单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-06-27	Diverse Landscape of Group 1 Innate Lymphoid Cells Predicts the Prognosis in Patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma 2025-Jun-19, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17122047 PMID:40563696	研究论文	通过单细胞RNA测序分析头颈部鳞状细胞癌患者中ILC亚群的多样性和功能状态，并开发预后预测模型	首次揭示了ieILC1/NK细胞在HNSCC患者中的多样性景观及其预后意义	研究依赖于公开数据集，可能受限于样本量和数据质量	探索头颈部鳞状细胞癌患者中ILC亚群的多样性和功能状态，并开发预后预测模型	头颈部鳞状细胞癌患者	生物信息学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	生存预测模型	基因表达数据	95,809个免疫细胞(来自GSE164690数据集)
62	2025-06-27	The Role of Cardiac Fibroblast Heterogeneity in Myocardial Fibrosis and Its Novel Therapeutic Potential 2025-Jun-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26125882 PMID:40565343	综述	本文综述了心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用及其新的治疗潜力	揭示了心脏成纤维细胞的高度异质性和动态性，探讨了针对不同亚群的精准抗纤维化治疗策略	未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有文献综述	探讨心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用及其治疗潜力	心脏成纤维细胞及其不同亚群	心血管疾病	心血管疾病	单细胞转录组学、谱系追踪、表观遗传分析	NA	NA	NA
63	2025-06-27	Spatial Transcriptomics Reveals Regional and Temporal Dynamics of Gene Expression in the Mouse Brain Across Development and Aging 2025-Jun-18, Biology DOI:10.3390/biology14060717 PMID:40563967	研究论文	本研究利用空间转录组学技术分析了小鼠大脑在三个关键时间点的基因表达动态，揭示了大脑发育和衰老过程中区域特异性的转录变化	首次直接比较大脑发育与衰老过程的分子特征，建立了大脑发育和衰老的空间转录组学参考数据	研究仅针对小鼠模型，结果可能无法完全反映人类大脑的发育和衰老过程	探究健康大脑发育和衰老过程中的转录组变化及其分子机制	小鼠大脑组织	空间转录组学	神经退行性疾病	空间转录组学	NA	转录组数据	三个时间点的小鼠大脑样本（P21、3月龄、28月龄）
64	2025-06-27	Identification Exploring the Mechanism and Clinical Validation of Mitochondrial Dynamics-Related Genes in Membranous Nephropathy Based on Mendelian Randomization Study and Bioinformatics Analysis 2025-Jun-17, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13061489 PMID:40564208	研究论文	本研究通过孟德尔随机化研究和生物信息学分析，探讨了线粒体动力学相关基因在膜性肾病中的机制和临床验证	发现了四个关键线粒体动力学相关基因（RTTN、MYO9A、USP40和NFKBIZ）在膜性肾病中的重要作用，并构建了具有优异诊断性能的列线图模型	研究样本量有限，且主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	探索线粒体动力学相关基因在膜性肾病发病机制中的作用	膜性肾病患者和对照组的基因表达数据	生物信息学	膜性肾病	孟德尔随机化、机器学习算法、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）	列线图模型	转录组数据	三个转录组数据集（GSE200828、GSE73953和GSE241302）
65	2025-06-27	Progenitor Cell Dynamics in Androgenetic Alopecia: Insights from Spatially Resolved Transcriptomics 2025-Jun-17, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26125792 PMID:40565255	研究论文	本研究利用空间转录组学技术探究雄激素性脱发（AGA）中祖细胞动态变化的分子机制	首次使用GeoMX数字空间分析平台在维持组织空间背景的情况下比较AGA患者与健康对照的祖细胞区域转录组差异	未明确说明样本量大小及具体基因名称	揭示AGA中祖细胞耗竭的分子机制	雄激素性脱发患者的毛囊祖细胞区域	空间转录组学	雄激素性脱发	GeoMX Digital Spatial Profiling (DSP)	NA	空间转录组数据	NA
66	2025-06-27	The Transcriptomic Signature of Donkey Ovarian Tissue Revealed by Cross-Species Comparative Analysis at Single-Cell Resolution 2025-Jun-14, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1 DOI:10.3390/ani15121761 PMID:40564314	研究论文	通过单细胞RNA测序和跨物种比较分析，揭示了驴卵巢组织的转录组特征及其在生殖效率中的分子机制	首次在单细胞分辨率下构建了驴卵巢的高分辨率转录组图谱，并鉴定了驴特有的基因表达模式	研究仅关注了驴卵巢的转录组特征，未涉及其他生殖器官或生理过程	探索驴卵巢生物学分子机制及其在生殖效率中的作用	驴卵巢组织	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	17,423个细胞
67	2025-06-27	Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer 2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304 PMID:40358364	研究论文	本研究探讨了PARP抑制剂和雄激素抑制联合治疗原发性前列腺癌的效果及其生物学机制	在缺乏同源重组修复通路突变的情况下，研究了PARP抑制剂和雄激素抑制联合治疗的临床效果及其潜在生物学机制	样本量较小，且未明确说明具体样本数量	研究PARP抑制剂和雄激素抑制联合治疗在原发性前列腺癌中的效果及其生物学机制	原发性前列腺癌患者	肿瘤学	前列腺癌	IHC, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因测序	NA	组织样本, 基因表达数据	NA
68	2025-06-27	Chemokine CCL12 in trigeminal ganglion contributes to CFA-induced mechanical allodynia in mice 2025-Jun-13, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.06.026 PMID:40517940	研究论文	本研究探讨了CCL12在三叉神经节中对CFA诱导的小鼠机械性异常性疼痛的作用	揭示了CCL12通过促进巨噬细胞浸润和IL-6、TNF-α的产生来影响疼痛发展的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本	探究CCL12在慢性炎症性疼痛中的作用机制	小鼠三叉神经节和脊髓三叉神经尾侧核	神经科学	慢性疼痛	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、腺相关病毒(AAV)干扰	小鼠CFA诱导的口面部疼痛模型	基因表达数据、行为学数据	未明确提及具体样本数量，使用小鼠模型
69	2025-06-27	Dissecting liver inflammation ecosystem identifies annexin A1 as a pro-resolving target for liver failure 2025-Jun-12, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001427 PMID:40560812	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序等技术解析了急性-慢性肝衰竭(ACLF)的免疫景观，并发现ANXA1作为潜在的治疗靶点	首次全面描绘ACLF的免疫特征，并鉴定ANXA1-FPR1轴作为炎症调控的关键通路	临床样本量有限，ANXA1治疗机制仍需进一步验证	解析ACLF的免疫失调机制并寻找治疗靶点	ACLF患者肝脏组织及免疫细胞	免疫学	肝衰竭	单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 生物信息学分析	NA	基因表达数据	ACLF、ALF、DC患者及对照组的肝脏样本
70	2025-06-27	Integrative Single-Cell Transcriptomics and Network Modeling Reveal Modular Regulators of Sheep Zygotic Genome Activation 2025-Jun-11, Biology DOI:10.3390/biology14060676 PMID:40563927	研究论文	通过单细胞转录组学和网络建模揭示绵羊合子基因组激活的模块化调控因子	首次在绵羊胚胎中应用单细胞RNA测序技术（Smart-seq2）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），揭示了合子基因组激活（ZGA）的模块化调控架构	研究仅限于绵羊胚胎的8-、16-和32-细胞阶段，未涵盖更早期或更晚期的发育阶段	解析绵羊合子基因组激活的调控机制	绵羊胚胎（体内和体外来源）	发育生物学	NA	单细胞RNA测序（Smart-seq2），加权基因共表达网络分析（WGCNA），STRING v11蛋白互作网络分析	NA	单细胞转录组数据	绵羊胚胎的8-、16-和32-细胞阶段样本
71	2025-06-27	scRL: Utilizing Reinforcement Learning to Evaluate Fate Decisions in Single-Cell Data 2025-Jun-11, Biology DOI:10.3390/biology14060679 PMID:40563931	研究论文	本文提出了一种名为scRL的单细胞强化学习框架，用于评估单细胞数据中的命运决策	scRL框架将分化过程重新定义为在可解释的潜在流形上的顺序决策过程，通过actor-critic架构量化每个细胞的命运强度并追踪最优发育路径	未明确提及具体局限性	解码单细胞数据中的发育逻辑，精确定位命运决策发生的时间和位置	单细胞RNA测序数据	机器学习	急性髓系白血病	单细胞RNA测序	强化学习（actor-critic框架）	单细胞转录组数据	数十万个细胞（具体数量未明确说明）
72	2025-06-27	Maintenance of chronic neuroinflammation in multiple sclerosis via interferon signaling and CD8 T cell-mediated cytotoxicity 2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.09.658729 PMID:40568143	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体测序，探讨了多发性硬化症中慢性神经炎症的维持机制	揭示了干扰素信号和CD8 T细胞介导的细胞毒性在慢性神经炎症中的作用，并提出了潜在的治疗靶点	样本量较小，且未涵盖所有治疗类型的患者	探究多发性硬化症中慢性神经炎症的机制和潜在治疗靶点	多发性硬化症患者和健康对照者的脑脊液和血液免疫细胞	神经免疫学	多发性硬化症	scRNAseq, scTCR-seq, 流式细胞术, 蛋白质组学	NA	单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 蛋白质组数据	34名多发性硬化症患者（17名未治疗，6名接受B细胞清除治疗）和5名健康对照者
73	2025-06-27	Spatial Transcriptomics in Lung Cancer and Pulmonary Diseases: A Comprehensive Review 2025-Jun-09, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17121912 PMID:40563563	综述	本文综述了空间转录组学在肺癌和肺部疾病研究中的应用及其最新进展	空间转录组学技术保留了基因表达的空间分布，揭示了传统测序方法无法捕捉的局部免疫微环境、基质-上皮细胞互作及疾病相关转录热点	NA	探讨空间转录组学在呼吸系统疾病研究中的潜在应用	肺癌、慢性阻塞性肺疾病、哮喘和特发性肺纤维化等肺部疾病	数字病理	肺癌	空间转录组学(ST)	NA	基因表达空间数据	NA
74	2025-06-27	Identifying CDCA4 as a Radiotherapy Resistance-Associated Gene in Colorectal Cancer by an Integrated Bioinformatics Analysis Approach 2025-Jun-09, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes16060696 PMID:40565588	研究论文	通过整合生物信息学分析方法，识别出CDCA4作为结直肠癌放疗耐药相关基因	首次通过整合生殖系突变、转录组数据和免疫微环境特征，揭示CDCA4在结直肠癌放疗耐药中的关键作用	样本量较小（12例LARC患者），需进一步大样本验证	探索结直肠癌放疗耐药的遗传和分子机制	局部晚期直肠癌（LARC）患者	生物信息学	结直肠癌	全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、随机森林算法	随机森林	基因组数据、转录组数据	12例LARC患者（WES）、TCGA-READ和GSE150082队列（转录组）、GSE190826验证队列
75	2025-06-27	Chromoanagenesis in Osteosarcoma 2025-Jun-07, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom15060833 PMID:40563473	综述	本文综述了染色体灾难性事件（chromoanagenesis）在骨肉瘤中的作用及其对基因组不稳定性的影响	阐明了染色体灾难性事件（如染色体碎裂和染色体再合成）如何通过复制应激和DNA修复途径受损导致骨肉瘤的基因组不稳定性	针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现，且研究依赖于新兴技术的应用	探讨染色体灾难性事件在骨肉瘤中的作用及其对肿瘤进展的影响	骨肉瘤及其基因组不稳定性	基因组学	骨肉瘤	NGS, 光学基因组图谱, 单细胞测序	NA	基因组数据	NA
76	2025-06-27	Uridine, a Therapeutic Nucleoside, Exacerbates Alcoholic Liver Disease via SRC Kinase Activation: A Network Toxicology and Molecular Dynamics Perspective 2025-Jun-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26125473 PMID:40564937	研究论文	本研究通过多种分析方法探讨了酒精性肝病(ALD)与血液代谢物尿苷之间的潜在机制和因果关系	首次发现尿苷可能通过SRC激酶激活加剧酒精性肝病，并提供了分子动力学模拟证据	研究主要基于计算模拟和关联分析，需要进一步实验验证	阐明尿苷在酒精性肝病进展中的作用机制	酒精性肝病患者(1416例)和对照人群(217376例)的基因组数据，以及1091种血液代谢物	系统生物学	酒精性肝病	Mendelian随机化分析、分子动力学模拟、单细胞RNA测序、分子对接	NA	基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据	1416例ALD患者和217376例对照的GWAS数据，1091种血液代谢物
77	2025-06-27	Dynamic Transcriptomic and Cellular Remodeling Underlie Cuprizone-Induced Demyelination and Endogenous Repair in the CNS 2025-Jun-06, Antioxidants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/antiox14060692 PMID:40563324	研究论文	本研究探讨了铜宗诱导的中枢神经系统脱髓鞘和再髓鞘化过程中的动态细胞和分子变化	揭示了胶质细胞反应、血脑屏障完整性和神经免疫相互作用的动态变化，以及Psap-Gpr37l1信号通路的调控作用	研究仅基于小鼠模型，人类疾病中的情况可能有所不同	探索脱髓鞘和再髓鞘化的分子机制	铜宗诱导的小鼠脱髓鞘模型	神经科学	脱髓鞘疾病	单细胞RNA测序、组织学和免疫荧光分析	小鼠模型	转录组数据、组织学数据	未明确说明小鼠数量
78	2025-06-27	Angiogenesis in Atrial Fibrillation: A Literature Review 2025-Jun-06, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13061399 PMID:40564118	review	本文综述了血管生成在心房颤动（AF）进展中的双重作用及其治疗潜力	强调了血管生成在AF发病机制中的双重作用，并探讨了靶向血管生成途径的治疗策略	临床验证仍有限，需要进一步研究机制复杂性和生物标志物优化	阐明血管生成在AF发病机制中的作用并探索治疗策略	心房颤动（AF）及其与血管生成的关系	心血管疾病	心房颤动	单细胞测序	NA	文献数据	NA
79	2025-06-27	Integrated Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Novel Insights into the Role of Opioid Signaling in the Pathophysiology of Inflammatory Bowel Disease 2025-Jun-06, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13061398 PMID:40564117	研究论文	通过单细胞转录组分析探索阿片信号在炎症性肠病(IBD)病理生理学中的作用	在单细胞水平上鉴定了高表达阿片信号相关基因的新型单核细胞亚群(OpiHi单核细胞)，并揭示了其在IBD组织中的关键作用	研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证	阐明阿片信号在IBD发病机制中的作用	炎症性肠病(IBD)患者组织样本	数字病理学	炎症性肠病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序, CellChat分析, 转录因子活性评估	预测模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量
80	2025-06-27	Cell-surface proteomic profiling identifies CD72 as a regulator of microglial tiling 2025-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.02.657480 PMID:40501958	research paper	该研究通过细胞表面蛋白质组学分析，发现CD72作为调节小胶质细胞平铺现象的关键分子	首次鉴定出CD72作为调控小胶质细胞平铺现象的细胞表面蛋白，并揭示了其通过细胞粘附、排斥受体等通路发挥作用	研究主要基于体外模型，体内验证仍需进一步开展	探究小胶质细胞平铺现象的分子调控机制	小胶质细胞	细胞生物学	NA	细胞表面邻近标记技术、质谱分析、单细胞RNA测序	NA	蛋白质组数据、转录组数据、影像数据	NA