单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 7881 - 7900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7881 | 2024-10-11 |
scATAcat: cell-type annotation for scATAC-seq data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae135
PMID:39380946
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研究论文 | 提出了一种名为scATAcat的新方法，利用批量ATAC-seq数据作为原型来注释scATAC-seq数据 | scATAcat方法的创新之处在于利用已知的批量ATAC-seq数据作为原型，而不是依赖基因表达模式 | 文章未明确提及scATAcat方法的局限性 | 开发一种新的方法来注释scATAC-seq数据中的细胞类型 | scATAC-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | NA | scATAC-seq数据 | 多个数据集，具体样本数量未明确提及 |
| 7882 | 2024-10-11 |
Distinct melanocyte subpopulations defined by stochastic expression of proliferation or maturation programs enable a rapid and sustainable pigmentation response
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002776
PMID:39163475
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研究论文 | 本文通过单细胞测序研究了人类和斑马鱼皮肤中黑色素细胞的分化与增殖程序的分离现象 | 首次揭示了黑色素细胞中分化与增殖程序的随机表达机制，并通过系统方法构建了基因调控网络 | 研究主要集中在体外培养的黑色素细胞，对体内环境的适用性有待验证 | 探讨紫外线辐射下皮肤色素沉着反应的分子机制 | 人类和斑马鱼皮肤中的黑色素细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 基因调控网络 | RNA+ATAC | 人类和斑马鱼皮肤中的黑色素细胞 |
| 7883 | 2024-10-11 |
Single-cell RNA sequencing unveils unique transcriptomic signatures of endothelial cells and role of ENO1 in response to disturbed flow
2024-Jan-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318904121
PMID:38261622
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞在不同流体剪切力下的独特转录组特征，并探讨了ENO1在响应扰流中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了扰流和脉动剪切力对内皮细胞转录组的影响，并揭示了ENO1在响应扰流中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证结果 | 探讨不同流体剪切力对内皮细胞转录组的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞及其在扰流和脉动剪切力下的转录组变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个内皮细胞样本 |
| 7884 | 2024-10-11 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in Pituitary Research
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000540352
PMID:39053437
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在垂体研究中的应用，强调了其在揭示垂体细胞异质性和相互作用方面的潜力 | 单细胞RNA测序技术为研究垂体细胞的异质性和相互作用提供了前所未有的手段 | 目前该技术在探索垂体复杂性方面的应用还较少 | 加深对垂体及其在疾病状态下功能障碍的理解 | 垂体细胞及其在生理和病理机制中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7885 | 2024-10-11 |
Machine learning-based discovery of UPP1 as a key oncogene in tumorigenesis and immune escape in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475206
PMID:39380997
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研究论文 | 本文通过机器学习方法发现UPP1基因在胶质瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 | 本文首次将UPP1识别为胶质瘤发生和免疫逃逸的关键驱动基因 | NA | 揭示胶质瘤发生和进展的分子机制，以改进治疗和患者预后 | 胶质瘤样本的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 大规模胶质瘤样本 |
| 7886 | 2024-10-11 |
Systematic investigation of mitochondrial transfer between cancer cells and T cells at single-cell resolution
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.09.003
PMID:37816332
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术和MERCI统计反卷积方法，系统研究了癌细胞和T细胞之间线粒体转移的现象 | 引入MERCI方法，能够追踪和量化癌细胞和T细胞之间的线粒体转移，并准确预测接收细胞及其相对线粒体组成 | NA | 研究癌细胞和T细胞之间线粒体转移的现象，并探索其潜在的治疗机会 | 癌细胞和T细胞之间的线粒体转移 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 统计反卷积方法 | RNA序列 | 涉及多种癌症类型的人类癌症样本 |
| 7887 | 2024-10-11 |
ZNF683 marks a CD8+ T cell population associated with anti-tumor immunity following anti-PD-1 therapy for Richter syndrome
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.013
PMID:37738974
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研究论文 | 研究分析了Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的单细胞转录组数据，发现ZNF683标记的CD8+ T细胞与抗肿瘤免疫反应相关 | 首次发现ZNF683在PD-1阻断治疗后标记的CD8+ T细胞与Richter综合征患者的抗肿瘤免疫反应相关 | 研究样本量较小，仅涉及6名Richter综合征患者和10名其他患者的预处理外周血样本 | 探究Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的抗肿瘤免疫反应机制 | Richter综合征患者的骨髓样本和外周血样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 17个骨髓样本和10个外周血样本 |
| 7888 | 2024-10-11 |
Artificial Intelligence Models for Cell Type and Subtype Identification Based on Single-Cell RNA Sequencing Data in Vision Science
2023 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3284795
PMID:37294649
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序数据在视觉科学中使用人工智能技术进行细胞类型和亚型识别的最新进展 | 介绍了人工智能在细胞类型识别中的应用，提供了更快、更准确和用户友好的方法 | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法仍然是未来研究需要解决的问题 | 帮助视觉科学家选择合适的单细胞RNA测序数据集和计算工具进行分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7889 | 2024-10-11 |
Knowledge-primed neural networks enable biologically interpretable deep learning on single-cell sequencing data
2020-08-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02100-5
PMID:32746932
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合深度学习和生物网络解释性的知识引导神经网络（KPNNs），并展示了其在单细胞测序数据上的应用 | KPNNs通过在多层网络中赋予有意义的权重，增强了深度学习算法的解释性，并提供了一种广泛适用的可解释深度学习方法 | 本文仅在单细胞测序数据上验证了KPNNs的应用，未来需要在更多类型的数据上进行验证 | 结合深度学习的预测能力和生物网络的解释性，开发一种新的深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据，包括癌症和免疫细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 知识引导神经网络（KPNNs） | 单细胞RNA测序数据 | 五个生物应用中的单细胞RNA测序数据 |
| 7890 | 2024-10-11 |
Terminal exon characterization with TECtool reveals an abundance of cell-specific isoforms
2018-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0114-z
PMID:30202060
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研究论文 | 本文开发了TEC工具，用于鉴定和表征细胞特异性终端外显子 | 发现了数百种先前未知的同工型和细胞类型特异性终端外显子，并通过单细胞测序数据验证了这些新同工型的表达 | NA | 开发和应用TEC工具以鉴定细胞特异性终端外显子 | 人类细胞中的终端外显子和同工型 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 单细胞测序数据 |
| 7891 | 2024-10-09 |
Single-cell transcriptomics illustrates the immune inflammatory responses of septic mice spleen after capsaicin treatment
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101256
PMID:39376503
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7892 | 2024-10-10 |
VSIG4 induces the immunosuppressive microenvironment by promoting the infiltration of M2 macrophage and Tregs in clear cell renal cell carcinoma
2024-Dec-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113105
PMID:39260310
|
研究论文 | 本文研究了VSIG4在透明细胞肾细胞癌中通过促进M2巨噬细胞和Tregs的浸润来诱导免疫抑制微环境的作用 | 发现了新的免疫检查点靶点VSIG4，并探讨了其在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗耐药性的关系 | NA | 探索透明细胞肾细胞癌中的新型免疫治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌中的免疫相关基因VSIG4及其在免疫抑制微环境中的作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 多组学数据分析、病理学审查、批量转录组数据、单细胞测序、Western blotting、免疫组化、体外/体内实验 | NA | 基因表达数据、病理图像 | 训练组：36个正常组织和267个透明细胞肾细胞癌组织；验证组：36个正常组织和266个透明细胞肾细胞癌组织 |
| 7893 | 2024-10-10 |
Sequencing-based study of neural induction of human dental pulp stem cells
2024-Nov, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01121-7
PMID:39210197
|
研究论文 | 本研究评估了通过神经诱导的人类牙髓干细胞（DPSCs）获得的神经谱系细胞的细胞成分和分化途径 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）详细研究了DPSCs的神经诱导特性及其分化状态 | 研究主要集中在体外培养的DPSCs，未涉及体内实验 | 评估人类牙髓干细胞在神经诱导后的细胞成分和分化途径 | 人类牙髓干细胞（DPSCs）及其神经诱导后的细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓干细胞（DPSCs）的单细胞样本 |
| 7894 | 2024-10-10 |
Label-free high-throughput impedance-activated cell sorting
2024-Oct-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00487f
PMID:39315634
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研究论文 | 提出了一种基于阻抗检测和双膜泵的无标记、高通量、高精度的细胞分选系统 | 利用FPGA的低延迟特性，实现了实时双频单细胞阻抗检测，并实现了高吞吐量和高精度的单颗粒分选 | NA | 开发一种无标记、高通量、高精度的细胞分选系统，以应用于早期癌症诊断、细胞分化研究、药物筛选和单细胞测序等领域 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞 | NA | NA | 阻抗检测 | NA | 细胞 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞，每秒处理5 × 10个细胞，实验中Jurkat和MDA-MB-231细胞的吞吐量达到每秒1000个细胞 |
| 7895 | 2024-10-10 |
KLHL21 suppresses gastric tumourigenesis via maintaining STAT3 signalling equilibrium in stomach homoeostasis
2024-Oct-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331111
PMID:38969490
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研究论文 | 研究探讨了KLHL21在胃癌发生中的作用及其通过维持STAT3信号平衡来抑制胃肿瘤发生的机制 | 首次揭示了KLHL21缺失通过STAT3信号通路促进胃癌发生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，缺乏更大规模的人类临床数据验证 | 探讨KLHL21在胃癌发生中的作用及其分子机制 | KLHL21基因、STAT3信号通路、胃癌患者样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、质谱分析、核糖体测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括多个小鼠模型和胃癌患者样本 |
| 7896 | 2024-10-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies a subtype of FN1 + tumor-associated macrophages associated with glioma recurrence and as a biomarker for immunotherapy
2024-Oct-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00662-1
PMID:39375795
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研究论文 | 研究利用单细胞测序、空间转录组学和RNA测序数据，识别出与胶质瘤复发相关的FN1+肿瘤相关巨噬细胞亚型，并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次发现FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发相关，并提出其作为免疫治疗反应的预测标志物 | NA | 探讨胶质瘤复发的分子机制，并寻找新的治疗靶点 | FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序、空间转录组学、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7897 | 2024-10-10 |
The lncRNA SNHG26 drives the inflammatory-to-proliferative state transition of keratinocyte progenitor cells during wound healing
2024-Oct-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52783-8
PMID:39366968
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研究论文 | 本文研究了长链非编码RNA SNHG26在角质形成细胞祖细胞从炎症状态向增殖状态转变中的作用 | 首次揭示了SNHG26在角质形成细胞祖细胞炎症-增殖状态转变中的关键调控作用 | NA | 探讨长链非编码RNA在伤口愈合中的作用机制 | 角质形成细胞祖细胞在伤口愈合中的状态转变 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | Snhg26缺陷小鼠模型 |
| 7898 | 2024-10-10 |
Endothelial pyroptosis-driven microglial activation in choroid plexus mediates neuronal apoptosis in hemorrhagic stroke rats
2024-Oct-05, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106695
PMID:39370051
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研究论文 | 研究揭示了在出血性中风大鼠模型中，脉络丛中的内皮细胞焦亡通过NF-κB途径驱动小胶质细胞活化，进而介导神经元凋亡 | 首次揭示了内皮细胞焦亡在出血性中风后通过NF-κB途径触发小胶质细胞活化，并介导神经元凋亡的机制 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨出血性中风后炎症反应的来源及其对神经元损伤的影响 | 出血性中风大鼠模型中的内皮细胞、小胶质细胞和神经元 | NA | 出血性中风 | Luminex®分析、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA | 出血性中风大鼠模型的出血半球 |
| 7899 | 2024-10-10 |
The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung
2024-Oct-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52846-w
PMID:39358361
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研究论文 | 研究探讨了CD38+肺泡巨噬细胞在控制小鼠肺部结核分枝杆菌感染中的作用 | 首次通过多模态单细胞RNA测序揭示了不同肺泡巨噬细胞亚群在控制结核分枝杆菌感染中的不同作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨宿主巨噬细胞在控制结核分枝杆菌感染中的生物学作用 | 肺泡巨噬细胞及其在结核分枝杆菌感染中的作用 | 数字病理学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 7900 | 2024-10-10 |
A New Tissue Engineering Strategy to Promote Tendon-bone Healing: Regulation of Osteogenic and Chondrogenic Differentiation of Tendon-derived Stem Cells
2024-Oct, Orthopaedic surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.1111/os.14152
PMID:39043618
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综述 | 本文综述了当前促进肌腱-骨愈合的策略，并分析了相关的临床前和临床研究，重点探讨了肌腱来源干细胞（TDSCs）在肌腱-骨愈合中的潜力 | 本文提出了一种基于TDSCs驱动成骨和软骨分化的肌腱-骨愈合新策略 | NA | 旨在全面审查当前促进肌腱-骨愈合的策略，并分析相关研究，以优化肌腱-骨愈合结果 | 前交叉韧带（ACL）和肩袖（RC）损伤修复手术中的肌腱-骨愈合 | 再生医学 | 运动损伤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |