单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 7861 - 7880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7861 | 2024-09-30 |
Cellular Complexity of Hemochorial Placenta: Stem Cell Populations, Insights from scRNA-seq, and SARS-CoV-2 Susceptibility
2021, Current stem cell reports
IF:2.3Q4
DOI:10.1007/s40778-021-00194-6
PMID:34697582
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究胎盘细胞类型特异性基因表达模式中的应用，并探讨了SARS-CoV-2感染的潜在性 | 利用单细胞RNA测序技术深入研究了胎盘细胞的基因表达模式，并结合人类胎盘数据探讨了SARS-CoV-2感染的可能性 | 需要进一步研究评估胎盘干细胞在开发新疗法中的应用 | 探讨胎盘发育及其在母胎医学中的重要性 | 胎盘的祖细胞群体及其基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及从胚胎第7天到第12.5天的多个小鼠胎盘样本及部分人类胎盘样本 |
| 7862 | 2024-09-28 |
[Advances in the application of single-cell sequencing technology in the study of neonatal necrotizing enterocolitis]
2024-Oct-02, Zhonghua er ke za zhi = Chinese journal of pediatrics
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7863 | 2024-09-28 |
Machine Learning Developed a MYC Expression Feature-Based Signature for Predicting Prognosis and Chemoresistance in Pancreatic Adenocarcinoma
2024-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10625-0
PMID:38245886
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研究论文 | 本研究开发了一种基于MYC表达特征的签名，用于预测胰腺腺癌的预后和化疗耐药性 | 首次在胰腺腺癌中建立了基于MYC表达特征的风险模型，并发现了与MYC表达和患者生存密切相关的七个基因 | 研究主要基于TCGA和其他数据库的数据，缺乏临床验证 | 开发一种新的生物标志物，用于预测胰腺腺癌患者的预后和化疗耐药性 | 胰腺腺癌患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理 | 胰腺癌 | LASSO回归分析 | 风险模型 | 基因表达数据 | 训练集包括TCGA数据库的胰腺腺癌患者数据，验证集包括GSE57495、GSE62452和ICGC-PACA数据库的数据 |
| 7864 | 2024-09-28 |
The miR-203/ZBTB20/MAFA Axis Orchestrates Pancreatic β-Cell Maturation and Identity During Weaning and Diabetes
2024-Oct-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0604
PMID:39058664
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研究论文 | 研究报告了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在断奶和糖尿病期间调控胰腺β细胞成熟和身份的机制 | 揭示了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在营养过渡期间调控β细胞成熟的新机制，并提出了一种通过操纵该轴来增加功能性β细胞数量以缓解糖尿病的新策略 | NA | 探讨营养过渡与β细胞成熟之间的分子机制 | 胰腺β细胞的成熟过程 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7865 | 2024-09-28 |
Interactions between fibroblasts and monocyte-derived cells in chronic lung injuries induced by real-ambient particulate matter exposure
2024-Oct, Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis
DOI:10.1016/j.mrgentox.2024.503807
PMID:39326935
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研究论文 | 研究长期暴露于细颗粒物（PM）引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的相互作用 | 揭示了特定成纤维细胞和单核细胞来源细胞亚群在长期PM暴露下的显著增加及其促炎和促纤维化功能 | 仅在C57BL/6 J雄性小鼠中进行了实验，结果的普适性有待验证 | 探讨长期暴露于细颗粒物（PM）引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的多样性和功能 | 成纤维细胞、髓源抑制细胞（MDSCs）和间质巨噬细胞（IMs） | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 16周暴露于石家庄市真实环境PM的C57BL/6 J雄性小鼠 |
| 7866 | 2024-09-28 |
Single-cell mapping of peripheral blood mononuclear cells reveals key transcriptomic changes favoring coronary artery lesion in IVIG-resistant Kawasaki disease
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37857
PMID:39323779
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了静脉免疫球蛋白（IVIG）抵抗型川崎病（KD）患者的外周血单核细胞（PBMCs）的转录组特征 | 首次全面描绘了IVIG抵抗型KD患者PBMCs的整体转录组图谱，揭示了CD8+效应T细胞分化受阻以及髓系细胞与T细胞之间的关键相互作用 | 样本量较小，仅包括12名参与者 | 探索IVIG抵抗型KD患者外周血单核细胞的转录组特征，揭示其与冠状动脉病变的关系 | IVIG抵抗型KD患者、IVIG反应型KD患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12名参与者，包括5名IVIG抵抗型KD患者、4名IVIG反应型KD患者和3名健康对照 |
| 7867 | 2024-09-28 |
Monocytes Reprogrammed by 4-PBA Potently Contribute to the Resolution of Inflammation and Atherosclerosis
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325023
PMID:39224974
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研究论文 | 研究探讨了4-PBA对单核细胞的重新编程作用及其在减轻炎症和动脉粥样硬化中的效果 | 首次展示了4-PBA能够将单核细胞重新编程为具有抗炎特性的细胞，并通过特定的分子机制实现这一效果 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其效果 | 探索4-PBA对单核细胞的重新编程及其在治疗动脉粥样硬化中的潜力 | 单核细胞、动脉粥样硬化 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫学方法、生物化学和遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | 高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠模型 |
| 7868 | 2024-09-28 |
Macrophage-Expressed Coagulation Factor VII Promotes Adverse Cardiac Remodeling
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324114
PMID:39234697
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研究论文 | 研究了巨噬细胞表达的凝血因子VII在心肌梗死后不良心脏重塑中的作用 | 首次揭示了外周TF-FVIIa-PAR2信号复合体在缺血性心脏病中驱动炎症性巨噬细胞极化的作用，并提出了针对这一信号复合体的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类适用性尚需进一步验证 | 探讨凝血-炎症回路在心肌梗死后巨噬细胞重编程中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 心肌梗死后巨噬细胞的极化和心脏重塑 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、共聚焦显微镜、纵向监测 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、显微镜图像 | 使用永久性左前降支结扎的小鼠模型进行研究 |
| 7869 | 2024-09-28 |
Loss of synovial tissue macrophage homeostasis precedes rheumatoid arthritis clinical onset
2024-Sep-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1252
PMID:39321281
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研究论文 | 本研究深入探讨了类风湿性关节炎（RA）患者、RA高风险个体和健康对照者的滑膜组织中髓系细胞的景观 | 发现了在RA临床发作前滑膜组织巨噬细胞稳态失衡的现象，并识别出早期致病性髓系特征，为早期诊断和治疗干预提供了独特的机会 | NA | 探讨类风湿性关节炎患者滑膜组织中髓系细胞的特征及其在疾病发生前的变化 | 类风湿性关节炎患者、RA高风险个体和健康对照者的滑膜组织 | NA | 类风湿性关节炎 | 流式细胞术、RNA测序、代谢分析、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 67,908个RA和健康对照者的滑膜组织细胞 |
| 7870 | 2024-09-28 |
Skewed epithelial cell differentiation and premature aging of the thymus in the absence of vitamin D signaling
2024-Sep-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9582
PMID:39321290
|
研究论文 | 研究了维生素D信号缺失对胸腺上皮细胞分化和胸腺衰老的影响 | 发现维生素D信号缺失会导致胸腺上皮细胞分化异常和胸腺过早衰老 | NA | 探讨维生素D信号缺失对胸腺功能和衰老的影响 | 胸腺上皮细胞和胸腺衰老 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Cyp27b1敲除小鼠 |
| 7871 | 2024-09-28 |
Systemic comparison of molecular characteristics in different skin fibroblast senescent models
2024-Sep-27, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003312
PMID:39329281
|
研究论文 | 本研究比较了不同皮肤成纤维细胞衰老模型中的转录组特征 | 首次系统比较了儿童和老年人皮肤成纤维细胞与四种衰老模型之间的转录组特征差异 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内实验 | 比较不同衰老模型中成纤维细胞的转录组特征 | 儿童和老年人皮肤成纤维细胞及四种衰老模型 | NA | NA | 流式细胞术、免疫荧光染色、实时定量聚合酶链反应、共培养免疫细胞、批量RNA测序 | NA | RNA | 儿童和老年人皮肤成纤维细胞及四种衰老模型样本 |
| 7872 | 2024-09-28 |
A Ctnnb1 enhancer transcriptionally regulates Wnt signaling dosage to balance homeostasis and tumorigenesis of intestinal epithelia
2024-Sep-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98238
PMID:39320349
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研究论文 | 本文研究了Ctnnb1增强子对Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的作用 | 发现了ieCtnnb1增强子在肠道稳态和肿瘤发生中的关键作用，揭示了增强子依赖的Wnt信号调控机制 | NA | 研究Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的机制 | Ctnnb1增强子及其在肠道上皮中的功能 | NA | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7873 | 2024-09-27 |
Kidney fibrosis molecular mechanisms Spp1 influences fibroblast activity through transforming growth factor beta smad signaling
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109839
PMID:39323737
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据深入探讨了肾脏纤维化过程中纤维母细胞和肌纤维母细胞的关键作用，并揭示了Spp1基因通过TGF-β/Smad信号通路促进纤维母细胞向肌纤维母细胞分化的机制 | 首次揭示了Spp1基因在肾脏纤维化中的关键作用及其通过TGF-β/Smad信号通路促进纤维母细胞分化的机制 | NA | 探讨肾脏纤维化过程中的分子机制 | 肾脏纤维化过程中的纤维母细胞和肌纤维母细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7874 | 2024-09-28 |
Unraveling the impact of lysosomal dysfunction on myeloproliferative neoplasm
2024-Sep, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70238
PMID:39320136
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研究论文 | 研究溶酶体功能障碍对骨髓增殖性肿瘤的影响及其病理机制 | 首次探讨了溶酶体功能障碍在骨髓增殖性肿瘤中的作用，并揭示了其通过诱导异常炎症促进肿瘤发展的机制 | 样本量较小，尤其是单细胞RNA测序的样本数量有限 | 阐明溶酶体功能障碍在骨髓增殖性肿瘤发病机制中的作用 | 骨髓增殖性肿瘤患者和健康对照组 | NA | 血液肿瘤 | 全转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据 | 190名骨髓增殖性肿瘤患者和461名健康对照组 |
| 7875 | 2024-09-28 |
Gene Misexpression in a Smoc2+ve/Sox2-Low Population in Juvenile Prop1-Mutant Pituitary Gland
2024-Aug-27, Journal of the Endocrine Society
IF:3.0Q2
DOI:10.1210/jendso/bvae146
PMID:39253355
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研究论文 | 研究了Prop1突变小鼠垂体中Smoc2阳性/Sox2低表达细胞群体的基因错误表达 | 发现了Prop1突变小鼠垂体中Smoc2阳性/Sox2低表达细胞群体的基因错误表达，并探讨了Smoc2和Sox2在垂体发育中的作用 | 研究仅限于Prop1突变小鼠，未探讨其他突变类型对垂体发育的影响 | 阐明Prop1突变小鼠垂体发育中Smoc2和Sox2的作用及其对垂体疾病的影响 | Prop1突变小鼠的垂体细胞 | NA | 垂体疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和Prop1突变P4雌性小鼠的垂体细胞 |
| 7876 | 2024-09-28 |
Benchmarking Algorithms for Gene Set Scoring of Single-cell ATAC-seq Data
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae014
PMID:39049508
|
研究论文 | 本文系统地评估了十种基因集评分（GSS）工具在单细胞ATAC-seq数据上的适用性和性能 | 首次系统地比较了多种GSS工具在单细胞ATAC-seq数据上的表现，并提供了实用的选择指南 | 研究主要集中在GSS工具的性能评估，未深入探讨其生物学意义 | 评估现有GSS工具在单细胞ATAC-seq数据上的适用性和性能 | 单细胞ATAC-seq数据和GSS工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因集评分数据 | 多达十个单细胞ATAC-seq数据集 |
| 7877 | 2024-09-28 |
Opportunities and Challenges in Advancing Plant Research with Single-cell Omics
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae026
PMID:38996445
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在植物研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了单细胞转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学等技术在植物科学中的应用 | 单细胞技术在植物中的应用受到细胞结构的限制 | 探讨单细胞组学技术在植物系统中的进展、未来研究应用及其面临的挑战 | 植物细胞类型及其发育过程 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7878 | 2024-09-28 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-May-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
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研究论文 | 研究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质中调节透明质酸基质外基质的作用及其对乳腺肿瘤生长的影响 | 首次揭示了LYVE-1+巨噬细胞在肿瘤微环境中促进肿瘤生长的机制，并展示了其在透明质酸重塑中的作用 | 研究主要基于遗传小鼠模型，可能无法完全反映人类乳腺肿瘤中的情况 | 探讨LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质中的功能及其对乳腺肿瘤生长的影响 | LYVE-1+巨噬细胞、透明质酸基质外基质、乳腺肿瘤 | NA | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 7879 | 2024-09-28 |
HCCDB v2.0: Decompose Expression Variations by Single-cell RNA-seq and Spatial Transcriptomics in HCC
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae011
PMID:38886186
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研究论文 | 本文介绍了HCCDB v2.0数据库，该数据库整合了肝细胞癌（HCC）临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据，提供了对HCC分子特征的深入理解 | 提出了sc-2D指标，用于总结细胞类型特异性和失调基因表达模式，并整合了最新的单细胞和空间转录组数据 | NA | 通过整合大规模转录组数据，深入理解肝细胞癌的分子特征 | 肝细胞癌（HCC）临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 共整合了3917个bulk样本和1656个新样本，以及182,832个单细胞和69,352个空间位点 |
| 7880 | 2024-09-28 |
cnnImpute: missing value recovery for single cell RNA sequencing data
2024-02-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53998-x
PMID:38365936
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研究论文 | 本文介绍了一种基于卷积神经网络（CNN）的方法cnnImpute，用于恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 提出了cnnImpute，一种新颖的基于卷积神经网络的方法，用于解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 未提及 | 开发一种有效的方法来恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络（CNN） | RNA测序数据 | 未提及 |