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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7881 | 2026-02-07 |
Lactylation-Related Gene Signature and Immune Infiltration Crosstalk in Heart Failure: Insights From Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2026-Feb-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001775
PMID:41252712
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研究论文 | 本研究通过批量与单细胞转录组学分析,探讨了乳酰化相关基因特征与免疫浸润在心力衰竭中的相互作用 | 首次系统性地将蛋白质乳酰化修饰与心力衰竭的免疫微环境联系起来,并构建了基于乳酰化相关基因的诊断模型和基因特征 | 研究结果主要基于转录组数据,需要进一步的实验验证来确认乳酰化修饰在心力衰竭中的具体调控机制 | 探索乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用,并识别相关的生物标志物和潜在治疗靶点 | 心力衰竭患者样本、小鼠心力衰竭模型以及相关的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 无监督聚类, 诊断模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 200个心力衰竭样本和166个非心力衰竭样本,以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7882 | 2026-02-07 |
Single-cell and Mendelian analyses reveal shared mechanisms between head and neck neoplasms and aging
2026-Feb-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04550-y
PMID:41621040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和机制 | 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,首次系统性地揭示了头颈部肿瘤与衰老在CD4_naive T细胞下调方面的共同特征,并识别出FHIT作为潜在的分子连接点 | 验证阶段仅保留FHIT基因,且共定位分析显示GWAS与eQTL信号共享因果变异的证据有限(H4=0.01),样本来源局限于外周血单细胞数据 | 探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照的外周血单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯建模, 共定位分析, 代谢通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照的外周血样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7883 | 2026-02-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics uncover neoadjuvant chemotherapy-resistant malignant cells with inhibitory signalling on B cells in gastric cancer
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70600
PMID:41630531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7884 | 2026-02-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Revealed the Interplay Between Intratumoral Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Breast Cancer
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71600
PMID:41635010
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序,揭示了乳腺癌中肿瘤内异质性与肿瘤微环境之间的相互作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统分析了不同乳腺癌分子亚型中细胞间通讯网络,并识别出与预后相关的关键信号通路 | 研究依赖于公共数据库数据,可能受样本来源和技术平台差异的影响,且未进行实验验证 | 研究乳腺癌分子亚型中肿瘤微环境内差异信号通路及其与临床预后的关联 | 乳腺癌样本中的上皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | SingleR, Monocle, CellChat | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7885 | 2026-02-07 |
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502979R
PMID:41555841
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研究论文 | 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序,发现成纤维细胞中VCAN高表达促进高干性胃腺癌细胞的进展 | 首次结合bulk测序与单细胞测序揭示VCAN在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达及其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进高干性胃腺癌细胞恶性表型的作用机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证;信号通路机制尚未完全阐明 | 探究VCAN在胃腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胃腺癌组织、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个数据库的样本(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7886 | 2026-02-07 |
Mining Potential Therapeutic Targets for T Cell Exhaustion in Osteoarthritis by Integrating Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503295R
PMID:41603583
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞测序技术,挖掘骨关节炎中T细胞耗竭的潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞测序方法,系统鉴定骨关节炎中T细胞耗竭相关基因作为生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行独立队列验证实验 | 确定骨关节炎中与T细胞耗竭相关的生物标志物,为治疗和预后提供潜在靶点 | 骨关节炎患者样本数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7887 | 2026-02-07 |
Adult leptomeningeal vestigial neural crest-derived multipotent cells promote vascular repair after stroke
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116747
PMID:41456275
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪、单细胞与空间转录组学等方法,在成年小鼠软脑膜中发现了一群神经嵴来源的多能细胞,并揭示了其在脑卒中后通过特定信号通路促进血管修复的作用机制 | 首次在成年哺乳动物软脑膜中发现并证实了胚胎神经嵴来源的多能细胞持续存在,并阐明了其在脑损伤后被重新激活、迁移至血管损伤部位并通过分泌多效蛋白等机制促进血管修复的全新生物学过程 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;这些多能细胞在长期修复中的具体命运及其在其它神经系统疾病中的作用仍需进一步探索 | 探究成年大脑中是否存在胚胎神经嵴来源的残留多能细胞及其在脑卒中后血管修复中的潜在功能 | 成年小鼠软脑膜中的神经嵴来源多能细胞及其在缺血性脑卒中模型中的行为与功能 | 单细胞生物学与神经血管修复 | 脑卒中 | 神经嵴谱系追踪、单细胞转录组学、空间转录组学、相互作用组建模、活体成像 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7888 | 2026-02-07 |
Astrocytic response to traumatic brain injury to rescue neuronal mitochondrial dysfunction through mitochondrial transfer
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.701145
PMID:41648326
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研究论文 | 本研究探讨了创伤性脑损伤后,星形胶质细胞通过线粒体转移来拯救神经元线粒体功能障碍的内在神经保护机制 | 揭示了星形胶质细胞在TBI后通过直接接触和细胞外囊泡两种方式向神经元转移功能性线粒体,并首次证明EV介导的线粒体转移能显著改善兴奋性毒性诱导的神经元线粒体功能障碍 | 研究未观察到线粒体转移至神经元突触的增加,且主要基于急性TBI模型(24小时),长期效应和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究创伤性脑损伤后中枢神经系统内细胞间线粒体转移的机制及其神经保护作用 | 表达线粒体荧光标记(mtD2/mtGFP)的转基因小鼠、原代皮层星形胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、线粒体生物能量学分析、共培养实验、细胞外囊泡分离 | NA | 基因表达数据、荧光成像数据、生物能量学数据 | 使用特定转基因小鼠品系(Aldh1l1-CreER; mtD2/mtGFP 和 CamK2aCre; mtD2/mtGFP)及原代细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7889 | 2026-02-07 |
Uncovering the molecular logic of cortical wiring between neuronal subtypes across development through ligand-receptor inference
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68059-8
PMID:41565644
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学追踪小鼠17个发育阶段主要神经元群体的基因表达动态,揭示了皮层神经元亚型间配体-受体相互作用的分子逻辑 | 识别了NEOGENIN-1作为CBLN4在围产期的主要受体,并发现钙粘蛋白超家族成员在突触特异性中的上下文依赖性作用 | 研究基于小鼠模型,可能不完全适用于人类皮层发育,且功能验证有限 | 解码皮层神经元亚型间精确连接的分子机制 | 小鼠大脑皮层中的兴奋性和抑制性神经元亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个发育阶段的小鼠神经元群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7890 | 2026-02-07 |
Fibroblast-specific Deletion of Yap/Taz Impairs Mouse Postnatal Dermal Development by Suppressing Collagen Production and Deposition
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.19.700422
PMID:41648482
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研究论文 | 本研究探讨了YAP/TAZ在成纤维细胞中对小鼠出生后皮肤真皮发育的关键作用,特别是通过抑制胶原蛋白的生产和沉积来影响真皮成熟 | 揭示了YAP/TAZ在成纤维细胞中调控细胞外基质(ECM)稳态的新机制,特别是在出生后皮肤发育过程中胶原蛋白合成和沉积的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类皮肤;未详细探讨YAP/TAZ在其他细胞类型或疾病状态下的作用 | 探究YAP/TAZ在成纤维细胞中对出生后皮肤真皮发育和ECM稳态的调控作用 | 小鼠皮肤成纤维细胞和出生后皮肤组织 | 分子生物学与细胞生物学 | 皮肤发育与再生相关疾病 | 基因敲除、RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、空间转录组数据 | 使用基因敲除小鼠模型,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 7891 | 2026-02-07 |
Macrophage efferocytosis mediated by the TP63-RAC2 pathway promotes immunosuppressive remodeling in esophageal cancer
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102529
PMID:41418775
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验,探讨了巨噬细胞胞葬作用在食管鳞状细胞癌中的作用及其免疫抑制机制 | 首次揭示了TP63和RAC2作为关键调节因子,介导巨噬细胞胞葬作用,从而促进食管癌的免疫抑制微环境重塑 | 样本量较小(仅9名患者的27个样本),且主要基于食管鳞状细胞癌,结果在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究胞葬作用在食管癌肿瘤微环境中的作用机制及其对免疫反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的巨噬细胞和凋亡肿瘤细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名患者的27个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7892 | 2026-02-07 |
Restoring immune homeostasis in atherosclerotic plaques via inorganic violet phosphorus nano-immunotherapy
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102528
PMID:41494534
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研究论文 | 本文开发了一种无机纳米颗粒平台(聚乙二醇化紫磷纳米片),用于通过免疫调节治疗动脉粥样硬化 | 首次利用无机紫磷纳米片作为纳米免疫疗法平台,通过单细胞RNA测序揭示其调节斑块内四种关键免疫细胞群并重塑细胞间通讯的机制 | 未在人类临床试验中验证,且未详细探讨长期副作用或与其他疗法的比较 | 开发一种靶向免疫调节的纳米疗法以治疗动脉粥样硬化 | 动脉粥样硬化小鼠模型中的免疫细胞(如巨噬细胞、单核细胞、T/B细胞) | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但基于小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7893 | 2026-02-07 |
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns underlying accumulation of p-Ser129 α-synuclein in a transgenic mouse model
2026-Jan-16, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-01246-y
PMID:41545426
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研究论文 | 本研究利用成像空间转录组学结合免疫荧光技术,在转基因小鼠模型中揭示了p-Ser129 α-突触核蛋白积累的分子模式 | 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合,在同一组织切片中识别出易积累pSyn的神经元亚型,并揭示了Plk2和hSNCA表达在pSyn形成中的关键作用 | 研究基于转基因小鼠模型,可能无法完全模拟人类帕金森病或路易体痴呆的复杂性 | 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白选择性积累的分子机制 | 转基因过表达人α-突触核蛋白的小鼠皮层和海马神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 成像空间转录组学,免疫荧光 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7894 | 2026-02-07 |
Integrative Single-cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Osteosarcoma Reveals Conserved and Distinct Ecosystems Across Sites and Species
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.698472
PMID:41648517
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学分析,揭示了骨肉瘤在跨物种和不同部位间保守且独特的生态系统 | 构建了首个跨物种骨肉瘤单细胞转录组数据集,涵盖人类、犬类、PDX和同基因小鼠模型,并识别了保守的肿瘤细胞状态和肿瘤相关细胞群的重编程特征 | 研究依赖于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平或表观遗传变化,且样本来源的多样性可能引入批次效应 | 探究骨肉瘤的肿瘤微环境异质性及其在跨物种和不同解剖部位的保守与差异 | 人类、犬类骨肉瘤标本、患者来源异种移植(PDX)、同基因小鼠模型的原发(骨)和转移(肺)部位细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 超过一百万个细胞/核,来自多物种和多部位样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7895 | 2026-02-07 |
A supervised ontology-aware cell annotation method for single-cell transcriptomic data
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699356
PMID:41648349
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研究论文 | 提出一种基于监督学习和本体论的细胞注释方法SOCAM,用于单细胞转录组数据,通过概率传播策略确保细胞类型分类的层次一致性 | 引入概率传播策略以强制本体一致性,无需重新训练现有模型即可提升性能,并提出了基于跳数的F1评分用于本体感知评估 | NA | 开发一种快速、可解释且本体一致的细胞注释方法,以改进单细胞RNA-seq数据的细胞类型分类 | 人类单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 逻辑回归 | 单细胞转录组数据 | 4200万个人类细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7896 | 2026-02-07 |
From glycolytic signatures to patients: A translational roadmap for reproducible, equitable deployment of multi-omics and AI in colorectal cancer
2026-Jan-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03236-3
PMID:41528598
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综述 | 本文提出一个基于多组学和人工智能的可重复、公平部署的路线图,用于结直肠癌的精准肿瘤学 | 整合国际公认框架(TRIPOD+AI、PROBAST+AI、DECIDE-AI)以确保透明度、校准和分阶段临床评估,并强调使用代谢成像和光谱学进行正交验证 | 未具体说明数据样本量或模型类型,主要关注方法论和路线图,缺乏实证研究细节 | 为结直肠癌中多组学和人工智能的可重复、公平临床工具开发提供结构化路线图 | 结直肠癌的糖酵解异质性及相关生物标志物 | 机器学习 | 结直肠癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、代谢成像、光谱学 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7897 | 2026-02-07 |
Interpreting the molecular and cellular landscape of PCOS through bulk transcriptomics, single-cell transcriptomics and machine learning
2026-Jan-07, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01956-0
PMID:41501917
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研究论文 | 本研究通过整合bulk转录组学、单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了多囊卵巢综合征的分子机制和细胞组成,并开发了诊断模型 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序与机器学习,识别了PCOS中关键的颗粒细胞亚群GC9,并构建了基于三基因标志的诊断模型 | 研究样本量有限,且主要基于转录组数据,未全面探索其他分子层面如蛋白质组或代谢组 | 阐明PCOS的分子机制和细胞基础,以发现潜在治疗靶点并提高诊断准确性 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 机器学习 | 多囊卵巢综合征 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, western blotting | 机器学习算法 | RNA测序数据, 临床样本数据 | PCOS患者和对照组的临床样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7898 | 2026-02-07 |
Therapeutic potential of CDK8 inhibitor combined with sorafenib for hepatocellular carcinoma: mechanistic insights and in vitro validation
2026-Jan-07, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03780-0
PMID:41501937
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研究论文 | 本研究探讨了CDK8抑制剂MSC2530818与索拉非尼联合使用对肝细胞癌的治疗潜力,通过机制分析和体外实验验证其协同抗肿瘤效果 | 首次结合单细胞RNA-seq分析揭示CDK8在肝细胞癌中的表达模式,并验证CDK8抑制剂与索拉非尼的联合治疗策略在体外模型中的协同增效作用 | 研究主要基于体外细胞实验(Huh7细胞),缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证,且样本量有限 | 探索肝细胞癌的新型治疗靶点及联合治疗策略 | 肝细胞癌组织样本、Huh7肝癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组化、RNA-seq、微阵列数据分析、单细胞RNA-seq、细胞增殖实验、划痕实验、Transwell实验 | NA | 组织样本数据、基因表达数据、单细胞转录组数据、体外细胞实验数据 | 75例肝细胞癌及癌旁组织样本,整合分析3969例肝细胞癌和3245例非肿瘤肝样本的RNA-seq和微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 7899 | 2026-02-07 |
scGACL: a generative adversarial network with multi-scale contrastive learning for accurate single-cell RNA sequencing imputation
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag018
PMID:41632596
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研究论文 | 本文提出了一种结合生成对抗网络和多尺度对比学习的单细胞RNA测序数据插补方法scGACL,以解决现有方法存在的过度平滑问题 | 提出了一种集成生成对抗网络与多尺度对比学习的新框架,通过细胞级和细胞类型级对比学习协同工作,在保持细胞间异质性的同时恢复基因表达 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够准确插补单细胞RNA测序数据并保持细胞异质性的计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络, 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7900 | 2026-01-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates potential mechanisms of endothelial cells in lung region-specific repair and remodeling in combined pulmonary fibrosis and emphysema
2026-Jan-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03460-x
PMID:41491179
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |