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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7961 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and analysis of rodent blood stage Plasmodium
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102491
PMID:37581982
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研究论文 | 本文提供了一种利用单细胞RNA测序技术分析啮齿动物血液阶段疟原虫发育阶段特异性基因表达调控的方案 | 首次应用单细胞RNA测序技术于疟原虫血液阶段研究,克服了传统批量RNA测序无法区分发育阶段特异性基因调控的局限 | NA | 建立疟原虫血液阶段发育特异性基因表达分析的方法学 | 啮齿动物血液阶段的疟原虫(Plasmodium chabaudi chabaudi AS)感染的红色血细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,FACS分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7962 | 2025-10-06 |
Isolation of Thymus Stromal Cells from Human and Murine Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2679-5_13
PMID:36255703
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研究方法论文 | 详细介绍从人类和小鼠组织中分离胸腺基质细胞的方法学 | 提供了针对胸腺基质细胞分离优化的组织解离方案 | NA | 开发胸腺基质细胞分离方法以支持下游分析 | 人类和小鼠的胸腺组织 | 单细胞分析 | 免疫系统疾病 | 组织解离、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7963 | 2025-10-06 |
Molecular mapping of interstitial lung disease reveals a phenotypically distinct senescent basal epithelial cell population
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.143626
PMID:33705361
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研究论文 | 本研究通过分子图谱分析揭示了间质性肺病中表型独特的衰老基底上皮细胞群体 | 首次在ILD中识别出具有独特表型的衰老基底上皮细胞群体,并建立了肺上皮细胞特异性衰老转录特征 | 缺乏功能性研究验证,人类肺组织样本中环境特异性细胞衰老特征分析工具不足 | 阐明间质性肺病中衰老细胞的起源和特征 | 特发性肺纤维化(IPF)和系统性硬化相关间质性肺病(SSc-ILD)的肺组织 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,体外模型 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 对照、IPF和SSc-ILD肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7964 | 2025-10-06 |
Overcoming immunotherapy resistance in colorectal cancer through nano-selenium probiotic complexes and IL-32 modulation
2025-Sep, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种新型纳米硒益生菌复合物,通过调节IL-32增强CD8+ T细胞免疫应答,克服结直肠癌免疫治疗耐药性 | 首次将硒纳米颗粒负载的细胞外囊泡与工程化益生菌及IL-32结合,创建了新型纳米生物材料复合物 | 研究主要基于人源化异种移植小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发克服结直肠癌免疫治疗耐药性的新策略 | 结直肠癌患者样本和人源化小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,电子显微镜,动态光散射 | 人源化异种移植小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,图像数据 | 免疫治疗耐药结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7965 | 2025-10-06 |
Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer
2025-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24200
PMID:38476085
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序探索胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞异质性,并鉴定分泌性白细胞蛋白酶抑制剂作为胰腺癌致癌基因 | 首次在胰腺癌中通过单细胞测序识别八个细胞亚群,发现SPPI和血管内皮生长因子相关通路在不同细胞中的激活,并鉴定SLPI作为新的治疗靶点 | 未提及样本量大小和研究队列特征,功能验证实验可能不够充分 | 探索胰腺癌肿瘤微环境的细胞异质性并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌肿瘤微环境中的各类细胞(上皮细胞、髓系细胞、癌症相关成纤维细胞等) | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7966 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Exploring the tumor microenvironment: Chemokine-related genes and immunotherapy/chemotherapy response in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24190
PMID:38488671
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研究论文 | 本研究通过构建趋化因子相关基因预后模型,探索了透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境对免疫治疗和化疗反应的影响 | 首次基于趋化因子相关基因构建ccRCC预后模型,并鉴定IGF2BP3作为舒尼替尼耐药的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 识别趋化因子相关基因并构建透明细胞肾细胞癌的预后模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和786-O、A498细胞系 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, CCK-8, Western blot, RT-qPCR | 预后风险模型 | 转录组数据, 单细胞数据 | 531例批量转录组数据, GSE159115单细胞数据集及其他验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
7967 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of diquat-induced oxidative stress and its impact on organ-specific toxicity
2025-Jun-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118246
PMID:40327929
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示敌草快中毒诱导的氧化应激微环境在多器官损伤中的核心作用 | 首次构建敌草快中毒多器官单细胞图谱,揭示氧化应激微环境通过调控细胞死亡和代谢重编程加剧组织损伤的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,缺乏人类临床样本验证 | 探究敌草快中毒诱导多器官损伤的分子机制 | 敌草快中毒小鼠的肺、肝、肾器官细胞 | 单细胞组学 | 中毒性器官损伤 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过270,000个小鼠细胞,包含10小时、20小时、36小时三个时间点及对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7968 | 2025-10-06 |
Hypoxia-induced RHCG as a key regulator in psoriasis and its modulation by secukinumab
2025-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250742
PMID:40351602
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的RHCG在银屑病发病机制中的关键调控作用及其被苏金单抗调节的机制 | 首次发现RHCG在银屑病皮损中显著上调且受缺氧诱导,并阐明其通过调控角质形成细胞标志物和CXCL14分泌参与免疫细胞活化的新机制 | RHCG在银屑病中的具体信号通路机制尚未完全阐明 | 阐明RHCG在银屑病发病机制中的生物学功能及其治疗意义 | 银屑病患者皮肤标本、角质形成细胞、树突状细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 空间转录组学分析、单细胞转录组学分析、批量数据分析 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床银屑病皮肤标本 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
7969 | 2025-05-14 |
Epigenetic dynamics and molecular mechanisms in oncogenesis, tumor progression, and therapy resistance
2025-May-13, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04217-5
PMID:40358685
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综述 | 本文综述了癌症进展中遗传、表观遗传和分子机制的动态相互作用,重点关注致癌基因和肿瘤抑制基因的遗传改变、表观遗传修饰及其对肿瘤发生、发展和治疗抵抗的影响 | 整合了分子、遗传和表观遗传视角,强调了创新靶向治疗方法的必要性,并探讨了CRISPR-Cas9介导的表观基因组编辑和单细胞RNA测序等前沿技术在癌症研究中的应用 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或临床验证 | 探讨癌症发生、发展和治疗抵抗的分子机制,为开发更有效的治疗方法提供理论基础 | 癌症细胞及其微环境 | 肿瘤生物学 | 癌症 | CRISPR-Cas9介导的表观基因组编辑、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7970 | 2025-05-14 |
Multi-omics Analysis Reveals the Propagation Mechanism of Ferroptosis in Acute Kidney Injury
2025-May-13, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02311-7
PMID:40358793
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了急性肾损伤中铁死亡的传播机制 | 首次揭示了GPX4、FTH1和FTL基因在急性肾损伤中铁死亡传播中的关键作用,并发现KLF6作为铁死亡相关基因的抑制因子 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本数据,需要在更大规模的人类研究中验证 | 探究急性肾损伤中铁死亡的传播机制 | 急性肾损伤患者的肾脏组织和双侧肾缺血再灌注损伤小鼠模型 | 生物医学 | 急性肾损伤 | snRNA-seq、空间转录组学、染色质可及性分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量,包括AKI患者和健康人的肾脏组织以及小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
7971 | 2025-10-06 |
Inhibition of DOCK1 suppresses Notch signalling pathway and impairs leukaemogenesis
2025-May-12, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.20140
PMID:40355246
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研究论文 | 本研究揭示了DOCK1通过调控Notch信号通路促进急性髓系白血病发生发展的机制 | 首次系统阐明DOCK1在AML中的致病作用及其通过Notch信号通路调控白血病干细胞功能的机制 | 研究主要基于临床样本分析和动物模型,需要进一步验证在人类原代AML细胞中的适用性 | 探究DOCK1在急性髓系白血病中的病理作用及其分子机制 | 341名新发非M3型AML患者、白血病细胞系、异种移植模型和Dock1条件性基因敲除小鼠 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲除技术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 341名AML患者、多种细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7972 | 2025-10-06 |
High-resolution spatial transcriptomics and cell lineage analysis reveal spatiotemporal cell fate determination during craniofacial development
2025-May-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59206-2
PMID:40355462
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研究论文 | 通过高分辨率空间转录组学和细胞谱系分析揭示颅面发育过程中细胞命运决定的时空动态 | 首次构建了小鼠腭发育过程中颅神经嵴细胞来源间充质谱系分化的高分辨率时空转录组图谱,并发现Sox9+异质性间充质祖细胞群在腭发育起始前就已激活早期谱系特异性标记 | 研究局限于小鼠模型,需要进一步验证在人类发育中的适用性 | 解析颅面发育过程中细胞命运决定的分子机制 | 小鼠颅神经嵴细胞来源的间充质细胞 | 空间转录组学 | 发育生物学 | 空间转录组学,细胞谱系追踪 | NA | 空间转录组数据 | E12.5至E15.5胚胎期小鼠组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
7973 | 2025-05-14 |
Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq
2025-May-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00853-y
PMID:40355601
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7974 | 2025-10-06 |
IL-11/IL-11R signal inhibition by 9MW3811 remodels immune tumor microenvironment and enhances anti-tumor efficacy of PD-1 blockade
2025-May-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00913-w
PMID:40355638
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研究论文 | 介绍一种靶向IL-11信号通路的单克隆抗体9MW3811,通过重塑肿瘤免疫微环境增强PD-1阻断疗法的抗肿瘤效果 | 首次证明9MW3811可通过调节XCL1和CCL7逆转T细胞耗竭,并与抗PD-1疗法产生协同作用,即使在PD-1无应答模型中仍有效 | 目前研究仅限于小鼠模型,临床疗效尚待验证 | 开发靶向IL-11信号通路的抗肿瘤治疗策略 | IL-11/IL-11R信号通路和肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7975 | 2025-10-06 |
INHBA+ macrophages and Pro-inflammatory CAFs are associated with distinctive immunosuppressive tumor microenvironment in submucous Fibrosis-Derived oral squamous cell carcinoma
2025-May-12, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14261-2
PMID:40355814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌具有独特的免疫抑制肿瘤微环境 | 首次发现INHBA+巨噬细胞和促炎性癌症相关成纤维细胞在ODSCC中的特异性富集及其通过INHBA-ACVR信号通路调节Treg细胞的机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证INHBA信号通路的具体作用机制 | 阐明口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌中肿瘤免疫抑制微环境的细胞组成和调控网络 | 口腔鳞状细胞癌组织样本,包括OSF衍生的ODSCC和非OSF衍生的NODSCC | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 来自GEO数据库的scRNA-seq和ST数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
7976 | 2025-10-06 |
Integrated bioinformatic analysis identifies GADD45B as an immune-related prognostic biomarker in skin cutaneous melanoma
2025-May-11, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00437-0
PMID:40350499
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研究论文 | 通过整合多组学数据分析发现GADD45B是皮肤黑色素瘤中与免疫相关的预后生物标志物 | 首次系统揭示GADD45B在皮肤黑色素瘤中的免疫调节功能及其作为新型免疫检查点的潜力 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,临床验证仍需进一步开展 | 探究GADD45B在皮肤黑色素瘤中的生物学功能和临床意义 | 皮肤黑色素瘤患者数据、细胞系和小鼠模型 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序、单细胞分析、功能富集分析、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据 | 26个SKCM相关数据集、30个人类SKCM细胞系、29个SKCM细胞系表型特征 | NA | 转录组测序,单细胞分析 | NA | NA |
7977 | 2025-10-06 |
Anti-Müllerian hormone signalling sustains circadian homeostasis in zebrafish
2025-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59528-1
PMID:40348785
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研究论文 | 本研究揭示了抗缪勒氏管激素(Amh)信号通路在维持斑马鱼昼夜节律稳态中的关键作用 | 首次发现Amh-Bmpr2a/Bmpr1bb-Smad1/5/9信号轴通过调控垂体细胞群时钟基因表达来维持昼夜节律稳态 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的保守性尚未验证 | 探索维持昼夜节律稳态的关键信号通路 | 斑马鱼及其垂体细胞群 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析,基因敲除 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7978 | 2025-10-06 |
Air pollutants and lung regeneration: impact on the fate of lung stem cells
2025-May-09, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109525
PMID:40354720
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综述 | 本文综述了空气污染物对肺干细胞命运的影响及其在肺再生中的作用机制 | 从组织再生视角探讨吸入污染物与肺干细胞的相互作用,并引入类器官和单细胞测序技术的新研究方法 | NA | 阐明空气污染物如何影响肺干细胞的再生能力,为预防和控制相关肺疾病提供策略 | 肺上皮-黏膜屏障中的区域特异性干细胞(气道和肺泡关键干细胞) | 毒理学与再生医学 | 肺疾病 | 单细胞测序、类器官培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7979 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for clustering and hidden driver inference from single-cell transcriptomics data
2025-May-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59620-6
PMID:40341143
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研究论文 | 介绍了一个基于互信息的单细胞转录组数据分析框架scMINER,用于细胞聚类和隐藏驱动因子推断 | 开发了首个基于互信息的集成框架,在细胞聚类和网络推断方面优于现有方法,特别擅长区分密切相关的细胞群体和揭示T细胞耗竭等关键转录因子驱动因子 | NA | 解决单细胞转录组数据的随机性和稀疏性带来的分析挑战 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,CROP-seq | 互信息框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
7980 | 2025-10-06 |
Patient-derived models of UBA5-associated encephalopathy identify defects in neurodevelopment and highlight potential therapeutic avenues
2025-May-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn8417
PMID:40333994
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研究论文 | 本研究建立了UBA5相关脑病患者来源的皮质类器官模型,揭示了神经发育缺陷并探索了潜在治疗方法 | 首次开发了UBA5相关脑病的人类神经元模型,通过单细胞RNA测序发现GABA能中间神经元发育缺陷,并评估了两种增强UBA5蛋白表达的潜在治疗策略 | 研究仅基于两名患者的样本,样本量较小 | 研究UBA5基因变异导致的脑病发病机制并探索潜在治疗方法 | UBA5相关脑病患者来源的皮质类器官和工程化U87-MG细胞 | 神经科学 | 脑病 | 单细胞RNA测序,CRISPRa,SINEUP技术 | 类器官模型 | RNA测序数据,电生理数据 | 两名UBA5相关脑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |