单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37491 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-03-10 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Oct, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0441
PMID:41027482
|
研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式，首次实现了从混沌系统中进行准确预测 | 首次引入混沌学习，通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入交互式混沌动力系统，并调制其动态行为以实现准确预测 | NA | 探索混沌系统的可预测性，并开发一种能够从混沌中提取物理属性的新学习范式 | 28个数据集，包括脑波、蛋白质基准数据、单细胞RNA测序数据和图像数据，以及Lorenz和Rossler吸引子两种混沌动力系统 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混沌学习范式 | 脑波数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 762 | 2026-03-10 |
Nephrobase Cell+: Multimodal Single-Cell Foundation Model for Decoding Kidney Biology
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.30.679471
PMID:41256511
|
研究论文 | 本研究开发了首个专注于肾脏的大型基础模型Nephrobase Cell+，用于解码肾脏生物学 | 首次构建了肾脏特异性的大型基础模型，通过器官规模的多模态预训练和专门的Transformer架构，实现了跨物种、跨模态的高保真表示学习 | 模型主要针对四种哺乳动物物种，可能无法完全覆盖所有肾脏细胞类型或疾病状态 | 开发一个统一的、高保真的肾脏生物学表示模型，以提升单细胞分析能力 | 人类、小鼠、大鼠和猪的肾脏单细胞和单核转录组及空间转录组数据 | 机器学习 | 肾脏疾病 | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq, 空间转录组学 | Transformer-based encoder-decoder with gene-token cross-attention and mixture-of-experts | 单细胞和单核转录组、表观基因组及空间转录组数据 | 约39.5百万个单细胞和单核图谱，来自4,319个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 763 | 2026-03-10 |
Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424487122
PMID:40920930
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪技术，揭示了增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）中纤维化形成的细胞起源和机制，并识别了TSP-1作为关键驱动基因 | 首次结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪，系统绘制了PVR纤维化形成的细胞路线图，并发现TSP-1作为治疗靶点 | NA | 解析增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）中纤维化形成的细胞机制，以开发治疗策略 | 视网膜色素上皮细胞、免疫细胞和Müller细胞在PVR病变中的贡献 | 数字病理学 | 增殖性玻璃体视网膜病变 | 单细胞转录组学，遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2026-03-10 |
Dynamic and precise electromagnetic levitation of single cells
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512246122
PMID:40920932
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Electro-LEV的创新平台，它结合电磁和磁悬浮原理，实现了在3-D微流体环境中对单细胞位置进行动态精确控制 | 该平台通过周期性调制和跟踪细胞在z轴的位置，能够区分单细胞与细胞簇的悬浮行为，并显著提高了悬浮分选的纯度和效率 | NA | 开发一种用于动态3-D控制细胞位置的新平台，以研究细胞异质性、区分细胞大小和类型，并提高细胞分选效率 | 单细胞和细胞簇 | 数字病理学 | NA | 电磁悬浮和磁悬浮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 765 | 2026-03-10 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和GNAS基因分型策略，分析了人类纤维性结构不良骨中的非造血细胞，揭示了GNAS变异在多种细胞谱系中的存在以及共同的纤维化转录组特征 | 首次在纤维性结构不良骨中，除了骨骼基质谱系外，还在内皮细胞和血管周围细胞中检测到GNAS c.602G>A和c.601C>T变异，并识别出跨细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 样本来源有限，仅分析了非造血细胞，可能未全面覆盖所有相关细胞类型 | 探究体细胞嵌合体在纤维性结构不良疾病中的细胞和分子机制 | 人类纤维性结构不良骨和非纤维性结构不良骨中的非造血细胞 | 数字病理学 | 纤维性结构不良 | 单细胞RNA测序, GNAS基因分型, BaseScope | NA | RNA测序数据 | 来自FD和非FD人类骨组织的非造血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2026-03-10 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-02-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40036846
|
研究论文 | 本研究构建了TcEVdb数据库，通过SEVtras方法从T细胞单细胞RNA测序数据中探索T细胞来源的小细胞外囊泡的表达和聚类 | 首次创建了专门针对T细胞来源小细胞外囊泡的综合性数据库，整合了多项目、多组织来源的单细胞转录组数据，揭示了TcEV的异质性 | 数据库依赖于现有单细胞RNA测序数据的质量和覆盖范围，可能无法完全捕捉所有TcEV亚群 | 探索T细胞来源细胞外囊泡的转录组特征和异质性，以促进基于EV的疾病诊断和治疗研究 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目中的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2026-03-10 |
ScLineageAtlas: a comprehensive single-cell genomics database for characterizing cellular clones in cancer
2025-01-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf046
PMID:40996711
|
研究论文 | 介绍了一个名为ScLineageAtlas的综合单细胞基因组学数据库，用于表征多种癌症类型中的细胞克隆 | 整合了24个处理过的单细胞RNA测序数据集，涵盖13种不同癌症类型，并利用先进计算方法识别细胞克隆，提供克隆关系和进化动力学的详细视图 | 数据库目前仅包含24个数据集，可能覆盖的癌症类型和样本量有限，且依赖于现有计算方法，可能受算法准确性限制 | 通过表征细胞克隆来研究癌症的起始、发展和治疗机制，促进对肿瘤异质性和进化轨迹的理解 | 多种癌症类型中的细胞克隆，包括单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24个处理过的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2026-03-10 |
PRMT5/WDR77 Enhances the Proliferation of Squamous Cell Carcinoma via the ΔNp63α-p21 Axis
2024-Nov-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16223789
PMID:39594744
|
研究论文 | 本研究揭示了PRMT5及其结合伴侣WDR77通过稳定ΔNp63α蛋白并抑制p21，从而促进鳞状细胞癌增殖的新机制 | 首次发现PRMT5与WDR77协同通过ΔNp63α-p21轴促进鳞状细胞癌增殖，为该类癌症提供了新的治疗靶点 | NA | 探究PRMT5在鳞状细胞癌增殖中的作用及其分子机制 | 鳞状细胞癌患者数据、癌细胞系、小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, 流式细胞术, MTT法 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞增殖数据 | 来自TCGA和DepMap的鳞状细胞癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 769 | 2026-03-10 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
|
研究论文 | 本文提出了一种名为spoon的统计框架，用于解决空间转录组学数据中的均值-方差关系偏差，以更准确地识别空间可变基因 | 首次在空间转录组学数据中证明并处理均值-方差关系偏差，采用经验贝叶斯技术进行校正 | 未在摘要中明确说明，可能涉及方法在特定数据类型或条件下的适用性限制 | 改进空间转录组学数据分析中空间可变基因的识别准确性 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 经验贝叶斯统计模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 770 | 2026-03-10 |
Distinct Patterns of Smooth Muscle Phenotypic Modulation in Thoracic and Abdominal Aortic Aneurysms
2024-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd11110349
PMID:39590192
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调制的独特模式 | 首次在单细胞水平上比较了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的转录组差异，并识别出独特的SMCmod细胞群 | 研究主要基于小鼠模型数据，人类样本验证有限，未来需要更多研究来揭示具体的致病通路 | 探究胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调制的差异及其在疾病发病机制中的作用 | 小鼠和人类的胸主动脉瘤及腹主动脉瘤组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | RNA测序数据，图像数据 | 来自GEO数据库的小鼠TAA数据集(GSE153534)和AAA数据集(GSE164678, GSE152583)及对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-03-10 |
A LDH-Derived Metal Sulfide Nanosheet-Functionalized Bioactive Glass Scaffold for Vascularized Osteogenesis and Periprosthetic Infection Prevention/Treatment
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403009
PMID:39159063
|
研究论文 | 本研究开发了一种功能化生物活性玻璃支架，用于促进血管化骨生成并预防/治疗假体周围感染 | 首次将MgCuFe-LDH衍生的硫化物纳米片功能化到生物活性玻璃支架上，结合抗菌阳离子和NIR-II光热性能，同步解决假体周围感染和骨整合问题 | 研究主要基于动物模型，临床转化效果尚需验证 | 开发一种多功能骨科植入材料，同步促进血管化骨生成和预防/治疗假体周围感染 | 生物活性玻璃支架功能化材料及其在骨再生和抗感染中的应用 | 生物材料与组织工程 | 骨科植入并发症 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 772 | 2026-03-10 |
From Cell to Gene: Deciphering the Mechanism of Heart Failure With Single-Cell Sequencing
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308900
PMID:39159065
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示心力衰竭（HF）机制中的应用，重点关注心肌细胞异质性和细胞间通讯网络 | 利用单细胞测序技术克服传统高通量测序的局限性，在单个细胞水平上解析基因表达，从而揭示HF中细胞组成和基因表达的变化，以及微环境中不同细胞群体的独特作用 | 当前心血管研究中单细胞测序技术仍面临挑战，如技术复杂性、数据分析难度以及样本获取限制等 | 深入探究心力衰竭的发病机制，特别是细胞异质性和细胞间相互作用 | 心力衰竭相关的心肌细胞及其他心脏细胞类型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组/转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-03-10 |
GJB2 Promotes HCC Progression by Activating Glycolysis Through Cytoplasmic Translocation and Generating a Suppressive Tumor Microenvironment Based on Single Cell RNA Sequencing
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402115
PMID:39162005
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序发现GJB2在肝细胞癌恶性细胞中高表达，并通过细胞质易位激活糖酵解及抑制性肿瘤微环境促进HCC进展 | 首次揭示了GJB2在HCC中的细胞定位改变（从细胞膜转向细胞质/核），并阐明了其通过激活NF-κB和HIF-1α/GLUT-1/PD-L1通路促进糖酵解及免疫抑制微环境的新机制 | 未明确说明样本数量及具体实验模型细节，机制研究主要在细胞层面进行 | 寻找肝细胞癌的有效治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC）细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-03-10 |
DrugFormer: Graph-Enhanced Language Model to Predict Drug Sensitivity
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405861
PMID:39206872
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DrugFormer的新型图增强大语言模型，用于在单细胞水平预测药物敏感性 | 提出首个结合序列化基因标记和基于基因的知识图谱的图增强大语言模型，用于单细胞水平的药物反应预测 | 模型训练依赖于带药物反应信息的单细胞数据，数据质量和覆盖范围可能影响预测性能 | 预测药物耐药性并揭示耐药细胞的分子机制 | 难治性多发性骨髓瘤和急性髓系白血病患者的单细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤, 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 图增强大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 775 | 2026-03-10 |
Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400584
PMID:39206808
|
研究论文 | 本研究探讨了Smek1在tau蛋白病中防止神经退行性变的作用 | 首次揭示Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍，以年龄依赖性方式诱导神经退行性变 | NA | 研究Smek1在阿尔茨海默病和其他tau蛋白病中的生理和病理作用 | 小鼠模型和人类大脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2026-03-10 |
Myeloid Cells and Sensory Nerves Mediate Peritendinous Adhesion Formation via Prostaglandin E2
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405367
PMID:39207041
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合条件性基因敲除小鼠模型，揭示了髓系细胞和感觉神经通过前列腺素E2介导肌腱周围粘连形成的机制 | 首次阐明髓系细胞中的COX2和感觉神经中的EP4受体在肌腱粘连形成中的关键作用，并发现PGE2局部治疗可改善修复肌腱的生物力学性能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析有限；PGE2治疗的长期效果和安全性尚未评估 | 探究肌腱周围粘连形成的分子机制和潜在治疗靶点 | 人类和小鼠的肌腱组织样本、八种条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞组学 | 肌腱损伤/粘连 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠标本（具体数量未明确），八种基因敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-03-10 |
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405421
PMID:39207055
|
研究论文 | 本研究揭示了内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群通过IER2/GMFG/ITGB1轴促进脊索瘤进展的分子机制 | 首次系统阐明了缺氧微环境如何通过上调IER2将CAFs重编程为ERS-CAF亚群，并发现该亚群通过旁分泌GMFG信号靶向肿瘤细胞ITGB1驱动脊索瘤进展 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化潜力需进一步验证；ERS抑制剂的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群在脊索瘤中的致癌机制 | 脊索瘤肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚群、肿瘤细胞和SPP1巨噬细胞 | 单细胞组学与空间转录组学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析、数据非依赖性采集蛋白质组学、bulk RNA-seq、多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, bulk RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiler | NA |
| 778 | 2026-03-10 |
Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis
2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320030
PMID:38152886
|
研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集，定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化 | 开发了基于报告基因表达的算法来量化平滑肌细胞向巨噬细胞表型的转分化，并整合多个数据集进行元分析以解决现有研究中的不一致发现 | 研究受限于现有数据集的实验条件，且转分化事件在检测范围内极为罕见 | 解决动脉粥样硬化单细胞RNA测序研究中的不一致结果，并深入理解驻留血管细胞在疾病中的作用 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞，包括平滑肌细胞、内皮细胞和主动脉瓣细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，原位杂交 | 分类算法 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多个已发表数据集的整合，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2026-03-10 |
Dissecting the immune suppressive human prostate tumor microenvironment via integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses
2023-02-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36325-2
PMID:36750562
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，深入解析了人类前列腺肿瘤微环境的免疫抑制特性 | 首次结合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组技术，全面描述局部前列腺癌的肿瘤微环境，并推断未解离组织切片中的细胞间相互作用 | 未明确提及研究样本量限制或技术验证的不足 | 理解前列腺癌免疫逃逸和肿瘤进展的驱动因素，以改善临床治疗策略 | 局部前列腺癌患者样本、邻近正常组织和健康对照 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 780 | 2026-03-10 |
Single-cell RNA sequencing in human lung cancer: Applications, challenges, and pathway towards personalized therapy
2021-06-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000000535
PMID:33883467
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类肺癌研究中的应用、挑战及其在推动个性化治疗发展中的潜力 | 填补了现有综述的空白，全面总结了scRNA-seq在肺癌研究中的广泛应用，并探讨了其在个性化癌症治疗中的未来应用与挑战 | NA | 总结scRNA-seq在人类肺癌研究中的各种应用，并探讨其在促进未来个性化癌症治疗发展中的潜力与挑战 | 人类肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |