单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7921 - 7940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7921 | 2025-10-06 |
Pulmonary Myeloid Cells in Mild Cases of COVID-19 Upregulate the Intracellular Fc Receptor TRIM21 and Transcribe Proteasome-Associated Molecules
2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062769
PMID:40141410
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析轻症COVID-19患者肺髓样细胞中TRIM21及其下游信号通路的转录特征 | 首次发现轻症COVID-19患者肺髓样细胞中胞内Fc受体TRIM21转录上调并表达蛋白酶体相关分子，而炎症分支通路被沉默 | 研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平和功能验证 | 探究COVID-19不同严重程度患者肺免疫细胞中Fc受体及其下游信号通路的转录特征 | 健康个体和轻症、重症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和轻症、重症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7922 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveal a Novel Prognostic Signature of Combining Cuproptosis- and Ferroptosis-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062779
PMID:40141422
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个结合铜死亡和铁死亡相关基因的肝细胞癌预后特征模型 | 首次将铜死亡和铁死亡相关基因结合构建预后特征模型，并通过单细胞测序数据验证其与肿瘤微环境的关联 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌的预后预测模型和治疗策略 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 共识聚类分析, 主成分分析, 多变量COX回归分析, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7923 | 2025-10-06 |
Diverse Subsets of γδT Cells and Their Specific Functions Across Liver Diseases
2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062778
PMID:40141420
|
综述 | 本文系统阐述了γδT细胞在不同肝脏疾病中的功能多样性及其治疗潜力 | 整合单细胞测序和空间转录组学最新发现，揭示γδT细胞亚群（Vδ1/Vδ2/γδT17）在肝脏疾病中的特异性功能 | γδT细胞的功能多样性和调控机制尚未完全阐明 | 探讨γδT细胞在肝脏疾病发病机制中的作用及免疫治疗应用前景 | γδT细胞及其亚群（Vδ1、Vδ2、γδT17等） | 免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 7924 | 2025-10-06 |
Inflammatory Transformation of Skin Basal Cells as a Key Driver of Cutaneous Aging
2025-Mar-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062617
PMID:40141258
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和GWAS数据揭示了皮肤衰老过程中角质形成细胞的异质性和炎症转化机制 | 首次发现基底细胞在衰老过程中可向棘状分化或炎症状态两个不同路径分化，并识别出IFI27角质形成细胞亚群在衰老过程中的关键作用 | 研究主要基于测序数据分析，需要进一步的实验验证 | 探究皮肤衰老过程中角质形成细胞的异质性和发育轨迹 | 皮肤角质形成细胞亚群 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞测序, 转录组学, 全基因组关联研究(GWAS) | 单细胞伪时间分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7925 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Molecular Mechanisms in Rapid Antler Osteogenesis During Growth and Ossification Stages
2025-Mar-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062642
PMID:40141284
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究梅花鹿鹿角在生长和骨化阶段的快速成骨分子机制 | 首次在鹿角生长和骨化阶段进行单细胞水平分析，识别了8种细胞类型及其分子特征 | NA | 探究快速成骨的分子调控机制 | 梅花鹿鹿角组织 | 单细胞组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台 |
| 7926 | 2025-10-06 |
Impact of Peripheral Inflammation on Blood-Brain Barrier Dysfunction and Its Role in Neurodegenerative Diseases
2025-Mar-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062440
PMID:40141084
|
综述 | 探讨外周炎症通过血脑屏障功能障碍在神经退行性疾病中的作用机制 | 系统阐述肠-脑轴与血脑屏障完整性的关联，强调区域特异性血脑屏障异质性对神经退行过程的影响 | 关于血脑屏障功能障碍的精确分子机制仍存在关键知识空白 | 阐明外周炎症、肠道微生物群与血脑屏障功能障碍在神经退行性疾病中的分子机制联系 | 血脑屏障、外周炎症过程、肠道微生物群、神经退行性疾病（阿尔茨海默病和帕金森病） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、器官芯片模型 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7927 | 2025-10-06 |
Construction of T-Cell-Related Prognostic Risk Models and Prediction of Tumor Immune Microenvironment Regulation in Pancreatic Adenocarcinoma via Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq
2025-Mar-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062384
PMID:40141028
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了胰腺腺癌T细胞相关预后风险模型并预测肿瘤免疫微环境调控 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建基于T细胞标记基因的胰腺癌预后风险模型，并验证其与免疫治疗效果的关联 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性验证队列 | 开发胰腺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗效果 | 胰腺腺癌患者及其肿瘤免疫微环境中的T细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7928 | 2025-10-06 |
scSAMAC: saliency-adjusted masking induced attention contrastive learning for single-cell clustering
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf128
PMID:40131310
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞聚类的新型深度学习方法scSAMAC，通过整合对比学习和负二项式损失来提升聚类性能 | 开发了基于基因特征显著性调整的负样本生成掩码模块，并结合软k均值损失、Wasserstein距离和对比损失的新型损失函数 | NA | 解决单细胞数据高维度、稀疏性和dropout事件带来的聚类挑战 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 变分自编码器(VAE), 对比学习, 多头注意力机制 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7929 | 2025-10-06 |
The Spatial Transcriptomic Atlas of Human Limbus and Vital Niche Microenvironment Regulating the Fate of Limbal Epithelial Stem Cells
2025-Mar-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.3.52
PMID:40131296
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组技术构建了人眼角膜缘空间图谱，揭示了角膜缘上皮干细胞与微环境之间的相互作用 | 首次绘制人眼角膜缘空间转录组图谱，发现GPHB5作为角膜缘上皮干细胞潜在新生物标志物，揭示COL6A2/CD44信号通路在细胞间通讯中的关键作用 | 样本数量有限，需要进一步验证GPHB5作为生物标志物的功能 | 构建人眼角膜缘空间转录组图谱，研究角膜缘上皮干细胞与微环境的相互作用机制 | 人眼角膜缘组织及其中包含的各种细胞类型 | 空间转录组学 | 眼科疾病 | 空间转录组技术，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 每个样本包含400多个检测点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Genomics Space Ranger | 10x Genomics空间转录组平台 |
| 7930 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Analysis of Epoxide Hydrolase 2 (EPHX2) in Pan-Cancer
2025-Mar, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70188
PMID:40129060
|
研究论文 | 通过生物信息学方法全面分析EPHX2在泛癌中的表达特征、预后价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次在泛癌水平系统评估EPHX2的诊断预后价值及其与免疫浸润的关联，并探索其作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于qPCR在癌细胞系中的表达验证 | 阐明EPHX2在人类恶性肿瘤中的作用机制及其在肿瘤免疫微环境中的功能 | 33种人类肿瘤类型及多种癌细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 生物信息学分析，qPCR，基因集变异分析(GSVA)，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，临床预后数据，免疫细胞浸润数据 | 33种肿瘤类型的多组学数据 | NA | 单细胞测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7931 | 2025-10-06 |
Identification of RCC2 as a Risk Gene Associated With Basal Cell Carcinoma and Experimental Validation
2025-Mar, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70082
PMID:40129067
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化分析鉴定出与基底细胞癌风险相关的RCC2基因，并通过体外实验验证其功能 | 首次将RCC2基因鉴定为基底细胞癌的风险基因，并通过单细胞转录组分析和体外功能实验验证 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 鉴定基底细胞癌的新风险基因并验证其功能 | 基底细胞癌患者数据和A431细胞系 | 生物信息学 | 皮肤癌 | 孟德尔随机化分析, eQTL, mQTL, pQTL, 单细胞转录组分析, 基因沉默 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 蛋白质组数据 | GEO数据库中的基底细胞癌队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 7932 | 2025-10-06 |
Identification and validation of m6A RNA methylation and ferroptosis-related biomarkers in sepsis: transcriptome combined with single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543517
PMID:40124361
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序技术识别并验证了脓毒症中m6A RNA甲基化和铁死亡相关的生物标志物 | 首次将m6A RNA甲基化与铁死亡机制结合研究脓毒症，并在单细胞水平验证生物标志物的表达 | 研究依赖于公共数据库数据，临床样本验证范围有限 | 识别和验证脓毒症中m6A RNA甲基化和铁死亡相关的生物标志物 | 脓毒症患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | 机器学习, WGCNA, ROC分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 未明确具体样本数量，包含公共数据库数据和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 7933 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the oncogenic role of ANXA5 in gastric cancer and its association with drug resistance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562395
PMID:40124374
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示ANXA5在胃癌中的致癌作用及其与耐药性的关联 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序识别MUC5AC+恶性上皮细胞亚群在胃癌侵袭和EMT中的关键作用，并验证ANXA5的致癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索胃癌恶性上皮细胞亚群及其在肿瘤进展和耐药性中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,肿瘤突变负荷分析 | 预后模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和OMIX001073数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 7934 | 2025-10-06 |
TGF-β-mediated activation of fibroblasts in cervical cancer: implications for tumor microenvironment and prognosis
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19072
PMID:40124621
|
研究论文 | 本研究探讨TGF-β信号通路在宫颈癌相关成纤维细胞中的激活作用及其对肿瘤微环境和预后的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示TGF-β信号在成纤维细胞中的激活机制，并构建基于三个基因的预后预测模型 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 阐明TGF-β信号通路在宫颈癌肿瘤微环境中的作用机制 | 宫颈癌患者肿瘤微环境中的细胞类型，特别是癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，实时定量PCR，细胞功能实验 | Cox回归模型，LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，临床数据 | TCGA-CESC数据集及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7935 | 2025-10-06 |
AQP1 Affects Necroptosis by Targeting RIPK1 in Endothelial Cells of Atherosclerosis
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S487327
PMID:40129682
|
研究论文 | 本研究揭示AQP1通过靶向RIPK1抑制内皮细胞坏死性凋亡从而影响动脉粥样硬化斑块稳定性 | 首次发现AQP1通过结合RIPK1并抑制RIPK3/MLKL表达来调控内皮细胞坏死性凋亡的新机制 | 研究主要聚焦内皮细胞，未涉及其他细胞类型在动脉粥样硬化中的作用 | 探究AQP1是否通过结合RIPK1影响动脉粥样硬化中的坏死性凋亡过程 | 人股动脉粥样硬化样本、正常主动脉样本和ox-LDL处理的内皮细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 空间转录组, 加权基因共表达网络分析, 差异表达基因分析, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质数据 | 动脉粥样硬化组织与正常主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7936 | 2025-10-06 |
Hypoxia-associated genes as predictors of outcomes in gastric cancer: a genomic approach
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1553477
PMID:40129974
|
研究论文 | 本研究通过分析缺氧相关基因构建了胃腺癌预后预测模型 | 首次识别了胃腺癌中缺氧细胞亚群特异性转录因子并构建了新型预后模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 研究缺氧相关基因在胃腺癌中的作用并构建预后模型 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, WGCNA, GO-BP/KEGG富集分析 | LassoCox算法 | RNA表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库数据，GSE183904原发胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7937 | 2025-10-06 |
Interleukin-27-polarized HIV-resistant M2 macrophages are a novel subtype of macrophages that express distinct antiviral gene profiles in individual cells: implication for the antiviral effect via different mechanisms in the individual cell-dependent manner
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1550699
PMID:40129989
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IL-27极化的巨噬细胞(27-Mac)是一种新型巨噬细胞亚型，具有独特的抗HIV机制 | 首次发现IL-27极化的巨噬细胞构成新型M2亚型，在单细胞水平表达独特的抗病毒基因组合 | 研究样本来源于健康供体，未在HIV感染者中验证；样本量未明确说明 | 比较IL-27极化巨噬细胞与M2d亚型的生物学功能和基因表达谱差异 | 健康供体来源的单核细胞分化形成的巨噬细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), p24抗原捕获试验, 过氧化氢检测, 吞噬试验, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质检测数据, 功能测定数据 | NA | IsoPlexis | 单细胞RNA测序, 细胞因子检测 | NA | IsoPlexis系统用于细胞因子检测 |
| 7938 | 2025-10-06 |
Myosin 1f and Proline-rich 13 are transcriptionally upregulated yet functionally redundant in CD4+ T cells during blood-stage Plasmodium infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320375
PMID:40132035
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现Myo1f和Prr13基因在疟疾感染期间CD4+ T细胞中表达上调，但功能验证表明这两个基因对效应和记忆T细胞反应并非必需 | 首次在T辅助细胞中发现并功能验证了Myo1f和Prr13两个基因在疟疾感染期间的表达模式，同时确认了cMaf对滤泡辅助T细胞分化的关键作用 | 研究仅限于小鼠疟疾感染模型，未在人类样本中验证；基因功能冗余性可能掩盖了某些特定条件下的功能 | 探究疟疾感染期间CD4+ T细胞中新型基因的表达调控和功能作用 | 小鼠CD4+ T细胞，特别是疟原虫特异性T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除，T细胞受体转基因技术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7939 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptome analyses revealed CTHRC1 a potential therapeutic target mediating invasion and tumor microenvironment in TNBC: experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534981
PMID:40134434
|
研究论文 | 通过单细胞和转录组分析揭示CTHRC1作为三阴性乳腺癌潜在治疗靶点，实验验证其介导侵袭和肿瘤微环境的作用 | 首次系统揭示CTHRC1阳性癌症相关成纤维细胞通过调控M2型巨噬细胞在TNBC免疫抑制微环境中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 探究CTHRC1在三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的关键作用及其治疗潜力 | 三阴性乳腺癌患者样本和相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, RNA转录组分析, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 7940 | 2025-10-06 |
Jing-Yin-Gu-Biao formula protects mice from postinfluenza Staphylococcus aureus infection by ameliorating acute lung injury and improving hypercoagulable state via inhibiting NETosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567522
PMID:40134435
|
研究论文 | 研究荆银固表方通过抑制NETosis改善流感后继发金黄色葡萄球菌感染引起的急性肺损伤和高凝状态 | 首次揭示荆银固表方通过抑制ERK/ROS轴调控中性粒细胞胞外诱捕网形成，改善继发感染 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究荆银固表方对流感后继发金黄色葡萄球菌感染的防护作用及机制 | 流感病毒PR8感染后继发金黄色葡萄球菌感染的小鼠模型 | NA | 急性呼吸道感染 | 单细胞RNA测序, 体外验证 | NA | 基因表达数据, 病理学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |