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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-11-09 |
Revealing tissue architecture through the hypercomplex Fourier analysis of spatial transcriptomics data
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf191
PMID:41195088
|
研究论文 | 提出了一种使用四元数域离散傅里叶变换分析空间转录组学数据的新方法 | 首次将四元数表示应用于空间转录组学数据，将每个位置的转录组特征表示为三维向量，实现了多维ST数据的傅里叶分析 | 方法主要针对空间转录组学数据，对其他类型组学数据的适用性需要进一步验证 | 开发新的数学框架来分析和可视化空间转录组学数据 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 四元数域离散傅里叶变换 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Visium HD空间转录组平台 |
| 762 | 2025-11-09 |
Role of Monocyte/Macrophage-Associated Gene Ccl9 in Acute Myocardial Infarction Analysis: Based on Bulk and Single Cell RNA Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S516092
PMID:41195292
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别了急性心肌梗死中单核/巨噬细胞相关基因，并重点探讨了Ccl9在调控M2巨噬细胞极化和减轻心肌细胞损伤中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据系统分析急性心肌梗死中的单核/巨噬细胞相关基因，并通过实验验证Ccl9在M2巨噬细胞极化和心肌保护中的新功能 | 研究主要基于公共数据库数据，动物和细胞实验样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索急性心肌梗死中单核/巨噬细胞相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用机制 | 急性心肌梗死患者基因表达数据、AMI小鼠模型、原代小鼠心肌细胞和RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 细胞共培养 | t-SNE, 差异表达分析, 免疫浸润分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个GEO数据集(GSE163129, GSE158157, GSE23294)及动物实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2025-11-09 |
Across the space: applications of spatial transcriptomic technology in healthy and diseased muscle
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656918
PMID:41195339
|
综述 | 探讨空间转录组技术在健康和病变肌肉组织中的应用及其对细胞相互作用研究的推动作用 | 系统梳理空间转录组技术在肌肉研究中的创新应用，突破单细胞技术无法保留空间信息的局限 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据收集与分析 | 总结空间转录组技术在肌肉组织研究中的应用进展 | 骨骼肌组织中的细胞群体及其空间相互作用 | 空间转录组学 | 肌肉疾病 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 764 | 2025-11-09 |
Single-cell stimulus-response gene expression trajectories reveal the stimulus specificities of dynamic responses by single macrophages
2024-Nov-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.09.023
PMID:39413794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建单细胞基因表达轨迹，揭示了巨噬细胞对刺激的动态响应特异性 | 首次生成高分辨率时间序列单细胞RNA测序数据，并构建实时单细胞基因表达轨迹集合，揭示动态信息对巨噬细胞刺激响应特异性的重要贡献 | 技术限制可能影响单细胞可诱导基因表达动态的捕获能力 | 研究巨噬细胞对免疫威胁的基因表达动态响应机制 | 小鼠巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因表达轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | 针对六种刺激的巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2025-11-09 |
Cellular senescence in white matter microglia is induced during ageing in mice and exacerbates the neuroinflammatory phenotype
2023-06-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05027-2
PMID:37353538
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示白质小胶质细胞在衰老过程中发生细胞衰老，并加剧神经炎症表型 | 首次发现白质小胶质细胞在衰老和疾病模型中发生细胞衰老，并证实共生细菌促进衰老小胶质细胞积累 | 研究主要基于小鼠模型，人类中枢神经系统中的相关性尚需进一步验证 | 探讨中枢神经系统细胞衰老特征及其在神经功能障碍中的作用 | 小鼠脑部和脊髓中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2025-11-08 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05317-9
PMID:40750734
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA测序，揭示了心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边缘区动态变化 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统解析心肌梗死后免疫细胞时空动态变化，并发现TREM2高表达巨噬细胞在组织修复中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限；技术方法复杂度高，数据分析存在一定主观性 | 探究心肌梗死后复杂细胞和分子动态变化机制 | 小鼠心肌梗死模型、AC16心肌细胞、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,RT-qPCR,Western blot,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术 | Milo,Monocle2,CellPhoneDB,NicheNet,SCENIC | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌梗死模型和缺血再灌注模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 767 | 2025-11-08 |
Elucidating cardiomyocyte state transitions in zebrafish heart development using transcriptome dynamics
2025-Nov-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152736
PMID:41110187
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型分析心脏发育过程中的转录组动态，揭示了心肌细胞状态转变的关键机制 | 首次通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，识别出M5模块在心肌细胞状态转变中的关键作用，并发现smtnl1作为枢纽基因 | 研究仅聚焦于斑马鱼胚胎发育早期阶段(24-48 hpf)，未验证在哺乳动物或人类中的保守性 | 阐明心脏发育过程中心肌细胞状态转变的分子机制，为先天性心脏病发病机制提供新见解 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎心脏在24、30、36、48 hpf四个时间点的样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2025-11-08 |
Inflammatory niches as spatial drivers of disease mechanisms and targets for personalized treatment
2025-Nov-07, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70170
PMID:41200832
|
综述 | 本文探讨炎症微空间作为疾病机制的空间驱动因素及其在个性化治疗中的靶向价值 | 整合单细胞测序与空间分析技术揭示疾病特异性炎症机制，提出空间组织化炎症微环境的新范式 | NA | 解析炎症微空间在疾病机制中的作用并推动个性化治疗策略发展 | 免疫细胞与非免疫细胞在组织空间中的相互作用网络 | 空间转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序, 空间分析 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 769 | 2025-11-08 |
Distinct Roles of Atf3, Zfp711, and Bcl6b in Early Embryonic Hematopoietic and Endothelial Lineage Specification
2025-Nov-07, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204792
PMID:41200855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在早期胚胎造血和内皮谱系特化中的不同作用 | 首次在单细胞分辨率下系统研究这三个相对未被充分研究的转录因子在早期胚胎造血发育中的功能，并揭示了Zfp711对Atf3启动子的结合调控关系 | Bcl6b在造血内皮祖细胞中特异性表达但敲除后对早期造血无显著影响，其具体功能仍需进一步研究 | 解析转录因子在早期胚胎造血和内皮谱系特化中的调控机制 | 小鼠胚胎干细胞体外分化模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 770 | 2025-11-08 |
GPC3-based circular RNA vaccine suppresses hepatocellular carcinoma progression by activating adaptive immune responses
2025-Nov-07, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001605
PMID:41201153
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于GPC3的环状RNA疫苗，通过激活适应性免疫反应抑制肝细胞癌进展 | 首次开发靶向GPC3的环状RNA癌症疫苗，克服传统mRNA疫苗的不稳定性，结合TLR4激动剂增强免疫反应 | 研究目前仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发更稳定有效的癌症疫苗治疗肝细胞癌 | 肝细胞癌小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | 多重免疫荧光，单细胞测序，空间转录组学，质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据，免疫细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 771 | 2025-11-08 |
Unraveling the effects and characteristics of proliferating tumor and cytotoxic T cells in colorectal cancer
2025-Nov-07, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2026
PMID:41201451
|
研究论文 | 本研究通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析结直肠癌中增殖肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特征及预后意义 | 首次系统揭示肿瘤细胞增殖与更好预后的关联，并发现增殖性细胞毒性T细胞的空间定位会减弱其预后价值差异 | 研究基于回顾性队列，需要前瞻性研究验证 | 探讨结直肠癌中增殖肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特性及预后价值 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化，单细胞RNA测序，数字图像分析 | NA | 图像，基因表达数据 | 1839例患者（两个独立队列），62例结肠癌单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2025-11-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers molecular features underlying microglial lipid accumulation and depression-related behaviors in high-fat diet mouse model of obesity
2025-Nov-06, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02273-2
PMID:41198848
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高脂饮食肥胖小鼠模型中微胶质细胞脂质积累的分子特征及其与抑郁相关行为的联系 | 首次在单细胞分辨率下发现高脂饮食诱导的脂滴积累微胶质细胞(LDAM)及其转录特征，并鉴定ACSL1作为关键调控因子 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未探讨性别差异；机制研究主要基于体外实验 | 探索肥胖相关神经精神共病的神经炎症机制 | 高脂饮食诱导的肥胖雄性小鼠脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖及相关神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高脂饮食喂养的雄性小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2025-11-08 |
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2025-Nov-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00366-y
PMID:41198929
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研究论文 | 本研究探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌中的预后价值和免疫浸润影响 | 首次发现PDE8B作为致癌基因通过促进上皮间质转化诱导TNBC转移，构建了包含四个核酸代谢相关基因的精准预后预测模型 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证预测模型的普适性 | 阐明核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用机制及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体内外实验验证 | 预后预测模型 | RNA测序数据，临床数据 | 297个TNBC样本来自三个数据集 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 774 | 2025-11-08 |
Advancements in single-cell sequencing for cervical cancer research
2025-Nov-06, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05407-8
PMID:41199110
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在宫颈癌研究中的最新进展，包括肿瘤异质性、肿瘤微环境动态和分子机制 | 揭示了宫颈癌中HPV驱动的致癌机制、代谢重编程空间组织以及肿瘤微环境中免疫细胞与基质细胞的复杂相互作用 | 临床转化面临耐药机制挑战，缺乏关键靶点抑制剂，需要进一步功能验证 | 推动单细胞测序在宫颈癌精准免疫治疗领域的应用 | 宫颈癌肿瘤微环境中的各类细胞（肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞） | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 775 | 2025-11-08 |
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Nov-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084
PMID:40695620
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术揭示了脂肪性肝病相关肝癌中Treg细胞与CAF通过TNFSF14-TNFRSF14信号轴驱动免疫抑制和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现TNFSF14-TNFRSF14介导的Treg-CAF相互作用是SLD-HCC免疫治疗抵抗的关键驱动因素，并证明靶向该信号轴可增强抗肿瘤免疫 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证 | 研究SLD-HCC的免疫微环境和免疫治疗抵抗机制 | 脂肪性肝病相关肝癌患者组织和肝癌模型 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞转录组学,质谱流式细胞术,空间转录组学,多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据 | 22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC病例，另有103例患者独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 776 | 2025-11-08 |
Sox9 prevents retinal degeneration and is required for limbal stem cell differentiation in the adult mouse eye
2025-Nov-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102337
PMID:41190718
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研究论文 | 本研究揭示了Sox9转录因子在成年小鼠眼睛中维持视网膜完整性和促进角膜缘干细胞分化的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术证明Sox9在基底角膜缘干细胞群体中的表达及其在形成两种长寿细胞克隆中的功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 揭示Sox9转录因子在成年眼睛不同细胞类型中的功能 | 成年小鼠的眼睛组织，特别是视网膜色素上皮细胞、Müller胶质细胞和角膜缘基底上皮细胞 | 发育生物学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | 成年基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 777 | 2025-11-08 |
Single-nuclei sequencing of Moricandia arvensis reveals bundle sheath cell function in the photorespiratory shuttle of C3-C4 intermediate Brassicaceae
2025-Nov-04, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf245
PMID:40590299
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术揭示了Moricandia arvensis中维管束鞘细胞在C3-C4中间型光合作用中的功能 | 首次在十字花科C3-C4中间型植物中应用单核RNA测序技术，揭示了光呼吸相关基因在维管束鞘细胞中的特异性表达模式 | 研究仅限于十字花科中的一种C3-C4中间型植物，需要更多物种验证 | 探究C3-C4中间型植物中细胞特异性对光呼吸途径的影响 | Moricandia arvensis（十字花科C3-C4中间型植物）和拟南芥（C3植物）的叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单核RNA测序，电子显微镜，免疫金标记 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | Moricandia arvensis单核RNA测序数据集和拟南芥公开单细胞转录组数据 | NA | 单核RNA测序，单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 778 | 2025-11-08 |
RANBP1 promotes immune evasion in triple-negative breast cancer by suppressing T cell infiltration via the miR-769-5p/PRUNE2 axis
2025-Nov-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03872-7
PMID:41186818
|
研究论文 | 本研究揭示RANBP1通过miR-769-5p/PRUNE2轴抑制T细胞浸润，促进三阴性乳腺癌免疫逃避的分子机制 | 首次发现RANBP1通过调控miR-769-5p/PRUNE2通路影响T细胞浸润，揭示了三阴性乳腺癌免疫逃避的新机制 | 研究样本量有限（87例TNBC组织），机制研究仍需进一步验证 | 探究RANBP1在三阴性乳腺癌中调控T细胞浸润和肿瘤进展的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学、Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床生存数据 | 87对三阴性乳腺癌肿瘤及癌旁组织，TCGA和GSE65194数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2025-11-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning reveals 4-aminobiphenyl exposure signatures and novel diagnostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03819-y
PMID:41186865
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了4-氨基联苯暴露特征并识别了膀胱癌的新型诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明4-氨基联苯的致癌机制，并通过机器学习识别出由六个核心基因组成的诊断面板 | 研究具有回顾性性质，依赖公共测序数据，缺乏详细临床元数据，无法对识别亚型进行生存分析 | 研究环境致癌物4-氨基联苯在膀胱癌发生中的分子机制并识别诊断生物标志物 | 膀胱癌组织样本 | 生物信息学, 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接模拟, ssGSEA | LASSO, SVM, 随机森林 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 95,136个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2025-11-08 |
Heterogeneity in an adeno-associated virus transfection-based production process limits the production efficiency
2025-Nov-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26261-0
PMID:41188389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了基于腺相关病毒转染的生产过程中细胞异质性对生产效率的限制 | 首次在单细胞水平上揭示了rAAV生产过程中细胞转染异质性的关键瓶颈，发现仅不到5%的细胞实际产生病毒颗粒 | 研究仅针对rAAV9血清型和HEK293T细胞系，结果可能不适用于其他AAV血清型或生产细胞系 | 提高基于瞬时转染的rAAV生产效率和产量 | HEK293T细胞系和rAAV9病毒载体 | 生物技术 | 基因治疗 | 单细胞转录组学,流式细胞术,qPCR | NA | 转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |