭示了胰腺淋巴结中淋巴毒素-β(LTB)的显著上调及其在滤泡B细胞中的来源,并发现了胰岛炎病变中LTB表达的增加 | 研究样本量有限,且依赖于独立供者集进行验证,可能影响结果的普遍性 | 探索1型糖尿病中胰腺和胰腺淋巴结的炎症分子特征,以期为未来治疗干预提供信息 | 无糖尿病个体、风险性自身抗体阳性个体和1型糖尿病供者的胰腺及胰腺淋巴结组织 | 空间转录组学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包括无糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病供者的胰腺及胰腺淋巴结组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 使用多细胞分辨率空间转录组学和正交亚细胞分辨率空间转录组学平台 |
| 64 | 2026-04-04 |
Intranasal HSV-1 Infection Drives Region-Specific Interferon-Dominant Microglial Remodeling
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.13.711627
PMID:41928984
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序、染色质可及性分析和空间转录组学,首次揭示了HSV-1感染如何驱动小胶质细胞的区域特异性干扰素主导重塑 | 首次在体内生理相关模型中整合单核多组学与空间转录组学,系统解析HSV-1感染下小胶质细胞的转录与表观遗传重塑机制 | 研究基于动物模型,人类直接适用性需进一步验证;未探讨长期感染对小胶质细胞功能的持续影响 | 阐明HSV-1感染在体内调控小胶质细胞持续神经炎症活动的分子机制 | HSV-1感染小鼠模型中的小胶质细胞和巨噬细胞群体 | 单细胞多组学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量,基于CD11b⁺核的单细胞分析 | NA | 单核RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-04-04 |
Spatial transcriptomics identifies dysregulated programs across neural and non-neural tissues in spinal muscular atrophy
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.20.713154
PMID:41929160
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术,在症状前脊髓性肌萎缩症(SMA)小鼠模型中,系统地揭示了SMN蛋白缺乏导致的早期、跨组织转录重编程,包括脊髓、肌肉、骨骼和脂肪等多个组织的病理变化 | 首次在SMA中应用空间转录组学对整个腰椎区域进行组织层面的转录分析,揭示了SMN缺乏在症状前阶段就驱动了跨神经和非神经组织的广泛转录重编程,并识别了非神经元病理程序作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类SMA;且为早期时间点(出生后第4天)的分析,未涵盖疾病晚期变化 | 阐明脊髓性肌萎缩症(SMA)中SMN蛋白缺乏导致的早期、跨组织转录病理程序 | 症状前SMA小鼠和对照小鼠的整个腰椎区域组织,包括脊髓、背根神经节、肌肉、骨骼、软骨、骨髓、脂肪和结缔组织 | 空间转录组学 | 脊髓性肌萎缩症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 症状前SMA小鼠和对照小鼠的腰椎区域组织切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-04-04 |
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06113-4
PMID:41863623
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM21通过泛素化降解FBL抑制PI3K/AKT信号通路,从而调控透明细胞肾细胞癌进展的机制 | 首次鉴定TRIM21为FBL的新型E3泛素连接酶,并阐明其通过K48连接的多聚泛素化在Lys292位点促进FBL降解,进而抑制PI3K/AKT信号通路 | 未在动物模型中验证TRIM21-FBL轴的体内治疗效果,且临床样本量可能有限 | 探究FBL在ccRCC中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 | 透明细胞肾细胞癌细胞和组织 | 癌症生物学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱、分子对接 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及ccRCC组织和细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-04-04 |
Hyperinnervation inhibits organ-level regeneration in mammalian skin
2026-Mar-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.027
PMID:41864207
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物皮肤器官水平再生的机制,发现出生后伤口特异性成纤维细胞通过诱导过度神经支配抑制再生能力 | 首次发现胚胎晚期皮肤损伤具有器官水平再生能力,鉴定出Timp1、Cxcl12和Ccl7三个基因为关键抑制因子,证明通过减少过度神经支配可恢复出生后皮肤的再生潜能 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类皮肤中得到验证;神经支配调控再生的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究哺乳动物皮肤器官水平再生的调控机制及出生后再生能力丧失的原因 | 小鼠胚胎期和出生后皮肤的全层损伤模型 | 发育生物学与再生医学 | 皮肤损伤与再生障碍 | 单细胞测序、体内筛选、基因过表达、神经消融 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 未明确样本数量的小鼠胚胎和出生后皮肤损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-04-04 |
[Mechanism of MDA5 in macrophages in SiO(2)-induced epithelial-mesenchymal transition]
2026-Mar-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞来源的MDA5在二氧化硅诱导的肺上皮细胞上皮-间质转化中的调控作用及分子机制 | 首次在矽肺模型中结合单细胞RNA测序和体外细胞实验,系统阐明了巨噬细胞MDA5通过促炎级联反应调控肺上皮细胞EMT的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和THP-1/A549细胞系,尚未在人体组织或原代细胞中进行验证;体内实验样本量较小 | 探究二氧化硅暴露下巨噬细胞MDA5对肺上皮细胞EMT的调控机制 | C57BL/6小鼠、THP-1细胞系、A549细胞系 | 单细胞组学 | 肺纤维化/矽肺 | 单细胞RNA测序、Western blot、qRT-PCR、siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、基因表达数据 | 16只C57BL/6雄性小鼠(每组8只),THP-1细胞实验设3个重复 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-04-04 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白乳酸化修饰,特别是H3K18la,通过激活胸苷激酶1(TK1)转录并促进嘧啶生物合成,从而驱动口腔鳞状细胞癌发生的分子机制 | 首次发现并阐明了糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路在口腔癌发生中的作用,建立了表观遗传调控与乳酸驱动代谢重编程之间的新联系 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,其临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及分子机制 | 口腔白斑(OLK)和口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织及细胞 | 表观遗传学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR | NA | 组织样本、细胞、测序数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及OLK和OSCC组织、细胞系及4NQO诱导的小鼠舌癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-04-04 |
Targeting the MICA-mediated oxidative stress-immune axis: a novel therapeutic strategy for ankylosing spondylitis
2026-Mar-18, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/ngvjin
PMID:41930655
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了MICA蛋白作为强直性脊柱炎风险的关键调节因子,其作用部分通过特定T细胞亚群介导 | 首次通过整合基因组学、蛋白质组学和单细胞转录组学,系统阐明了氧化应激相关基因(尤其是MICA)通过免疫失调途径驱动强直性脊柱炎的因果机制 | 研究主要基于生物信息学分析和公共数据集,实验验证部分相对有限;介导分析的结果需要更大样本的独立队列进一步验证 | 阐明氧化应激与免疫失调在强直性脊柱炎发病中的分子联系,并寻找新的治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者相关的基因表达数据、蛋白质数据和免疫细胞表型 | 生物信息学与计算生物学 | 强直性脊柱炎 | mRNA微阵列、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、Western blotting | 逻辑回归模型、孟德尔随机化模型 | 基因表达数据、蛋白质丰度数据、单细胞转录组数据 | 731个免疫表型的遗传信息,以及未明确数量的临床样本和单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, mRNA微阵列 | NA | NA |
| 71 | 2026-04-04 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了在胰腺导管腺癌中,TNFα和TWEAK分别通过RELA和RELB激活经典与非经典NF-κB信号通路的差异机制及其在肿瘤微环境中的特异性调控作用 | 首次系统比较了PDAC中RELA和RELB的时空激活模式、染色质结合特性及与AP1的协同调控关系,明确了TNFα/RELA与TWEAK/RELB通路在转录调控和肿瘤微环境分布中的互补功能 | 研究主要基于体外刺激模型和部分原代组织分析,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 阐明胰腺导管腺癌中经典与非经典NF-κB信号通路的差异激活机制及其转录调控特异性 | 胰腺导管腺癌细胞系及原代肿瘤组织 | 计算生物学 | 胰腺癌 | 转录组测序、全基因组占据图谱、表观基因组分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像数据 | 未明确样本数量,涉及细胞系刺激实验和原代PDAC组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-04-04 |
Müller glia-mediated regeneration restores neuronal diversity and retinal circuit organization in the adult zebrafish
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.15.711785
PMID:41889825
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研究论文 | 本研究通过结合诱导谱系追踪、单细胞RNA测序和形态学分析,探讨了成年斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞介导的神经元再生如何恢复神经元多样性和视网膜环路组织 | 首次在成年斑马鱼中系统评估了Müller胶质细胞再生神经元在分子和结构特征上与原内源性神经元的匹配程度,揭示了损伤环境如何影响再生神经元的比例和多样性 | 研究主要基于斑马鱼模型,结果可能不完全适用于哺乳动物;再生神经元的长期功能和环路整合需进一步验证 | 探究成年斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞介导的神经元再生是否能够恢复神经元多样性、身份和环路组织,为再生神经科学提供见解 | 成年斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞及其再生的神经元,包括光感受器和内视网膜神经元 | 再生神经科学 | 视网膜损伤 | 诱导谱系追踪,单细胞RNA测序,形态学分析,光损伤和NMDA损伤模型 | NA | 单细胞转录组数据,形态学图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-04-04 |
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03025-x
PMID:41839843
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和靶向血浆代谢组学,揭示了赖氨酸在急性肺损伤中通过恢复α-微管蛋白乙酰化和纤毛活性来促进肺泡上皮修复的作用机制 | 首次将赖氨酸代谢与α-微管蛋白乙酰化、纤毛信号传导及钙稳态联系起来,并发现赖氨酸补充能显著提高小鼠存活率(从0%提升至62.5%) | 研究主要基于动物模型(小鼠和非人灵长类),在人类患者中的直接疗效仍需进一步临床验证 | 探究氨基酸代谢在急性肺损伤后肺泡上皮修复中的具体作用机制 | 急性肺损伤(ALI)模型中的肺上皮细胞,特别是SFTPC+肺泡上皮II型(AT2)细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),靶向血浆代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,代谢组数据 | 人类ALI样本和小鼠及非人灵长类ALI模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-04-04 |
MAPK14/SLC7A11/GPX4 axis dysregulation drives podocyte ferroptosis via mediating glycerophospholipid metabolism
2026-Mar-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02990-7
PMID:41813669
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法,揭示了糖尿病肾病中足细胞铁死亡的关键驱动机制,并验证了黄芪甲苷IV的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序确定足细胞是糖尿病肾病的核心细胞枢纽,并发现MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调通过介导甘油磷脂代谢驱动足细胞铁死亡 | 未明确说明样本的具体数量及临床特征细节 | 阐明糖尿病肾病的细胞类型特异性发病机制,并探索新的治疗靶点和诊断生物标志物 | 人类糖尿病肾脏组织、足细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | RNA测序数据, 代谢组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-04-04 |
ChatSpatial: Schema-Enforced Agentic Orchestration for Reproducible and Cross-Platform Spatial Transcriptomics
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.26.708361
PMID:41890081
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研究论文 | 介绍ChatSpatial平台,该平台通过模式强制的智能编排,统一了空间转录组学分析工具,实现了跨Python和R生态系统的可重复工作流程 | 提出基于模式强制编排的LLM驱动平台,将60多种方法统一到单一对话工作流中,通过预验证工具模式而非生成自由代码来确保可重复性 | 未明确说明平台对计算资源的要求、对新分析工具的扩展性限制,以及在实际大规模数据集上的性能评估 | 解决空间转录组学数据分析中工具碎片化和跨平台兼容性问题,提高分析可重复性和效率 | 空间转录组学数据分析工作流程和工具集成 | 空间转录组学 | 卵巢癌,口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学分析 | LLM(大语言模型) | 空间转录组学数据 | 基于两项已发表研究的数据(具体样本数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-04-04 |
Smarca4 maintains mitochondrial homeostasis and energy metabolism during cardiac development
2026-Mar-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06168-3
PMID:41794942
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研究论文 | 本研究揭示了Smarca4在心脏发育过程中作为关键染色质重塑因子,通过调控线粒体稳态和能量代谢来维持心脏和骨骼肌功能 | 首次将SWI/SNF染色质重塑ATP酶亚基Smarca4确定为线粒体稳态和细胞能量代谢的关键调控因子,并建立了其与脊椎动物肌肉发育中核调控与线粒体能量稳态之间的直接联系 | 研究主要基于斑马鱼模型,虽在人类心肌细胞和小鼠肌管中进行了验证,但体内复杂调控机制仍需进一步探索 | 探究表观遗传机制如何调控线粒体结构和功能,特别是在心脏发育过程中的作用 | 斑马鱼(smarca4a缺陷模型)、人类心肌细胞和小鼠肌管 | 表观遗传学 | 代谢性肌病 | RNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 高分辨率共聚焦成像, Seahorse代谢分析, AAV介导的基因敲低 | NA | 基因组学数据、成像数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-04-04 |
CNS-resident B cells develop locally into a pro-inflammatory age-associated phenotype during aging and after stroke
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.02.709112
PMID:41847014
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、单细胞RNA测序和B细胞受体测序,揭示了衰老和缺血性中风后中枢神经系统内B细胞亚群的局部发育和促炎性表型转变 | 首次在小鼠和人类中鉴定出中枢神经系统内独特的B1b祖细胞池,并揭示其向年龄相关B细胞(ABC)亚群的分化轨迹及中风后的克隆扩增 | 研究主要基于小鼠模型和死后人类脑组织,缺乏活体人类动态观察数据 | 阐明衰老和缺血性中风后中枢神经系统内B细胞亚群的发育动态和免疫表型特征 | 老年雄性和雌性小鼠的未损伤及中风后脑组织、老年人类供体的死后脑实质组织 | 免疫学 | 缺血性中风 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, 序列数据 | 老年小鼠脑组织B细胞、老年人类死后脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-04-04 |
Influence of body composition on the efficacy of nivolumab plus ipilimumab for metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014363
PMID:41775432
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研究论文 | 本研究探讨了身体成分(皮下脂肪和骨骼肌质量)对转移性透明细胞肾细胞癌患者接受一线纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗疗效的影响 | 首次使用人工智能分割工具量化身体成分,并结合单细胞RNA测序探索其与肿瘤微环境的关系,超越了传统BMI指标的局限性 | 回顾性研究设计,样本量有限,OS关联结果不明确,需要前瞻性验证 | 评估身体成分与免疫检查点抑制剂治疗转移性透明细胞肾细胞癌疗效之间的关联 | 转移性透明细胞肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 人工智能图像分割,单细胞RNA测序 | Cox回归模型,立方样条 | CT图像,临床数据,单细胞RNA测序数据 | 309名患者用于回顾性分析,12名患者用于单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-04-04 |
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08506-6
PMID:41775697
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子ZMYM3通过上调CTTN表达并诱导侵袭伪足形成,从而促进肝细胞癌转移的分子机制 | 首次揭示了ZMYM3在肝细胞癌转移中的关键作用,并阐明其通过直接结合CTTN启动子促进侵袭伪足形成的新机制 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析,缺乏体内动物模型的直接验证 | 探究肝细胞癌侵袭和转移的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织和细胞 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、染色质免疫沉淀测序、免疫组织化学、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、测序数据、病理图像 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-04-04 |
MLRR-ATV: A Robust Manifold Nonnegative Low-Rank Representation With Adaptive Total-Variation Regularization for scRNA-seq Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3432740
PMID:39046863
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研究论文 | 本文提出了一种名为MLRR-ATV的新型单细胞RNA测序数据聚类方法,该方法结合了自适应全变分正则化与流形非负低秩表示以提高聚类性能 | 将自适应全变分正则化引入低秩表示模型以通过梯度学习降低噪声影响,并同时学习数据中的线性和非线性流形结构 | 模型是非凸的,需要采用交替方向乘子法进行优化,可能影响计算效率 | 开发一种鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |