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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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761 | 2025-10-05 |
A Systematic Review on the Role of the Stria Vascularis in Menière's Disease Pathogenesis
2025-Sep-23, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-01006-y
PMID:40987969
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系统综述 | 本文系统综述了血管纹在梅尼埃病发病机制中的作用,识别了血管纹细胞类型中表达的基因及其与梅尼埃病的病理生理联系 | 首次系统性地识别了血管纹三种细胞类型中与梅尼埃病相关的特定基因,并揭示了免疫相关基因在散发性梅尼埃病中的重要作用 | 纳入研究数量有限(130项),且人类研究相对较少(26项),可能影响结果的普适性 | 评估血管纹基因在梅尼埃病发病机制中的病理生理作用 | 血管纹细胞类型(边缘细胞、中间细胞、基底细胞)和缝隙连接蛋白 | 系统综述 | 梅尼埃病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 多组学研究 | NA | 文献数据, 基因表达数据 | 1293篇文章经筛选后纳入130项研究(26项人类研究,101项动物研究,3项人-动物研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
762 | 2025-10-05 |
Impaired early type I interferon responses to influenza virus infection in aged mice are associated with subsequent increased pulmonary inflammation
2025-Sep-23, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01892-3
PMID:40987991
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研究论文 | 本研究通过比较年轻和老年小鼠对甲型流感病毒感染的先天免疫反应,揭示衰老导致早期I型干扰素反应受损并增强后期肺部炎症的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示老年小鼠在流感病毒感染后不同免疫细胞中持续炎症反应的分子特征 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,结果可能需要人类研究验证 | 探究衰老对流感病毒感染先天免疫反应的影响机制 | 年轻(12周)和老年(70周)C57BL/6J小鼠 | 免疫学 | 流感病毒感染 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 年轻和老年C57BL/6J小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
763 | 2025-10-05 |
Fibroblast Dysregulation in Multiple Idiopathic External Cervical Resorption: Laboratory Investigation From a Rare Case of 13 Affected Teeth
2025-Sep-23, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70037
PMID:40988149
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研究论文 | 通过实验室研究探讨多发性特发性颈部外吸收中成纤维细胞的异常调控机制 | 首次在MIECR中通过单细胞RNA测序揭示成纤维细胞的异常活性特征及其在疾病进展中的关键作用 | 基于单个罕见病例研究,样本量有限 | 阐明多发性特发性颈部外吸收的发病机制 | 来自MIECR患者的肉芽组织和健康牙龈组织 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 组织病理学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 | 1例患者(13颗受影响牙齿) | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
764 | 2025-10-05 |
Neuroprotective role of DNTαβ Cell transplantation on modulating immune microenvironment in spinal cord injured mice
2025-Sep-22, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00743
PMID:40987706
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研究论文 | 本研究探讨了DNTαβ细胞移植通过调节免疫微环境对脊髓损伤小鼠的神经保护作用 | 首次发现DNTαβ细胞移植可通过Gzmb和IFN通路调节免疫反应,促进脊髓损伤后的早期修复和神经保护 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探究DNTαβ细胞移植对脊髓损伤免疫微环境的调节作用及神经保护机制 | 脊髓损伤小鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 流式细胞术,单细胞测序,免疫组化分析,转录组测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞测序数据,行为评估数据,免疫组化数据,转录组数据 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
765 | 2025-10-05 |
Leveraging single-cell transcriptomics of developing rat ocular outflow tissues to prioritize congenital glaucoma candidate genes
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672439
PMID:40909638
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析发育期大鼠眼房水流出通路的基因表达,为先天性青光眼候选基因的优先排序提供资源 | 首次生成了发育期房水流出通路的单细胞RNA测序数据集,揭示了395个在发育TM/SC亚型中特异性上调的基因 | 研究基于大鼠模型,与人类疾病存在物种差异;仅分析了三个关键发育阶段 | 识别先天性青光眼的候选致病基因并理解房水流出通路的发育机制 | 发育期大鼠眼房水流出通路组织,特别是小梁网和Schlemm管 | 单细胞转录组学 | 先天性青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 86,653个细胞,包含超过10,000个TM/SC相关细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
766 | 2025-10-05 |
Decoding functional and developmental trajectories of tissue-resident uterine dendritic cells through integrative omics
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113351
PMID:40949104
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研究论文 | 通过整合多组学方法解析子宫组织驻留树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次系统识别子宫树突状细胞亚型并揭示其发育轨迹和功能特化 | 样本来源仅限于人类子宫内膜,未涉及其他物种验证 | 探究子宫树突状细胞的起源和功能作用机制 | 人类子宫内膜组织中的树突状细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 不同月经周期和早孕期子宫组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
767 | 2025-10-05 |
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673874
PMID:40950147
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研究论文 | 通过单血管空间转录组分析揭示毛细血管畸形中NR2F2介导的平滑肌细胞表型获得机制 | 首次在单血管水平构建毛细血管畸形的空间转录组图谱,发现NR2F2在促进平滑肌细胞表型获得中的核心调控作用 | 研究样本量有限,主要基于体外iPSC模型验证,需要更多临床样本验证 | 探究毛细血管畸形的血管发病机制和病理重塑过程 | 毛细血管畸形病变组织及iPSC分化的血管细胞 | 空间转录组学 | 血管畸形 | 空间全转录组分析, 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 免疫荧光染色, 计算机基因扰动模拟 | iPSC分化模型, Tet-on系统 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 磷酸化蛋白质组数据, 免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NanoString | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学 | GeoMx | GeoMx空间全转录组分析平台 |
768 | 2025-10-05 |
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Sep-17, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105252
PMID:40972808
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学开发了一个30基因分类器,用于区分低风险骨髓增生异常综合征的造血干细胞与健康造血干细胞 | 首次开发了能够区分低风险MDS HSPCs与健康HSPCs的30基因分类器,并揭示了囊泡运输通路在MDS病理生理中的重要作用 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的验证研究来确认分类器的普适性 | 识别低风险骨髓增生异常综合征的分子特征和潜在治疗靶点 | 低风险骨髓增生异常综合征患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | 基因分类器 | 单细胞转录组数据 | 患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
769 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424487122
PMID:40920930
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组和遗传谱系追踪技术,揭示了增殖性玻璃体视网膜病变中纤维化形成的细胞路线图 | 首次结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪技术系统描绘了PVR纤维化形成过程中不同细胞类型的贡献 | NA | 解析增殖性玻璃体视网膜病变中纤维化形成的细胞机制 | 视网膜色素上皮细胞、免疫细胞和Müller细胞 | 单细胞组学 | 增殖性玻璃体视网膜病变 | 单细胞转录组测序, 遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
770 | 2025-10-05 |
Dynamic and precise electromagnetic levitation of single cells
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512246122
PMID:40920932
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研究论文 | 介绍了一种名为Electro-LEV的新型平台,通过电磁悬浮技术实现单细胞的动态精确操控 | 整合电磁与磁悬浮原理,实现单细胞在3D微流体环境中的动态位置控制,能够区分单细胞与细胞簇的悬浮行为差异 | NA | 开发精确操控单细胞的技术,提高细胞分选的纯度和效率 | 单细胞和细胞簇 | 生物医学工程 | NA | 电磁悬浮技术 | NA | 位置追踪数据 | 多种颗粒和细胞类型 | NA | 电磁悬浮分选 | Electro-LEV | 整合电磁和磁悬浮原理的平台,通过周期性调制和追踪细胞z轴位置 |
771 | 2025-10-05 |
Sorting nexin 3 promotes ischemic retinopathy through RIP1- and RIP3-mediated myeloid cell necroptosis and mitochondrial fission
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426578122
PMID:40924459
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现分选连接蛋白3(SNX3)在缺血性视网膜病变中通过RIP1/RIP3介导的髓系细胞坏死性凋亡和线粒体分裂促进病理性血管生成 | 首次揭示SNX3通过调控RIP1/RIP3信号通路促进髓系细胞坏死性凋亡和线粒体分裂,进而驱动缺血性视网膜病变的新机制 | 研究主要基于小鼠氧诱导视网膜病变模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究SNX3在缺血性视网膜病变中的作用机制 | 小鼠视网膜髓系细胞(小胶质细胞/巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, GST pull-down, 免疫共沉淀, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
772 | 2025-10-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-Sep-16, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞RNA测序数据,利用机器学习方法识别了辐射性肺损伤的氧化应激特征基因 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据,结合机器学习算法系统分析辐射性肺损伤的氧化应激分子特征 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 识别辐射性肺损伤的早期诊断生物标志物和分子机制 | 辐射性肺损伤小鼠模型 | 机器学习 | 肺损伤 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,RT-PCR,免疫组化 | 随机森林,支持向量机,LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
773 | 2025-10-05 |
Revealing the core immunotoxicity of di-n-pentyl phthalate exposure in murine models using single-cell RNA sequencing
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118754
PMID:40753775
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示邻苯二甲酸二正戊酯在小鼠模型中的核心免疫毒性作用 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统评估DNPP对免疫系统的全面影响,揭示了其对多种免疫细胞功能的具体损害机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证;剂量反应关系需要更深入分析 | 系统评估DNPP暴露引起的免疫系统改变 | 小鼠脾脏组织和外周血白细胞 | 单细胞组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | DNPP暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
774 | 2025-10-05 |
The food-derived metabolite trimethylamine and trimethylamine-N-oxide promote colorectal cancer progression via SREBF1
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118996
PMID:40912095
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物TMA和TMAO通过SREBF1介导的PI3K/AKT信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次证明TMA和TMAO通过激活PI3K/AKT信号通路促进结直肠癌细胞增殖,并确定SREBF1是TMA和TMAO诱导CRC增殖的关键介质 | NA | 研究TMA和TMAO对结直肠癌进展的影响及其分子机制 | 结直肠癌细胞系和小鼠肿瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 实时PCR、Western blotting、细胞活力和迁移实验、凋亡分析、单细胞RNA测序、肿瘤异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
775 | 2025-10-05 |
Decoding coal-induced pulmonary endothelial injury using single-cell omics
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118989
PMID:40914082
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析煤尘暴露引起的肺内皮细胞损伤机制 | 首次在煤工尘肺小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术,系统识别了四种内皮细胞亚群并揭示了煤尘通过内外在机制共同导致内皮细胞损伤 | 研究仅基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究煤尘暴露引起肺内皮细胞损伤的分子机制 | 煤工尘肺小鼠模型的肺组织内皮细胞 | 单细胞组学 | 尘肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 煤尘暴露组和对照组小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
776 | 2025-10-05 |
Integration of network toxicology, machine learning and single-cell sequencing reveals the effects of soil pollutants on prostate cancer
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119010
PMID:40925179
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研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序技术研究土壤污染物对前列腺癌的影响机制 | 首次将网络毒理学、101种机器学习算法和单细胞测序技术相结合,系统揭示土壤污染物通过DNMT1和mTOR关键分子靶点影响前列腺癌的新机制 | 研究主要基于计算预测和数据库分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验确认机制 | 探究土壤污染物影响前列腺癌发展的分子机制 | 前列腺癌相关分子靶点和10种土壤污染物(DBP、DOP、DMP、PFOA、PFOS、MEK、TOL、ZEN、OTA、DON) | 生物信息学 | 前列腺癌 | 网络毒理学、机器学习、单细胞测序、分子对接 | 101种机器学习算法、Cox回归模型、Kaplan-Meier分析 | 基因组数据、蛋白质互作数据、单细胞表达数据 | 242个潜在靶点,26个风险靶分子 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
777 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics meets diabetic kidney disease: Illuminating the path to precision medicine
2025-Sep-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v16.i9.107663
PMID:40980298
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综述 | 本文探讨空间转录组学技术在糖尿病肾病研究中的应用及其对精准医疗的推动作用 | 将空间转录组学技术引入糖尿病肾病研究,实现基因表达与空间定位的整合分析,揭示肾脏微环境中细胞互作和局部分子改变 | 空间分辨率有限、数据复杂度高、计算需求大 | 探索空间转录组学在糖尿病肾病精准医疗中的应用价值 | 糖尿病肾病肾脏组织 | 空间转录组学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 机器学习,网络分析 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | Slide-seqV2 | NA |
778 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics unravels the interactive network of aflatoxin B1-driven gastric cancer: Multi-omics integration of transcriptome and mendelian randomization
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118919
PMID:40850114
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研究论文 | 通过空间转录组学和多组学整合揭示黄曲霉毒素B1驱动胃癌的分子网络机制 | 首次构建AFB1诱导胃癌的多层次分子调控图谱,建立了环境致癌物毒理机制研究的多组学整合新范式 | AFB1诱导胃癌的具体分子机制仍有待进一步明确 | 阐明黄曲霉毒素B1驱动胃癌恶性进展的分子网络机制 | 人类胃癌组织及黄曲霉毒素B1核心靶基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接模拟,多组学整合 | 分子对接模拟 | 转录组数据,空间转录组数据 | 人类胃癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
779 | 2025-10-05 |
Polyethylene terephthalate microplastics promote pulmonary fibrosis via AKT1, PIK3CD, and PIM1: A network toxicology and multi-omics analysis
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118954
PMID:40876188
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研究论文 | 通过网络毒理学和多组学分析揭示聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料通过AKT1、PIK3CD和PIM1蛋白加剧特发性肺纤维化的分子机制 | 首次结合网络毒理学、分子对接、孟德尔随机化和单细胞测序分析系统揭示PET-MPs通过特定信号通路和细胞类型加剧IPF的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和数据库挖掘,缺乏实验验证 | 确定PET-MPs在加剧特发性肺纤维化中的作用机制 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料及其与肺纤维化的关联 | 网络毒理学 | 特发性肺纤维化 | 网络毒理学、分子对接、孟德尔随机化、单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 从多个数据库识别120个潜在靶点和81个交叉靶点 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
780 | 2025-10-05 |
Major PM2.5 components promote intracranial aneurysm via TP53: Insights from a comprehensive network analysis
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118953
PMID:40886600
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研究论文 | 通过整合网络毒理学和双样本孟德尔随机化分析,揭示PM2.5主要成分通过TP53基因促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次将网络毒理学与孟德尔随机化相结合,系统阐明PM2.5成分通过TP53介导颅内动脉瘤形成的因果机制 | 研究主要基于数据库分析和计算模拟,需要更多实验验证 | 探究PM2.5主要成分影响颅内动脉瘤发展的潜在机制 | PM2.5六种代表性成分(铅、镉、砷、苯并[a]芘、甲醛、苯)及其与TP53基因的相互作用 | 生物信息学 | 颅内动脉瘤 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 基因组数据, 蛋白质结构数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |