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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-02 |
Single-Cell Dissection of Malignant Cell Heterogeneity Reveals Functional Programs and Clinically Relevant Subtypes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-05, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70104
PMID:42068156
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研究论文 | 通过整合58例头颈部鳞状细胞癌患者的单细胞RNA测序数据,揭示恶性细胞异质性、功能程序及临床相关亚型 | 首次系统性解析HNSCC恶性细胞异质性,鉴定12个恶性细胞亚群及其分化状态、发育轨迹和空间定位,并通过hdWGCNA和NMF识别共表达基因模块和元程序,定义三种具有不同临床预后的分子亚型(MS-1/2/3),开发了能预测预后和免疫治疗反应的25基因恶性细胞评分(MCScore) | 基于公共数据整合,缺乏独立外部验证队列;单细胞数据可能遗漏稀有细胞亚群;细胞间相互作用分析基于配体-受体预测,需实验验证 | 解析HNSCC恶性细胞异质性,构建临床相关分子亚型,开发预后和免疫治疗预测标志物 | 58例HNSCC患者的181,003个恶性细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | hdWGCNA, NMF | 单细胞转录组数据, bulk RNA-seq数据 | 58例HNSCC患者(181,003个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-06-02 |
Single-cell RNAseq identifies persistent epithelial and immune dysfunction in PwCF by mitigating inter-individual sampling heterogeneity
2026-May, Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society
IF:5.4Q1
DOI:10.1016/j.jcf.2026.01.009
PMID:41807181
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者鼻腔上皮的细胞类型特异性基因表达和免疫功能障碍 | 通过单细胞转录组学揭示囊性纤维化患者鼻腔上皮的细胞类型特异性差异表达基因,并发现伴侣蛋白表达下调在低CFTR表达细胞类型中的调节作用 | 样本量较小,仅9名患者和7名健康志愿者,且未涉及下气道直接比较 | 探究囊性纤维化患者鼻腔上皮组织的细胞类型异质性及其在疾病中的影响 | 囊性纤维化患者和健康志愿者的鼻腔刮取样本 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 9名囊性纤维化患者和7名健康志愿者的鼻腔刮取样本,其中5名患者和5名健康志愿者有配对批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-06-02 |
Multi-organ single-cell analysis of preferential expression of CAKUT genes
2026-04-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05003-y
PMID:42045859
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研究论文 | 通过多器官单细胞分析揭示CAKUT相关基因优先表达模式 | 首次系统分析91个CAKUT相关基因在多个发育组织和成人组织中的单细胞表达,发现共享的基质-间充质基因表达特征 | 基于公开数据集,可能缺乏特定发育阶段的完整覆盖 | 探究CAKUT相关基因在肾脏及泌尿道发育中的细胞类型特异性表达模式 | 人类胎儿和成体肾脏、输尿管、膀胱的单细胞RNA测序数据,以及早期胚胎转录组数据 | 单细胞组学 | 先天性肾脏和泌尿道畸形(CAKUT) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集的整合分析,具体样本量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 64 | 2026-06-02 |
Zinc ions attenuates iridovirus infection through regulation of ferroptosis pathways
2026-Apr-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03114-x
PMID:42009668
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研究论文 | 探究锌离子通过调节铁死亡途径抑制虹彩病毒复制的机制 | 揭示了锌离子通过激活铁死亡通路抑制病毒复制的新机制,重新定义了锌的免疫机制和铁死亡在病毒感染中的双重作用 | 未提及具体局限性 | 研究锌离子如何通过铁死亡途径抑制传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)的复制 | 斑鳢及其感染ISKNV的细胞 | 机器学习 | 鱼类病毒感染 | RNA-seq, 单细胞测序, 酶活性测定, 透射电子显微镜 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 酶活性数据, 图像数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-06-02 |
Unveiling DEFB1 as a novel driver and promising therapeutic target in lung adenocarcinoma
2026-Apr-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08748-4
PMID:42009648
|
研究论文 | 通过全基因组CRISPR/Cas9筛选、单细胞测序及功能实验,揭示DEFB1是肺腺癌的新驱动因子,并开发出靶向DEFB1的单克隆抗体mAb-5作为潜在治疗策略 | 首次鉴定DEFB1为肺腺癌驱动因子,并开发出有效抑制其功能的单克隆抗体mAb-5,同时在多种模型中验证其抗肿瘤效果 | 未提及具体局限性 | 探索肺腺癌增殖相关基因并开发靶向治疗 | DEFB1基因及其在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞测序, 多重免疫组化, 免疫共沉淀, 质谱分析 | NA | 基因表达数据, 细胞图像, 蛋白质组学数据 | 涉及体外细胞系、类器官、异种移植模型和自发肺癌小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq批量测序 |
| 66 | 2026-06-02 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal divergent immunological and stromal programs in peritoneal versus ovarian endometriosis
2026-Apr-20, BMC women's health
DOI:10.1186/s12905-026-04456-5
PMID:42010552
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2026-06-02 |
The B7 family subgroup reflects tumor cell heterogeneity and patient post-operative prognosis in gallbladder cancer
2026-Apr-18, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00802-7
PMID:42001193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B7家族亚群在胆囊癌中反映肿瘤细胞异质性并影响患者术后预后 | 首次在单细胞分辨率下系统研究B7家族免疫检查点分子CD276、VTCN1和HHLA2在胆囊癌中的表达及其下游信号机制,并构建整合表达的梯度提升机模型用于术后风险分层 | 样本量有限(7个原发肿瘤用于scRNA-seq,188例患者用于生存模型),且未进行独立外部验证 | 阐明胆囊癌细胞生物异质性并改善术后风险分层 | 胆囊癌患者肿瘤细胞及术后预后 | 机器学习和数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序和NMF分析 | 梯度提升机 | 基因表达数据 | 7个原发肿瘤用于单细胞RNA测序,188例胆囊癌术后患者用于生存模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-06-02 |
Autophagy related 7 dysfunction in senescent melanocytes and hypopigmented skin: reversal by metformin
2026-04-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf529
PMID:41453137
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研究论文 | 该文研究了自噬相关7功能异常在衰老黑素细胞和色素减退皮肤中的作用,并评估了二甲双胍作为逆转策略的效果 | 首次确定自噬失调为紫外线诱导黑素细胞衰老过程中的早期事件,早于糖酵解重编程,并提出通过维持ATG7延缓衰老的干预策略 | 未明确说明 | 识别黑素细胞衰老前的早期分子事件,并评估预防衰老的治疗策略 | 紫外线诱导的衰老黑素细胞及特发性点状色素减退皮肤样本 | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、时间序列批量转录组分析、基因和蛋白检测、免疫组化、基因敲低/过表达 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 69 | 2026-06-02 |
Single-cell transcriptomics identifies regulatory T cell heterogeneity in gestational diabetes mellitus
2026-Apr-03, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01563-0
PMID:41933176
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research paper | 通过单细胞转录组学分析揭示了妊娠期糖尿病中调节性T细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上系统解析妊娠期糖尿病中调节性T细胞亚群的转录组变化,发现TXNIP等基因可作为GDM状态的重要判别标志 | 未能观察到Treg细胞亚群比例在疾病状态下的显著差异,样本量有限(仅13名健康孕妇和10名GDM患者) | 探究妊娠期糖尿病中调节性T细胞亚群的转录失调机制 | 13名健康孕妇和10名女性GDM患者血液中的调节性T细胞和CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23名受试者(13名健康孕妇+10名GDM患者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-06-02 |
Fibroblast-Driven Fibroblast Growth Factor and Fibronectin 1 Signaling Orchestrates Extracellular Matrix Remodeling for Ovine Mammary Lactation Decline
2026-04, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70150
PMID:41998868
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研究论文 | 该研究整合绵羊泌乳高峰和后期乳腺的单细胞RNA测序数据,揭示了成纤维细胞通过FGF和FN1信号通路驱动细胞外基质重塑的调控网络 | 首次在绵羊泌乳衰退过程中建立成纤维细胞驱动的ECM重塑调控网络,并通过跨物种比较发现成纤维细胞和内皮细胞的保守转录程序 | 未提及 | 阐明绵羊泌乳后期乳腺组织中细胞外基质重塑的细胞和分子机制 | 绵羊泌乳高峰期和后期乳腺组织样本 | 单细胞转录组学 | 正常生理过程 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 绵羊泌乳高峰期和后期乳腺组织样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-06-02 |
Harnessing arginase 2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive cutaneous T-cell lymphoma
2026-03-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf450
PMID:41208405
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研究论文 | 探讨精氨酸酶2特异性CD8+ T细胞靶向免疫抑制性皮肤T细胞淋巴瘤的潜力 | 首次证明恶性皮肤T细胞淋巴瘤细胞可被ARG2特异性CD8+ T细胞靶向识别,揭示ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的可能性 | 仅在体外细胞系和公共单细胞数据集中验证,缺乏体内动物模型和临床试验证据 | 评估恶性CTCL细胞是否高表达ARG2并可作为ARG2特异性CD8+ T细胞的免疫治疗靶点 | 八种CTCL细胞系及患者病变组织中的恶性T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,CRISPR-Cas9基因编辑,酶联免疫斑点检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 8种CTCL细胞系,多名供体的CD8+ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用公开的单细胞RNA测序数据集分析患者病变组织 |
| 72 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover glycolytic dysregulation linking skin and systemic inflammation in dermatomyositis
2026-03-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf486
PMID:41329255
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示皮肌炎中糖酵解失调连接皮肤与系统性炎症 | 首次构建皮肌炎皮肤病变的高分辨率单细胞图谱,鉴定出炎症性成纤维细胞亚群,并揭示IFN-I信号通路和CXCL10-糖酵解轴作为核心炎症驱动机制 | 未明确说明 | 明确皮肌炎系统性及皮肤病变的炎症景观,并探究其潜在致病机制 | 成人经典皮肌炎患者的皮肤病变样本及实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、转录组学 | NA | 图像 | 成人经典皮肌炎患者样本及实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'端测序 |
| 73 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing: a tool for precision dermatology
2026-Mar-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag013
PMID:41518002
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2026-06-02 |
Imbalance of Ciliary Programs Drives Fibroblast Differentiation and Fibrotic Signaling in Systemic Sclerosis
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.25.707978
PMID:42124727
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研究论文 | 本研究利用正交多模态策略,包括人类队列、单细胞轨迹和靶向扰动模型,揭示了纤毛程序失衡是系统性硬化症中成纤维细胞分化与纤维化信号的关键驱动因素 | 首次证明纤毛组装与去组装失衡作为系统性硬化症中纤维化成纤维细胞命运的中心决定因素,并指出纤毛破坏是成纤维细胞编程的起始事件而非次级事件 | 未提及具体局限性 | 阐明纤毛程序动态失衡如何驱动系统性硬化症中成纤维细胞至肌成纤维细胞的病理转化及纤维化信号传导 | 系统性硬化症患者皮肤活检组织、培养的成纤维细胞以及相关基因扰动模型 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、靶向遗传扰动 | 轨迹映射模型 | 基因表达数据(包括微阵列和单细胞RNA-seq数据) | 整合了8个微阵列数据集和2个独立单细胞RNA-seq队列中的皮肤活检样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于单细胞RNA测序,但具体平台配置未详细说明 |
| 75 | 2026-06-02 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts promote bladder cancer progression via angiogenesis and immune modulation: an analysis based on single-cell Transcriptomics
2026-01-16, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyag001
PMID:41544201
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示POSTN+癌症相关成纤维细胞通过血管生成和免疫调节促进膀胱癌进展 | 首次系统阐明POSTN+ CAFs在膀胱癌中通过IL1B/IL1R1轴增强与单核细胞通讯、促进血管生成和免疫抑制的机制 | 该研究为公开数据的二次分析,缺乏验证性实验且样本量有限 | 探索POSTN+癌症相关成纤维细胞在膀胱癌进展中的具体作用机制 | 膀胱癌患者样本中的单细胞转录组数据及CAF细胞系 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个膀胱癌样本和4个对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 76 | 2026-06-02 |
Trim45 promotes the occurrence and development of cervical cancer by inhibiting the cGAS/STING signaling pathway
2026-01-16, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyag009
PMID:42186236
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研究论文 | 通过整合单细胞测序、功能实验和分子分析,揭示Trim45通过抑制cGAS/STING信号通路促进宫颈癌发生发展的机制 | 首次发现Trim45通过与ANXA2相互作用抑制cGAS/STING信号通路,进而上调HK2和ENO2表达增强有氧糖酵解,促进宫颈癌进展,揭示了新的Trim45-ANXA2-cGAS/STING-糖酵解轴 | 未提及 | 探究Trim45在宫颈癌发生发展中的具体机制及其对cGAS/STING信号通路的影响 | 宫颈癌组织细胞和HPV-18感染患者 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 宫颈癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-06-02 |
Biomimetic Liposome Coloaded ES-Cu and PFK15 Amplify Cuproptosis through Inhibition of Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes for Rheumatoid Arthritis Therapy
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17592
PMID:41457948
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研究论文 | 提出一种仿生脂质体共同递送ES-Cu和PFK15,通过抑制成纤维样滑膜细胞中的糖酵解来放大铜死亡,用于类风湿关节炎治疗 | 首次通过单细胞RNA测序揭示RAFLS中过度活跃的糖酵解是抵抗铜死亡的关键机制,并据此设计仿生脂质体共同递送糖酵解抑制剂和铜死亡诱导剂,实现特异性诱导RAFLS细胞死亡 | 未在文中明确提及,可能需要进一步验证在体内的长期安全性和有效性 | 探索通过抑制糖酵解放大铜死亡来治疗类风湿关节炎的新策略 | 类风湿关节炎患者的成纤维样滑膜细胞(RAFLS) | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-06-02 |
SELL Marks an Effector-Deficient CD8+ T Cell Subset That Promotes Intracerebral Hemorrhage and Responds to Rutin Therapy
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4033506
PMID:41937927
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research paper | 通过整合多组学分析,识别出SELL标记的效应缺陷CD8+ T细胞亚群,该亚群促进脑出血并响应芦丁治疗 | 首次在脑出血中发现SELL高表达的CD8+ T细胞亚群,该亚群具有全面的效应功能障碍,并利用机器学习算法筛选出SELL作为共识诊断生物标志物 | 未明确提及样本量限制或潜在的选择偏倚 | 通过整合多组学分析,识别与脑出血相关的CD8+ T细胞亚群及潜在治疗靶点 | 人和小鼠脑出血模型中的CD8+ T细胞 | machine learning | 脑出血 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | LASSO, random forest, XGBoost, SVM, Boruta | sequencing data | 130名患者(66例脑出血和64例高血压对照),13名患者的单细胞RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-06-02 |
Multiomics integration of single-cell transcriptomics and bulk sequencing data identifies key biomarkers and predictive models for IBD subtype classification
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1729642
PMID:41939783
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组和批量测序数据,识别IBD亚型分类的关键生物标志物和预测模型 | 首次结合外周血单细胞RNA-seq和批量测序数据,通过跨数据集整合分析鉴定出IBD亚型间的分子特征差异,并构建了18基因机器学习模型进行亚型分类 | 诊断模型AUC仅为0.73,属于中等水平;需在前瞻性临床验证中进一步确认才能应用于常规实践 | 通过多组学整合分析识别区分溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)的分子特征和生物标志物 | IBD患者(包括UC和CD患者)的外周血单细胞和批量测序数据 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序、免疫组化验证 | 机器学习模型(18基因) | 基因表达数据 | GSE125527(单细胞数据集)、GSE75214(批量测序数据集)、GSE179285(独立验证数据集)及临床样本(未明确数量) | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-06-02 |
Multi-omics integration and machine learning reveal gut-immune signatures in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from bulk RNA-seq, single-cell profiles, spatial transcriptomics, and experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1730289
PMID:41939867
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研究论文 | 通过多组学整合和机器学习揭示特发性肺纤维化中的肠道-免疫特征,并实验验证关键基因表达 | 首次整合批量RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组及外周血多组学数据,结合孟德尔随机化分析证实肠道-免疫-肺轴在IPF中的因果作用,并利用药物特征反转预测潜在治疗药物 | 基于公共数据集分析,样本量有限;实验验证仅在部分模型中进行,缺乏大规模临床队列验证 | 阐明特发性肺纤维化中肠道-免疫-肺轴的分子机制,识别诊断标志物和治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者及动物模型(TGF-β1刺激的成纤维细胞、博来霉素诱导小鼠)、患者血浆 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, qPCR, ELISA, 孟德尔随机化 | CNN | 基因表达数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个公共数据集及实验样本(TGF-β1刺激成纤维细胞、博来霉素小鼠肺组织、患者血浆) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |