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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2025-Nov-12, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示老年脓毒症中骨髓免疫重塑的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘老年脓毒症的骨髓免疫图谱,发现HSC-髓系细胞间Lgals9-Cd44信号通路的通讯障碍是免疫衰竭的关键机制 | 临床可行性和安全性尚未验证,样本量较小(每组2-3只小鼠) | 探究老年脓毒症免疫功能障碍的分子机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,CellChat细胞通讯分析,Transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 10只小鼠(Y-Sham组2只,Y-CLP组3只,A-Sham组2只,A-CLP组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-14 |
The landscape of dynamic tumor immunophenotyping on neoadjuvant chemotherapy combined with trastuzumab for the treatment of HER2-positive breast cancer
2025-Nov-12, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02483-8
PMID:41225463
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研究论文 | 本研究通过空间表达谱分析探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗期间肿瘤免疫表型的动态变化 | 首次在HER2阳性乳腺癌中开展与治疗疗效相关的特异性免疫表型研究,建立了可预测治疗反应的动态免疫分型系统 | 样本量相对有限(28例患者),需要在更大队列中验证 | 研究HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合靶向治疗期间肿瘤免疫表型动态变化与病理完全缓解的关系 | HER2阳性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间表达谱分析,DSP技术 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 28例HER2阳性乳腺癌患者的94个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间分析技术 |
| 63 | 2025-11-14 |
THBS1high macrophages promote aortic aneurysm formation by orchestrating an inflammatory and smooth muscle cell phenotypic transition program in vascular Behçet's disease
2025-Nov-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04434-y
PMID:41225543
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研究论文 | 本研究揭示了THBS1高表达巨噬细胞通过促炎作用和诱导平滑肌细胞表型转换促进白塞病血管动脉瘤形成的机制 | 首次鉴定出THBS1高表达巨噬细胞在血管白塞病中的关键作用,并阐明ETS2转录因子和TNF-α调控该细胞亚群功能的分子机制 | 研究样本量有限,人类化小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 阐明血管白塞病动脉瘤形成的细胞和分子机制 | 血管白塞病患者主动脉组织、巨噬细胞、平滑肌细胞及人类化小鼠模型 | 单细胞生物学 | 血管白塞病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光染色、bulk RNA测序、功能共培养系统 | 人类化小鼠模型 | 单细胞转录组数据、组织图像、基因表达数据 | 血管白塞病患者主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-14 |
DAPK1 identified as a novel biomarker for colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04037-w
PMID:41225570
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研究论文 | 本研究通过机器学习结合多组学分析鉴定DAPK1作为结直肠癌肝转移的新型生物标志物 | 首次通过整合机器学习算法与单细胞多组学技术系统鉴定DAPK1在结直肠癌肝转移中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本验证 | 探索结直肠癌肝转移的分子机制并发现新的生物标志物 | 结直肠癌肝转移组织和LoVo细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | Lasso回归, SVM, 随机森林 | 基因表达数据, 表观遗传数据, 单细胞数据 | GEO数据集和实验细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-11-14 |
Single-cell RNA sequencing and in vitro validation reveal risankizumab induces anti-inflammatory macrophage polarization in psoriasis
2025-Nov-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03346-0
PMID:41225578
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体外实验验证利生奇珠单抗在银屑病中诱导抗炎巨噬细胞极化的机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示利生奇珠单抗通过调节巨噬细胞极化发挥治疗银屑病的作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外细胞实验,缺乏体内实验验证 | 探索利生奇珠单抗治疗银屑病的潜在治疗机制 | 银屑病患者单细胞RNA测序数据和THP-1单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, CCK-8检测, ELISA | Seurat, harmony, Monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 97,434个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-11-14 |
Neurogenic inducers inhibit the proliferation of pancreatic cancer by promoting tumor cell transdifferentiation
2025-Nov-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03563-9
PMID:41225636
|
研究论文 | 本研究通过诱导胰腺癌细胞转分化来降低其恶性程度 | 发现NeuroD1转录因子可促进胰腺癌细胞向神经元转分化并抑制增殖,鉴定出神经源性诱导剂Neuropathiazol通过MET-PI3K/Akt通路上调NeuroD1 | NA | 研究诱导胰腺癌细胞转分化是否能降低恶性肿瘤性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫共沉淀, 质谱分析, 分子对接, 药物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据, RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice
2025-Nov-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01499-3
PMID:41225641
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中髓系偏祖造血干细胞亚群的扩增及其预白血病特征 | 首次发现骨质疏松可诱导髓系偏祖HSPCs亚群扩增并具有预白血病特征,鉴定出BRD4染色质重塑蛋白的关键调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究骨质疏松条件下髓系偏祖造血发生及其与白血病发生的关系 | 废用性骨质疏松小鼠模型的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松小鼠模型的骨髓和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-11-14 |
A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015
PMID:40957419
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研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结内TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴通过PD-L1介导免疫逃逸促进转移的机制 | 首次发现TNBC中TLR4依赖的FRC-单核细胞轴在TDLNs中形成免疫抑制微环境,并证明局部TLR4抑制联合αPD-1疗法可有效减少转移 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究三阴性乳腺癌肿瘤引流淋巴结中细胞网络重组对转移的影响机制 | 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类TNBC样本 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠肿瘤模型和人类TNBC样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-11-14 |
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Nov-11, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyaf362
PMID:41138165
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研究论文 | 评估ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤患者中的临床活性和转化研究 | 首次在临床试验中探索IDH1抑制剂与抗PD1抗体联合治疗在IDH1突变实体瘤中的应用,并整合药效学、蛋白质组学和空间转录组学分析 | 样本量较小(15例患者),临床获益有限,需要更大规模研究验证 | 评估ivosidenib联合nivolumab在IDH1突变晚期实体瘤中的安全性和初步疗效 | 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 药效学分析、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 临床数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 15例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2025-11-14 |
Characterizing hypoxia-orchestrated post-stroke changes in oligodendrocyte precursor cells for optimized cell therapy
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102687
PMID:41173004
|
研究论文 | 本研究通过整合小鼠单细胞RNA测序数据与体外实验,揭示了缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞在不同缺氧程度下的动态适应性变化 | 首次发现缺氧程度调控OPC命运转变,提出'氧张力'作为OPC动态适应的关键调节因子,并证明严重缺氧预处理的血管生成性OPC移植可促进脑卒中恢复 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探索缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞的功能适应性及其在细胞治疗中的优化策略 | 少突胶质前体细胞(OPCs)和小鼠脑卒中模型 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, 细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-11-14 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示骨髓细胞介导的干扰素信号传导导致肾细胞癌对免疫检查点阻断治疗的耐药性 | 开发了推断细胞因子信号传导效应的推理建模框架,首次发现骨髓细胞而非肿瘤细胞是干扰素驱动免疫治疗耐药的关键介质 | 研究主要基于观察性数据和体外实验,需要进一步的功能验证实验 | 探究干扰素信号在肾细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗疗效的影响 | 肾细胞癌患者的肿瘤免疫微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床试验队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-11-14 |
Platelet CKB as a potential contributor to serum creatine kinase abnormalities and metastasis in cancer patients
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01912-8
PMID:41217562
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研究论文 | 本研究探讨了癌症患者血清肌酸激酶异常现象,发现血小板中的CKB可能是导致CK-MB>CK异常和癌症转移的潜在因素 | 首次揭示血小板来源的CKB与癌症转移的关联,并开发了整合CK-BB和线粒体CK亚型的复合指标CK-Sub | 研究主要基于回顾性队列和公共数据库分析,需要进一步实验验证机制 | 探究癌症患者血清肌酸激酶异常现象的分子机制及其与肿瘤生物学的关联 | 癌症患者(结直肠癌和肺癌)的血清样本、血小板样本及相关公共数据库 | 癌症生物学 | 肺癌,结直肠癌 | 血清CK同工酶电泳,qRT-PCR,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 血清样本,血小板样本,RNA测序数据,单细胞数据 | 回顾性癌症队列1,651例患者 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-14 |
Single-cell multi-omics of ribosome biogenesis-related genes reveals immune microenvironment in psoriasis and constructs a diagnostic model
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01916-4
PMID:41217566
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研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞测序数据,系统分析了核糖体生物发生相关基因在银屑病中的作用,构建了高精度诊断模型并探讨其与免疫微环境的相互作用 | 首次系统整合批量测序和单细胞测序转录组数据来表征银屑病中核糖体生物发生相关基因的分子网络,揭示了Tregs失衡和STAT1介导的炎症极化的机制基础 | NA | 阐明核糖体生物发生相关基因在银屑病中的分子网络,构建诊断模型并研究其与免疫微环境的相互作用 | 银屑病患者转录组数据 | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组测序,单细胞测序,机器学习 | 诊断模型,WGCNA,机器学习模型 | 转录组数据,单细胞数据 | 多中心数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-11-14 |
Tracing the enteric neural crest cell pathway from origin to colonization: insights into Hirschsprung's disease
2025-Nov-11, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11211-w
PMID:41217573
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综述 | 本文系统综述了肠道神经系统发育过程中肠神经嵴细胞的迁移路径及其在赫希施普龙病中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学新技术,揭示ENS发育的时空异质性和谱系多样性 | 肠道组织的固有复杂性(包括多样细胞类型、微环境互作和多尺度调控网络)仍阻碍机制解析 | 阐明肠神经嵴细胞迁移的分子机制及其与赫希施普龙病的关联 | 肠神经嵴细胞和肠道神经系统 | 发育生物学 | 赫希施普龙病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2025-11-14 |
Identification and external validation of a prognostic signature based on MAPK-related genes to evaluate survival prognosis and treatment efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01925-3
PMID:41217578
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据构建了一个基于MAPK相关基因的预后特征,用于评估肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | 首次结合孟德尔随机化分析和随机生存森林算法构建MAPK相关基因预后模型,并通过单细胞RNA测序揭示其在免疫调节和血管生成中的作用机制 | 模型需要在更多独立队列中进行外部验证,且部分机制需要进一步实验验证 | 构建可靠的MAPK相关基因特征以改善肺腺癌的风险分层和治疗指导 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组测序, 孟德尔随机化分析, 随机生存森林算法, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 随机生存森林(RSF) | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA-LUAD队列和三个独立GEO队列的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-11-14 |
Tertiary lymphoid organ-associated transcriptomic features predict rejection and outcome in kidney transplantation: integrative analysis and experimental validation
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01899-2
PMID:41217598
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研究论文 | 本研究通过多组学方法分析肾移植中三级淋巴器官的转录组特征,并验证其与移植排斥和预后的关联 | 首次建立连接TLO特征与临床结局的全面多组学框架,识别出基于TLO相关基因的生物标志物 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要在前瞻性研究中进一步验证 | 探讨肾移植中三级淋巴器官的分子特征及其与移植排斥和预后的关系 | 肾移植患者样本和大鼠同种异体移植排斥模型 | 生物信息学 | 肾脏移植 | 单细胞RNA测序, 非负矩阵分解, 机器学习算法, 体转录组分析 | 多种机器学习算法集成 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个肾移植队列的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 体转录组测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-14 |
Single-cell hdWGCNA identifies ICI-related-colitis key CD8 + T cells linked to immunotherapy response and prognosis in colon cancer
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03891-4
PMID:41217618
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和hdWGCNA分析鉴定与免疫检查点抑制剂相关结肠炎(CIC)相关的关键CD8+T细胞,并探讨其对结肠癌预后和免疫治疗疗效的影响 | 首次应用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)识别CIC相关基因模块,发现具有独特Galectin信号通路的CIC关键CD8+T细胞亚群 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索免疫检查点抑制剂相关结肠炎的免疫学机制及其对结肠癌预后和免疫治疗疗效的影响 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和未发生结肠炎患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, hdWGCNA, 细胞间通讯分析, 伪时间分析 | 预后评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和对照患者的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-14 |
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-Nov-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
DOI:10.1044/2025_JSLHR-25-00050
PMID:41091061
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研究论文 | 本研究通过系统分析40年来与特定阅读障碍相关的候选基因,探索其进化保守性、发育表达模式和功能网络 | 挑战了阅读特异性基因存在的观点,提出特定阅读障碍反映了古老进化神经机制在人类特有脑结构中的破坏 | 基于文献回顾的候选基因方法可能存在选择偏差,功能验证实验不足 | 理解阅读障碍的遗传基础架构 | 175个特定阅读障碍候选基因 | 遗传学 | 特定阅读障碍 | 生物信息学分析、发育转录组分析、单细胞转录组分析、功能通路分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 175个候选基因 | 艾伦脑科学研究所 | 单细胞RNA-seq, 发育转录组学 | 艾伦脑图谱 | 艾伦脑图谱发育和单细胞转录组数据集 |
| 79 | 2025-11-14 |
Deciphering cell-type-and temporally specific matrisome expression signatures in human cortical development and neurodevelopmental disorders via scRNA-seq meta-analysis
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64381-3
PMID:41219193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序元分析揭示人类皮质发育过程中细胞类型特异性基质组表达特征及其在神经发育障碍中的作用 | 首次系统绘制人类皮质发育过程中细胞类型特异性基质组基因表达动态图谱,并揭示其与神经发育障碍的关联特异性 | 研究基于已有数据集(37个供体,孕周8-26周),样本时间点和数量有限 | 解析人类皮质发育过程中细胞类型特异性基质组表达特征及其在神经发育障碍中的意义 | 人类皮质发育过程中的各种细胞类型及其基质组基因表达 | 单细胞转录组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | 元分析 | 单细胞RNA测序数据 | 37个供体,孕周8-26周,来自6个独立研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-11-14 |
ELLA: modeling subcellular spatial variation of gene expression within cells in high-resolution spatial transcriptomics
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64867-0
PMID:41219206
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研究论文 | 提出了一种名为ELLA的统计框架,用于建模亚细胞mRNA定位并检测细胞内的空间变异基因 | 使用过度分散的非齐次泊松过程建模空间计数数据,并采用统一的细胞坐标系来锚定不同的细胞形态 | NA | 开发用于高分辨率空间转录组学中亚细胞空间表达分析的工具 | 亚细胞水平的基因表达空间变异 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 过度分散的非齐次泊松过程 | 空间计数数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |