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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-11-02 |
Parental Specific Expression by scRNA-Seq Reveals HaWRKY40 Contributing to Heterosis of Sunflower
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70266
PMID:41170640
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 762 | 2025-11-04 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
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研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达谱,发现其在癌相关成纤维细胞中高表达,并揭示其通过调节CXCL2调控中性粒细胞浸润的新机制 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要更多临床验证 | 探究免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤患者组织和细胞,小鼠模型 | 生物信息学,肿瘤免疫学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学,去卷积分析,相关性分析 | 逻辑回归模型,风险评分模型,列线图 | RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据,图像数据 | 肝母细胞瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2025-11-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a metastasis-associated PCSK1+ neuroendocrine subpopulation in pancreatic neuroendocrine tumors
2025-Nov, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70084
PMID:40817830
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现胰腺神经内分泌肿瘤中与转移相关的PCSK1+神经内分泌亚群 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤中鉴定出富含于肝转移灶的PCSK1+神经内分泌亚群,并揭示其高拷贝数变异负荷、低分化潜能和独特的转录调控特征 | 基于公开数据库的回顾性分析,样本量有限(27个样本),需要后续实验验证机制 | 探索胰腺神经内分泌肿瘤中神经内分泌细胞的异质性及其与转移的关系 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者组织样本(包括癌旁正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | 单细胞组学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 伪时间轨迹分析, 转录调控网络分析, 细胞间通讯分析 | CytoTRACE2, Monocle3, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 27个样本(包括正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 764 | 2025-11-04 |
Neoadjuvant chemotherapy modulates mast cell phenotypes and immune infiltration in high-grade serous carcinoma
2025-Nov-01, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.10.014
PMID:41176887
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研究论文 | 本研究探讨新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫浸润模式的影响,特别关注肥大细胞表型变化 | 首次揭示NACT诱导肥大细胞从CD52+KIT+表型向JUN+/TNFRSF12A+亚群转变的动态过程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫景观的影响及其临床意义 | 高级别浆液性癌患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序,免疫组织化学,单细胞RNA测序 | Scissor分析,伪时间分析 | RNA测序数据,免疫组织化学图像,单细胞RNA测序数据 | 81对NACT前后样本(8+7内部RNA-seq,73对IHC),三个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2025-11-04 |
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01881-y
PMID:41171372
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定C1QA作为早期肺腺癌预后标志物和免疫抑制中性粒细胞调节因子 | 首次发现C1QA是调控早期肺腺癌免疫抑制中性粒细胞的关键基因,并揭示其通过补体受体与中性粒细胞相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库分析,需要进一步实验验证C1QA功能机制 | 探索早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制 | 早期肺腺癌患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 基因表达分析,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,RT-qPCR | CIBERSORTx,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 公共数据集GSE31210及独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 766 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals bidirectional development of infantile hemangioma
2025-Oct-31, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次在人类婴儿血管瘤中构建单细胞图谱,发现血管瘤壁细胞通过释放VEGFA和PGF配体促进内皮细胞增殖和血管生成的新机制 | 样本量较小(仅3名婴儿),缺乏功能验证实验 | 探究婴儿血管瘤的发病机制和细胞组成 | 婴儿血管瘤组织样本 | 单细胞组学 | 血管瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名婴儿的血管瘤样本,共36,237个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 767 | 2025-11-04 |
Single-cell sequencing analysis reveals CHURC1 as a non-canonical oncoprotein governing goblet cell-driven colorectal tumorigenesis
2025-Oct-31, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112197
PMID:41177418
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析发现杯状细胞是结直肠癌的潜在细胞起源,并鉴定CHURC1作为新型致癌基因 | 首次发现杯状细胞作为结直肠癌的细胞起源,并揭示CHURC1作为非经典致癌蛋白的功能机制 | 样本量较小(4名患者),需要更大规模研究验证 | 探索结直肠癌的细胞起源和致癌机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织、肠息肉和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者的14个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 768 | 2025-11-04 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理学的空间框架,用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理学整合,在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因风险模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究,样本量较小(5个膀胱肿瘤标本),需要更大规模研究验证 | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱肿瘤组织标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全切片图像, 基因表达数据 | 5个膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 769 | 2025-11-04 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学,揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次整合GWAS、单细胞和空间转录组学数据,发现STK24作为新的凋亡相关基因在LUAD中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多中心样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2025-11-04 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
|
研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型,用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型,并识别出两种不同的ABC亚群 | 研究基于小鼠模型,与人类疾病可能存在差异;模型验证仍需进一步临床相关性研究 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 771 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2025-Oct-30, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117483
PMID:41173056
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益作用机制 | 首次探索Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用,并发现其通过PIM1-AKT-FOXO1通路调节Teff/Treg细胞平衡的新机制 | NA | 研究Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型和Vogt-Koyanagi-Harada病(VKH)患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2025-11-04 |
Deciphering the role of RGS1-overexpressing CD8+T cells in immune evasion of bone metastatic cancer in the urinary system via single-cell sequencing analysis
2025-Oct-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152893
PMID:41176933
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示RGS1过表达的CD8+T细胞在泌尿系统骨转移癌免疫逃逸中的作用机制 | 首次阐明RGS1在骨转移癌免疫微环境中对CD8+T细胞功能的调控作用,并建立了前列腺癌骨转移小鼠模型进行验证 | 样本量相对有限(8例肾细胞癌和9例前列腺癌患者),需要更大规模研究验证 | 阐明RGS1在肿瘤骨转移免疫微环境中的调控作用及CD8+T细胞功能 | 肾细胞癌和前列腺癌患者的骨转移病灶组织及小鼠前列腺癌骨转移模型 | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 单细胞RNA测序数据 | 8例肾细胞癌患者和9例前列腺癌患者的骨转移病灶,共215,864个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2025-11-04 |
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Oct-30, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156280
PMID:41177096
|
综述 | 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 | 全面探讨了NGS在临床基因组学中的多领域应用,并强调了云计算平台和多组学数据整合的未来发展方向 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据或具体案例研究 | 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 | 新一代测序技术及其在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗中的应用 | 生物信息学 | 癌症、罕见病 | NGS, 单细胞测序 | NA | DNA测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 新一代测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 774 | 2025-11-04 |
Advancements in Personalized Medicine for Leukemia: Integrating Genetic, Transcriptomic, and Artificial Intelligence Insights
2025-Oct-29, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
综述 | 探讨遗传学、转录组学和人工智能在白血病精准医疗中的整合应用与进展 | 整合多组学数据与人工智能算法推动白血病个性化治疗策略的优化 | 存在克隆进化、遗传异质性和治疗耐药性等挑战 | 推进白血病精准医疗发展 | 白血病患者 | 自然语言处理 | 白血病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 775 | 2025-11-04 |
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2025-Oct-28, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202561
PMID:41147439
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研究论文 | 评估II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | 首次通过临床试验和动物实验证实II型5α-还原酶抑制剂能促进TURP术后伤口修复,并揭示其通过减轻纤维化和炎症的作用机制 | 样本量相对有限(87例患者,12只比格犬),随访时间较短(6个月) | 研究II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | BPH患者和比格犬动物模型 | 医学研究 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 | NA | 临床数据,分子标记数据,组织学数据 | 87例BPH患者(47例治疗组,42例安慰剂组),12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2025-11-04 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
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研究论文 | 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态及IFNγ信号的关键作用 | 开发MetTag单细胞追踪技术,首次发现早期播散克隆具有IFNγ依赖的转移适应机制 | 研究主要聚焦腹膜转移模型,其他转移器官的普适性需进一步验证 | 解析肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态和分子决定因素 | 播散性肿瘤细胞(DTCs)和转移微环境 | 单细胞组学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9筛选,RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 腹水和转移灶组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 777 | 2025-11-04 |
Isolation of mitochondrial mutation-specific T cell receptors
2025-Oct-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf139
PMID:40587813
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研究论文 | 本研究首次成功分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性T细胞受体 | 首次报道从健康供体中分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性TCRs,证明了线粒体突变也能产生可被T细胞识别的新抗原 | 研究中存在一些生物学障碍需要考虑,且仅针对HLA-A*0201等位基因进行了筛选 | 探索肿瘤线粒体DNA突变是否能够产生被T细胞受体识别的新抗原 | 肿瘤线粒体DNA非同义突变及其对应的T细胞受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞测序,表位预测算法,TCR筛选验证 | NA | 基因组数据,蛋白质序列数据 | 10名HLA-A*0201纯合子健康供体,38种肿瘤类型的3,798个非同义单核苷酸突变 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 778 | 2025-11-04 |
Single-Cell Transcriptomics Shows Cellular Heterogeneity, Intercellular Communication, and Extracellular Matrix Remodeling in Corneal Fibrosis In Vivo
2025-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.13.48
PMID:41147949
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示兔角膜纤维化过程中细胞异质性、细胞间通讯和细胞外基质重塑的动态变化 | 首次在体内建立角膜纤维化的整合转录组框架,识别四种基质细胞亚群及其双向分化轨迹 | 研究仅使用新西兰白兔模型,未验证人类样本 | 表征角膜纤维化过程中的细胞异质性和细胞外基质重塑机制 | 新西兰白兔的正常和碱损伤纤维化角膜 | 单细胞组学 | 角膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、轨迹推断、CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 新西兰白兔角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 779 | 2025-11-04 |
Integration of phospho-signaling and transcriptomics in single cells reveals distinct Th17 cell fates
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116006
PMID:40674215
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研究论文 | 开发了一种名为Vivo-seq的创新平台,可在单细胞水平同时捕获转录组和磷酸化信号状态 | 开发了Vivo-seq平台,首次实现单细胞水平转录组与磷酸化信号状态的同步捕获 | NA | 研究Th17细胞分化过程中的信号转导和功能可塑性机制 | T辅助17细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞内转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据,磷酸化信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | Vivo-seq | 使用低共熔溶剂固定细胞的单细胞转录组和表位索引测序平台 |
| 780 | 2025-11-04 |
Atlas-scale metabolic activities inferred from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.653038
PMID:40463045
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研究论文 | 开发了一个名为scCellFie的计算框架,用于从单细胞和空间转录组数据推断代谢活动 | 提出了首个能够从转录组数据系统推断代谢活动的计算框架,并应用于约3000万个细胞图谱分析 | 基于转录组数据间接推断代谢活动,而非直接测量代谢物 | 开发计算工具从转录组数据推断细胞代谢功能 | 人类和小鼠的单细胞及空间转录组数据 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,子宫内膜癌 | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 计算框架 | 转录组数据 | 约3000万个细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |