单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-Sep-16, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞RNA测序数据，利用机器学习方法识别了辐射性肺损伤的氧化应激特征基因 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法系统分析辐射性肺损伤的氧化应激分子特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 识别辐射性肺损伤的早期诊断生物标志物和分子机制 | 辐射性肺损伤小鼠模型 | 机器学习 | 肺损伤 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,RT-PCR,免疫组化 | 随机森林,支持向量机,LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 762 | 2025-10-05 |
Revealing the core immunotoxicity of di-n-pentyl phthalate exposure in murine models using single-cell RNA sequencing
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118754
PMID:40753775
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示邻苯二甲酸二正戊酯在小鼠模型中的核心免疫毒性作用 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统评估DNPP对免疫系统的全面影响，揭示了其对多种免疫细胞功能的具体损害机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证；剂量反应关系需要更深入分析 | 系统评估DNPP暴露引起的免疫系统改变 | 小鼠脾脏组织和外周血白细胞 | 单细胞组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | DNPP暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 763 | 2025-10-05 |
The food-derived metabolite trimethylamine and trimethylamine-N-oxide promote colorectal cancer progression via SREBF1
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118996
PMID:40912095
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物TMA和TMAO通过SREBF1介导的PI3K/AKT信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次证明TMA和TMAO通过激活PI3K/AKT信号通路促进结直肠癌细胞增殖，并确定SREBF1是TMA和TMAO诱导CRC增殖的关键介质 | NA | 研究TMA和TMAO对结直肠癌进展的影响及其分子机制 | 结直肠癌细胞系和小鼠肿瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 实时PCR、Western blotting、细胞活力和迁移实验、凋亡分析、单细胞RNA测序、肿瘤异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 764 | 2025-10-05 |
Decoding coal-induced pulmonary endothelial injury using single-cell omics
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118989
PMID:40914082
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析煤尘暴露引起的肺内皮细胞损伤机制 | 首次在煤工尘肺小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术，系统识别了四种内皮细胞亚群并揭示了煤尘通过内外在机制共同导致内皮细胞损伤 | 研究仅基于小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究煤尘暴露引起肺内皮细胞损伤的分子机制 | 煤工尘肺小鼠模型的肺组织内皮细胞 | 单细胞组学 | 尘肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 煤尘暴露组和对照组小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2025-10-05 |
Integration of network toxicology, machine learning and single-cell sequencing reveals the effects of soil pollutants on prostate cancer
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119010
PMID:40925179
|
研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序技术研究土壤污染物对前列腺癌的影响机制 | 首次将网络毒理学、101种机器学习算法和单细胞测序技术相结合，系统揭示土壤污染物通过DNMT1和mTOR关键分子靶点影响前列腺癌的新机制 | 研究主要基于计算预测和数据库分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能实验确认机制 | 探究土壤污染物影响前列腺癌发展的分子机制 | 前列腺癌相关分子靶点和10种土壤污染物（DBP、DOP、DMP、PFOA、PFOS、MEK、TOL、ZEN、OTA、DON） | 生物信息学 | 前列腺癌 | 网络毒理学、机器学习、单细胞测序、分子对接 | 101种机器学习算法、Cox回归模型、Kaplan-Meier分析 | 基因组数据、蛋白质互作数据、单细胞表达数据 | 242个潜在靶点，26个风险靶分子 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 766 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics meets diabetic kidney disease: Illuminating the path to precision medicine
2025-Sep-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v16.i9.107663
PMID:40980298
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综述 | 本文探讨空间转录组学技术在糖尿病肾病研究中的应用及其对精准医疗的推动作用 | 将空间转录组学技术引入糖尿病肾病研究，实现基因表达与空间定位的整合分析，揭示肾脏微环境中细胞互作和局部分子改变 | 空间分辨率有限、数据复杂度高、计算需求大 | 探索空间转录组学在糖尿病肾病精准医疗中的应用价值 | 糖尿病肾病肾脏组织 | 空间转录组学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 机器学习，网络分析 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | Slide-seqV2 | NA |
| 767 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics unravels the interactive network of aflatoxin B1-driven gastric cancer: Multi-omics integration of transcriptome and mendelian randomization
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118919
PMID:40850114
|
研究论文 | 通过空间转录组学和多组学整合揭示黄曲霉毒素B1驱动胃癌的分子网络机制 | 首次构建AFB1诱导胃癌的多层次分子调控图谱，建立了环境致癌物毒理机制研究的多组学整合新范式 | AFB1诱导胃癌的具体分子机制仍有待进一步明确 | 阐明黄曲霉毒素B1驱动胃癌恶性进展的分子网络机制 | 人类胃癌组织及黄曲霉毒素B1核心靶基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接模拟,多组学整合 | 分子对接模拟 | 转录组数据,空间转录组数据 | 人类胃癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 768 | 2025-10-05 |
Polyethylene terephthalate microplastics promote pulmonary fibrosis via AKT1, PIK3CD, and PIM1: A network toxicology and multi-omics analysis
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118954
PMID:40876188
|
研究论文 | 通过网络毒理学和多组学分析揭示聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料通过AKT1、PIK3CD和PIM1蛋白加剧特发性肺纤维化的分子机制 | 首次结合网络毒理学、分子对接、孟德尔随机化和单细胞测序分析系统揭示PET-MPs通过特定信号通路和细胞类型加剧IPF的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和数据库挖掘，缺乏实验验证 | 确定PET-MPs在加剧特发性肺纤维化中的作用机制 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料及其与肺纤维化的关联 | 网络毒理学 | 特发性肺纤维化 | 网络毒理学、分子对接、孟德尔随机化、单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 从多个数据库识别120个潜在靶点和81个交叉靶点 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 769 | 2025-10-05 |
Major PM2.5 components promote intracranial aneurysm via TP53: Insights from a comprehensive network analysis
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118953
PMID:40886600
|
研究论文 | 通过整合网络毒理学和双样本孟德尔随机化分析，揭示PM2.5主要成分通过TP53基因促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次将网络毒理学与孟德尔随机化相结合，系统阐明PM2.5成分通过TP53介导颅内动脉瘤形成的因果机制 | 研究主要基于数据库分析和计算模拟，需要更多实验验证 | 探究PM2.5主要成分影响颅内动脉瘤发展的潜在机制 | PM2.5六种代表性成分（铅、镉、砷、苯并[a]芘、甲醛、苯）及其与TP53基因的相互作用 | 生物信息学 | 颅内动脉瘤 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 基因组数据, 蛋白质结构数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2025-10-05 |
Pathogenic Mechanism of the Lactylation-Related Gene DCBLD1 in Ulcerative Colitis: A Multi-Omics and Machine Learning Analysis
2025-09-11, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 通过多组学和机器学习方法探究乳酰化相关基因DCBLD1在溃疡性结肠炎中的致病机制 | 首次将乳酰化修饰与溃疡性结肠炎发病机制联系起来，并采用多组学整合分析和机器学习方法构建诊断模型 | 需要进一步实验验证DCBLD1通过乳酰化调控免疫代谢的具体分子机制 | 探究乳酰化相关基因DCBLD1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照的肠道组织 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,RNA测序,定量PCR,SMR分析 | CATboost,XGBoost,NGboost | 基因表达数据,单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 771 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals diet-dependent dynamics of glucosinolate sulfatases expression and cellular origin in the midgut of Plutella xylostella
2025-Sep-09, Insect biochemistry and molecular biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.ibmb.2025.104399
PMID:40930467
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小菜蛾中肠内硫代葡萄糖苷硫酸酯酶的表达动态及细胞来源受饮食调控的机制 | 首次构建小菜蛾中肠单细胞图谱，揭示不同饮食条件下GSS基因的细胞特异性表达模式及分化轨迹 | 研究仅针对两种植物饲料条件，未涵盖更广泛的寄主植物范围 | 探究小菜蛾中肠细胞类型特异性GSS表达及其在饮食适应中的作用机制 | 小菜蛾幼虫中肠细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 28,451个中肠细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling reveals immunoregulation of artemisinin on CD8+GZMB+ T cells via JAK2-STAT3 in malaria-infected mice
2025-Sep-08, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.101080
PMID:40979296
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示青蒿素通过JAK2-STAT3通路调节CD8+GZMB+ T细胞的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平系统描绘疟疾感染和青蒿素治疗下的免疫细胞图谱，发现青蒿素通过JAK2-STAT3通路调节致病性CD8+GZMB+ T细胞的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，青蒿素的确切免疫调节机制仍需进一步验证 | 探究青蒿素在疟疾感染中的免疫调节机制 | 疟疾感染小鼠的肝脏、脾脏和外周血免疫细胞 | 单细胞测序 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 241,837个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2025-10-05 |
MitoScribe single-cell molecular recorder logs graded signaling dynamics into mitochondrial DNA
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.05.674553
PMID:40949974
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研究论文 | 开发了一种基于线粒体DNA的分子记录平台MitoScribe，用于在单细胞水平记录分级信号动态 | 首次利用线粒体DNA作为记录介质，通过mtDNA碱基编辑器将分级生物信号转化为单核苷酸替换，实现高灵敏度、非破坏性的分子记录 | 未明确说明技术应用的细胞类型限制或记录容量上限 | 开发高分辨率分子记录技术以重建细胞历史状态 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其向中胚层分化的过程 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序，线粒体转录组富集，mtDNA碱基编辑 | DdCBEs(线粒体DNA碱基编辑器) | 基因组DNA，转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2025-10-05 |
Targeting RPE Senescence Via Suppressing IL-6/IL-6R Signaling for Treating Retinal Degenerative Diseases
2025-Sep-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.12.44
PMID:40970669
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研究论文 | 本研究通过抑制IL-6/IL-6R信号通路靶向视网膜色素上皮细胞衰老，探索治疗视网膜退行性疾病的新策略 | 首次揭示IL-6/IL-6R轴在RPE细胞衰老中的关键作用，并证明托珠单抗通过阻断该信号通路可有效治疗视网膜退行性疾病 | 研究主要基于NaIO₃诱导的小鼠模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索IL-6/IL-6R信号轴在RPE细胞衰老中的作用机制及其抑制剂的治疗效果 | 视网膜色素上皮细胞和NaIO₃诱导的视网膜退行性病变小鼠模型 | 眼科疾病研究 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序,qPCR,Western blotting,免疫荧光染色,OCT,H&E染色,视网膜电图 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据,电生理数据 | NaIO₃诱导的视网膜退行性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2025-10-05 |
High-Fat and High-Sugar Diet Induces Murine Premature Ovarian Failure by Promoting Mitochondrial Oxidative Phosphorylation Response
2025-Sep, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.70973
PMID:40979580
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子病理学技术系统分析了高脂高糖饮食诱导的小鼠卵巢早衰机制 | 首次应用单细胞RNA测序分析高脂高糖饮食小鼠卵巢图谱，并验证其通过激活氧化磷酸化信号通路诱导卵巢早衰 | 研究仅针对小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 探究高脂高糖饮食诱导卵巢早衰的分子机制 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 卵巢早衰 | 单细胞RNA测序, ELISA, 免疫荧光染色, qPCR | NA | 单细胞转录组数据, 病理图像, 分子检测数据 | 小鼠卵巢组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2025-10-05 |
A comparative transcriptomic analysis at single-cell resolution reveals acral melanoma features distinct from cutaneous melanoma
2025-Aug-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤的分子特征差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤的转录组特征，发现具有雪旺细胞特性的MPZ+黑色素瘤细胞亚群 | 样本量相对有限（39例AM和18例CM），需要更大规模研究验证 | 揭示肢端黑色素瘤与皮肤黑色素瘤在分子水平上的关键差异 | 肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析工具 | 单细胞转录组数据 | 39例肢端黑色素瘤患者和18例皮肤黑色素瘤病例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 777 | 2025-10-05 |
SMOC2 high myofibroblastic cancer-associated fibroblast drives primary cilia-associated tumor microenvironment remodeling and poor prognosis in gastric cancer
2025-Aug-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 本研究通过整合大量胃癌转录组数据定义了原发性纤毛亚型，建立了预后特征，并发现SMOC2高表达肌成纤维细胞性癌症相关成纤维细胞是驱动胃癌不良预后的关键因素 | 首次在胃癌中系统定义原发性纤毛亚型，建立多机器学习生存框架的预后特征，并鉴定SMOC2高mCAF作为关键驱动细胞群 | 研究主要基于转录组数据分析，功能验证仍需进一步扩展 | 定义胃癌原发性纤毛亚型并建立预后特征，为个性化治疗提供策略 | 胃癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, 细胞培养, 异种移植模型 | 多机器学习生存框架 | 转录组数据 | 超过1500个胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 778 | 2025-10-05 |
Integration of phospho-signaling and transcriptomics in single cells reveals distinct Th17 cell fates
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116006
PMID:40674215
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研究论文 | 开发了一种名为Vivo-seq的创新平台，可在单细胞水平同时捕获转录组和磷酸化信号状态 | 开发了Vivo-seq平台，通过深共晶溶剂固定细胞，首次实现单细胞水平转录组和磷酸化信号的同步捕获 | 未明确说明样本规模和实验重复次数 | 研究Th17细胞分化过程中的信号网络和细胞状态 | T辅助17细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞内转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据，磷酸化信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | Vivo-seq | 整合scRNA-seq和细胞内转录组表位索引测序的平台，使用深共晶溶剂固定细胞 |
| 779 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights specific cell types manipulated by Fusarium head blight fungus leading to wheat susceptibility
2025-Aug-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.022
PMID:40845857
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小麦中受赤霉病真菌操纵的特定细胞类型及其导致易感性的机制 | 首次在小麦中应用单细胞RNA测序技术解析不同细胞类型对适应性和非适应性真菌侵染的特异性响应 | 研究仅关注了接种后1-3天的早期响应，未涵盖整个病害发展过程 | 探究小麦胚芽鞘细胞类型特异性响应在真菌侵染过程中的作用机制 | 小麦胚芽鞘细胞 | 植物病理学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过90,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2025-10-05 |
Evolutionary trends in the emergence of skeletal cell types
2025-Aug, Evolution letters
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/evlett/qraf012
PMID:40980705
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研究论文 | 本研究通过整合基因组系统发育地层学和单细胞转录组学，探索骨骼细胞类型特异性基因表达程序的进化趋势 | 挑战了关于脊椎动物骨骼结构进化的长期观点，提出软骨内骨化和软骨细胞肥大可能在颌口类最后共同祖先中已经进化 | NA | 探索骨骼细胞类型特异性基因表达程序的进化趋势 | 成骨细胞、肥厚软骨细胞和未成熟软骨细胞 | 进化生物学 | NA | 基因组系统发育地层学，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |