单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 37260 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-03-03 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
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研究论文 | 本研究通过在小鼠气道中失活E-cadherin，揭示了其缺失如何导致细胞增殖增加、杯状细胞化生和免疫浸润，模拟哮喘表型 | 首次证明E-cadherin在气道上皮祖细胞中的失活可引发类似哮喘的病理变化，无需过敏原暴露，并揭示了上皮细胞通过趋化因子如Cxcl17感知连接破坏并启动免疫防御的内在机制 | 研究基于小鼠模型，可能不完全反映人类哮喘的复杂性；未详细探讨E-cadherin失活在终末分化纤毛细胞中的影响 | 探究E-cadherin如何控制细胞命运及其在气道重塑中的作用 | 小鼠气道上皮细胞，特别是上皮祖细胞俱乐部细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 762 | 2026-03-03 |
Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
PMID:40798884
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研究论文 | 本研究揭示了肺细胞通过外泌体通讯在造血干细胞自我更新和移植中的重要作用 | 首次通过单细胞外泌体追踪分析和体内移植研究，发现肺细胞通过外泌体通讯调控造血干细胞稳态，挑战了传统认为仅骨髓微环境调控的观点 | 研究主要基于实验条件，在人类疾病如镰状细胞病和骨髓衰竭中的实际应用潜力仍需进一步验证 | 探究肺细胞外泌体通讯对造血干细胞自我更新和移植能力的影响及其分子机制 | 造血干细胞，特别是长期造血干细胞，以及人原代小气道上皮细胞来源的外泌体 | 单细胞生物学 | 镰状细胞病，骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序，外泌体microRNA分析，蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，外泌体microRNA数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2026-03-03 |
Mitochondrial and Glucose Metabolic Patterns in Pre-Granulosa Cells and Oocytes and Their Dysfunctions Induce Impaired Primordial Follicle Formation in Mice
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70110
PMID:41251108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠卵巢组织中前颗粒细胞和卵母细胞在糖酵解和氧化磷酸化信号通路上的动态基因表达变化，及其对原始卵泡形成的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了原始卵泡形成过程中前颗粒细胞和卵母细胞的能量代谢动态变化模式 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究原始卵泡形成过程中能量代谢的供应与需求机制 | 小鼠卵巢组织中的前颗粒细胞和卵母细胞 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠卵巢组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2026-03-03 |
LogicSR: prior-guided symbolic regression for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf621
PMID:41269283
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研究论文 | 本文提出了一种名为LogicSR的计算框架，用于从单细胞转录组数据中高精度重建基因调控网络 | 将布尔逻辑模型的机制可解释性与符号回归的方程发现能力相结合，并利用先验知识通过多目标蒙特卡洛树搜索框架确保生物学合理性并加速最优调控方程的搜索 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于单细胞数据的稀疏性和噪声，以及动态组合调控的复杂性 | 从单细胞转录组数据中推断基因调控网络，以揭示基因调控机制 | 基因调控网络，特别是转录因子与靶基因之间的复杂组合调控 | 系统生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 布尔逻辑模型，符号回归，蒙特卡洛树搜索 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2026-03-03 |
From Single-Cell Atlas to Functional Validation: Critical Next Steps for Understanding Tip Cell-Mediated Communication in the Injured Spinal Cord
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70117
PMID:41288006
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评论 | 本文对Zeng等人（2025年）利用单细胞RNA测序研究脊髓损伤的研究进行了前瞻性展望和批判性审视，强调了从单细胞图谱到功能验证的关键后续步骤 | 提出了对单细胞测序研究中计算预测的旁分泌网络（如Angptl4-Sdc4轴）进行严格体内功能验证的必要性，并探讨了靶向尖端细胞治疗策略中的治疗困境 | 评论文章本身不产生新数据，主要基于对现有研究的分析和展望；未提供具体的实验验证方案 | 批判性审视单细胞测序在脊髓损伤研究中的应用，提出从描述性见解向机制理解和治疗策略转化的关键挑战 | 脊髓损伤中的内皮尖端细胞、星形胶质细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2026-03-03 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究探讨了Epac1在缺血诱导的视网膜病变（OIR）小鼠模型中的作用，发现Epac1缺失可减轻Müller胶质细胞的病理性激活，并缓解视网膜神经变性 | 揭示了Epac1通过调节Müller细胞中的VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新作用机制 | 研究基于小鼠OIR模型，其发现向人类疾病的转化仍需进一步验证 | 探究Epac1在缺血诱导视网膜病变中的作用及其分子机制 | 小鼠氧诱导视网膜病变（OIR）模型中的视网膜组织，特别是Müller胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫染色、qPCR、Western blot、邻近连接分析 | 小鼠遗传缺失模型（Epac1敲除） | 单细胞转录组数据、组织图像、蛋白质印迹数据 | 未明确说明具体数量的小鼠OIR模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 767 | 2026-03-03 |
Single-cell transcriptome and surfaceome profiling of the adult human retinal pigment epithelium
2025-Sep-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102611
PMID:40882639
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研究论文 | 本研究利用CITE-seq技术对成人视网膜色素上皮细胞进行单细胞转录组和表面组分析，揭示了其亚群的多样性、空间分布和功能差异 | 首次结合单细胞转录组和表面蛋白标记（CITE-seq）对成人RPE进行综合分析，发现了具有独特空间模式和功能的新亚群，并验证了培养过程中亚群的保留情况 | 研究主要基于成人样本，未涵盖发育或疾病状态下的RPE变化；样本量相对有限 | 探索成人视网膜色素上皮细胞的亚群多样性及其对视网膜生物学和细胞治疗的意义 | 成人视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 年龄相关性黄斑变性 | CITE-seq（转录组和表面蛋白标记测序），免疫组织化学分析 | NA | 单细胞转录组数据，表面蛋白数据，图像数据 | 成人RPE细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，表面蛋白检测 | NA | NA |
| 768 | 2026-03-03 |
High-resolution spatial transcriptomics in fixed tissue using a cost-effective PCL-seq workflow
2025-Sep-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279906.124
PMID:40764053
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PCL-seq的高分辨率空间转录组学方法，适用于固定组织，具有成本效益 | 采用光控DNA标记策略和光裂解寡核苷酸，实现亚细胞分辨率，并兼容FFPE组织 | NA | 开发一种高分辨率、成本效益高的空间转录组学工作流程 | 小鼠胚胎的冷冻和FFPE组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎组织（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | PCL-seq工作流程 | 使用光裂解寡核苷酸和连接适配器，通过显微镜控制的光照指定感兴趣区域 |
| 769 | 2026-03-03 |
Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00994-3
PMID:40550901
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研究论文 | 本研究探讨了Pten缺失如何通过先天免疫和NF-κB通路调控前列腺基底细胞的可塑性、重编程和肿瘤起始 | 揭示了Pten缺失导致基底细胞以区域化方式重编程为hillock样状态，并进展为近端样管腔状态，最终形成侵袭性肿瘤，且这一过程与先天免疫激活相关 | NA | 研究前列腺基底细胞可塑性和肿瘤起始的分子机制 | 前列腺基底细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 原位表征 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据, 原位图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 770 | 2026-03-03 |
Single-Cell Sequencing-Based Exploration of the Role of Tip Cells on Astrocytes and Macrophages After Spinal Cord Injury
2025-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70088
PMID:40891625
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和体外实验，探讨了尖端细胞在脊髓损伤后对星形胶质细胞和巨噬细胞的作用 | 揭示了尖端细胞通过Angptl4-Sdc4配体-受体通路调控星形胶质细胞迁移和巨噬细胞极化，并首次报道其在脊髓损伤中的核糖体蛋白表达特征 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，体内验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探索脊髓损伤后尖端细胞对炎症微环境中星形胶质细胞和巨噬细胞的影响 | 尖端细胞、星形胶质细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-03-03 |
Population analysis and immunologic landscape of melanoma in people living with HIV
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.648995
PMID:40313919
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研究论文 | 本研究通过分析HIV感染者（PLWH）与HIV阴性者（PLw/oH）的黑色素瘤临床数据，结合空间免疫转录组学和多色免疫荧光技术，揭示了PLWH患者肿瘤微环境的免疫抑制特征及其与不良临床结局的关联 | 首次在HIV感染背景下，结合大规模临床队列分析与空间免疫转录组学技术，系统揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的免疫抑制特征及其与治疗延迟、脑转移风险增加和生存率降低的关联 | 样本量相对有限（空间转录组学n=11，多色免疫荧光n=29），且为回顾性研究，可能受混杂因素影响 | 剖析HIV感染者黑色素瘤的临床和免疫学特征，以解释其比HIV阴性患者更差的临床结局 | HIV感染者（PLWH）和HIV阴性者（PLw/oH）的黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间免疫转录组学，多色免疫荧光 | NA | 电子健康记录，空间转录组数据，免疫荧光图像 | 临床队列：1,019名PLWH和373,121名PLw/oH；空间转录组：11个肿瘤样本；多色免疫荧光：15名PLWH和14名PLw/oH的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 772 | 2026-03-03 |
Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas
2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.584091
PMID:38559270
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研究论文 | 本研究揭示了自噬在突变IDH1胶质瘤生存中的关键作用，并通过靶向Atg7抑制自噬，增强了肿瘤对放疗的敏感性 | 首次发现mIDH1胶质瘤通过表观遗传重编程激活自噬作为能量来源，并开发了靶向Atg7的合成蛋白纳米颗粒siRNA递送系统，在体内实现放疗增敏 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和患者样本分析，临床转化效果仍需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 突变IDH1胶质瘤细胞、患者肿瘤样本、基因工程小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, siRNA纳米递送 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、单细胞转录组数据 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤细胞及患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-03-03 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
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综述 | 本文更新并扩展了先前关于心脏病分子与细胞神经生物学基础的论文，重点关注心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 强调了利用患者特异性干细胞研究交感神经功能障碍的新方法，以及新型成像技术和空间转录组学在心脏自主神经失调治疗靶点发现中的应用 | 文中指出了未解决的问题和争议领域，但未具体说明研究方法或数据局限性 | 探讨心脏病的分子与细胞神经生物学机制，以发现治疗心脏自主神经失调的新靶点 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、新型成像技术、干细胞技术 | NA | 分子与细胞数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 774 | 2024-10-04 |
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0232LE
PMID:39356793
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 775 | 2026-03-03 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
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综述 | 本文综述了在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中，胶质细胞（特别是小胶质细胞）在神经免疫反应中的作用，以及转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学等技术在揭示胶质细胞亚群和功能中的应用 | 整合了多种组学方法（如单细胞RNA测序、空间转录组学和核糖体标记策略）来阐明胶质细胞在缺血性疾病中的动态响应，并强调了这些技术在识别新型细胞亚型和生成新假设方面的潜力 | NA | 阐明胶质细胞在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中的神经免疫反应，并探索多组学方法在进一步解析这些反应中的应用 | 胶质细胞，包括小胶质细胞和星形胶质细胞，在缺血性中风和脑小血管病中的响应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核糖体标记策略, 转录组分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 776 | 2026-03-03 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
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综述 | 本文为胶质细胞生物学家提供单细胞RNA-seq实验设计与分析的入门指南 | 针对胶质细胞研究领域，系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 作为入门指南，未涉及具体算法或工具的深入技术细节 | 提升胶质生物学家对单细胞组学数据的分析、解释与批判能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 单细胞组学 | 神经疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-03-03 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的中性粒细胞，揭示了其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的潜在作用及异质性 | 首次利用基于微孔的单细胞RNA测序技术，对鼻息肉组织中的中性粒细胞进行高分辨率分析，揭示了其基因表达谱的改变和亚群异质性 | 样本量较小（5例对照、5例鼻息肉组织），且仅分析了粒细胞富集样本，可能未完全捕获所有细胞类型 | 揭示中性粒细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用和异质性 | 鼻息肉组织、对照鼻窦组织及患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法、通路富集分析、基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织、5例鼻息肉组织及匹配外周血样本 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 微孔基单细胞RNA测序检测方法 | 新型基于微孔的单细胞RNA测序检测方法，使用粒细胞富集样本 |
| 778 | 2026-03-03 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了利用多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中小胶质细胞反应的文献，旨在阐明小胶质细胞在AD病理中的作用机制 | 整合了多种组学技术（如单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学等）来系统分析AD小鼠模型中小胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究，可能无法完全反映人类AD的复杂性；且为综述性文章，未提供原始实验数据 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病病理中的驱动和贡献机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2026-03-03 |
Techniques and analytic workflow for spatial transcriptomics and its application to allergy and inflammation
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.009
PMID:39837466
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在过敏和炎症研究中的应用，重点关注数据处理和分析方法 | 通过整合单细胞基因表达数据与细胞定位，在完整空间背景下提供前所未有的生物学见解，为数据解释增加新维度 | NA | 总结空间转录组学领域的最新进展及其在过敏和炎症研究中的应用 | 过敏和炎症疾病，如特应性皮炎和慢性阻塞性肺疾病 | 数字病理学 | 过敏和炎症疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 780 | 2026-03-03 |
Deciphering key roles of B cells in prognostication and tailored therapeutic strategies for lung adenocarcinoma: a multi-omics and machine learning approach towards predictive, preventive, and personalized treatment strategies
2025-Mar, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00390-4
PMID:39991096
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研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习方法，揭示了B细胞在肺腺癌预后中的关键作用，并开发了SRBS评分以支持预测性、预防性和个性化治疗策略 | 整合了多组学数据（包括bulk RNA、ATAC-seq、单细胞RNA和空间转录组测序）和机器学习算法，首次构建了与B细胞相关的SRBS评分，用于肺腺癌的预后预测和个性化治疗指导 | 未明确说明样本量大小，且实验验证部分可能有限，需要进一步临床验证 | 探索B细胞在肺腺癌预后中的作用，并开发个性化治疗策略以改善患者结局 | 肺腺癌患者及其相关的多组学数据 | 机器学习 | 肺癌 | 多组学整合分析，包括bulk RNA-seq、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 | 多种机器学习算法整合 | 多组学数据（RNA、ATAC、单细胞、空间转录组） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |