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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7941 | 2025-10-06 |
Alpha-1 adrenergic signaling drives cardiac regeneration via extracellular matrix remodeling transcriptional program in zebrafish macrophages
2023-11-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.011
PMID:37875117
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研究论文 | 本研究揭示了α-1肾上腺素能信号通过调控巨噬细胞表型分化激活细胞外基质重塑转录程序,从而驱动斑马鱼心脏再生的机制 | 首次发现α-1肾上腺素能受体通过调控巨噬细胞表型分化激活细胞外基质重塑程序,并阐明其通过midkine介导的旁分泌信号激活胶原-12表达成纤维细胞的分子机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物系统中验证 | 探究肾上腺素能信号在心脏修复过程中调控免疫反应和再生能力的分子机制 | 斑马鱼心脏再生模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,药理学干预,遗传操作 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7942 | 2025-10-06 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on Clinical Manifestation, Immune Response, and Viral Dynamics in SARS-CoV-2 Coinfection
2023-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.15.567132
PMID:38014096
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研究论文 | 本研究探讨SIV诱导的免疫缺陷对SARS-CoV-2共感染的临床表现、免疫反应和病毒动态的影响 | 首次在受控环境中直接研究慢性SIV感染导致的免疫缺陷对COVID-19疾病和病毒持续性的影响 | 样本量较小(仅2只猪尾猕猴),属于初步研究 | 评估免疫缺陷状态下SARS-CoV-2共感染的临床和病毒学特征 | 慢性感染SIVmac239的猪尾猕猴 | 传染病学 | HIV/AIDS, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床观察数据 | 2只SIV感染的猪尾猕猴,与先前发表的SIV未感染队列比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7943 | 2025-05-15 |
Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease
2025-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04700-3
PMID:39890696
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点 | 首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应,并识别出五个潜在药物靶点 | 需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性 | 探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS | NA | 基因表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
7944 | 2025-05-15 |
A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Jun, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.14397
PMID:39988467
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研究论文 | 通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应 | 利用单细胞转录组学等多组学方法,首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制 | 研究样本量较小,仅包含两名患者的数据 | 评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应 | 两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | DNA和RNA数据 | 两名患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
7945 | 2025-10-06 |
Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9
2025-May-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003104
PMID:38945689
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研究论文 | 本研究揭示了迷走神经通过调控巨噬细胞产生CXCL9参与慢加急性肝衰竭发展的神经免疫通讯机制 | 首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯在ACLF发展中的关键作用 | 动物模型与人类疾病存在差异,临床转化需要进一步验证 | 探索ACLF发病机制中的关键分子及迷走神经与免疫紊乱的神经免疫通讯 | ACLF模型小鼠和ACLF患者 | 免疫学 | 肝病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,免疫荧光,CRISPR/Cas9技术 | 动物模型 | 蛋白质组学数据,单细胞转录组数据,病理图像 | ACLF模型小鼠和ACLF患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | NA |
7946 | 2025-05-15 |
MS4A7 based metabolic gene signature as a prognostic predictor in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1591446
PMID:40356720
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研究论文 | 本研究探讨了MS4A7基因在肺腺癌预后和免疫微环境动态中的作用,并开发了一个基于代谢基因的预后预测模型 | 首次将MS4A7基因与肺腺癌的预后和免疫微环境动态联系起来,并开发了一个高预测准确性的预后模型 | 研究依赖于TCGA数据库的RNA-seq数据,可能无法完全代表所有肺腺癌患者的异质性 | 探索MS4A7基因在肺腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 肺腺癌患者和MS4A7基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归 | RNA-seq数据 | 500名肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
7947 | 2025-05-15 |
Single-cell transcriptomics and functional validation revealed PLEKHA5-L as a promoter of growth and migration in brain metastatic melanoma cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1560954
PMID:40356756
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和功能验证揭示了PLEKHA5-L作为促进脑转移黑色素瘤细胞生长和迁移的分子 | 首次在单细胞水平上发现PLEKHA5在脑转移黑色素瘤中的表达增加,并验证了PLEKHA5-L通过上调HRAS、AKT3等癌基因促进黑色素瘤的迁移和增殖 | 样本量较小(7个黑色素瘤样本),且仅在动物模型中验证了PLEKHA5的表达 | 研究促进黑色素瘤脑转移的分子机制,寻找潜在的治疗靶点 | 黑色素瘤细胞,特别是脑转移的黑色素瘤细胞 | 癌症研究 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,RNA干扰,慢病毒载体过表达,CCK8测试,集落形成测试,transwell小室实验,RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 7个黑色素瘤样本(4个原发,3个脑转移) | NA | NA | NA | NA |
7948 | 2025-05-15 |
An immune cell activation signature reflected hepatocellular carcinoma heterogeneity and predicted clinical outcomes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534611
PMID:40356904
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研究论文 | 本研究开发了一个六基因特征,用于预测肝细胞癌(HCC)患者的预后,并探讨了候选基因RORC在HCC进展中的作用 | 开发了一个新的六基因特征,能够有效预测HCC患者的预后,并揭示了候选基因RORC在HCC进展中的调控机制及其与多药耐药性的关联 | 研究依赖于公共数据集进行验证,可能受到数据质量和样本量的限制 | 识别可靠的免疫激活相关预后标志物,以预测HCC患者的临床结果 | 肝细胞癌(HCC)患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 基因表达分析、单细胞测序、免疫组化(IHC) | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、免疫组化数据 | 三个独立的GEO数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
7949 | 2025-05-15 |
Identification of B cell antigens in solid cancer: initial insights and functional implications
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571570
PMID:40356924
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review | 本文综述了B细胞在实体癌中的抗原识别及其功能意义 | 强调了B细胞抗原在癌症免疫反应中的重要性,并利用单细胞测序技术进行抗原特异性研究 | NA | 探索B细胞在癌症中的抗原识别及其功能 | B细胞抗原 | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序、重组单克隆抗体生产、癌症结合筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7950 | 2025-05-15 |
Exploring WNT pathway dysregulation in serrated colorectal cancer for improved diagnostic and therapeutic strategies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1586867
PMID:40357363
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研究论文 | 本研究探讨了WNT通路在锯齿状结直肠癌(SCC)中的异常调控,旨在通过多组学数据开发一种WNT驱动的分型模型以识别SCC患者 | 整合了批量数据和单细胞数据到多组学框架中,开发了WNT驱动的分型模型,并探索了针对SCC的潜在药物靶点 | 研究中使用的样本量虽然较大,但SCC作为一种罕见亚型,样本代表性可能有限 | 探索WNT通路在结直肠癌中的改变,开发识别SCC患者的分型模型 | 1751例结直肠癌患者的多组学数据和33例正常及癌组织的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞转录组测序 | 无监督聚类模型 | 基因组数据,转录组数据 | 1751例结直肠癌患者(来自TCGA和GEO数据库),33例正常和癌组织(来自SMC研究队列) | NA | NA | NA | NA |
7951 | 2025-05-15 |
Single-cell transcriptomic construction of fibroblast score for analysis of immune infiltration in primary and metastatic ovarian cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1549541
PMID:40357367
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据构建成纤维细胞评分,分析原发性和转移性卵巢癌中的免疫浸润 | 构建了一种新的成纤维细胞评分(Fib score),并发现TIMP3通过调控CXCL12/CXCR4信号轴影响卵巢癌的预后、免疫抑制和耐药性 | 研究仅基于单细胞转录组数据,未进行实验验证 | 探索原发性和转移性卵巢癌中的免疫浸润及成纤维细胞差异标志物在卵巢癌免疫调节中的作用 | 原发性和转移性卵巢癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | COX单因素分析 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7952 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2024-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.601561
PMID:39005414
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术,识别出再生原基中的13个不同细胞群,并发现至少4种新的前体细胞群 | 研究局限于海参这一特定物种,分子机制仍需进一步验证 | 探究海参肠道再生过程中再生原基细胞的分子特征和分化潜能 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HCR-FISH分析 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光原位杂交图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7953 | 2025-10-06 |
Cancer-specific innate and adaptive immune rewiring drives resistance to PD-1 blockade in classic Hodgkin lymphoma
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54512-7
PMID:39737927
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间分析揭示了经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制 | 首次发现循环和肿瘤浸润的IL1β单核细胞/巨噬细胞群在cHL患者中的特异性存在及其与PD-1阻断耐药性的关联 | 样本来源和数量未明确说明,需要进一步验证外周血检测的临床实用性 | 阐明经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制和耐药性原因 | 经典霍奇金淋巴瘤患者和健康供体的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
7954 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-induced severe epidermal necrolysis mediated by macrophage-derived CXCL10 and abated by TNF blockade
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54180-7
PMID:39737932
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂诱导的严重表皮坏死松解症的发病机制 | 首次发现巨噬细胞来源的CXCL10在ICI-SJS/TEN发病机制中的关键作用,并证实TNF阻断可有效治疗该病症 | 样本量较小(仅25例患者),需要更大规模研究验证 | 探究免疫检查点抑制剂诱导严重皮肤不良反应的分子机制和治疗方法 | 免疫检查点抑制剂诱导的Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症患者 | 单细胞测序分析 | 皮肤不良反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个队列共25例ICI诱导SJS/TEN患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7955 | 2025-10-06 |
Monocyte Invasion into the Retina Restricts the Regeneration of Neurons from Müller Glia
2024-Nov-13, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0938-24.2024
PMID:39353729
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研究论文 | 本研究揭示外周免疫系统中的单核细胞通过浸润受损视网膜并分泌骨桥蛋白抑制Müller胶质细胞的神经再生能力 | 首次发现外周免疫系统(单核细胞)是中枢神经系统再生的屏障,并鉴定出骨桥蛋白是抑制神经再生的关键细胞因子 | 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探索限制哺乳动物视网膜神经元再生的机制 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和浸润的单核细胞 | 神经再生 | 视网膜疾病 | scRNA-seq(单细胞RNA测序) | CCR2基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 不同性别的CCR2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7956 | 2025-10-06 |
Identification and Analysis of Biomarkers Associated with Lipophagy and Therapeutic Agents for COVID-19
2024-06-07, Viruses
DOI:10.3390/v16060923
PMID:38932215
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与脂噬相关的COVID-19生物标志物和潜在治疗药物 | 首次系统研究脂噬相关基因在COVID-19中的作用,并发现7个脂噬相关基因作为生物标志物和药物靶点 | 基于生物信息学分析的预测结果需要实验验证 | 研究脂噬相关生物标志物和基于脂噬的COVID-19治疗药物 | COVID-19患者基因表达数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习 | 随机森林,支持向量机,广义线性模型,极限梯度提升 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE145926,GSE183533,GSE190496) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
7957 | 2025-10-06 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化程序 | 发现了新生儿肺间充质细胞的新亚型,包括能够分化为成熟肺泡肌成纤维细胞的未成熟祖细胞 | NA | 研究新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化机制 | 新生小鼠肺组织中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞分选,原代细胞培养,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7958 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学筛选胰腺癌表面受体靶点,开发靶向紧密连接蛋白claudin-4的分子成像诊疗剂 | 首次通过空间转录组学数据驱动筛选发现claudin-4作为胰腺癌诊疗靶点,开发了特异性肽类分子成像剂 | NA | 开发胰腺癌分子成像和诊疗新方法 | 胰腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 分子成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
7959 | 2025-10-06 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
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研究论文 | 提出一种分析结核分枝杆菌感染小鼠肺部单细胞RNA测序数据的标准化流程 | 开发了专门针对肺部淋巴细胞群体的单细胞RNA测序数据分析流程,特别针对感染与健康状态的比较分析 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,依赖已处理数据而非原始数据 | 建立标准化分析流程以解析肺部淋巴细胞在结核感染中的变化 | 健康与结核分枝杆菌感染小鼠的肺部淋巴细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7960 | 2025-10-06 |
Protocol for identifying immune checkpoint on circulating tumor cells of human pancreatic ductal adenocarcinoma by single-cell RNA sequencing
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102539
PMID:37659082
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研究论文 | 本文介绍了一种通过单细胞RNA测序识别胰腺导管腺癌循环肿瘤细胞上免疫检查点的实验方案 | 开发了从胰腺导管腺癌肝转移患者中分离循环肿瘤细胞并进行单细胞RNA测序以识别免疫检查点的标准化流程 | NA | 建立有效的免疫治疗方案以预防肿瘤转移 | 胰腺导管腺癌肝转移患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |