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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7881 | 2025-10-06 |
Unveiling the role of PPIF and macrophage subtypes in LSCC progression via single-cell and exosome RNA sequencing
2025-Mar-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93584-3
PMID:40128571
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研究论文 | 通过单细胞和外泌体RNA测序揭示PPIF和巨噬细胞亚型在喉鳞状细胞癌进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示LSCC中巨噬细胞-C1-C1QC亚群通过上调PPIF表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究样本量有限,需要进一步验证PPIF在巨噬细胞亚型中的具体功能机制 | 探究喉鳞状细胞癌肿瘤微环境中细胞异质性及其在癌症进展中的作用 | 喉鳞状细胞癌组织和肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 外泌体RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 外泌体RNA测序 | NA | NA |
7882 | 2025-10-06 |
Prognostic and immunological implications of protein kinases in gastric cancer: a focus on hub gene ABL2 and its impact on the polarization of M2 macrophages
2025-Mar-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00636-9
PMID:40128818
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研究论文 | 本研究通过分析胃癌中蛋白激酶的表达特征,构建预后模型并揭示核心基因ABL2通过调控M2巨噬细胞极化促进胃癌进展的机制 | 首次基于蛋白激酶基因构建胃癌分子分型和预后模型,发现ABL2作为核心基因调控M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多临床样本验证模型的普适性 | 探索蛋白激酶在胃癌中的预后价值和免疫调控机制 | 胃癌患者和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 体外实验 | 机器学习模型 | 转录组数据, 多组学数据, 单细胞测序数据 | GEO和TCGA数据库中的胃癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7883 | 2025-10-06 |
Dietary emulsifier carboxymethylcellulose-induced gut dysbiosis and SCFA reduction aggravate acute pancreatitis through classical monocyte activation
2025-Mar-24, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02074-1
PMID:40128912
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研究论文 | 本研究揭示食品乳化剂羧甲基纤维素通过诱导肠道菌群失调和短链脂肪酸减少,经经典单核细胞激活加重急性胰腺炎 | 首次阐明羧甲基纤维素通过肠道菌群-单核细胞轴加重急性胰腺炎的机制,并发现阿克曼氏菌和丁酸盐的干预潜力 | 动物模型研究,人类临床相关性需进一步验证 | 探究羧甲基纤维素对急性胰腺炎的影响及其机制 | C57BL/6小鼠和急性胰腺炎患者 | 免疫学 | 急性胰腺炎 | 16S rRNA基因扩增子测序, 单细胞RNA测序, 粪便微生物移植, 短链脂肪酸定量 | 小鼠急性胰腺炎模型 | 基因测序数据, 免疫参数, 分子参数 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
7884 | 2025-10-06 |
NCKAP1 Inhibits the Progression of Renal Carcinoma via Modulating Immune Responses and the PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathway
2025-Mar-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062813
PMID:40141455
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研究论文 | 本研究探讨NCKAP1在肾癌免疫调节和肿瘤进展中的具体作用 | 首次揭示NCKAP1通过调节免疫反应和PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制肾癌进展的机制 | NCKAP1在肾癌中的具体功能此前未知,研究结果需要进一步实验验证 | 研究NCKAP1在肾癌免疫调节和肿瘤进展中的功能 | 肾癌患者样本和769P肾癌细胞系 | 癌症生物学 | 肾癌 | RNA测序, ssGSEA, 单细胞RNA测序, CIBERSORT分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 多种癌症类型的患者样本和769P细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
7885 | 2025-10-06 |
Pulmonary Myeloid Cells in Mild Cases of COVID-19 Upregulate the Intracellular Fc Receptor TRIM21 and Transcribe Proteasome-Associated Molecules
2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062769
PMID:40141410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析轻症COVID-19患者肺髓样细胞中TRIM21及其下游信号通路的转录特征 | 首次发现轻症COVID-19患者肺髓样细胞中胞内Fc受体TRIM21转录上调并表达蛋白酶体相关分子,而炎症分支通路被沉默 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证 | 探究COVID-19不同严重程度患者肺免疫细胞中Fc受体及其下游信号通路的转录特征 | 健康个体和轻症、重症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和轻症、重症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7886 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveal a Novel Prognostic Signature of Combining Cuproptosis- and Ferroptosis-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062779
PMID:40141422
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个结合铜死亡和铁死亡相关基因的肝细胞癌预后特征模型 | 首次将铜死亡和铁死亡相关基因结合构建预后特征模型,并通过单细胞测序数据验证其与肿瘤微环境的关联 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌的预后预测模型和治疗策略 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 共识聚类分析, 主成分分析, 多变量COX回归分析, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
7887 | 2025-10-06 |
Diverse Subsets of γδT Cells and Their Specific Functions Across Liver Diseases
2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062778
PMID:40141420
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综述 | 本文系统阐述了γδT细胞在不同肝脏疾病中的功能多样性及其治疗潜力 | 整合单细胞测序和空间转录组学最新发现,揭示γδT细胞亚群(Vδ1/Vδ2/γδT17)在肝脏疾病中的特异性功能 | γδT细胞的功能多样性和调控机制尚未完全阐明 | 探讨γδT细胞在肝脏疾病发病机制中的作用及免疫治疗应用前景 | γδT细胞及其亚群(Vδ1、Vδ2、γδT17等) | 免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
7888 | 2025-10-06 |
Inflammatory Transformation of Skin Basal Cells as a Key Driver of Cutaneous Aging
2025-Mar-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062617
PMID:40141258
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和GWAS数据揭示了皮肤衰老过程中角质形成细胞的异质性和炎症转化机制 | 首次发现基底细胞在衰老过程中可向棘状分化或炎症状态两个不同路径分化,并识别出IFI27角质形成细胞亚群在衰老过程中的关键作用 | 研究主要基于测序数据分析,需要进一步的实验验证 | 探究皮肤衰老过程中角质形成细胞的异质性和发育轨迹 | 皮肤角质形成细胞亚群 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞测序, 转录组学, 全基因组关联研究(GWAS) | 单细胞伪时间分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
7889 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Molecular Mechanisms in Rapid Antler Osteogenesis During Growth and Ossification Stages
2025-Mar-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062642
PMID:40141284
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究梅花鹿鹿角在生长和骨化阶段的快速成骨分子机制 | 首次在鹿角生长和骨化阶段进行单细胞水平分析,识别了8种细胞类型及其分子特征 | NA | 探究快速成骨的分子调控机制 | 梅花鹿鹿角组织 | 单细胞组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台 |
7890 | 2025-10-06 |
Impact of Peripheral Inflammation on Blood-Brain Barrier Dysfunction and Its Role in Neurodegenerative Diseases
2025-Mar-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062440
PMID:40141084
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综述 | 探讨外周炎症通过血脑屏障功能障碍在神经退行性疾病中的作用机制 | 系统阐述肠-脑轴与血脑屏障完整性的关联,强调区域特异性血脑屏障异质性对神经退行过程的影响 | 关于血脑屏障功能障碍的精确分子机制仍存在关键知识空白 | 阐明外周炎症、肠道微生物群与血脑屏障功能障碍在神经退行性疾病中的分子机制联系 | 血脑屏障、外周炎症过程、肠道微生物群、神经退行性疾病(阿尔茨海默病和帕金森病) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、器官芯片模型 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7891 | 2025-10-06 |
Construction of T-Cell-Related Prognostic Risk Models and Prediction of Tumor Immune Microenvironment Regulation in Pancreatic Adenocarcinoma via Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq
2025-Mar-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26062384
PMID:40141028
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了胰腺腺癌T细胞相关预后风险模型并预测肿瘤免疫微环境调控 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建基于T细胞标记基因的胰腺癌预后风险模型,并验证其与免疫治疗效果的关联 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性验证队列 | 开发胰腺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗效果 | 胰腺腺癌患者及其肿瘤免疫微环境中的T细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
7892 | 2025-10-06 |
scSAMAC: saliency-adjusted masking induced attention contrastive learning for single-cell clustering
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf128
PMID:40131310
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研究论文 | 提出一种用于单细胞聚类的新型深度学习方法scSAMAC,通过整合对比学习和负二项式损失来提升聚类性能 | 开发了基于基因特征显著性调整的负样本生成掩码模块,并结合软k均值损失、Wasserstein距离和对比损失的新型损失函数 | NA | 解决单细胞数据高维度、稀疏性和dropout事件带来的聚类挑战 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 变分自编码器(VAE), 对比学习, 多头注意力机制 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7893 | 2025-10-06 |
The Spatial Transcriptomic Atlas of Human Limbus and Vital Niche Microenvironment Regulating the Fate of Limbal Epithelial Stem Cells
2025-Mar-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.3.52
PMID:40131296
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术构建了人眼角膜缘空间图谱,揭示了角膜缘上皮干细胞与微环境之间的相互作用 | 首次绘制人眼角膜缘空间转录组图谱,发现GPHB5作为角膜缘上皮干细胞潜在新生物标志物,揭示COL6A2/CD44信号通路在细胞间通讯中的关键作用 | 样本数量有限,需要进一步验证GPHB5作为生物标志物的功能 | 构建人眼角膜缘空间转录组图谱,研究角膜缘上皮干细胞与微环境的相互作用机制 | 人眼角膜缘组织及其中包含的各种细胞类型 | 空间转录组学 | 眼科疾病 | 空间转录组技术,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 每个样本包含400多个检测点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Genomics Space Ranger | 10x Genomics空间转录组平台 |
7894 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Analysis of Epoxide Hydrolase 2 (EPHX2) in Pan-Cancer
2025-Mar, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70188
PMID:40129060
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研究论文 | 通过生物信息学方法全面分析EPHX2在泛癌中的表达特征、预后价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次在泛癌水平系统评估EPHX2的诊断预后价值及其与免疫浸润的关联,并探索其作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qPCR在癌细胞系中的表达验证 | 阐明EPHX2在人类恶性肿瘤中的作用机制及其在肿瘤免疫微环境中的功能 | 33种人类肿瘤类型及多种癌细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 生物信息学分析,qPCR,基因集变异分析(GSVA),单细胞测序 | NA | 基因表达数据,临床预后数据,免疫细胞浸润数据 | 33种肿瘤类型的多组学数据 | NA | 单细胞测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
7895 | 2025-10-06 |
Identification of RCC2 as a Risk Gene Associated With Basal Cell Carcinoma and Experimental Validation
2025-Mar, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70082
PMID:40129067
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化分析鉴定出与基底细胞癌风险相关的RCC2基因,并通过体外实验验证其功能 | 首次将RCC2基因鉴定为基底细胞癌的风险基因,并通过单细胞转录组分析和体外功能实验验证 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 鉴定基底细胞癌的新风险基因并验证其功能 | 基底细胞癌患者数据和A431细胞系 | 生物信息学 | 皮肤癌 | 孟德尔随机化分析, eQTL, mQTL, pQTL, 单细胞转录组分析, 基因沉默 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 蛋白质组数据 | GEO数据库中的基底细胞癌队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
7896 | 2025-10-06 |
Identification and validation of m6A RNA methylation and ferroptosis-related biomarkers in sepsis: transcriptome combined with single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543517
PMID:40124361
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序技术识别并验证了脓毒症中m6A RNA甲基化和铁死亡相关的生物标志物 | 首次将m6A RNA甲基化与铁死亡机制结合研究脓毒症,并在单细胞水平验证生物标志物的表达 | 研究依赖于公共数据库数据,临床样本验证范围有限 | 识别和验证脓毒症中m6A RNA甲基化和铁死亡相关的生物标志物 | 脓毒症患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | 机器学习, WGCNA, ROC分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 未明确具体样本数量,包含公共数据库数据和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
7897 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the oncogenic role of ANXA5 in gastric cancer and its association with drug resistance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562395
PMID:40124374
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示ANXA5在胃癌中的致癌作用及其与耐药性的关联 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序识别MUC5AC+恶性上皮细胞亚群在胃癌侵袭和EMT中的关键作用,并验证ANXA5的致癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索胃癌恶性上皮细胞亚群及其在肿瘤进展和耐药性中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,肿瘤突变负荷分析 | 预后模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和OMIX001073数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
7898 | 2025-10-06 |
TGF-β-mediated activation of fibroblasts in cervical cancer: implications for tumor microenvironment and prognosis
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19072
PMID:40124621
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研究论文 | 本研究探讨TGF-β信号通路在宫颈癌相关成纤维细胞中的激活作用及其对肿瘤微环境和预后的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示TGF-β信号在成纤维细胞中的激活机制,并构建基于三个基因的预后预测模型 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 阐明TGF-β信号通路在宫颈癌肿瘤微环境中的作用机制 | 宫颈癌患者肿瘤微环境中的细胞类型,特别是癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,实时定量PCR,细胞功能实验 | Cox回归模型,LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,临床数据 | TCGA-CESC数据集及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7899 | 2025-10-06 |
AQP1 Affects Necroptosis by Targeting RIPK1 in Endothelial Cells of Atherosclerosis
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S487327
PMID:40129682
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研究论文 | 本研究揭示AQP1通过靶向RIPK1抑制内皮细胞坏死性凋亡从而影响动脉粥样硬化斑块稳定性 | 首次发现AQP1通过结合RIPK1并抑制RIPK3/MLKL表达来调控内皮细胞坏死性凋亡的新机制 | 研究主要聚焦内皮细胞,未涉及其他细胞类型在动脉粥样硬化中的作用 | 探究AQP1是否通过结合RIPK1影响动脉粥样硬化中的坏死性凋亡过程 | 人股动脉粥样硬化样本、正常主动脉样本和ox-LDL处理的内皮细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 空间转录组, 加权基因共表达网络分析, 差异表达基因分析, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质数据 | 动脉粥样硬化组织与正常主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
7900 | 2025-10-06 |
Hypoxia-associated genes as predictors of outcomes in gastric cancer: a genomic approach
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1553477
PMID:40129974
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研究论文 | 本研究通过分析缺氧相关基因构建了胃腺癌预后预测模型 | 首次识别了胃腺癌中缺氧细胞亚群特异性转录因子并构建了新型预后模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究缺氧相关基因在胃腺癌中的作用并构建预后模型 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, WGCNA, GO-BP/KEGG富集分析 | LassoCox算法 | RNA表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库数据,GSE183904原发胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |