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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-01-20 |
Integrating multiple key molecules in uveal melanoma to uncover metastatic and immune microenvironment-related gene signatures
2026, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2026.01.02
PMID:41523997
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,在葡萄膜黑色素瘤中鉴定出与转移和预后相关的七个关键基因,并构建了一个用于生存预测的风险评分模型 | 整合了TCGA和GEO的转录组数据、单细胞RNA-seq数据以及体外细胞实验验证,构建了一个与转移和免疫微环境相关的七基因特征,并首次在单细胞水平揭示了这些基因在具有高转移潜能的肿瘤细胞亚群中的特异性表达 | 样本量相对较小(TCGA队列80例,GEO验证集13例,单细胞数据11个肿瘤),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列进行验证 | 鉴定葡萄膜黑色素瘤中与转移相关的预后基因,并构建一个稳健的分子特征用于患者生存预测 | 葡萄膜黑色素瘤患者(来自TCGA-UVM队列和GEO数据集)、葡萄膜黑色素瘤细胞系(92.1, OMM1, MEL270)以及成人视网膜色素上皮细胞(ARPE-19) | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序、微阵列、单细胞RNA-seq、qRT-PCR、Western blotting | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、体细胞突变数据、拷贝数变异数据 | TCGA队列80例患者,GEO数据集GSE73652中13例(8例非转移 vs 5例转移),单细胞数据集GSE139829中11个肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-01-20 |
Surface Marker Identification to Capture Live Circulating Tumor Cells in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0536
PMID:41543394
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于活体循环肿瘤细胞捕获和单细胞RNA测序的工作流程,以增强转移性三阴性乳腺癌中CTC的检测 | 识别了四个新的CTC表面标志物(AHNAK2、CAVIN1、ODR4和TRIML2),并结合传统标志物提高了检测灵敏度和覆盖率 | NA | 提高转移性三阴性乳腺癌中活体循环肿瘤细胞的检测和捕获效率 | 转移性三阴性乳腺癌小鼠模型和患者样本中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个TNBC小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-01-20 |
Sex in Immune Cells and Parasitic Diseases - A Complex Relationship
2026-Jan, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70097
PMID:41546136
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综述 | 本文综述了性别在免疫细胞与寄生虫病关系中的作用,重点探讨了生物学性别差异如何通过免疫系统影响寄生虫感染的易感性和控制 | 结合经典免疫学与单细胞转录组学,揭示了激素和染色体因素驱动的先天与适应性免疫细胞的性别特异性差异 | 许多寄生虫病研究仍缺乏充分的性别分层数据,且未应用最先进的免疫学分析来全面表征生物学性别效应 | 总结当前关于先天和适应性免疫关键细胞成分中性别差异的知识,并讨论其对全球重要寄生虫病的相关性 | 利什曼病、恰加斯病、阿米巴病、血吸虫病和疟疾等寄生虫病 | 自然语言处理 | 寄生虫病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2026-01-20 |
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/nep.70165
PMID:41549440
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和多组学分析,探讨了GSTO1作为糖尿病肾病潜在风险因素的因果关联 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序技术,系统评估GSTO1在糖尿病肾病中的因果作用 | 研究主要基于观察性数据和体外细胞实验,需要进一步的功能验证和临床研究 | 探究GSTO1与糖尿病肾病风险的潜在因果关系 | 糖尿病肾病患者样本、HK-2细胞系 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-01-20 |
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70469
PMID:41549547
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研究论文 | 本研究探索了外周血单核细胞中线粒体活性氧水平与冠状动脉疾病之间的关联,并利用单细胞RNA测序分析CCBE1基因的表达 | 首次结合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序技术,在BioHEART-CT队列中评估PBMC mROS作为CAD生物标志物的潜力 | 样本量较小(仅40名参与者),结果为探索性且不一致,未发现mROS与CAD状态或心血管风险因素的明确关联 | 评估PBMC中mROS水平是否可作为冠状动脉疾病的血液生物标志物 | BioHEART-CT研究参与者的外周血单核细胞 | 心血管疾病研究 | 冠状动脉疾病 | MitoSOX流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据 | 40名BioHEART-CT参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-01-20 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
|
研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎微环境中骨重塑失调的机制作用 | 首次揭示lncRNA ZFAS1作为炎症性骨丢失的关键驱动因子,通过促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成发挥双重调控作用 | 研究主要基于体外细胞模型(RAW264.7和MC3T3-E1),体内验证和临床转化潜力有待进一步探索 | 阐明lncRNA ZFAS1在牙周炎骨破坏中的调控机制 | 牙周炎患者组织样本、RAW264.7破骨前体细胞、MC3T3-E1成骨前体细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、qPCR、组织学、免疫组化 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、组织图像 | 未明确样本数量,涉及健康与患病牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-01-20 |
Enhanced MiRISC expression noise reduction by self-feedback regulation of mRNA degradation
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.12.025
PMID:41550138
|
研究论文 | 本文通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析,探讨了miRISC通过负自我反馈调控mRNA降解来增强表达噪声抑制的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声,并证明通过mRNA降解的直接自我反馈调控实现噪声减少 | NA | 研究miRNA介导的调控子系统中的噪声减少机制 | miRISC(microRNA诱导沉默复合体)及其靶向的mRNA | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-01-20 |
Adding highly variable genes to spatially variable genes can improve cell type clustering performance in spatial transcriptomics data
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf285
PMID:41550256
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研究论文 | 本研究探讨了在空间转录组学数据中,将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 | 首次系统评估了高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响,覆盖了超过50个真实数据集和多种平台 | 未详细说明具体基因选择方法或聚类算法的优化策略,可能受限于数据集的多样性和平台差异 | 提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和性能 | 空间转录组学数据集中的基因表达数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 超过50个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2026-01-20 |
Protrichocysts: a hybrid defense extrusive organelle bridging mechanical projection and chemical secretion in ciliates
2026, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100539
PMID:41551587
|
研究论文 | 本研究通过综合方法探究了纤毛虫中的protrichocysts,揭示了其作为结合机械投射与化学分泌的混合防御细胞器的多功能性 | 首次系统描述了protrichocysts的喷射过程三阶段,并通过组学分析鉴定了其蛋白质组成,提出了其作为混合防御器官的新功能 | 研究主要基于模型生物,可能无法完全代表所有纤毛虫中protrichocysts的多样性 | 探究纤毛虫中protrichocysts的结构、功能及其在真核生物分泌系统进化中的意义 | 纤毛虫中的protrichocysts(一种突出的喷射细胞器) | NA | NA | 捕食者-猎物互作实验、电子显微镜、组织化学分析、SDS-PAGE、HPLC-MS/MS、单细胞转录组分析 | NA | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2026-01-20 |
A multimodal framework to identify molecular mechanisms driving patient group-associated morphology through the integration of spatial transcriptomics and whole slide imaging
2026, NPJ artificial intelligence
DOI:10.1038/s44387-025-00050-6
PMID:41551846
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研究论文 | 本研究提出了一种整合空间转录组学与全切片成像的多模态AI框架,以识别与患者群体相关形态背后的分子机制 | 开发了结合基础模型特征、多示例学习、无监督聚类和分子分析的AI驱动框架,首次在形态-分子机制-临床结局轴向上提供可解释性分析 | 空间转录组数据可用性有限,框架在更大规模WSI数据集上的泛化能力有待验证 | 识别驱动患者群体相关形态模式的分子机制,为精准医疗提供见解 | HER2阳性乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,全切片成像 | 基础模型,多示例学习,无监督聚类 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2026-01-20 |
Lymph Node Metastasis-Associated Spatiotemporal Mapping of the TFF3-Linked Niche in Breast Cancer: Integrating Radiogenomic Signatures with Immune-Ecosystem Remodeling
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1016
PMID:41551914
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学、放射组学和功能验证,揭示了TFF3在乳腺癌淋巴结转移中的核心调控作用及其与免疫微环境重塑和MAPK-EMT轴的关联 | 首次将淋巴结转移状态下的单细胞免疫图谱、孟德尔共定位分析、空间多组学与放射组学模型相结合,系统性阐明了TFF3作为枢纽基因调控转移前生态位的双功能机制,并发现了6-巯基嘌呤作为其新型拮抗剂 | 研究主要基于回顾性队列数据,缺乏前瞻性临床验证;动物模型未能完全模拟人类免疫微环境的复杂性;药物重定位发现需进一步临床前评估 | 解析乳腺癌淋巴结转移的分子机制与免疫微环境特征,并探索其诊疗策略 | 原发性乳腺癌患者组织样本、TCGA/Foshan队列数据、小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔共定位分析, 放射组学, 蛋白质组学, 药理学筛选 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 放射影像数据, 蛋白质组数据 | TCGA与佛山队列的乳腺癌样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-01-20 |
Integrative Bioinformatics and Machine Learning Identify Novel Diagnostic Biomarkers and Molecular Mechanisms in Sjögren's Syndrome
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5044551
PMID:41551935
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明了其分子机制 | 整合了多个外周血转录组数据集,应用12种机器学习算法和单细胞RNA测序验证,识别出12个具有卓越诊断性能的枢纽基因,并进行了药物重定位分析 | 研究主要基于公共转录组数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且样本量相对有限 | 识别干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明其分子机制 | 干燥综合征患者和健康对照的外周血转录组数据 | 机器学习 | 干燥综合征 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法 | 转录组数据 | 351名干燥综合征患者和91名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-01-20 |
The Distinct Monocyte Subsets and Intercellular Communication in Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec-27, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01974-z
PMID:41454184
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了原发性干燥综合征患者中单核细胞亚群及其亚群的独特变化、转录因子差异和免疫细胞相互作用 | 首次在原发性干燥综合征中通过单细胞RNA测序全面表征单核细胞亚群及其亚群的基因表达模式、转录因子和细胞间通信网络 | 样本量有限,未涉及长期随访或治疗干预效果评估 | 探究原发性干燥综合征患者单核细胞亚群及其亚群的变异和功能角色 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的单核细胞样本 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,涉及pSS患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-01-20 |
Transcriptome-wide mapping reveals an RNA-dependent mechanism of platinum cancer drugs
2025-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.20.694502
PMID:41509293
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研究论文 | 本文通过开发PlatRNA-seq技术,系统性地研究了抗癌药物顺铂与RNA的相互作用,揭示了其通过结合RNA G-四链体结构介导细胞毒性的非经典作用机制 | 首次开发了PlatRNA-seq技术,在全转录组水平上绘制顺铂的RNA结合图谱,并证明顺铂通过结合RNA G-四链体结构影响其形成与稳定性,从而介导细胞毒性,为铂类化疗药物提供了新的RNA依赖作用机制 | 研究主要聚焦于顺铂,其他抗癌药物的RNA结合情况仍需进一步探索;临床样本分析仅限于卵巢癌患者,需在其他癌症类型中验证 | 探究临床抗癌药物(特别是顺铂)与RNA的相互作用及其在化疗中的功能意义 | 抗癌药物(尤其是顺铂)及其在癌症细胞中的RNA结合靶点 | 转录组学 | 卵巢癌 | PlatRNA-seq(点击化学辅助的全转录组分析)、单细胞RNA-seq、基因组学、生物物理学和计算分析 | NA | RNA序列数据 | 治疗初治卵巢癌患者的肿瘤活检单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-01-20 |
PD-1 regulates CD4+ T cell-mediated CD8+ T cell responses in the brain to balance viral control and neuroinflammation
2025-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8215051/v1
PMID:41510262
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研究论文 | 本研究探讨了PD-1在小鼠多瘤病毒脑炎中如何通过调节CD4+ T细胞介导的CD8+ T细胞反应,以平衡病毒控制和神经炎症 | 揭示了PD-1在脑内自主作用中通过CD4+ T细胞内在信号调节CD8+ T细胞反应,首次在单细胞水平展示了PD-1缺失对CD8+ T细胞效应功能和转录组的影响 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类PML的复杂性,且未详细探讨PD-1阻断在患者中效果可变的临床机制 | 探究PD-1在多瘤病毒中枢神经系统感染中如何平衡抗病毒防御和神经损伤 | 小鼠多瘤病毒(MuPyV)感染模型中的脑浸润CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 神经炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-01-20 |
Erythrocyte-microglia crosstalk contributing to sex differences in pediatric brain tumorigenesis
2025-Dec-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6323329/v1
PMID:41510281
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研究论文 | 本研究揭示了红细胞与小胶质细胞之间的相互作用如何导致儿童脑肿瘤(以髓母细胞瘤为模型)发病率的性别差异,并发现新生儿高胆红素血症是潜在的可干预风险因素 | 首次发现红细胞膜糖蛋白GYPA表达差异通过影响小胶质细胞的红细胞吞噬作用及脂质代谢,导致神经前体细胞分化速度的性别差异,从而解释男性儿童脑肿瘤发病率更高的机制 | 研究主要基于髓母细胞瘤模型,其他儿童脑肿瘤类型的普适性需进一步验证;临床数据的meta分析可能存在混杂因素 | 探究儿童脑肿瘤发病率性别差异的细胞与分子机制 | 发育中的人和小鼠小脑组织、神经前体细胞、小胶质细胞、红细胞 | 肿瘤生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及人和小鼠的发育小脑组织及临床数据meta分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-01-20 |
Hypoxia-induced USP13 expression drives ferroptosis resistance and tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma through the stabilization of ACLY
2025-Dec-02, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02869-z
PMID:41330897
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的USP13通过稳定ACLY蛋白,驱动肝细胞癌的铁死亡抵抗和肿瘤免疫逃逸,并验证了靶向USP13的治疗潜力 | 首次阐明了缺氧/HIF-1α/USP13/ACLY轴在肝细胞癌中介导铁死亡抵抗和免疫逃逸的分子机制,并发现USP13抑制剂2-Methoxyestradiol具有抗肿瘤疗效 | 研究主要基于临床前模型(细胞系、动物模型、PDOs),尚未进行人体临床试验;USP13抑制剂的特异性和潜在脱靶效应需进一步评估 | 探索USP13在肝细胞癌进展中的作用,并评估其作为诱导铁死亡和增强免疫反应的治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者来源的类器官、肝细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术分析、蛋白质稳定性分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | 未明确具体样本数量,但使用了患者来源的类器官、多种细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-01-20 |
Folic acid prevents inner hair cell degeneration via genomic stability
2025-Dec-02, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02880-4
PMID:41330911
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研究论文 | 本研究揭示了钙稳态破坏在内毛细胞损伤中的作用,并发现叶酸可能是一种有前景的保护毛细胞的治疗剂 | 首次揭示了低频率与高频率内毛细胞在钙清除率上的差异与PMCA1表达相关,并利用特异性敲除小鼠模型结合单细胞RNA-seq分析,发现叶酸通过降低DNA损伤标志物γ-H2A.X水平来保护内毛细胞 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证,且具体分子机制细节有待深入探索 | 探究内毛细胞损伤的机制及预防策略 | 内毛细胞,特别是Pmca1特异性敲除小鼠模型中的内毛细胞 | NA | 听力损失 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-01-20 |
HDAC4 Promotes Neuroprotection of Retinal Ganglion Cells After Optic Nerve Injury
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.60
PMID:41533933
|
研究论文 | 本研究探讨了HDAC4在视神经损伤后视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的作用 | 首次将HDAC4鉴定为视神经损伤后RGC生存和轴突再生的关键调节因子,并展示了其突变体对基因表达变化的调控能力 | 研究基于小鼠视神经挤压模型,可能无法完全模拟人类青光眼或其他视神经病变的复杂性 | 探索HDAC4在视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的功能,以开发针对青光眼等视神经病变的治疗策略 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-01-20 |
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02853-7
PMID:41318555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组等技术,揭示了口腔黏膜慢性炎症中上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速炎症的机制 | 首次发现上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔慢性炎症中的关键作用,并建立了ORGUAMIA在线数据库整合多组学数据 | NA | 探究口腔慢性炎症的发病机制 | 口腔扁平苔藓等口腔慢性炎症性疾病 | 数字病理学 | 口腔黏膜疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 临床随访数据 | 大型临床随访队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |