单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 7781 - 7800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7781 | 2024-10-01 |
Factors Affecting Cell Viability during the Enzymatic Dissociation of Human Endocrine Tumor Tissues
2024-Aug-27, Biology
DOI:10.3390/biology13090665
PMID:39336093
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研究论文 | 研究了酶解法分离人内分泌肿瘤组织过程中影响细胞活力的因素 | 探讨了不同酶解参数对不同类型肿瘤细胞活力的影响，强调了优化组织消化协议的重要性 | 未详细说明具体的优化方法和实验结果 | 研究酶解法分离人内分泌肿瘤组织过程中影响细胞活力的因素 | 人内分泌肿瘤组织及其细胞 | 数字病理学 | 内分泌肿瘤 | 酶解法 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 7782 | 2024-10-01 |
Helicobacter pylori CagA Promotes the Formation of Gallstones by Increasing the Permeability of Gallbladder Epithelial Cells
2024 May-Jun, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.13100
PMID:38873839
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研究论文 | 研究了幽门螺杆菌CagA通过增加胆囊上皮细胞的通透性促进胆结石形成的作用 | 首次发现幽门螺杆菌CagA是导致胆结石形成的关键致病因素 | 研究主要基于小鼠模型和少量患者样本，需要进一步的人体研究验证 | 探索导致慢性炎症和胆结石形成的关键致病菌及其机制 | 胆结石患者和小鼠模型的胆囊上皮细胞 | NA | 胆结石 | 单细胞转录组测序、bulk转录组测序、16S rRNA测序 | NA | 转录组数据、微生物组数据 | 6名胆结石患者和6名肝移植供体的胆囊黏膜样本，以及胆结石小鼠模型 |
| 7783 | 2024-10-01 |
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03475-7
PMID:37382633
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响 | 首次探讨了在CAR T细胞制造过程中敲除CD70对T细胞扩增、存活和抗肿瘤效果的影响 | 研究仅限于实验室环境，尚未在临床上验证其效果 | 探讨CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响，为CAR T细胞治疗T细胞癌症提供指导 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞的制造和抗肿瘤能力 | 细胞治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞 |
| 7784 | 2024-10-01 |
Identification of an antigen-presenting cells/T/NK cells-related gene signature to predict prognosis and CTSL to predict immunotherapeutic response for lung adenocarcinoma: an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03485-5
PMID:37458771
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研究论文 | 本研究旨在通过综合分析bulk和单细胞RNA测序数据，识别与抗原呈递细胞（APC）/T/NK细胞相关的基因特征（ATNKGS）和潜在的免疫细胞相关基因（IRGs），以实现肺癌腺癌（LUAD）患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 本研究首次构建了一个包含16个基因的ATNKGS，用于预测LUAD患者的总体生存率，并揭示了CTSL在免疫治疗反应预测中的重要作用 | 本研究主要基于公共数据集和外部免疫治疗队列进行验证，未来需要更多的临床试验数据来进一步验证这些发现 | 识别与APC/T/NK细胞相关的基因特征和潜在的免疫细胞相关基因，以实现LUAD患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 肺癌腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | 1108名患者 |
| 7785 | 2024-10-01 |
Female Gene Networks Are Expressed in Myofibroblast-Like Smooth Muscle Cells in Vulnerable Atherosclerotic Plaques
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319325
PMID:37589136
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研究论文 | 研究探讨了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达 | 首次揭示了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达，并识别了两个主要的平滑肌细胞基因调控网络 | 研究主要集中在人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型上，可能无法完全代表所有动脉粥样硬化情况 | 探讨女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的作用 | 人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类颈动脉斑块样本和Apoe-/-小鼠模型 |
| 7786 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用，能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型，并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序，可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7787 | 2024-10-01 |
Effects of 3-HAA on HCC by Regulating the Heterogeneous Macrophages-A scRNA-Seq Analysis
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202207074
PMID:37013458
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研究论文 | 研究3-HAA对肝细胞癌（HCC）的免疫调节作用及其对异质性巨噬细胞的影响 | 首次通过scRNA-Seq分析揭示了3-HAA在HCC中的免疫调节作用及其对巨噬细胞亚群的影响 | 研究仅限于实验模型，尚未在临床环境中验证 | 探讨3-HAA在肝细胞癌中的免疫调节作用 | 3-HAA对HCC模型中巨噬细胞亚群的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及HCC模型的多个细胞亚群 |
| 7788 | 2024-10-01 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535410
PMID:37066368
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研究论文 | 研究了与结直肠癌相关的关键病原体如何促进致癌重编程 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了Fn和ETBF在结直肠癌模型小鼠中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨关键病原体在结直肠癌中的作用及其对上皮细胞和局部免疫细胞的影响 | 结直肠癌患者肠道微生物群中的Fn和ETBF | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和结直肠癌模型小鼠 |
| 7789 | 2024-10-01 |
A method for low-coverage single-gamete sequence analysis demonstrates adherence to Mendel's first law across a large sample of human sperm
2022-12-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76383
PMID:36475543
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研究论文 | 开发了一种名为rhapsodi的方法，用于分析低覆盖率的单配子测序数据，并验证了人类精子样本中孟德尔第一定律的遵守情况 | 提出了rhapsodi方法，利用稀疏的配子基因型数据进行二倍体基因组分型、缺失基因型推断和减数分裂重组断点的发现 | 研究主要集中在人类精子样本，可能不适用于其他物种或组织类型 | 验证孟德尔分离定律在人类精子中的遵守情况，并开发新的方法来分析低覆盖率的单配子测序数据 | 人类精子样本中的基因型数据和减数分裂重组事件 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因型数据 | 41,189个精子细胞，来自25名捐赠者 |
| 7790 | 2024-10-01 |
Single cell analysis of spondyloarthritis regulatory T cells identifies distinct synovial gene expression patterns and clonal fates
2021-12-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02931-3
PMID:34907325
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研究论文 | 研究分析了强直性脊柱炎和银屑病关节炎患者的外周血和滑液中的调节性T细胞的单细胞转录组 | 首次详细描述了炎症部位调节性T细胞的亚群特征，并发现了具有细胞毒性标志物的CD8+调节性T细胞亚群和IL-10及LAG-3表达的Th17样调节性T细胞亚群 | 研究样本仅限于少数患者，可能影响结果的普适性 | 探讨炎症部位调节性T细胞的表型和功能特征 | 强直性脊柱炎和银屑病关节炎患者的调节性T细胞 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 16,000多个调节性T细胞样本，来自5名患者 |
| 7791 | 2024-10-01 |
Single-cell classification using graph convolutional networks
2021-Jul-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04278-2
PMID:34238220
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研究论文 | 本文提出了一种名为sigGCN的多模态端到端深度学习模型，用于细胞分类，结合了图卷积网络（GCN）和神经网络来利用基因相互作用网络 | 本文的创新点在于将基因相互作用网络与基因表达数据结合，通过图卷积网络方法提取有效特征，从而提高细胞分类的性能 | NA | 研究目的是通过结合基因相互作用网络和基因表达数据，提高细胞分类的准确性 | 研究对象是单细胞RNA测序（scRNAseq）数据中的细胞分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | NA |
| 7792 | 2024-10-01 |
μCB-seq: microfluidic cell barcoding and sequencing for high-resolution imaging and sequencing of single cells
2020-11-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d0lc00169d
PMID:32931539
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研究论文 | 本文介绍了一种名为μCB-seq的微流控细胞条形码和测序平台，用于高分辨率成像和单细胞测序 | μCB-seq通过一种新的制造方法，在微流控设备的可寻址反应室中预加载带有已知条形码序列的引物，从而实现了单细胞的高分辨率成像和测序 | NA | 结合单细胞RNA测序和光学成像，提供全面的单细胞分析，整合基因表达谱和细胞状态表征 | 单细胞 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像和文本 | NA |
| 7793 | 2024-10-01 |
A Single-Cell RNA Expression Map of Human Coronavirus Entry Factors
2020-May-27, SSRN
DOI:10.2139/ssrn.3611279
PMID:32714119
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据分析了人类冠状病毒进入因子在不同健康人体组织中的表达情况 | 首次构建了人类冠状病毒进入因子在多种健康人体组织中的单细胞RNA表达图谱，揭示了SARS-CoV-2在不同器官中的潜在感染路径 | 研究主要基于健康人体组织的单细胞RNA测序数据，未涉及疾病状态下的组织样本 | 预测人类冠状病毒的宿主嗜性，并分析其在不同人体组织中的潜在感染路径 | 人类冠状病毒进入因子在不同健康人体组织中的表达情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 28个SCARFs，涵盖多种健康人体组织 |
| 7794 | 2024-09-30 |
KNSTRN Is a Prognostic Biomarker That Is Correlated with Immune Infiltration in Breast Cancer and Promotes Cell Cycle and Proliferation
2024-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10615-2
PMID:38198023
|
研究论文 | 本研究分析了KNSTRN在乳腺癌中的表达、预后、与免疫浸润的相关性及其调控细胞周期的作用 | 首次揭示了KNSTRN在乳腺癌中的生物学功能及其作为预后标志物的潜力 | 主要依赖于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨KNSTRN在乳腺癌中的表达及其生物学功能 | KNSTRN在乳腺癌中的表达、预后、免疫浸润相关性及细胞周期调控 | NA | 乳腺癌 | 基因集富集分析、单细胞转录组数据分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas、Gene Expression Omnibus、TIMER和The Human Protein Atlas数据库中的数据 |
| 7795 | 2024-09-30 |
Integrated multi-omics analyses reveal the pro-inflammatory and pro-fibrotic pulmonary macrophage subcluster in silicosis
2024-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116899
PMID:39181076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了硅肺病中促进炎症和纤维化的肺巨噬细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了硅肺病中Mmp12hi巨噬细胞亚群的异质性和空间定位 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨硅肺病中肺巨噬细胞的表型和功能异质性 | 硅肺病小鼠模型中的肺巨噬细胞 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 硅肺病小鼠模型和患者样本 |
| 7796 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing of estrual mice reveals PM2.5-induced uterine cell heterogeneity and reproductive toxicity
2024-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116968
PMID:39236655
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了PM2.5暴露对小鼠子宫细胞群和基因表达的影响 | 首次揭示了PM2.5暴露导致子宫细胞异质性和生殖毒性的细胞机制，特别是NK细胞中IL-17信号通路的抑制 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨PM2.5暴露对小鼠子宫细胞群和基因表达的影响及其生殖毒性的机制 | 小鼠子宫细胞群和基因表达 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本，具体数量未在摘要中提及 |
| 7797 | 2024-09-30 |
SpaTopic: A statistical learning framework for exploring tumor spatial architecture from spatially resolved transcriptomic data
2024-Sep-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4942
PMID:39331720
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研究论文 | 介绍了一种名为SpaTopic的统计学习框架，用于整合单细胞转录组学和空间转录组学数据，以探索肿瘤微环境的空间结构 | SpaTopic通过主题建模将肿瘤微环境划分为具有一致细胞组织的空间域，提高了空间结构注释的性能，并能准确预测三级淋巴结构和肿瘤边界 | NA | 开发一种新的分析框架，用于探索、比较和解释肿瘤空间转录组学数据 | 肿瘤微环境的空间结构 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 主题建模 | 转录组数据 | 涉及多种肿瘤类型 |
| 7798 | 2024-09-30 |
Single-cell sequencing suggests a conserved function of Hedgehog-signalling in spider eye development
2024-Sep-26, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-024-00230-6
PMID:39327634
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研究论文 | 本文通过单细胞测序数据重新分析，揭示了Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的保守功能 | 本文首次发现Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的作用，并展示了其在蜘蛛中的保守性 | 本文主要基于已发表的单细胞测序数据进行分析，未进行新的实验验证 | 探讨Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的作用及其保守性 | 蜘蛛眼睛发育过程中的基因表达调控网络 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个蜘蛛物种的胚胎样本 |
| 7799 | 2024-09-30 |
POU4F3 is a Sensitive and Specific Marker of Merkel Cell Carcinoma
2024-Sep-26, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100627
PMID:39341281
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研究论文 | 研究确定了POU4F3作为Merkel细胞癌的敏感和特异性标记物 | 首次发现POU4F3作为Merkel细胞癌的特异性标记物，并验证了其在区分Merkel细胞癌与其他类似肿瘤中的应用 | 研究样本主要集中在TCGA数据集和其他公开数据集，可能存在数据偏倚 | 寻找和验证Merkel细胞癌的敏感和特异性标记物 | Merkel细胞癌及其类似肿瘤 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA测序 | NA | RNA | 9264个实体肿瘤和超过600,000个单细胞转录组数据 |
| 7800 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing revealed the roles of macromolecule epidermal growth factor receptor (EGFR) in the hybrid sterility of hermaphroditic Argopecten scallops
2024-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136062
PMID:39341320
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了巨分子表皮生长因子受体（EGFR）在雌雄同体扇贝杂交不育中的作用 | 首次在杂交扇贝的性腺中进行全面的单细胞RNA测序，揭示了EGFR在杂交不育中的关键作用 | NA | 探讨EGFR在雌雄同体扇贝杂交不育中的遗传机制 | 雌雄同体扇贝的杂交不育性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌雄同体扇贝的杂交不育性腺样本 |