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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7821 2025-11-14
Single cell deciphering of pruritic keloids: the interaction between fibroblasts and Schwann cells through the Midkine signaling
2025, Burns & trauma IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示瘢痕疙瘩中成纤维细胞与雪旺细胞通过Midkine信号通路的相互作用机制 首次发现Midkine(MDK)在瘢痕疙瘩疼痛和瘙痒中的关键作用,并阐明成纤维细胞通过MDK激活修复表型雪旺细胞的分子机制 未明确MDK信号通路的具体下游分子机制 探索成纤维细胞和雪旺细胞在瘙痒性和疼痛性瘢痕疙瘩中的潜在作用 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞和雪旺细胞 单细胞测序分析 皮肤纤维增生性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7822 2025-11-14
Different metabolic paradigms and distribution of regulatory T cells between primary and lymph node metastasis prostate cancer
2025, CytoJournal IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析比较了原发性前列腺癌和淋巴结转移中调节性T细胞的代谢特征和分布差异 首次在单细胞水平揭示了前列腺癌原发灶与转移灶中Treg细胞亚群的代谢重编程差异及其与淋巴转移的关系 样本量有限,需要更大规模的研究验证结果 探究前列腺癌原发灶与淋巴结转移中调节性T细胞的代谢特征和分布差异 原发性前列腺癌和淋巴结转移组织样本 单细胞测序分析 前列腺癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7823 2025-11-14
Development of a novel prognostic prediction model using mitochondrial-related genes and single-cell sequencing data for colorectal carcinoma
2025, Translational gastroenterology and hepatology IF:3.8Q2
研究论文 本研究开发了一种基于线粒体相关基因和单细胞测序数据的结直肠癌预后预测模型 首次结合单细胞RNA测序数据和线粒体基因集构建结直肠癌预后预测模型,识别出5个关键线粒体基因并建立风险评分系统 需要在更广泛的患者队列中验证研究结果,样本来源相对有限 系统研究线粒体基因在结直肠癌中的预后潜力,开发可靠的风险评分模型 结直肠癌患者组织样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,基因集富集分析,通路分析,Cox比例风险回归分析 Cox回归模型,风险评分模型 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 TCGA数据库结直肠癌组织样本,外部验证集GSE17536队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7824 2025-11-14
Decoding the Prognosis-Related S100A9high Monocyte in Glioblastoma Using Single-Cell and Spatial Transcriptome Sequencing
2025, OncoTargets and therapy IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组测序技术揭示了胶质母细胞瘤中S100A9高表达单核细胞的异质性及其与不良预后的关联 首次从配体-受体网络角度识别胶质母细胞瘤亚型,并发现S100A9高表达单核细胞这一新型预后不良相关细胞亚群 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究主要基于体外实验 解析胶质母细胞瘤中单核细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的功能 胶质母细胞瘤患者样本中的单核细胞和巨噬细胞 单细胞生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫荧光, T细胞共培养实验 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 NA NA
7825 2025-11-14
Unraveling the Heterogeneity of Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma by SingleCell RNA Sequencing and its Implications for Prognosis and Therapeutic Response
2024-11-28, The Turkish journal of gastroenterology : the official journal of Turkish Society of Gastroenterology
综述 通过单细胞RNA测序技术解析肝细胞癌肿瘤免疫微环境的异质性及其对预后和治疗反应的影响 首次从细胞、转录和标志物三个维度系统阐述肝细胞癌肿瘤免疫微环境异质性,并探讨其在免疫治疗时代的意义 对肿瘤免疫微环境异质性在肝细胞癌发展中的作用理解仍有限 探索肝细胞癌肿瘤免疫微环境异质性及其临床意义 肝细胞癌肿瘤免疫微环境 单细胞测序分析 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7826 2025-11-14
Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
2024-11-12, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究揭示了髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的关键作用及其受组蛋白突变调控的机制 首次在免疫健全的原位小鼠模型中证实髓系细胞是pHGGs中主要的非肿瘤浸润细胞,并发现组蛋白突变和肿瘤位置共同塑造髓系细胞异质性 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩展 探究髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用及潜在治疗靶点 儿童高级别胶质瘤(pHGGs)包括半球pHGGs和弥漫中线胶质瘤(DMGs) 单细胞生物学 儿童高级别胶质瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织切片图像 小鼠模型和人类pHGG样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7827 2025-11-14
CoCo-ST: Comparing and Contrasting Spatial Transcriptomics data sets using graph contrastive learning
2024-May-20, Research square
研究论文 提出一种名为CoCo-ST的图对比学习特征表示方法,用于比较和对比空间转录组数据集 通过引入代表正常组织的背景数据集,增强目标数据集中有趣模式的识别,同时减少共享主导模式的影响 方法主要针对空间转录组数据,在其他数据类型上的适用性尚未验证 开发能够更好识别空间转录组数据中生物学相关特征的方法 小鼠癌前肺组织样本 空间转录组学 肺癌 图对比学习 图对比学习模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
7828 2025-11-14
Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice
2023-12, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究揭示了衰老过程中记忆CD8+ T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆性扩增及其促动脉粥样硬化作用 首次发现衰老相关的记忆CD8+ T细胞亚群在动脉粥样硬化斑块中克隆性扩增并具有促动脉粥样硬化功能 研究仅使用雌性小鼠,未涉及雄性动物模型 探究衰老对CD8 T细胞在动脉粥样硬化发生过程中的作用机制 年轻和年老雌性小鼠的CD8 T细胞及动脉粥样硬化斑块 免疫学 心血管疾病 单细胞RNA测序,适应性转移实验,细胞清除实验 NA 单细胞转录组数据 年轻和年老雌性小鼠群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7829 2025-11-14
scDiffCom: a tool for differential analysis of cell-cell interactions provides a mouse atlas of aging changes in intercellular communication
2023-11, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 开发了scDiffCom工具和scAgeCom图谱,用于分析细胞间通讯的年龄相关变化 提供了首个覆盖23个小鼠组织的细胞间通讯衰老变化图谱,基于约5000个配体-受体相互作用 仅基于小鼠单细胞转录组数据,尚未在人类数据中验证 量化并探索细胞间通讯在衰老过程中的变化 小鼠23个组织的单细胞RNA测序数据 单细胞转录组学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 58个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7830 2025-11-14
Spatial and single-cell profiling of the metabolome, transcriptome and epigenome of the aging mouse liver
2023-11, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学结合单细胞多组学技术揭示了小鼠肝脏中不同区域细胞随年龄变化的代谢、表观遗传和转录组特征 首次整合空间转录组学、单细胞ATAC-seq和RNA-seq、脂质组学及功能分析,揭示肝脏微环境对细胞衰老轨迹的空间依赖性影响 研究仅针对雄性小鼠肝脏,未涉及雌性个体或其他组织类型 探究组织微环境变化如何影响不同空间位置细胞的表观遗传、代谢和表型特征随年龄的变化 雄性小鼠肝脏中的肝细胞 空间生物学,单细胞多组学 衰老相关疾病 空间转录组学,单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq,脂质组学,功能分析 NA 空间转录组数据,单细胞表观基因组数据,单细胞转录组数据,代谢组数据 NA NA 空间转录组学,单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq,脂质组学 NA NA
7831 2025-11-14
CD133+ endothelial-like stem cells restore neovascularization and promote longevity in progeroid and naturally aged mice
2023-11, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学鉴定出CD133+骨髓源性内皮样细胞,证明其能恢复衰老小鼠的新血管形成并延长寿命 首次鉴定CD133+内皮样干细胞作为潜在内皮祖细胞,并发现法尼基二磷酸合酶(FDPS)在衰老过程中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需验证 探索干细胞衰老机制及治疗早衰症和年龄相关疾病的策略 早衰模型小鼠和自然衰老小鼠 单细胞生物学 衰老相关疾病 谱系追踪, 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据 早衰和自然衰老小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7832 2025-11-14
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-06, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现皮肤老化与淋巴源性IL-17信号通路相关,并证明阻断该通路可延缓皮肤衰老特征 首次揭示皮肤衰老过程中T细胞、γδ T细胞和先天淋巴样细胞向IL-17表达表型的倾斜,并证明靶向IL-17信号可延缓皮肤老化 研究基于小鼠模型,尚未在人类皮肤中得到验证 探究皮肤衰老的炎症机制及干预策略 小鼠皮肤真皮层细胞 单细胞组学 皮肤衰老 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7833 2025-11-13
Single-cell immune landscape of acute kidney injury after cardiac surgery with cardiopulmonary bypass
2025-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了心脏手术后急性肾损伤患者的免疫细胞景观 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和蛋白质微阵列技术研究心脏手术相关急性肾损伤 单中心研究,样本量较小(4名患者) 阐明心脏手术后急性肾损伤的免疫细胞机制 接受心脏手术的成年患者 单细胞分析 急性肾损伤 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质微阵列 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质微阵列数据 4名患者,42,362个免疫细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7834 2025-11-13
Multimodal learning enables chat-based exploration of single-cell data
2025-Nov-11, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 开发了名为CellWhisperer的人工智能模型和软件工具,用于通过自然语言对话探索单细胞数据 建立了转录组与其文本注释的多模态嵌入,通过对比学习连接基因表达与文本描述,实现自然语言交互式探索单细胞数据 NA 解决单细胞测序数据解释的挑战,实现交互式单细胞数据探索 单细胞RNA测序数据和文本注释 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序,对比学习 多模态嵌入模型,大语言模型 基因表达数据,文本数据 100万个RNA测序图谱 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7835 2025-11-13
Identification of mitochondria-related hub genes and immune associations in acute myocardial infarction: A bioinformatic analysis
2025-Nov-07, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过生物信息学分析识别急性心肌梗死中线粒体相关枢纽基因及其与免疫系统的关联 首次系统性地识别了5个与线粒体相关的AMI诊断枢纽基因,并揭示了这些基因与免疫细胞的关联机制 这是一项探索性研究,需要严格的外部验证才能考虑临床应用 探索急性心肌梗死中线粒体代谢与免疫反应的相互作用机制 急性心肌梗死患者的基因表达数据 生物信息学 心血管疾病 差异表达分析、富集分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞测序、实时定量PCR 机器学习、列线图模型 基因表达数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
7836 2025-11-13
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化为免疫抑制状态中的关键作用及其对免疫疗法的负面影响 首次发现NRF2激活梯度将肿瘤相关巨噬细胞分为促炎CXCL9+和抗炎SPP1+亚群,并证明其通过沉默IFN-STAT1通路导致免疫抑制 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的验证仍需进一步临床研究 探索NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化中的作用及其对免疫疗法疗效的影响 肿瘤相关巨噬细胞、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 肿瘤免疫学 结肠癌、乳腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 小鼠肿瘤模型 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
7837 2025-11-13
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 首次在单细胞水平上揭示了n-irAEs患者体内存在特异性克隆扩增的CD4+CTLs,并发现其表达与神经炎症相关的效应基因谱 样本量较小(仅17例患者),且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 探究免疫检查点抑制剂治疗诱发神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,包括8例急性神经毒性患者 单细胞基因组学 癌症治疗相关神经系统并发症 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 伪时间分析 单细胞转录组数据,TCR序列数据 17例癌症患者(8例n-irAEs患者),共186,435个免疫细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7838 2025-11-13
Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析,揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 首次在单细胞水平系统描述了CAR-T治疗后骨髓微环境的动态变化,发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 样本量有限,需要在更大队列中验证发现;机制研究主要基于相关性分析,需要进一步功能验证 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境变化与治疗反应的关系 B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞人源化小鼠模型 单细胞生物学 B细胞急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 B-ALL患者治疗前后骨髓样本,人源化小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7839 2025-11-13
TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了TRIM28通过PARP1 SUMO化和NAD+耗竭驱动透明细胞肾细胞癌免疫逃逸的新机制 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制促进免疫抵抗:稳定PARP1并促进其SUMO化,以及耗竭肿瘤微环境中的NAD+ 研究主要基于细胞模型和动物实验,需要进一步临床验证 探索透明细胞肾细胞癌中免疫逃逸的分子机制 透明细胞肾细胞癌细胞系、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 癌症免疫学 肾细胞癌 单细胞转录组学、RNA-seq、质谱分析、代谢组学、虚拟筛选 Geneformer、患者来源异种移植模型 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA GSE159115数据集
7840 2025-11-13
SPP1high macrophage-induced T-cell stress promotes colon cancer liver metastasis through SPP1/CD44/PI3K/AKT signaling
2025-Oct-20, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示SPP1高表达巨噬细胞通过SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路诱导T细胞应激状态促进结肠癌肝转移的机制 首次发现SPP1高表达巨噬细胞诱导的T细胞应激状态在结肠癌肝转移中的作用,并揭示SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路机制 研究样本量有限,主要基于体外实验验证机制 阐明结肠癌肝转移免疫抑制微环境的形成机制并寻找免疫治疗新靶点 结肠癌肝转移患者的肿瘤标本和匹配的肝转移灶 单细胞转录组学 结肠癌肝转移 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 结肠癌肝转移患者肿瘤标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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