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当前共找到 40705 篇文献,本页显示第 7861 - 7880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7861 2026-02-21
A muscle-centered hierarchical breakdown underlies flight loss during silkworm domestication
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了家蚕在驯化过程中飞行能力丧失的分子机制,发现其核心在于飞行肌细胞的协调性崩溃 首次通过整合单细胞与空间转录组学解析昆虫飞行能力退化的多层次遗传模块,并发现该肌肉中心模块在迁徙性害虫中具有保守性 研究主要聚焦于家蚕与飞蛾两种物种,其他昆虫飞行能力退化的普适性机制仍需进一步验证 探究昆虫在驯化过程中复杂性状(飞行能力)退化的进化回归机制 家蚕及其飞行能力祖先飞蛾的发育期飞行器官,以及迁徙性害虫飞蛾 单细胞组学 NA 单细胞转录组测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据, 空间基因表达数据 未明确说明具体样本数量,涉及家蚕、飞蛾及迁徙性害虫飞蛾的飞行器官 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
7862 2026-02-21
Mathematical analysis of G1/S sub-networks in hematopoietic proliferation: Sequential and lineage-specific activation
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过计算分析和数学建模,研究了造血细胞中G1/S亚网络的激活模式,揭示了不同细胞类型在相同微环境中具有独特增殖特性的机制 首次将68种造血细胞类型映射到特定模型参数,并识别它们通过G1/S的个体化路径,为造血增殖提供了新的机制见解 研究基于已发表的单细胞转录组数据,可能受数据质量和样本异质性限制,且为理论工作需实验验证 探究造血细胞中G1/S网络与发育阶段的协调机制,以理解增殖与分化的平衡 人类骨髓中的造血干细胞和谱系祖细胞 计算生物学 NA 单细胞转录组学 数学模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7863 2026-02-21
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal tumor immunometabolism in lymph node metastasis of lung cancer
2026-Feb-19, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了肺癌淋巴结转移中肿瘤免疫代谢的调控机制 首次在肺癌淋巴结转移中鉴定出MOCCI驱动的氧化磷酸化重编程的PLMC亚群,并揭示了其通过GDF15-TGFBR2轴信号驱动Tfh耗竭和抑制B细胞活化的空间相互作用机制 样本量相对较小(10名患者),且主要基于转录组数据,功能验证仍需进一步扩展 探究肺癌淋巴结转移中肿瘤细胞代谢适应与免疫微环境相互作用的机制 肺癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结、未受累淋巴结和外周血样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,T细胞受体/B细胞受体测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 37个匹配样本(来自10名肺癌患者),共捕获671,467个细胞;另有一个独立队列(n=875)用于预后验证 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
7864 2026-02-21
Ketogenic Diet as an Epigenetic Therapy in SETD1B-Related Epilepsy
2026-Feb-19, Annals of clinical and translational neurology IF:4.4Q1
研究论文 本研究报道了一名患有SETD1B相关失神性癫痫的4岁男孩,在传统药物治疗无效后,通过改良阿特金斯生酮饮食实现了超过90%的癫痫发作减少,并通过单细胞RNA测序揭示了生酮饮食对染色质、核糖体、免疫和线粒体通路基因调控的逆转作用 首次将生酮饮食作为表观遗传疗法应用于SETD1B相关癫痫,并通过单细胞RNA测序在单细胞分辨率上展示了生酮饮食对染色质介导的基因调控通路的广泛逆转效应 研究仅基于单个病例,样本量有限,且缺乏长期随访数据 探索生酮饮食作为表观遗传疗法在SETD1B相关癫痫中的治疗效果及分子机制 一名4岁SETD1B相关失神性癫痫男性患者 单细胞组学 癫痫 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3个样本(基线、治疗3个月、年龄匹配对照),共25,159个外周单个核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7865 2026-02-21
Intestinal epithelial Smad7 drives purine metabolic dysregulation and ileal inflammation
2026-Feb-17, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本研究探讨了肠道上皮细胞中Smad7过表达如何通过干扰嘌呤代谢(特别是降低CD73介导的腺苷生成)导致自发性回肠炎,并揭示了其在克罗恩病病理中的作用 首次通过空间转录组学与代谢组学整合分析,揭示了上皮Smad7过表达通过下调CD73破坏嘌呤代谢-腺苷轴,从而驱动回肠炎症的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仅限于相关性分析,缺乏直接因果证据;腺苷治疗的长期效果和安全性未评估 阐明肠道上皮细胞中Smad7表达在回肠炎症发生中的具体作用机制 Smad7过表达转基因小鼠(Smad7TgCre+)的肠道组织、肠道上皮细胞(IECs)以及克罗恩病患者的回肠组织样本 空间转录组学 克罗恩病 空间转录组学、代谢组学、多重免疫荧光、流式细胞术 转基因小鼠模型 空间转录组数据、代谢组数据、组织图像、流式细胞数据 未明确样本数量,涉及Smad7TgCre+转基因小鼠、对照小鼠及克罗恩病患者回肠组织 NA 空间转录组学 NA NA
7866 2026-02-21
Relevance of Chemokines in Mobilizing γδ T Cells in the Biliary Tract Cancer Microenvironment: Potential for γδ T-Cell-Based Adoptive Cell Therapy
2026-Feb-17, American journal of clinical oncology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析胆道癌肿瘤微环境中的趋化因子表达模式,探讨了γδ T细胞的招募机制及其在基于γδ T细胞的过继细胞疗法中的潜在应用 首次利用单细胞RNA测序全面描绘胆道癌肿瘤微环境中的趋化因子景观,揭示了支持γδ T细胞浸润的选择性趋化因子招募特征,并发现了免疫抑制群体的共招募现象 研究样本量较小(19名患者),且为回顾性分析,需要进一步实验验证趋化因子介导的招募机制 探究胆道癌肿瘤微环境中趋化因子介导的γδ T细胞招募机制,为开发基于γδ T细胞的过继细胞疗法提供理论基础 胆道癌患者的肿瘤组织样本 单细胞组学 胆道癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 19名患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7867 2026-02-21
JADE: Joint Alignment and Deep Embedding for Multi-Slice Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为JADE的统一计算框架,用于多切片空间转录组学数据的联合对齐和深度嵌入分析 JADE首次在共享潜在空间中联合优化对齐和表示学习,采用循环框架交替进行对齐和嵌入细化,并利用注意力机制动态评估嵌入维度的重要性 NA 解决多切片空间转录组学数据中的空间对应关系和共享转录组特征识别问题 10x Visium人类背外侧前额叶皮层和Stereo-seq蝾螈脑数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学 深度学习框架(含注意力机制) 空间转录组学数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
7868 2026-02-21
Follicular Helper T Cells and B Cell Maturation in Patients with 22q11.2 Deletion Syndrome and Recurrent Infections
2026-Feb-03, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA-seq技术,分析了22q11.2缺失综合征患者(特别是伴有反复感染的患者)与对照组的基因表达模式,重点关注了T细胞功能异常和B细胞成熟减少的机制 首次在22q11.2缺失综合征患者中,通过单细胞RNA-seq技术,系统性地揭示了跨所有细胞类型的I型干扰素特征,并在滤泡辅助T细胞中识别出衰老特征,特别是在反复感染患者中最为显著 样本量相对较小(患者N=13,对照N=11),且研究主要基于基因表达分析,未深入验证功能机制 利用单细胞RNA-seq技术,更好地定义22q11.2缺失综合征患者(尤其是伴有反复感染的患者)中改变的基因表达模式,以阐明与反复感染相关的机制 22q11.2缺失综合征患者(包括伴有反复感染的亚组)和健康对照 数字病理学 免疫缺陷综合征 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 患者13例,对照11例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7869 2026-02-21
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了慢性乙型肝炎病毒(CHB)感染中库普弗细胞(KCs)的免疫分区紊乱如何通过LXRα介导的脂质代谢失调诱导癌症干细胞形成 首次揭示了库普弗细胞在肝脏疾病进展中的空间分区作用,并阐明了LXRα在KCs中通过脂质代谢失调和Stat3通路介导癌症干细胞形成的分子机制 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型,人类样本验证相对有限;机制研究集中在KCs与肝细胞的相互作用,其他免疫细胞类型的作用可能未完全涵盖 探究慢性乙型肝炎病毒(CHB)感染如何通过肝脏微环境中的细胞间通讯驱动从炎症到肝细胞癌的疾病进展 AAV-HBV小鼠模型、人类HBV患者肿瘤组织、库普弗细胞(KCs)、肝细胞、内皮细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 AAV-HBV小鼠模型(时间序列样本)、人类HBV患者肿瘤组织(包括正常组织、癌旁组织和肿瘤组织) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
7870 2026-02-21
CD168 Identifies Proliferating Pancreatic Islet Cells in Murine and Human
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文发现CD168作为小鼠和人类胰岛中增殖细胞的保守表面标记物,用于富集活体增殖β细胞 首次鉴定CD168为胰岛增殖细胞的保守表面标记,并开发CD168-CreERT2小鼠模型进行谱系追踪,揭示新生β细胞约60天的成熟轨迹 未明确说明样本量限制或技术潜在偏差 研究糖尿病治疗中通过增殖恢复功能性β细胞质量的目标 小鼠和人类胰岛细胞,特别是增殖中的β细胞 单细胞生物学 糖尿病 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫染色,谱系追踪,多组学分析 CD168-CreERT2小鼠模型 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,免疫染色图像,谱系追踪数据 未明确指定具体样本数量,但提到成年胰岛细胞中CD168细胞约占0.5% NA 单细胞RNA-seq NA NA
7871 2026-02-21
BHLHE40 Orchestrates Effector Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells and Limits Long-Term Survival of Kidney Graft
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过小鼠肾移植模型,利用单细胞和空间转录组学技术,揭示了CD49aPD1 CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞亚群在移植排斥中的作用,并发现BHLHE40是其分化和功能的关键调控因子 首次在小鼠肾移植模型中鉴定出CD49aPD1 CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞亚群,并阐明BHLHE40通过TGF-β信号调控其分化和功能,强调了驻留免疫细胞而非循环细胞在移植排斥中的主导作用 研究基于小鼠模型,结果在人类肾移植中的适用性需进一步验证;长期观察机制的具体时间点未详细说明 探究组织驻留记忆T细胞在肾移植排斥中的分化和稳态机制 小鼠肾移植模型中的CD8+ T细胞,特别是CD49aPD1亚群 数字病理学 肾移植排斥 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据,空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
7872 2026-02-21
RBM15/IGF2BP3 promotes immune escape in bladder cancer by enhancing m6A modification of PFKFB4
2026-Feb, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究揭示了RBM15通过m6A修饰和IGF2BP3依赖的机制稳定PFKFB4表达,从而促进膀胱癌糖酵解并抑制CD8 T细胞功能,为免疫治疗提供了新靶点 首次整合单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq和乳酰化蛋白质组学,阐明了RBM15通过m6A-IGF2BP3-PFKFB4轴调控肿瘤糖酵解和免疫逃逸的双重机制,并验证了靶向RBM15可增强抗PD1疗法疗效 研究主要基于膀胱癌模型,机制在其他癌种中的普适性有待验证;体内实验仅使用了siRNA沉默策略,缺乏更特异的基因编辑验证 探究m6A修饰在膀胱癌肿瘤微环境塑造中的作用,特别是RBM15在调控糖酵解和免疫逃逸中的分子机制 膀胱癌恶性上皮细胞、CD8 T细胞、RBM15/IGF2BP3/PFKFB4分子轴 肿瘤免疫学 膀胱癌 单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq、乳酰化蛋白质组学、RIP-qPCR、MeRIP-qPCR、荧光素酶报告实验、RNA稳定性检测、脂质纳米颗粒递送 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、m6A修饰数据、蛋白质组数据、体外功能实验数据、体内治疗数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
7873 2026-02-21
Enteric nervous system and inflammatory bowel disease
2026-Feb, Gastroenterology report IF:3.8Q2
综述 本文综述了肠道神经系统(ENS)与炎症性肠病(IBD)之间复杂的相互作用,探讨了ENS功能障碍如何促进IBD的发病机制,并评估了靶向ENS的治疗潜力 强调了ENS作为“第二大脑”在IBD中的核心作用,系统阐述了ENS功能障碍(如神经兴奋性增高、突触脆弱性)与肠道炎症的双向关联,并指出了靶向ENS的神经调控疗法作为新兴治疗前沿 研究ENS面临神经元细胞丰度低、技术限制等挑战,需要空间转录组学等先进方法来克服 探讨ENS在IBD发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 肠道神经系统、炎症性肠病、肠道胶质细胞、神经免疫相互作用 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
7874 2026-02-21
Applications of Spatial Transcriptomics in Ischemic Stroke Research
2026-Jan-31, The American journal of pathology
综述 本文综述了空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用,重点探讨了胶质细胞在卒中病理生物学中的复杂作用 通过结合空间转录组学与单细胞及多组学方法,识别了新的治疗靶点,如不同激活状态的胶质细胞及其关键信号通路 当前研究仍面临挑战,包括需要多时间点分析、三维重建和标准化数据集以推动临床应用 探讨空间转录组学如何促进对卒中后细胞变化的理解,并推动卒中研究与治疗 缺血性卒中后的脑组织,特别是小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 缺血性卒中 空间转录组学,单细胞多组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
7875 2026-02-21
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出DRIFT框架,通过热核扩散在空间图上整合空间上下文到基础模型的输入表示中,以改进空间转录组学分析 利用热核扩散在空间图上传播嵌入,将ST数据的局部邻域上下文整合到现有单细胞基础模型中,弥补了空间信息利用的不足 未明确提及具体局限性,但可能依赖于基础模型的性能和数据质量 开发一个通用框架,将空间上下文整合到基础模型中,以提升空间转录组学数据的分析性能 空间转录组学数据及其在细胞类型注释、聚类和跨样本对齐等任务中的应用 数字病理学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 基础模型(包括scRNA-seq和ST-based模型) 基因表达谱数据(空间转录组学和单细胞RNA测序数据) NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
7876 2026-02-21
scAURA: Alignment- and Uniformity-based Graph Debiased Contrastive Representation Architecture for Self-Supervised Clustering of Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为scAURA的统一框架,结合图去偏对比学习和自监督聚类,用于单细胞转录组数据的细胞类型识别 scAURA通过整合图去偏对比学习与自监督聚类,解决了单细胞RNA测序数据中的高维性、稀疏性和噪声问题,在多个数据集上超越了现有最先进方法 NA 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和鲁棒性 人类和小鼠的单细胞转录组数据 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 图去偏对比学习架构 单细胞转录组数据 18个真实单细胞数据集,涵盖多种组织和细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7877 2026-02-21
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2,驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织,阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2转录来驱动肿瘤进展的新机制 研究主要基于患者来源的组织和细胞系,体内模型为异种移植小鼠模型,未来需要在更接近人类肿瘤微环境的基因工程小鼠模型中进一步验证 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 肿瘤生物学 恶性外周神经鞘瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot NA RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
7878 2026-02-21
Spatially resolved transcriptome-metabolome integration reveals region-specific glial lipid dysregulation associated with Alzheimer's pathology
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个名为iMIST的集成平台,结合代谢物成像、组织学和空间转录组学,揭示了阿尔茨海默病小鼠模型中胶质细胞脂质代谢失调的区域特异性模式及其与病理的联系 首次开发了iMIST集成平台,能够在同一组织切片上整合MALDI代谢物成像、组织学和空间转录组学数据,直接展示了胶质细胞稳态失调如何在不同脑区和微环境中表现,并将局部病理与整体代谢失衡联系起来 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;技术整合的复杂性可能限制其广泛推广 探究阿尔茨海默病中胶质细胞脂质代谢失调的空间分布特征及其与病理的关联 晚发性阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 空间转录组学 阿尔茨海默病 MALDI代谢物成像,空间转录组学,组织学分析 NA 空间多组学数据(代谢组、转录组、图像) NA NA 空间转录组学 NA NA
7879 2026-02-21
Super-resolved, three-dimensional spatial transcriptomics reveals cell-type and brain-region-specific modulation of key epitranscriptomic switches following adolescent alcohol exposure
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种超分辨三维空间转录组学方法,用于量化大鼠脑内关键表观转录组开关在青少年酒精暴露后的细胞类型和脑区特异性变化 开发了首个超分辨三维空间转录组学方法,实现了在完整脑组织中以细胞类型和脑区特异性方式量化关键表观转录组调节因子 研究仅针对特定表观转录组调节因子(m6A甲基转移酶),且仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人类样本或更广泛的表观转录组标记中验证 阐明表观转录组机制在神经精神疾病中的作用,特别是青少年酒精暴露对大脑表观转录组调控的影响 大鼠脑组织(包括杏仁核中央核、海马CA1区、齿状回、杏仁基底外侧核、海马CA3区)中的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 空间转录组学 神经精神疾病 空间转录组学,表观转录组分析 NA 空间转录组数据,RNA表达数据 青少年间歇性乙醇暴露(AIE)大鼠模型 NA 空间转录组学 NA 超分辨三维空间转录组学方法(作者自主研发)
7880 2026-02-21
The Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术,构建了福鼎大白茶的高质量单倍型基因组,揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 首次利用单细胞测序技术对茶叶精子细胞进行测序,结合长读长测序实现高精度单倍型基因组组装,并建立了基于半同胞的QTL定位平台 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种,其他茶叶品种的基因组变异和代谢多样性可能未被全面覆盖 探究茶叶基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 福鼎大白茶(Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha)的基因组和代谢产物 基因组学 NA 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 NA 基因组序列数据, 代谢组数据 107个精子细胞 PacBio, Oxford Nanopore Technologies 单细胞测序, 长读长测序 PacBio HiFi, ONT PacBio HiFi测序和ONT超长测序技术
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