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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2025-12-06
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Nov-19, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了成熟三级淋巴结构在直肠癌中的抗肿瘤免疫作用及其受新辅助治疗的影响 揭示了成熟三级淋巴结构与B细胞介导的免疫特征及良好预后的关联,并首次系统分析了新辅助治疗对三级淋巴结构的破坏作用 研究为回顾性设计,样本量有限,且缺乏前瞻性验证 阐明成熟三级淋巴结构在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及其治疗调控机制 直肠癌患者肿瘤组织样本 数字病理学 直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 组织图像数据 未治疗队列:bulk RNA-seq (n=123), 免疫组化/多重免疫荧光 (n=161), scRNA-seq (n=10), scBCR-seq (n=10);新辅助治疗队列:bulk RNA-seq (n=19), 免疫组化 (n=125) NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 批量RNA测序 NA NA
62 2025-12-06
SPINK1-driven cellular heterogeneity and interaction networks in intrahepatic cholangiocarcinoma revealed by integrated multi-omics analysis
2025-Nov-17, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析揭示了SPINK1驱动的细胞异质性及相互作用网络在肝内胆管癌中的作用 发现了SPINK1-CCL20-LAMs轴,该轴协调免疫细胞招募和代谢重编程,揭示了SPINK1通过LAMs建立富含谷氨酰胺的微环境促进肿瘤生长的新机制 NA 剖析肝内胆管癌的细胞异质性和细胞间相互作用,特别关注SPINK1过表达的上皮亚群 人类肝内胆管癌肿瘤及邻近正常组织 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 整合蛋白质组学分析, Transwell实验, 共培养系统, 功能扰动实验 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2025-12-06
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与总体生存期的关联 首次在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短和肿瘤微环境免疫抑制特征的关联 单中心队列研究,样本量有限,需要进一步机制研究验证 评估胃癌患者神经元自身抗体的临床预后意义 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 NA 胃癌 免疫荧光、细胞基础检测、单细胞测序 NA 血清样本、肿瘤组织、单细胞测序数据 323例胃癌患者(144例TBA阳性,179例TBA阴性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2025-12-06
Technology-enabled integration of single-cell transcriptomics and microbiome data identifies RNA-targetable host-microbiota networks in colorectal adenoma
2025-Nov-13, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究开发了一个可重复的计算流程,整合单细胞转录组学和微生物组数据,识别结直肠腺瘤中可RNA靶向的宿主-微生物网络 结合单细胞技术与RNA治疗方法,首次系统性地识别结直肠腺瘤中的宿主-微生物相互作用网络,并转化为RNA治疗靶点 研究依赖于现有公共数据集,可能受样本异质性影响,且实验验证尚未进行 识别结直肠腺瘤中可RNA靶向的宿主-微生物网络,为精准干预提供框架 结直肠腺瘤患者样本 数字病理学 结直肠腺瘤 单细胞RNA测序, 微生物组分析 MaAsLin2, QIIME2/DADA2, Seurat/Harmony 单细胞RNA测序数据, 微生物组数据 426,425个细胞(来自3个数据集), 975个微生物组样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
65 2025-12-06
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Nov-11, The oncologist
研究论文 本研究评估了ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤患者中的初步活性和安全性 首次在临床试验中探索IDH1抑制剂与抗PD1抗体联合治疗IDH1突变实体瘤的疗效,并结合空间转录组学等先进技术进行转化分析 样本量较小(仅15例患者),临床获益有限,需要更大规模研究验证 评估ivosidenib联合nivolumab在IDH1突变晚期实体瘤中的治疗效果和免疫调节作用 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 数字病理学 实体瘤 空间转录组学,蛋白质组学,药效动力学分析 NA 临床数据,蛋白质组数据,空间转录组数据 15例患者 NA 空间转录组学 NA NA
66 2025-12-06
Identification of plasma cell infiltration-related gene signatures as a novel prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究旨在识别调控肾透明细胞癌中浆细胞浸润的关键基因,并构建一个新的预后模型来预测肾透明细胞癌 通过机器学习识别了9个与浆细胞浸润相关的枢纽基因,并基于这些基因构建了一个名为PC评分的预后模型,该模型整合了年龄、分期和PC评分,显示出比单独分期更高的预测价值 NA 识别肾透明细胞癌中浆细胞浸润相关的关键基因,并构建一个预后模型来预测患者风险 肾透明细胞癌患者 机器学习 肾癌 单细胞测序 机器学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
67 2025-12-06
Platelet CKB as a potential contributor to serum creatine kinase abnormalities and metastasis in cancer patients
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了癌症患者血清肌酸激酶-MB活性超过总肌酸酶活性的异常现象,揭示了血小板CKB作为潜在贡献者与癌症转移的关联 首次将血小板CKB与癌症患者血清肌酸激酶异常及转移潜力联系起来,并开发了整合CK-BB和线粒体CK亚型的复合指数CK-Sub 研究主要基于回顾性队列和公共数据集,需要进一步实验验证血小板CKB在癌症转移中的直接功能作用 探究癌症患者血清肌酸激酶-MB活性异常超过总肌酸激酶活性的分子起源及其与肿瘤生物学的相关性 癌症患者(特别是结直肠癌和肺癌患者)的血清、血小板样本以及公共RNA测序数据集 癌症生物学 肺癌 qRT-PCR、血清肌酸激酶同工酶电泳、RNA测序、单细胞RNA测序 NA 血清样本、血小板样本、RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 1651名癌症患者的回顾性队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
68 2025-12-06
Single-cell multi-omics of ribosome biogenesis-related genes reveals immune microenvironment in psoriasis and constructs a diagnostic model
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合批量测序和单细胞测序数据,系统分析了核糖体生物发生相关基因在银屑病中的作用,构建了高精度的诊断模型,并揭示了其与免疫微环境的相互作用 首次系统整合批量测序和单细胞测序转录组数据来表征银屑病中核糖体生物发生相关基因的分子网络,构建了具有临床转化潜力的诊断模型,并阐明了Tregs失衡和STAT1介导的炎症极化的机制基础 未明确说明研究的样本量大小,且诊断模型的临床验证和转化潜力有待进一步研究 阐明核糖体生物发生相关基因在银屑病中的分子网络,构建诊断模型,并研究其与免疫微环境的相互作用 银屑病患者的转录组数据 生物信息学 银屑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 机器学习模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
69 2025-12-06
Identification and external validation of a prognostic signature based on MAPK-related genes to evaluate survival prognosis and treatment efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,构建了一个基于MAPK相关基因的预后模型,用于肺腺癌患者的生存预后评估和治疗疗效预测 首次结合孟德尔随机化分析筛选MAPK相关基因,并利用随机生存森林算法构建多组学预后模型,同时通过单细胞RNA测序揭示了这些基因在内皮细胞中的富集及其在免疫调节和血管生成中的作用 模型主要在公共数据库(如TCGA和GEO)的回顾性数据中进行开发和验证,缺乏前瞻性临床队列的验证 构建一个稳健的MAPK相关基因特征模型,以改善肺腺癌的风险分层和治疗指导 肺腺癌患者 生物信息学 肺腺癌 转录组测序, 孟德尔随机化分析, 随机生存森林算法, 通路富集分析, 药物敏感性预测, 逆转录定量PCR, 单细胞RNA测序 随机生存森林 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 TCGA-LUAD队列及三个独立的GEO队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
70 2025-12-06
Tertiary lymphoid organ-associated transcriptomic features predict rejection and outcome in kidney transplantation: integrative analysis and experimental validation
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了三级淋巴器官(TLOs)在肾移植排斥反应和预后中的关键作用,并开发了基于TLO相关特征的诊断和预后模型 首次建立了连接TLO特征与临床结果的多组学框架,并识别出具有诊断和预后效用的TLO相关基因生物标志物 研究主要基于回顾性转录组数据集,需要在更大队列中进行前瞻性验证 表征TLO相关的免疫景观,并研究其与肾移植排斥反应和预后的关联 肾移植患者的移植肾组织 数字病理学 肾移植排斥反应 单细胞RNA测序, 非负矩阵分解, 机器学习算法 ssGSEA, NMF, 多种机器学习算法 转录组数据 多个肾移植队列的批量转录组数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
71 2025-12-06
Circuit-specific gene editing for precision modulation of neuronal activity with CRISPR-rabies virus
2025-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种结合CRISPR基因编辑和狂犬病毒跨突触传播的CRISPR-狂犬病毒(CRV)系统,用于在解剖学定义的神经回路中进行精确基因编辑 CRV系统首次利用狂犬病毒的跨突触传播特性,实现了在特定神经回路而非仅细胞类型层面的基因编辑,克服了传统方法对回路功能研究的限制 未明确提及样本量或实验验证范围,可能局限于特定脑区如海马CA3区 开发一种精确调控神经回路中神经元活动的基因编辑工具,以研究基因功能和开发脑部疾病的新疗法 神经元,特别是小清蛋白中间神经元和海马CA3区的锥体神经元 神经科学 脑部疾病 CRISPR基因编辑,狂犬病毒递送系统,3'-捕获单细胞RNA-seq NA 基因表达数据,单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 3'-捕获单细胞RNA-seq
72 2025-12-06
Exploring the prognostic value of T cell exhaustion and mitochondrial dysfunction related genes in breast cancer through bioinformatics analysis and RT-qPCR validation
2025-Nov-06, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和RT-qPCR验证,探索了与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的基因在乳腺癌中的预后价值 首次整合T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因构建乳腺癌预后模型,并结合单细胞转录组学分析免疫微环境 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证基因功能机制 识别乳腺癌中与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的预后基因并构建预后模型 乳腺癌患者肿瘤组织和正常组织的转录组及临床数据 生物信息学 乳腺癌 转录组测序、RT-qPCR、单细胞转录组学分析 回归分析、Cox回归分析、风险评分模型 转录组数据、临床数据 未明确具体样本数量,但涉及公共数据库中的肿瘤和正常样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
73 2025-12-06
Base editing and nanoparticle transfection of airway cell types essential for treatment of cystic fibrosis
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用碱基编辑技术和聚合物纳米颗粒转染,纠正了囊性纤维化(CF)患者气道细胞中的致病性剪接位点变异,并实现了CFTR功能的临床意义水平恢复 首次将碱基编辑器RNA与聚合物纳米颗粒(PNPs)非病毒递送平台结合,在CF原代气道细胞中纠正常见致病剪接变异,并通过单细胞RNA测序揭示了编辑后细胞类型特异性转录变化 研究未详细探讨PNPs在体内递送的长期安全性和效率,且对基底细胞亚型编辑后比例下降的机制解释有限 开发一种可扩展的非病毒治疗平台,用于纠正囊性纤维化及其他呼吸系统疾病中呼吸上皮细胞的功能障碍 囊性纤维化患者的气道上皮细胞,包括离子细胞、分泌性杯状细胞和基底祖细胞亚型 基因编辑与细胞治疗 囊性纤维化 碱基编辑,单细胞RNA测序(scRNA-seq),聚合物纳米颗粒(PNPs)转染 NA 单细胞RNA测序数据,功能测定数据 原代CF气道细胞和永生化气道细胞,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2025-12-06
HTRA1-AS1, an ARMS2-region long non-coding RNA, is downregulated in retinas of age-related macular degeneration patients
2025-Nov-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究识别并验证了位于ARMS2基因座的长链非编码RNA HTRA1-AS1,发现其在年龄相关性黄斑变性(AMD)患者视网膜中表达下调,可能通过转录调控参与AMD的发病机制 首次在ARMS2-HTRA1区域内识别并验证了一个新的长链非编码RNA HTRA1-AS1,并揭示了其在AMD患者视网膜中的表达下调,以及其在氧化应激条件下的表达变化 研究样本量相对有限(43例AMD患者 vs. 44例对照),且功能机制尚未完全阐明 探究10q26基因座在年龄相关性黄斑变性(AMD)中的致病基因、风险变异及潜在机制 人类视网膜组织、人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的视网膜色素上皮(RPE)细胞 基因组学 年龄相关性黄斑变性 RNA-seq, RT-PCR, Sanger测序, 单细胞RNA-seq分析 NA RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 43例AMD患者和44例对照的视网膜组织 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
75 2025-12-06
Single Cell Analysis of pBMCs of Psoriasis patients reveals distinct CD4+ T cell phenotypes associated with response to IL-23 blockade
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析银屑病患者外周血单个核细胞,揭示了与IL-23阻断治疗反应相关的CD4+ T细胞表型 首次利用单细胞RNA测序技术,在银屑病患者外周血中识别出与IL-23抑制剂治疗反应相关的特定CD4+ T细胞群体,并发现其转录组特征与皮损中的T细胞相似 样本量相对较小(27例患者),且仅基于外周血分析,未直接比较皮损组织,可能无法全面反映局部免疫微环境 旨在识别与IL-23阻断治疗反应相关的免疫细胞特征,以预测银屑病患者的临床疗效 银屑病或银屑病关节炎患者的外周血单个核细胞(pBMCs) 单细胞组学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 27例银屑病或银屑病关节炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2025-12-06
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和实验模型揭示了抗磷脂综合征(APS)微血管内皮细胞通过YAP1和CCN2介导的信号通路促进血管病变的机制 首次在APS患者皮肤微血管中鉴定出YAP1信号激活,并证明CCN2在介导内皮细胞与平滑肌细胞间促增殖通讯中的关键作用 研究主要基于皮肤活检和小鼠模型,在其他器官APS血管病变中的普遍性需进一步验证 探究APS血管病变的细胞和分子机制,寻找潜在治疗靶点 APS患者的皮肤微血管内皮细胞、血管平滑肌细胞、小鼠模型 数字病理学 抗磷脂综合征 单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜、ELISA、定量PCR、免疫印迹 NA RNA测序数据、显微镜图像、蛋白质浓度数据 APS患者的皮肤活检样本、血浆样本、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
77 2025-12-06
Single-Cell Analysis Reveals a Critical Role for Macrophage Epsins in Regulating the Origin of Foam Cells in Atherosclerosis
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了巨噬细胞epsin蛋白在动脉粥样硬化泡沫细胞形成中的关键作用 首次发现巨噬细胞特异性表达的epsin蛋白通过调节血管平滑肌细胞向巨噬细胞转化,加速动脉粥样硬化进程 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证 探究巨噬细胞epsin蛋白在动脉粥样硬化泡沫细胞形成中的分子机制 WT/Apoe-/-和LysM-DKO/Apoe-/-小鼠模型 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫染色,共培养实验 NA 单细胞转录组数据 WT/Apoe-/-和LysM-DKO/Apoe-/-小鼠,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2025-12-06
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库分析,揭示了肝移植排斥中克隆扩增、治疗抵抗性T细胞的转录组景观及其在组织中的持久性 首次在儿科肝移植排斥中,结合单细胞转录组和免疫组库技术,系统描绘了CD8 T细胞的克隆扩增、表型、定位及与库普弗细胞的互作网络 样本量相对较小(30例),且仅针对儿科患者,可能限制了结果的普适性 探究肝移植后T细胞介导的排斥反应中CD8 T细胞的克隆扩增、持久性及分子机制 儿科肝移植患者的冷冻肝活检组织 数字病理学 肝移植排斥 单细胞RNA测序, 免疫组库分析 NA 单细胞转录组数据, 免疫组库数据 30例冷冻肝活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
79 2025-12-06
Integrating bulk and single-cell transcriptome to identify novel gene markers for germinal center B cells (GCB) subtype of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Nov, Annals of hematology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据,开发了一个基于19个基因对的定性特征(19-GPS),用于区分弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的生发中心B细胞(GCB)亚型与非GCB亚型 利用基因的相对表达顺序(REO)模式,开发了高度稳定、抗批次效应和样本质量变化的定性特征,提高了DLBCL亚型分类的临床适用性和预后分层性能 未明确提及样本来源的多样性或外部验证的广泛性,可能影响模型的泛化能力 开发一个稳定的定性特征,以区分DLBCL的GCB亚型与非GCB亚型,并评估其预后和治疗指导价值 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者样本,包括GCB和非GCB亚型 生物信息学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 bulk转录组测序,单细胞转录组测序 基于基因对相对表达顺序(REO)的定性特征模型 基因表达数据 四个独立数据集,具体样本数量未明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
80 2025-12-06
ResNet50 and Single-Cell Multi-Omics analysis identify key cellular and molecular features in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov, Annals of hematology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合基于深度学习的图像分析与单细胞转录组学和T细胞受体测序,揭示了儿童急性淋巴细胞白血病的细胞和分子特征 首次将ResNet50深度学习模型用于白血病单细胞图像分类,并结合单细胞多组学数据(scRNA-seq和TCR-seq)进行综合分析,以揭示疾病机制和潜在生物标志物 未明确说明样本的具体数量或来源,可能限制了结果的普遍适用性 解决儿童急性淋巴细胞白血病早期诊断、复发预测和个体化治疗的挑战 儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),T细胞受体测序(TCR-seq) CNN(具体为ResNet50) 图像,单细胞转录组数据,TCR序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 NA NA
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