单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30404 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-07-25 |
Cross-talk of m6A methylation modification and the tumor microenvironment composition in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572810
PMID:40692788
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研究论文 | 本研究探讨了m6A甲基化修饰与食管癌肿瘤微环境组成之间的相互作用，并开发了一个m6A评分系统来预测免疫治疗反应 | 首次揭示了m6A甲基化在食管癌肿瘤微环境中的关键作用，并开发了新型m6A评分系统作为预测免疫治疗反应的生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 阐明m6A甲基化修饰对食管癌肿瘤微环境的影响并开发预测性生物标志物 | 食管癌患者样本和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 食管癌 | scRNA-seq, 共识聚类算法, 主成分分析 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的食管癌数据集 |
| 762 | 2025-07-25 |
Integrating GEO Database, Mendelian Randomization, and Molecular Docking to Identify HLA-C as a Potential Therapeutic Target for Periodontitis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9163431
PMID:40692979
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研究论文 | 本研究通过整合GEO数据库、孟德尔随机化和分子对接技术，识别HLA-C作为牙周炎的潜在治疗靶点 | 首次结合多种生物信息学方法和分子对接技术，系统性地探索牙周炎的分子机制并验证HLA-C作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索牙周炎的分子机制并识别关键治疗靶点 | 牙周炎相关基因表达数据和HLA-C分子 | 生物信息学 | 牙周炎 | GEO数据库分析、孟德尔随机化(MR)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接(MD) | NA | 基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序数据 | GSE10334微阵列数据集（具体样本数量未明确说明） |
| 763 | 2025-07-25 |
Tumor-associated bacteria activate PRDX1-driven glycolysis to promote immune evasion and PD-1 antibody resistance in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1599691
PMID:40693141
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关细菌通过激活PRDX1驱动的糖酵解促进肝细胞癌免疫逃逸和PD-1抗体耐药性的机制 | 首次将肿瘤内细菌与PD-1耐药性通过氧化还原调节代谢联系起来，并提出PRDX1和肠道菌群双重靶向作为一种新型组合免疫治疗策略 | 研究样本量较小（29例HCC临床样本和8只小鼠每组），需要更大规模的验证 | 探索细菌感染如何重塑肿瘤代谢从而削弱抗PD-1治疗的疗效 | 肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的微生物、代谢和免疫相互作用 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 原位HCC小鼠模型 | 基因测序数据、流式细胞数据 | 29例HCC临床样本和12,487个细胞的单细胞RNA测序数据，每组8只小鼠的动物模型 |
| 764 | 2025-07-25 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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review | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，以及单细胞和空间转录组学在这些模型中的应用 | 结合最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学研究，总结了这些模型中的主要发现 | 没有模型是完美的，这些模型仍存在局限性 | 研究阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的病因及潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 765 | 2025-07-25 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次结合scRNA-seq和定量蛋白质组学技术，识别出与脓毒症预后相关的活性蛋白，并揭示了不同患者群体的通路差异 | 样本量相对较小（脓毒症患者53例，对照16例），且仅分析了外周血样本 | 探索影响脓毒症预后的关键活性蛋白及其作用机制 | 脓毒症患者（NS=26，SV=27）和健康对照（Con=16）的外周血样本 | 生物医学研究 | 脓毒症 | scRNA-seq, DIA蛋白质组学, Viper算法 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 69例（53例脓毒症患者+16例对照） |
| 766 | 2025-07-25 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示LRRc17介导的心脏成纤维细胞铁死亡在心肌梗死后心肌纤维化中的调节作用 | 首次发现LRRc17通过调节心脏成纤维细胞的铁死亡影响心肌梗死后纤维化的程度 | 研究仅基于GEO数据库中的两个数据集，样本量有限 | 阐明心肌梗死后纤维化的发病机制并寻找调节心室重构的治疗靶点 | 心脏成纤维细胞(CFs) | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、WGCNA、qRT-PCR、Western blotting | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE153485和GSE210159数据集 |
| 767 | 2025-07-25 |
IMPLICATIONS OF YWHAH GENE EXPRESSION IN THE EARLY DETECTION OF SEPSIS
2024-09-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002409
PMID:38904460
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研究论文 | 本研究探讨了YWHAH基因表达在脓毒症早期检测中的潜在作用 | 首次发现YWHAH基因表达在感染和脓毒症患者之间存在差异，为脓毒症的早期检测和治疗策略提供了新见解 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据库和体外分析，需要进一步的临床验证 | 探索YWHAH基因表达与脓毒症早期检测的关联 | 感染个体和健康对照组的YWHAH基因表达 | 基因表达分析 | 脓毒症 | 实时聚合酶链反应（real-time PCR），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 公共单细胞转录组数据库中的样本 |
| 768 | 2025-07-25 |
TRANSCRIPTOMIC DIFFERENCES IN PERIPHERAL MONOCYTE POPULATIONS IN SEPTIC PATIENTS BASED ON OUTCOME
2024-08-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002379
PMID:38713581
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和通路分析，探讨了脓毒症患者外周单核细胞群体在转录组水平上的差异及其与临床结果的关系 | 首次在转录组水平上定义了脓毒症患者不同临床结果的免疫反应差异，特别是经典和非经典单核细胞的基因表达模式 | 研究样本量未明确说明，且未探讨其他免疫细胞类型的作用 | 阐明脓毒症患者不同临床结果的免疫学基础，寻找改善慢性危重病预后的治疗靶点 | 脓毒症患者的外周单核细胞群体 | 转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 769 | 2025-07-25 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
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研究论文 | 本研究探讨了与铜死亡相关的分子标志物在脓毒症患者中的表达及其对预后的影响 | 发现了与铜死亡相关的三个关键基因，并验证了GLS表达下降与O-GlcNAc水平降低的关系 | 铜与GLS变化之间的相关性需要进一步研究 | 探索脓毒症患者中与铜死亡相关的分子标志物，以帮助分层和改善预后 | 脓毒症患者的外周血样本和Jurkat细胞 | 分子生物学 | 脓毒症 | WGCNA、scRNA-seq、免疫印迹、流式细胞术、免疫荧光、CFSE分析 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 脓毒症患者的外周血样本和Jurkat细胞 |
| 770 | 2025-07-25 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-06-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 研究FAP靶向放射性配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其潜在机制 | 首次展示了Ga/Lu标记的LNC1004在肿瘤模型中的摄取和保留增强，以及联合疗法在完全消除肿瘤和促进抗肿瘤免疫方面的效果 | 初步临床研究样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 探索FAP靶向放射性配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植模型及难治性癌症患者 | 肿瘤学 | 癌症 | scRNA-seq, TCR测序 | NA | 基因表达数据、免疫组化数据 | 临床前研究使用小鼠模型，初步临床研究涉及难治性癌症患者 |
| 771 | 2025-07-25 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
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综述 | 本文系统总结了巨噬细胞在心血管疾病调控机制中的多样表型和功能可塑性，以及单细胞测序技术带来的新视角 | 利用单细胞测序技术揭示了巨噬细胞的异质性、细胞间相互作用及治疗靶点的下游机制，为心血管疾病的治疗提供了新的视角 | 未具体提及样本量或实验设计的详细限制 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制及治疗靶点 | 巨噬细胞在心血管疾病（如冠心病、瓣膜病、心肌炎、心肌病、心力衰竭、动脉粥样硬化和动脉瘤）中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 772 | 2025-07-25 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本研究探讨了靶向BCL9/BCL9L如何通过促进常规1型树突状细胞（cDC1）的激活和肿瘤浸润来增强抗原呈递 | 揭示了靶向BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路增强cDC1激活和抗原呈递的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索BCL9/BCL9L在肿瘤抗原呈递中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 常规1型树突状细胞（cDC1）、BCL9/BCL9L蛋白、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组分析、基因敲除小鼠模型 | Bcl9/Bcl9l敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用基因敲除小鼠和野生型小鼠进行对比 |
| 773 | 2025-07-25 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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综述 | 本文综述了导管原位癌（DCIS）向浸润性乳腺癌（IDC）进展的分子特征及其临床意义 | 系统总结了DCIS向IDC转变的关键信号通路、分子特征及肿瘤微环境变化，并探讨了单细胞测序、空间转录组学和人工智能等新技术在研究中的应用 | NA | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转变的分子机制，以促进更有效的临床管理 | 导管原位癌（DCIS）和浸润性导管癌（IDC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA |
| 774 | 2025-07-25 |
Characterization of Immunosuppressive Myeloid Cells in Merkel Cell Carcinoma: Correlation with Resistance to PD-1 Pathway Blockade
2024-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-1957
PMID:37851052
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和多重免疫组化染色技术，探讨了默克尔细胞癌（MCC）中免疫抑制性髓系细胞的特征及其与PD-1通路阻断抵抗的相关性 | 首次在MCC中详细描述了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的免疫抑制特性及其与PD-1阻断治疗抵抗的关联 | 样本量相对较小（单细胞转录组学9例，免疫组化54例），且未明确验证TAMs与CD8 T细胞空间相互作用的临床意义 | 探究MCC中髓系细胞的免疫抑制特性及其对免疫治疗响应的影响 | 默克尔细胞癌患者肿瘤组织中的髓系细胞和CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 默克尔细胞癌 | 单细胞转录组学，多重免疫组化染色（multiplex IHC） | NA | 转录组数据，免疫组织化学图像数据 | 单细胞转录组学分析9例患者，免疫组化分析54例患者治疗前肿瘤样本 |
| 775 | 2024-08-07 |
Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004763
PMID:37638872
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 776 | 2025-07-25 |
Exploring the Immune-related Molecular Mechanisms Underlying the Comorbidity of Temporal Lobe Epilepsy and Major Depressive Disorder through Integrated Data Set Analysis
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
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研究论文 | 通过整合数据集分析探索颞叶癫痫和重度抑郁症共病的免疫相关分子机制 | 识别了TLE和MDD共有的关键基因及其免疫相关分子机制，并预测了潜在治疗药物 | 研究依赖于公开数据库的数据，未进行实验验证 | 探索TLE和MDD共病的分子机制及其在诊断和治疗中的应用 | 颞叶癫痫(TLE)和重度抑郁症(MDD)患者 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析、WGCNA、PPI网络构建、LASSO、随机森林、ROC曲线分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | LASSO、随机森林(RF) | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的脑组织基因表达数据 |
| 777 | 2025-07-25 |
Differential gene expression analysis in single-cell RNA sequencing data
2017-Nov, Proceedings. IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine
DOI:10.1109/bibm.2017.8217650
PMID:40693108
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研究论文 | 本文提出了一种名为SigEMD的新方法，用于在单细胞RNA测序数据中精确高效地识别差异表达基因 | 结合逻辑回归模型和基于Earth Mover's Distance的非参数方法，并利用基因互作网络信息减少假阳性 | 未提及具体样本量或数据集的多样性限制 | 开发新方法以提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的检测精度 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 逻辑回归模型, 非参数方法(Earth Mover's Distance) | 基因表达数据 | NA |
| 778 | 2025-07-22 |
Bulk RNA sequencing combined with single-cell RNA sequencing analysis revealed the ferroptosis immune target of osteoarthritis synovial fibroblasts
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101587
PMID:40687616
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 779 | 2025-07-24 |
Identification and validation of the pivotal role of MANF gene in pancreatic β-cell aging using bioinformatics
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102106
PMID:40688493
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定并验证MANF基因在胰腺β细胞衰老中的关键作用 | 首次确立MANF作为β细胞蛋白质稳态的守护者，为糖尿病治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人体中进行验证 | 探索胰腺β细胞衰老的分子机制及其与糖尿病的关系 | 胰腺β细胞 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA-seq、微阵列分析 | d-半乳糖诱导的衰老小鼠模型、HO处理的MIN6细胞 | RNA-seq数据、微阵列数据 | 年轻和年老的食蟹猴及小鼠的胰腺β细胞数据，D-gal诱导的小鼠模型和HO处理的MIN6细胞 |
| 780 | 2025-07-24 |
Induction of host genes by nested genes during C. elegans development
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113021
PMID:40686608
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研究论文 | 本研究分析了在胚胎发育过程中，相反嵌套配置的基因组拓扑结构对转录的影响 | 揭示了嵌套基因如何影响其宿主基因的表达，特别是在神经元中诱导宿主基因的短版本转录 | 研究仅关注了线虫的胚胎发育，未涉及其他生物或发育阶段 | 探究相反嵌套配置的基因对宿主基因转录的影响 | 线虫（C. elegans）的胚胎发育 | 基因组学 | NA | CRISPR基因组工程、单分子FISH、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 数百个蛋白质编码基因的相反嵌套配置，覆盖线虫胚胎发育的单细胞RNA-seq数据 |