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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-07 |
Current trends in single-cell RNA sequencing applications in diabetes mellitus
2025-Nov, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70061
PMID:40537978
|
综述 | 总结单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新进展和应用 | 聚焦单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新应用趋势 | NA | 探索糖尿病发病机制并寻求新的诊断和治疗方法 | 人类胰岛细胞和免疫细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-07 |
SLGCA: spatial cross-level graph contrastive autoencoder for multislice spatial domain identification and microenvironment exploration
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf574
PMID:41182757
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研究论文 | 提出一种基于跨层级图对比学习的空间转录组数据分析方法SLGCA,用于多切片空间域识别和微环境探索 | 采用双通道学习机制,结合基于空间邻域信息的局部层级对比学习和跨视图的全局信息对比学习 | NA | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,肝癌 | 空间转录组技术 | 图对比自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-11-07 |
Globotriaosylceramide Gb3 Influences Wound Healing and Scar Formation by Orchestrating Fibroblast Heterogeneity
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509733
PMID:40810720
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研究论文 | 本研究通过整合分析发现Gb3糖脂通过HEXB-Gb3-FGF2调控轴影响成纤维细胞异质性和伤口愈合过程 | 首次揭示Gb3在皮肤损伤修复中的功能作用,发现HEXB是区分不同深度烧伤的特异性Gb3合成酶,建立了HEXB-Gb3-FGF2新型调控轴 | NA | 探究Gb3在皮肤伤口愈合和瘢痕形成中的功能机制 | 皮肤成纤维细胞,不同深度的烧伤临床标本 | 单细胞组学 | 皮肤烧伤 | 单细胞RNA测序,空间组学,脂质组学,组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据,空间组学数据,脂质组学数据,临床组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-07 |
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02734-z
PMID:40817406
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示B细胞急性淋巴细胞白血病微环境中不同的基质细胞群体及其功能 | 首次在B-ALL患者中鉴定出两种不同的间充质基质细胞群体,并发现第三种成骨谱系细胞群体,揭示了这些细胞通过不同信号通路支持白血病细胞生存和化疗耐药的新机制 | 研究主要基于儿科患者样本,样本来源相对有限,需要进一步验证在成人患者中的适用性 | 解析B细胞急性淋巴细胞白血病骨髓微环境的细胞异质性和功能特性 | 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 儿科B-ALL患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-11-07 |
The evolving nosology of myeloid neoplasms: the semi-centennial of the 1976 French-American-British classification
2025-Nov, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02746-9
PMID:40858808
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综述 | 回顾过去50年髓系肿瘤分类系统的演变历程,重点分析1976年FAB分类及其后续发展 | 从历史视角系统梳理髓系肿瘤分类学的演变,探讨新技术对疾病分类的影响 | NA | 分析髓系肿瘤分类系统的历史演变及其对临床实践的影响 | 髓系肿瘤分类系统 | NA | 髓系肿瘤 | 下一代测序技术,单细胞测序,多组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序,多组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-11-07 |
Cell Type-Specific Expression of Long Noncoding RNAs in Human Diabetic Kidneys Identifies TARID as a Key Regulator of Podocyte Function
2025-Nov-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0272
PMID:40902080
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术识别人类糖尿病肾脏中细胞类型特异性的长链非编码RNA,并发现TARID是调控足细胞功能的关键因子 | 首次在单细胞水平系统研究肾脏中lncRNA的细胞类型特异性表达,并发现TARID在足细胞中的关键功能 | 样本量较小(5名健康个体和6名DKD患者),需要在更大队列中验证发现 | 探索长链非编码RNA在糖尿病肾病中的细胞类型特异性表达和功能 | 人类肾脏样本(健康个体和糖尿病肾病患者) | 单细胞基因组学 | 糖尿病肾病 | 单核RNA测序,eQTL分析,GWAS,基因调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 11个肾脏样本(5健康+6糖尿病肾病) | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-11-07 |
Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09644-1
PMID:41193844
|
研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育过程中的高分辨率转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 通过大规模单细胞测序数据重建了视觉皮层所有细胞类型的发育轨迹图,揭示了细胞类型在不同发育阶段的连续多样化过程 | 研究仅限于小鼠视觉皮层,结果在其他脑区或物种中的普适性需要进一步验证 | 解析哺乳动物皮层细胞类型多样化的发育机制和分子逻辑 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,单核多组学测序 | 发育轨迹重建算法 | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单核Multiome测序平台 |
| 68 | 2025-11-07 |
The transcription factor LbYABBY1 of Limonium bicolor raises salt sensitivity by repressing the LbSAD2 pathway
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70560
PMID:41196280
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研究论文 | 本研究揭示了二色补血草转录因子LbYABBY1通过抑制LbSAD2通路负调控盐腺发育和盐敏感性的分子机制 | 首次发现LbYABBY1转录因子通过与LbKNAT7互作增强对LbSAD2的转录抑制,从而负调控盐腺发育 | NA | 探究LbYABBY1转录因子在盐腺发育和盐敏感性调控中的功能 | 二色补血草(Limonium bicolor)和拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 植物分子生物学 | NA | RNA原位杂交, 启动子驱动GUS组织染色, 酵母双杂交, 分裂荧光素酶互补, GST pull-down | NA | 基因表达数据, 蛋白互作数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2025-11-07 |
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome
IF:4.7Q1
DOI:10.7570/jomes25078
PMID:41094746
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和当前挑战 | 系统总结了空间转录组学如何突破单细胞测序缺乏空间信息的局限,为解析脂肪组织结构与功能提供新视角 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳分析 | 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 | 脂肪组织及其细胞组成(脂肪细胞亚群、基质祖细胞、免疫细胞等) | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,组织切片图像 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-11-07 |
Low-density lipoprotein receptor interacts with clusterin to regulate A1/A2 astrocyte polarization and ameliorate hemorrhagic brain injury
2025-Oct-30, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115539
PMID:41175961
|
研究论文 | 本研究探讨低密度脂蛋白受体通过调控星形胶质细胞极化改善脑出血损伤的机制 | 首次揭示LDLR与Clusterin相互作用调控A1/A2星形胶质细胞极化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究LDLR对脑出血后星形胶质细胞极化的影响及其分子机制 | C57BL/6J小鼠星形胶质细胞 | 神经科学 | 脑出血 | 单细胞测序, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-11-07 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞在自我更新过程中的分化延迟和休眠特征 | 首次在单细胞水平定义了具有连续多谱系造血重建能力的稀有FL-HSCs的分化延迟、细胞分裂对称性和生物合成休眠转录特征 | 研究主要依赖体外培养平台模拟内皮生态位,可能与体内真实环境存在差异 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,活细胞成像,移植实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-11-07 |
CCL26 and CXCL12 preserve insulin-sensitizing macrophages in subcutaneous adipose tissue in obesity
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116450
PMID:41100258
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研究论文 | 本研究揭示了皮下脂肪组织通过CCL26和CXCL12信号通路维持胰岛素敏感巨噬细胞从而抵抗肥胖代谢功能障碍的机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞释放的小细胞外囊泡具有改善胰岛素敏感性的功能,并阐明CCL26和CXCL12信号通路在维持驻留巨噬细胞稳态中的新作用 | NA | 探究皮下脂肪组织在肥胖中抵抗胰岛素抵抗和代谢功能障碍的保护机制 | 小鼠皮下脂肪组织和内脏脂肪组织中的巨噬细胞 | 细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-07 |
Extracellular cyclophilin a binding to CD146 is critical for Th17 cell differentiation in rheumatoid arthritis
2025-Oct-24, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.047
PMID:41137392
|
研究论文 | 本研究揭示了细胞外亲环素A通过结合CD146受体促进Th17细胞分化在类风湿关节炎发病机制中的关键作用 | 首次发现细胞外亲环素A与CD146结合通过促进CD146二聚化驱动STAT3介导的Th17细胞分化,并证明抗CypA单抗治疗效果优于抗TNF-α疗法 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类临床试验中验证 | 探索类风湿关节炎发病的新机制并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者样本、胶原诱导性和胶原抗体诱导性关节炎小鼠模型、CD4 T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、单克隆抗体治疗 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、临床数据 | 类风湿关节炎患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-11-07 |
Limited nasal IFN production contributes to delayed respiratory virus clearance and suboptimal vaccine responses
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182836
PMID:40956633
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研究论文 | 本研究揭示了鼻部干扰素产生受限导致呼吸道病毒清除延迟和疫苗应答不佳的机制 | 发现鼻部免疫环境处于静息状态,干扰素产生受限是病毒清除延迟的关键因素,并通过干扰素佐剂成功改善疫苗应答 | 主要使用小鼠模型,人类数据验证有限 | 探究鼻部免疫应答特征及其对呼吸道病毒清除和疫苗效果的影响 | 人类偏肺病毒(HMPV)感染的小鼠模型和COVID-19患者 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-11-07 |
Improving immunotherapy responses by dual inhibition of macrophage migration inhibitory factor and PD-1
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191539
PMID:41122966
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研究论文 | 本研究探讨了联合抑制巨噬细胞移动抑制因子(MIF)和PD-1在两种小鼠肿瘤模型中的免疫治疗效果 | 首次证明抗MIF疗法可增强抗PD-1免疫检查点抑制剂的抗肿瘤效果,并发现Cd74/C1q/Aif1表达巨噬细胞的抗肿瘤表型 | 研究仅限于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 评估抗MIF疗法与抗PD-1联合使用的抗肿瘤疗效 | YUMMER1.7黑色素瘤和MC38结直肠癌小鼠模型,以及人类黑色素瘤患者 | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤,结直肠癌 | scRNA-Seq,流式细胞术,免疫组织化学,细胞因子分析 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,临床数据 | 多种基因型小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-11-07 |
Unraveling enteroendocrine cell lineage dynamics and associated gene regulatory networks during intestinal development
2025-Oct-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.062083
PMID:41117135
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研究论文 | 本研究通过小鼠胚胎和人类多能干细胞来源的肠道类器官模型,结合单细胞转录组学,揭示了肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和基因调控网络 | 首次系统性地揭示了发育过程中肠道内分泌细胞亚型特化的机制,发现其独立于完整的隐窝-绒毛结构和饮食/微生物刺激 | 研究主要基于模型系统,需要进一步在体内验证;某些EEC亚型的出现机制仍需深入探索 | 阐明肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和分化机制 | 小鼠胚胎、人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 单细胞生物学 | 肠道发育疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎和人类肠道类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-11-07 |
Deciphering the crucial role of IGF2BP3 in modulating stemness traits of salivary adenoid cystic carcinoma
2025-Oct-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03068-7
PMID:41082045
|
研究论文 | 本研究揭示了IGF2BP3在调控唾液腺腺样囊性癌干细胞特性中的关键作用 | 首次系统阐明IGF2BP3通过调控干细胞特性通路影响SACC恶性表型的分子机制 | 未明确IGF2BP3调控干细胞特性的具体下游靶点 | 探究IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌中的功能作用和调控机制 | 唾液腺腺样囊性癌细胞 | 癌症生物学 | 唾液腺腺样囊性癌 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-07 |
Uncovering Cellular Interactome Drivers of Immune Checkpoint Inhibitor Response in Advanced Melanoma Patients
2025-Oct, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-025-00857-y
PMID:41185627
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据构建细胞相互作用网络,识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的网络模式 | 首次将肿瘤微环境中的细胞间相互作用建模为加权有向网络,并识别与治疗反应相关的网络模式 | 依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据,样本量有限 | 识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的细胞相互作用网络驱动因素 | 晚期黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 多元统计学习方法 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 多个黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-11-07 |
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Sep-24, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
PMID:40993310
|
综述 | 本文综述人工智能在组织学评估中的变革作用,从癌症诊断到个性化治疗的应用进展 | AI从诊断辅助工具发展为临床决策的核心组成部分,通过深度学习技术复制并增强病理学家决策,解决观察者间变异性和诊断可重复性挑战 | AI预测验证存在挑战,特别是在预后应用方面,资源有限环境中的可及性仍需解决 | 探讨人工智能在组织病理学评估中的变革作用及其在癌症诊断和个性化治疗中的应用 | 组织学评估、癌症诊断、个性化治疗 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习、空间转录组学、多模态方法 | 深度学习模型 | 全切片图像(WSIs)、基因组数据、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-07 |
CCDC137 knockdown suppresses bladder cancer progression by downregulating SCD
2025-Sep-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07033-w
PMID:40993629
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证揭示了CCDC137在膀胱癌中的促癌作用及其通过调控SCD影响肿瘤进展的机制 | 首次系统表征CCDC137在膀胱癌中的表达模式和功能,发现其通过调控脂代谢酶SCD影响肿瘤进展 | 未明确CCDC137调控SCD的具体分子机制,缺乏临床前药物开发验证 | 探究CCDC家族基因在膀胱癌中的临床意义和功能机制 | 膀胱癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 机器学习算法、RNA测序、定量RT-PCR、蛋白质印迹 | 预后模型 | 多组学数据、单细胞测序、空间转录组 | TCGA-BLCA队列及组织微阵列样本 | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |