单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-06-22	Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature 2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists IF:2.0Q3 DOI:10.1002/dvdy.532 PMID:36038963	research paper	本研究探讨了羊膜生成体壁细胞（ASCs）在心血管发育中的多样化贡献，特别关注甲状腺血管系统的形成	揭示了ASCs不仅形成羊膜，还迁移至胚胎内分化为心肌细胞、平滑肌细胞、心脏间质细胞和血管内皮细胞，尤其在甲状腺血管形成中发挥选择性作用	iASCs的详细分化过程和最终分布仍不完全清楚	阐明ASCs在心血管发育中的作用机制，特别是对甲状腺血管系统的贡献	鹌鹑-鸡嵌合体中的羊膜生成体壁细胞（ASCs）及其在胚胎内的分化	developmental biology	NA	quail-chick chimera analysis, explant culture, single-cell transcriptome analysis	NA	transcriptomic data, imaging data	鹌鹑-鸡嵌合体模型
62	2025-06-22	Mitochondrial dysfunction induces ALK5-SMAD2-mediated hypovascularization and arteriovenous malformations in mouse retinas 2022-12-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-35262-w PMID:36496409	研究论文	本研究揭示了线粒体功能障碍通过ALK5-SMAD2信号通路诱导视网膜血管畸变的新机制	发现了线粒体功能障碍通过ALK5-SMAD2信号通路导致视网膜血管生长迟缓和动静脉畸形的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类疾病中验证	探究线粒体功能障碍对视网膜血管发育的影响及其分子机制	小鼠视网膜血管内皮细胞	血管生物学	视网膜血管疾病	单细胞RNA测序	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	三种不同基因敲除小鼠的视网膜组织
63	2025-06-22	mTORC1 links pathology in experimental models of Still's disease and macrophage activation syndrome 2022-11-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-34480-6 PMID:36443301	研究论文	该研究揭示了mTORC1在Still病和巨噬细胞活化综合征病理中的关键作用	首次证明mTORC1激活与Still病和巨噬细胞活化综合征的发病机制直接相关，并发现TSC1/TSC2表达下降与疾病活动性相关	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探究mTORC1在Still病和巨噬细胞活化综合征发病机制中的作用	Still病患者和小鼠模型中的单核细胞/巨噬细胞	免疫学	Still病/巨噬细胞活化综合征	单细胞RNA测序、CRISPR/Cas基因编辑	小鼠疾病模型	转录组数据	小鼠模型和人类患者样本（具体数量未说明）
64	2025-06-22	Tracing the origin of disseminated tumor cells in breast cancer using single-cell sequencing 2016-12-09, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-1109-7 PMID:27931250	研究论文	通过单细胞测序技术追踪乳腺癌中播散性肿瘤细胞的起源	首次应用单细胞测序技术识别并追踪乳腺癌中播散性肿瘤细胞的起源，揭示了这些细胞的分子特征及其与原发性肿瘤和淋巴结转移的关系	样本量较小（仅6名非转移性乳腺癌患者），且部分细胞的起源仍不明确	研究乳腺癌中播散性肿瘤细胞的起源及其分子特征	非转移性乳腺癌患者的骨髓上皮样细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	基因组数据	6名非转移性乳腺癌患者的63个单细胞
65	2025-06-21	A dual-targeting strategy to inhibit colorectal cancer liver metastasis via tumor cell ferroptosis and cancer-associated fibroblast reprogramming 2025-Oct, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.025 PMID:40530415	研究论文	本文提出了一种双靶向策略，通过诱导肿瘤细胞铁死亡和重编程癌症相关成纤维细胞来抑制结直肠癌肝转移	利用单细胞转录组学鉴定关键驱动因素，并设计了一种双靶向纳米系统，同时诱导肿瘤细胞铁死亡和重编程CAFs	NA	克服结直肠癌肝转移的治疗挑战	结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞	肿瘤学	结直肠癌	单细胞转录组学	NA	NA	临床结直肠癌样本和患者来源的肿瘤异种移植人源化免疫小鼠模型
66	2025-06-21	Investigating the potential risk of cadmium exposure on Osteoporosis: An integrated multi-omics approach 2025-Aug, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118502 PMID:40517505	研究论文	本研究通过整合多组学方法探讨镉暴露对骨质疏松症的潜在风险	采用多组学数据分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化等多种方法，揭示了镉暴露与骨质疏松症的关系，并发现HMOX1作为潜在治疗靶点	研究主要基于NHANES的横断面分析，可能无法完全确定因果关系	探讨镉暴露在骨质疏松症发病机制中的作用	骨质疏松症患者及镉暴露相关基因	生物信息学	骨质疏松症	多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟	机器学习	多组学数据	NA
67	2025-06-21	Single-cell RNA sequencing analysis of intrahepatic cholangiocarcinoma reveals SPP1 facilitates disease progression via interaction with CD4+ T cells 2025-Aug, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2025.15135 PMID:40535101	研究论文	通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌，揭示SPP1通过与CD4+ T细胞相互作用促进疾病进展	首次使用单细胞RNA测序技术探索肝内胆管癌肿瘤微环境的异质性，并发现SPP1-CD44轴在肿瘤细胞与免疫细胞相互作用中的关键作用	研究未涉及SPP1-CD44轴的具体作用机制，且样本量有限	探究肝内胆管癌肿瘤微环境中CD4 T细胞的作用及其与肿瘤进展的关系	肝内胆管癌肿瘤微环境中的CD4 T细胞和肿瘤细胞	肿瘤免疫学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
68	2025-06-21	Molecular characterization of benign intracranial glioependymal and arachnoid cysts suggest heterogeneous mechanisms of action 2025-Jul-01, Journal of neuropathology and experimental neurology IF:3.2Q2 DOI:10.1093/jnen/nlaf029 PMID:40197611	研究论文	本研究对良性颅内胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿进行了分子特征分析，揭示了其不同的发病机制	首次通过单细胞测序和RNA表达谱比较，揭示了胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿具有不同的细胞特征和分子机制	样本量较小(仅16例患者)，且仅对部分样本进行了分子分析	探究良性颅内囊肿的形成和生长机制	16例接受手术治疗的良性颅内囊肿患者	神经病理学	颅内囊肿	H&E染色、免疫荧光染色、单细胞测序、RNA表达谱分析	NA	组织样本、囊肿液体、基因表达数据	16例患者(其中8例进行了病理分析，4例进行了囊肿液体分析)
69	2025-05-14	Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq 2025-Jul, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/s41576-025-00853-y PMID:40355601	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
70	2025-06-21	Comprehensive single-cell chromatin and transcriptomic profiling of peripheral immune cells in nonsegmental vitiligo 2025-Jun-20, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljaf041 PMID:39888372	研究论文	本研究通过单细胞多组学方法，分析了非节段性白癜风患者外周血免疫细胞的转录和染色质可及性，揭示了系统性免疫失调的机制	首次使用单细胞RNA测序和染色质可及性测序结合的方法，全面分析了非节段性白癜风患者的外周血免疫细胞	样本量相对较小（NSV患者11人，健康对照5人），且研究仅关注外周血免疫细胞，未直接研究皮肤病变	探究非节段性白癜风患者外周血免疫细胞的系统性免疫失调机制	非节段性白癜风患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）	免疫学	白癜风	scRNAseq, scATACseq, 光谱流式细胞术	NA	单细胞转录组数据, 染色质可及性数据	初始队列：NSV患者11人，健康对照5人；验证队列：NSV患者16人，健康对照9人
71	2025-06-21	MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173 PMID:40357547	研究论文	本研究探讨了间质巨噬细胞（iMΦ）浸润与肺动脉纤维化在肺动脉高压（PH）中的关联及其分子机制	首次发现MHCIIhiLYVE1loCCR2hi iMΦs通过WNT11/PCP通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化，导致肺动脉中膜纤维化	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证仍需进一步扩大	阐明肺动脉高压中肺动脉纤维化的细胞和分子机制	肺动脉高压患者和实验动物的肺组织样本、间质巨噬细胞和平滑肌细胞	病理生理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序、谱系追踪、组织学分析、共培养实验、转基因动物实验	Sugen-5416联合低氧-常氧刺激的PH动物模型	基因表达数据、组织学图像	未明确说明具体样本数量，包括人类患者和实验动物样本
72	2025-06-21	Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230 PMID:40365676	研究论文	通过创建一种新型的自发性主动脉夹层小鼠模型，研究内皮功能障碍和免疫浸润在主动脉夹层发病机制中的作用	首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者的FBN1基因错义变异引入小鼠模型，揭示了内皮细胞和单核/巨噬细胞在主动脉夹层起始中的相互作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	阐明主动脉夹层的分子机制	Fbn1G234D/G234D突变小鼠	心血管疾病研究	主动脉夹层	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、电子显微镜、同步辐射成像、Western blot分析	小鼠疾病模型	基因测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据	Fbn1G234D/G234D突变小鼠群体（50%在5周龄内死亡）
73	2025-06-21	SM22α-Lineage Perivascular Stromal Cells Contribute to Abdominal Aortic Aneurysm 2025-Jun-20, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325750 PMID:40371535	研究论文	本文研究了SM22α谱系血管周围基质细胞在腹主动脉瘤中的作用及其机制	揭示了SM22α谱系血管周围基质细胞中PGC-1α缺乏通过调节YAP信号通路破坏脂肪生成和肌纤维生成平衡，从而促进腹主动脉瘤发展的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究血管周围脂肪组织在腹主动脉瘤发病中的作用机制	小鼠和人类血管周围基质细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序，功能获得和缺失实验，放射组学分析	Ang II诱导和DOCA/盐诱导的小鼠AAA模型	基因表达数据，影像数据	年轻(2-3月龄)和老年(18-20月龄)小鼠，人类动脉瘤样本
74	2025-06-21	Lineage-resolved analysis of embryonic gene expression evolution in C. elegans and C. briggsae 2025-Jun-19, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adu8249 PMID:40536976	研究论文	通过单细胞RNA测序比较秀丽隐杆线虫和布氏隐杆线虫胚胎发育过程中基因表达的进化差异	利用两种线虫保守不变的胚胎谱系，系统比较了细胞类型基因表达在进化中的变化，揭示了发育基因表达进化的可能约束	仅研究了两种线虫，结果可能不适用于其他物种	探究发育过程中基因表达模式进化的约束机制	秀丽隐杆线虫(C. elegans)和布氏隐杆线虫(C. briggsae)的胚胎发育过程	发育生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两种线虫的胚胎发育过程
75	2025-06-21	Macrophages-derived NRG-1 promotes angiogenesis after ischemic stroke via the Akt-mTOR pathway 2025-Jun-19, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01323 PMID:40537024	研究论文	本研究探讨了巨噬细胞来源的NRG-1在缺血性中风后通过Akt-mTOR通路促进血管生成的作用	首次发现外周巨噬细胞是中风后NRG-1的来源，并阐明NRG-1通过Akt/mTOR/VEGF信号通路促进血管生成的神经保护机制	NRG-1的具体作用机制尚未完全阐明，临床转化潜力有待进一步验证	探究NRG-1在缺血性中风中的来源及其神经保护作用的分子机制	急性缺血性中风患者和短暂性大脑中动脉闭塞小鼠模型	神经科学	缺血性中风	单细胞测序	小鼠大脑中动脉闭塞模型	血液样本和脑组织样本	急性缺血性中风患者的配对血栓和外周血样本，以及小鼠模型
76	2025-06-21	In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate 2025-Jun-18, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.96152 PMID:40531183	研究论文	研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生	揭示了特定气味体验能选择性‘放大’特定嗅觉感觉神经元亚型，表明持续的神经元发生部分具有适应性功能	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证	探究嗅觉刺激如何及为何加速某些嗅觉感觉神经元亚型的神经发生速率	小鼠的嗅觉感觉神经元（OSNs）	神经科学	NA	scRNA-seq和亚型特异性OSN出生日期测定	NA	基因表达数据	NA
77	2025-06-21	Multidimensional bioinformatics analysis of chondrosarcoma subtypes and TGF-β signaling networks using big data approaches 2025-Jun-17, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02931-3 PMID:40526169	研究论文	通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，研究软骨肉瘤的细胞亚型、信号网络和基因表达模式，以揭示潜在的治疗靶点	首次在软骨肉瘤中应用单细胞RNA测序技术，结合机器学习模型分析细胞亚型和信号网络	样本量相对较小，且仅针对软骨肉瘤进行研究，结果可能不适用于其他类型肿瘤	解析软骨肉瘤的分子机制并寻找新的治疗靶点	临床和实验性软骨肉瘤样本	数字病理学	软骨肉瘤	scRNA-seq, UMAP/t-SNE, GSEA	机器学习模型	基因表达数据	未明确说明具体数量，包括临床和实验样本
78	2025-06-21	Exploring genetic causal relationships between spinal cord injury and glioma: a Mendelian randomization study 2025-Jun-17, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02919-z PMID:40526188	研究论文	本研究利用孟德尔随机化方法探索脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系	首次应用多种孟德尔随机化统计方法结合RNA测序数据和机器学习风险分层分析这两种疾病的遗传关联	样本量有限且仅使用四个SNPs作为工具变量，可能影响统计效力	探究脊髓损伤与胶质瘤之间的潜在遗传因果关系	脊髓损伤患者与胶质瘤患者的遗传数据	遗传流行病学	胶质瘤/脊髓损伤	孟德尔随机化(MR)、RNA测序、单细胞RNA测序	MR Egger回归/逆方差加权(IVW)/加权模式	基因组数据/基因表达数据	FinnGen R11数据集和TCGA/GEO数据库样本（具体数量未明确说明）
79	2025-06-21	Roles of ACSL4/GPX4 and FSP1 in oxalate-induced acute kidney injury 2025-Jun-17, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-025-02557-y PMID:40527896	研究论文	本研究探讨了ACSL4/GPX4和FSP1在草酸盐诱导的急性肾损伤（AKI）中的作用及其调控机制	首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析揭示了草酸盐诱导的AKI小鼠模型中肾小管细胞的铁死亡现象，并明确了ACSL4和FSP1在其中的调控作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床样本中验证	探究草酸盐诱导的急性肾损伤中铁死亡的关键调控基因及其机制	草酸盐诱导的急性肾损伤小鼠模型和鼠肾小管上皮细胞系（MTECs）	生物医学	急性肾损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	基因表达数据	NA
80	2025-06-21	A single-cell plume transcriptome atlas of the cold-seep tubeworm Paraescarpia echinospica 2025-Jun-17, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05392-z PMID:40527908	研究论文	本研究提供了深海管虫Paraescarpia echinospica羽状物的单细胞转录组图谱，为深海管虫的单细胞分辨率分析奠定了基础	首次对深海管虫Paraescarpia echinospica的羽状物进行单细胞转录组分析，揭示了六种细胞簇及其相关基因	研究仅针对一种深海管虫的羽状物，可能无法完全代表其他深海管虫或不同组织	研究深海管虫Paraescarpia echinospica羽状物的单细胞转录组，以了解其细胞组成和功能	深海管虫Paraescarpia echinospica的羽状物	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	NA