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当前共找到 40356 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-06-11
Multi-Omics Data Reveal Estrogen-Driven Dysregulation and Stromal-Epithelial Signaling Alterations in Endometrial Polyps
2026-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了子宫内膜息肉中雌激素驱动的失调及基质-上皮信号改变 首次在单细胞水平系统解析子宫内膜息肉中基质-上皮互作机制,结合空间转录组学定位WNT等信号通路异常 未提及具体局限性信息,可能包括样本量有限或体外类器官模型的生理相关性限制 探究子宫内膜息肉的发病机制,重点关注基质-上皮细胞互作和雌激素信号通路 正常子宫内膜、息肉旁组织及息肉组织,以及体外腺体类器官模型 数字病理学 妇科疾病(子宫内膜息肉) 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 涉及正常子宫内膜、息肉旁组织和息肉组织样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
62 2026-06-11
[Crosstalk of keratin 17-positive epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 探究口腔扁平苔藓中KRT17阳性上皮细胞与CD8+ T细胞的相互作用及其临床相关性 首次在口腔扁平苔藓中揭示KRT17阳性上皮细胞与CD8+ T细胞通过HLA-A/B/C-CD8和MIF-CD74/CXCR4信号通路互作,并证实KRT17表达与疾病临床严重程度正相关 样本量较小,仅涉及2例非糜烂型、2例糜烂型OLP和1例健康对照的单细胞RNA测序数据 为理解口腔扁平苔藓发病机制中KRT17阳性上皮细胞与CD8+ T细胞的相互作用提供理论基础 口腔扁平苔藓患者(非糜烂型与糜烂型)及健康对照的黏膜组织 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多重免疫荧光染色 NA 基因表达数据 单细胞RNA测序:2例非糜烂型、2例糜烂型OLP和1例健康对照;批量RNA测序:27例非糜烂型和13例糜烂型OLP;多重免疫荧光:20例非糜烂型、20例糜烂型OLP和5例健康对照 Illumina 单细胞RNA测序、批量RNA测序 Illumina NovaSeq NA
63 2026-06-11
Histological, ultrastructural, and single-cell profiling reveal immune-mediated remodeling in gallbladder inflammation
2026-Mar-05, Cell and tissue research IF:3.2Q3
研究论文 通过组织学、超微结构和单细胞分析揭示免疫介导的胆囊炎症重塑 首次结合组织学、超微结构和单细胞转录组学,系统定义了急性与慢性胆囊炎中不同的免疫-基质程序,揭示了急性炎症以促炎性髓系和细胞毒性T细胞为主,而慢性炎症则以巨噬细胞-B细胞-成纤维细胞网络为特征 样本量较小(41例患者),且未包含纵向或动物模型数据验证不同炎症状态间的时序转换关系 定义急性与慢性胆囊炎中上皮、免疫和基质改变的细胞及结构程序 胆囊组织及血样样本,来自12例急性胆囊炎和29例慢性胆结石症患者 单细胞转录组学 胆囊炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 41例患者(12例急性胆囊炎、29例慢性胆结石症) NA 单细胞RNA-seq NA 免疫富集悬浮液单细胞RNA测序
64 2026-06-11
COL8A1-positive cancer-associated fibroblasts are drivers of 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer
2026-Mar-05, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 发现COL8A1阳性癌症相关成纤维细胞驱动结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药性 首次鉴定COL8A1阳性成纤维细胞亚群通过COL8A1/ITGB1介导的上皮间质转化轴驱动5-FU耐药 多组学分析依赖公开数据,功能验证主要在体外和异种移植模型中进行 探究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌5-FU耐药中的功能和作用机制 结直肠癌患者队列数据、肿瘤细胞和成纤维细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9、siRNA干扰、异种移植、免疫化学分析 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、细胞实验数据 24个结直肠癌队列的多组学数据 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序,Illumina NovaSeq批量测序
65 2026-06-11
Amino acid metabolism-related model for prognosis and immunity in gastric cancer
2026-Mar-05, Amino acids IF:3.0Q3
研究论文 构建了基于氨基酸代谢相关基因的胃癌预后模型,并评估其与免疫浸润的关系 首次系统性地将氨基酸代谢重编程与胃癌预后及免疫微环境相结合,利用单细胞RNA-seq数据深入探究关键基因与免疫细胞的关系 未提及具体局限性,但可能包括样本来源有限(TCGA和GEO数据)、未进行外部独立队列验证等 系统研究胃癌中氨基酸代谢重编程并构建预后模型,验证基因标志物在预测和临床决策中的价值 胃癌患者的肿瘤组织及正常组织样本 机器学习 胃癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, PCR 预后模型(基于16个关键基因构建) 基因表达数据、单细胞转录组数据 TCGA和GEO数据集中的胃癌样本(具体数量未提供) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-06-11
Prospective study of patients with immune checkpoint inhibitor-induced hepatitis; characterization of liver injury, outcome of therapy, and management of steroid-unresponsive and steroid-dependent hepatitis
2026-Mar-05, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 前瞻性研究免疫检查点抑制剂相关肝炎患者的肝损伤特征、治疗结局以及对类固醇无应答或依赖型肝炎的管理 首次前瞻性研究免疫检查点抑制剂相关肝炎的类固醇无应答和依赖型表型,结合多重免疫组化和单细胞RNA测序分析免疫反应 样本量较小(34例患者),且为单中心研究,可能限制结论的普遍性 表征免疫相关性肝炎的表型和对类固醇的治疗反应,为指导治疗决策和预后提供见解 接受免疫检查点抑制剂治疗后出现3-4级免疫相关肝炎的患者 临床研究 肝癌 单细胞RNA测序,多重免疫组化 NA 组织样本,血液样本 34例免疫相关肝炎患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于外周血样本免疫反应表征
67 2026-06-11
FFAR4 negatively regulates colorectal cancer growth via blocking oxidative phosphorylation
2026-Mar-05, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 FFAR4通过阻断氧化磷酸化负调控结直肠癌生长 首次揭示FFAR4作为脂质感应受体在结直肠癌中通过调控线粒体功能和细胞代谢抑制肿瘤生长,并证明其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 未明确阐述FFAR4下游具体分子机制及在临床样本中的适用性验证 探究FFAR4在结直肠癌中的功能和潜在机制 结直肠癌组织和细胞系(CRC细胞系及MC38同基因肿瘤模型) 数字病理学 结直肠癌 多组学整合分析、单细胞RNA测序、代谢谱分析 NA 转录组数据、临床组织免疫荧光数据、代谢数据 临床结直肠癌组织样本(数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq、转录组测序 NA NA
68 2026-06-11
Topological Data Analysis for Unsupervised Feature Selection in Large Scale Spatial Omics Data Sets
2026-Mar-04, Bulletin of mathematical biology IF:2.0Q3
研究论文 应用持续同调(一种拓扑数据分析方法)对大规模空间组学数据集进行无监督特征选择,实现空间可变基因识别并推广至其他空间组学模态 首次将持续同调引入空间转录组学特征选择,通过连续量化空间结构替代传统p值方法,并展示其非参数特性可自然扩展到空间代谢组学等不同模态 未明确讨论计算扩展性在高分辨率大规模数据集中的具体瓶颈,且方法验证仅基于肾脏疾病和心肌梗死两个公共数据集 开发无监督的拓扑数据分析方法,实现大规模空间组学数据中空间结构特征的自动提取与跨模态统一分析 公共空间转录组数据中的基因表达模式及空间代谢组样本 机器学习和数字病理学 肾脏疾病和心肌梗死 空间转录组学和空间代谢组学 持续同调 空间表达数据 未明确说明样本数量(涉及公共空间转录组数据和空间代谢组样本) 未提及具体公司 空间转录组学和空间代谢组学 未提及具体平台产品 NA
69 2026-06-11
Deep learning linking mechanistic models to single-cell transcriptomics data reveals transcriptional bursting in response to DNA damage
2026-Mar-04, eLife IF:6.4Q1
研究论文 提出DeepTX框架,利用深度学习将机制模型与单细胞转录组数据连接,揭示DNA损伤反应中的转录爆发动力学 首次将深度学习方法与机制模型结合,实现从单细胞RNA测序数据中快速准确推断全基因组转录爆发动力学,并揭示不同DNA损伤药物诱导的转录爆发波动与细胞命运决定的关联 未提及具体局限性 揭示全基因组范围内转录爆发如何响应DNA损伤,并理解其与细胞命运决定的关系 小鼠胚胎干细胞和人结肠癌细胞中的DNA损伤药物处理数据 机器学习, 计算生物学 癌症 scRNA-seq 深度学习(DeepTX框架,可能包含神经网络) 单细胞转录组数据 多个DNA损伤药物处理数据集(具体数量未明确给定) NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2026-06-11
Epigenetically regulated pancreatic GABA-somatostatin signaling underlies gestational diabetes-induced glucose intolerance in offspring
2026-Mar-04, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究揭示了妊娠期糖尿病通过表观遗传调控胰腺GABA-生长抑素信号通路导致后代糖耐量异常的机制 首次发现宫内高血糖通过下调DNA去甲基化酶TET2/3,增加GABA合成基因GAD1的DNA甲基化,进而抑制GABA表达并升高生长抑素,影响β细胞功能 研究主要在动物模型中进行,人类数据仅来自脐动脉血GABA含量分析,缺乏直接的人体胰岛组织验证 探究妊娠期糖尿病导致后代糖代谢异常的机制 母鼠及其后代小鼠,以及人类脐动脉血样本 数字病理学 妊娠期糖尿病、糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据、代谢组数据 小鼠模型(具体数量未提供)及人类脐动脉血样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于胰岛细胞分析
71 2026-06-11
A hormetic transcriptional program coregulates invasion, proliferation and dormancy to define metastatic potential
2026-Mar-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了一个激素转录程序协同调控侵袭、增殖和休眠,从而决定转移潜能 首次发现转录因子Prrx1作为侵袭、增殖和休眠共调控的主调节因子,并通过中间表达水平优化三者间的平衡,产生非线性(激素性)关系 目前未提及具体限制 探究乳腺癌转移能力获得的决定因素及时间机制 人类乳腺癌队列及临床前模型中的细胞 机器学习 乳腺癌 空间转录组学、单细胞基因表达分析、染色质谱分析 NA 图像、文本 人类乳腺癌队列数据及临床前模型样本 10x Genomics, Illumina 空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Visium空间转录组学平台、单细胞RNA测序与染色质谱分析的平台配置
72 2026-06-11
Single-cell profiling of tumor lineage plasticity and the immune microenvironment in transformed small cell lung cancer
2026-Mar-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析从非小细胞肺癌向小细胞肺癌转化过程中的肿瘤谱系可塑性和免疫微环境 首次揭示了干细胞样恶性细胞亚群在肺癌转化中的谱系可塑性先驱作用,并发现ISG+淋巴细胞通过I型干扰素促进神经内分泌分化 样本量较小,仅包括5例LUAD、3例T-SCLC和4例SCLC患者,且缺乏更大规模的验证实验 研究非小细胞肺癌向小细胞肺癌转化的分子机制,特别是肿瘤谱系可塑性和免疫微环境的作用 LUAD、T-SCLC和SCLC患者的肿瘤细胞与免疫细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、体外共培养分析 NA 基因表达数据、图像数据 12名患者(5例LUAD、3例T-SCLC、4例SCLC)共73,195个细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
73 2026-06-11
Spatial and cellular composition of lung fibrosis induced by multi-walled carbon nanotubes
2026-Mar-04, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本文通过整合空间转录组学、mRNA测序、代谢组学、微生物组分析和体外验证,研究了多壁碳纳米管暴露如何影响小鼠肺免疫反应和肠道稳态 首次通过多组学方法揭示Slamf7-Slamf7相互作用在巨噬细胞过度活化中的关键作用,并提供了肺-肠轴的现代生物医学证据 NA 探究吸入多壁碳纳米管引起的肺部免疫机制及其对肠道的影响 多壁碳纳米管暴露的小鼠模型 计算机视觉 肺癌 空间转录组学, mRNA测序, 代谢组学, 微生物组分析, 体外验证 NA 图像, 文本, 视频 NA NA 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
74 2026-06-11
Influence of body composition on the efficacy of nivolumab plus ipilimumab for metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 评估身体成分对纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗转移性透明细胞肾细胞癌疗效的影响 使用人工智能分割工具测量身体成分,结合单细胞RNA测序探索身体成分与免疫治疗效果的关系 回顾性研究设计,单中心数据,样本量有限,单细胞RNA测序队列较小 探究身体成分(骨骼肌和皮下脂肪)对一线纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗转移性透明细胞肾细胞癌疗效的影响 309例转移性透明细胞肾细胞癌患者(其中12例进行单细胞RNA测序) 机器学习 肾细胞癌 单细胞RNA测序 NA 图像及转录组数据 309例患者(其中12例进行单细胞RNA测序) NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-06-11
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 揭示转录因子ZMYM3通过上调CTTN诱导足体形成促进肝细胞癌转移 首次发现ZMYM3在肝细胞癌组织中上调,通过直接结合CTTN启动子促进足体形成及上皮间质转化,从而增强肝癌细胞的侵袭和转移能力 主要基于体外细胞实验和组织样本分析,缺乏体内动物模型验证ZMYM3在转移中的直接作用 阐明ZMYM3在肝细胞癌侵袭和转移中的分子机制 肝细胞癌患者组织样本及细胞系 数字病理学 肝癌 RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 单细胞测序 NA 基因表达数据, 免疫组化图像, 单细胞测序数据 TCGA和GEO公开数据集样本,以及免疫组化组织样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 NA NA
76 2026-06-11
Multi-omics analysis of NEDD1 in hepatocellular carcinoma: biological function, prognostic value, and clinical significance
2026-Mar-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过多组学分析揭示NEDD1在肝细胞癌中的生物学功能、预后价值和临床意义 首次利用单细胞及空间转录组学数据揭示NEDD1-MZT2B功能模块在肿瘤细胞及免疫抑制性巨噬细胞中的细胞环境依赖性异质性 多组学分析主要基于公共数据库,临床样本量有限,且NEDD1-MZT2B模块的功能机制仍需进一步验证 探索NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用、调控机制及肿瘤微环境相互作用 肝细胞癌患者组织样本、HCC细胞系及皮下移植瘤模型 数字病理学 肝癌 NGS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 表达数据, 表观遗传学数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 TCGA、GEO公共数据集及临床样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞数据集GSE140228, 空间转录组数据集HRA000437
77 2026-06-11
iAODE for benchmarking and continuum modeling of single-cell chromatin accessibility
2026-Mar-03, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出iAODE模型,用于单细胞染色质可及性数据的基准测试和连续建模 创新性地结合变分自编码器、零膨胀负二项似然、隐式神经ODE、低权重KL正则化和可解释重构瓶颈,生成时间连续的低维潜空间,并建立包含248个scATAC-seq和123个scRNA-seq数据集的大规模基准及20项评估指标 未明确说明 开发能更好捕捉单细胞表观遗传连续轨迹的降维和轨迹分析方法 单细胞染色质可及性数据(scATAC-seq)和单细胞RNA测序数据(scRNA-seq) 机器学习 未涉及 scATAC-seq, scRNA-seq 变分自编码器 (VAE), 神经ODE, 零膨胀负二项模型 单细胞测序数据 248个scATAC-seq数据集和123个scRNA-seq数据集 NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
78 2026-06-11
HIV-seq reveals gene expression differences between HIV-transcribing cells from viremic and suppressed people with HIV
2026-Mar-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过HIV-seq方法,揭示病毒血症和ART抑制状态下HIV感染者中转录HIV基因的细胞的基因表达差异 开发了一种名为HIV-seq的新方法,通过在单细胞RNA-seq中引入针对HIV保守区域的捕获序列,显著提高了对低丰度HIV转录本的检测效率 未在摘要中明确说明局限性 研究ART抑制期间HIV转录细胞的持久性机制及其基因表达特征 HIV感染者中的HIV转录细胞 单细胞转录组学 HIV感染 scRNA-seq(单细胞RNA测序) NA 单细胞转录组数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA HIV-seq方法自定义捕获序列
79 2026-06-11
Pharmacological stabilization of hypoxia-inducible factor 1-α dampens the interferon response and promotes glycolysis in Aicardi-Goutières syndrome
2026-Mar-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和靶向代谢组学分析Aicardi-Goutières综合征患者外周血样本,发现HIF-1α表达和活性缺失与代谢转换相关,药物稳定HIF-1α可逆转代谢转换并减轻干扰素反应 首次发现Aicardi-Goutières综合征中HIF-1α表达缺失与能量代谢转换的关联,并证明药物稳定HIF-1α可逆转代谢异常并减轻炎症反应 未提及明确的局限性,但可能包括样本量较小和体外模型的适用范围 研究Aicardi-Goutières综合征中能量代谢转换对慢性炎症的作用及潜在治疗靶点 携带ADAR1、RNASEH2B或SAMHD1致病变异的Aicardi-Goutières综合征患者的外周血样本 机器学习 Aicardi-Goutières综合征 单细胞转录组学、靶向代谢组学 机器学习、差异基因表达分析 文本 Aicardi-Goutières综合征患者的外周血样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-06-11
Identification of cryosensitive niches and a targetable FOS/AP‑1 program in the human ovarian cortex by single‑cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-03, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学鉴定人类卵巢皮质中冷冻敏感生态位及可靶向的FOS/AP-1程序 首次在单细胞和空间水平系统鉴定卵巢冷冻损伤中易受影响的细胞亚群及关键分子机制,并发现FOS/AP-1通路可作为潜在治疗靶点 仅使用3例生殖器性别重置手术患者的卵巢皮质样本,样本量较小且来源单一;未评估长期冻存对卵母细胞质量的影响 揭示卵巢组织冷冻保存中易冻伤细胞亚群的转录组变化及关键信号通路 人体卵巢皮质组织、卵母细胞 单细胞转录组学、空间转录组学、生殖医学 卵巢冷冻损伤、女性生育力保存 单细胞RNA测序、空间转录组学、Smart-seq2 NA 基因表达数据、空间转录数据 3例生殖器性别重置手术患者的卵巢皮质组织(27,185个新鲜细胞和25,480个冻融细胞)及110个卵母细胞(66个新鲜、44个冷冻) 10x Genomics, BGI 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, BGI Stereo-seq 10x Genomics单细胞RNA测序用于卵巢细胞悬液,BGI Stereo-seq用于空间转录组学,Smart-seq2用于卵母细胞分析
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