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当前共找到 39535 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-05-09 |
10 × Genomics Flex Gene Expression is a powerful tool for single-cell transcriptomics of xenografts models
2026-May-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04092-0
PMID:42098734
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研究论文 | 该研究展示了10× Genomics Flex基因表达方案能有效分析异种移植模型中的单细胞转录组，通过组合人源和鼠源探针实现物种特异的细胞图谱 | 首次证明在单次反应中同时使用人鼠两种探针集可对混合细胞异种移植样本进行单细胞转录组分析，无需流式分选即可获得干净的物种特异性数据 | NA | 验证10× Genomics Flex基因表达方案在异种移植模型单细胞转录组研究中的适用性 | 异种移植样本中的人源和鼠源混合细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Flex | 10× Genomics Flex基因表达方案，基于探针的固定或冷冻样本处理方法 |
| 762 | 2026-05-09 |
Cross-Species Plant Single-Cell Analysis: Community Challenges and Shared Solutions
2026-May-08, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag218
PMID:42099283
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综述 | 报告了2025年植物单细胞分析暑期研讨会的成果，包括社区面临的挑战和解决方案，并建立了PlantSCHub社区门户以支持可重复的植物单细胞分析 | 通过研讨会形式系统梳理植物单细胞分析的五大优先挑战领域，并提出跨物种整合、多模态轨迹与基因调控网络推断、空间锚定可视化以及AI科学家代理等概念路线图 | 未具体说明局限性 | 推动植物单细胞分析领域从孤立研究转变为互操作、不断发展的生态系统，加速发现和作物改良 | 植物单细胞分析社区的需求和解决方案 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 深度生成模型, AI基础模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 763 | 2026-05-09 |
EssentCell: Discovering Essential Evolutionary Relations in Noisy Single-Cell Data
2026-May-07, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3691222
PMID:42096398
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研究论文 | 提出EssentCell算法，通过整数线性规划识别噪声单细胞数据中所有最优进化关系中的本质关系 | 首次关注单细胞测序数据中多个最优完美系统发育树间的本质关系，而非仅重建单一树 | 未明确讨论算法在大规模数据集上的计算效率及对噪声水平的鲁棒性 | 在考虑假阳性率约束下，从噪声单细胞数据矩阵中寻找最小翻转问题的最优解中的本质进化关系 | 肿瘤细胞单细胞测序数据中的突变矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | 整数线性规划 | 二元突变矩阵 | 多个数据集（具体样本量未说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 764 | 2026-05-09 |
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-May-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aec8514
PMID:42096520
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研究论文 | 开发了名为TranscriptFormer的生成式基础模型，基于多达1.12亿个细胞、跨越12个物种（涵盖15.3亿年进化历程）进行训练，实现了跨物种细胞类型分类、零样本疾病状态识别以及系统发育关系的自然涌现 | 首次训练跨越15.3亿年进化历程的跨物种单细胞基础模型，零样本识别人类疾病状态，且在不依赖显式训练的情况下从表示中自然涌现发育轨迹与系统发育关系 | 未提及具体限制 | 建立跨物种单细胞转录组定量分析与比较细胞生物学的通用框架 | 12个物种的细胞（跨越15.3亿年进化历程） | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 生成式基础模型（Transformer架构的变体） | 基因表达数据 | 1.12亿个细胞，12个物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2026-05-09 |
SCOTCH: isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2026-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72665-5
PMID:42098110
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研究论文 | 提出了SCOTCH，一个端到端、平台无关的分析流程，用于从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征 | 通过非重叠子外显子组合建模、动态阈值分配、整合读段覆盖与现有注释优化子外显子边界以及迭代聚类重构新转录本，比现有拼接图方法更可靠地恢复真实新异构体，并具有poly(A)感知过滤减少假阳性 | NA | 开发一种从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征的平台无关流程 | 人类血液和脑类器官数据集中的细胞类型特异性转录组谱和新异构体 | 计算生物学 | NA | 长读长单细胞RNA测序（lr-scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 多平台人类血液和脑类器官数据集 | 牛津纳米孔科技（ONT）, 太平洋生物科学（PacBio）, 10x Genomics, Parse Biosciences, BGI | 单细胞RNA测序 | 纳米孔测序仪（MinION, PromethION）, PacBio测序仪（Sequel, Revio）, 10x Chromium, Parse Biosciences分区生物试剂盒 | NA |
| 766 | 2026-05-09 |
Refinement of renal T lymphocytes enrichment strategies: advancing the in-depth study of renal immune responses
2026-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51954-5
PMID:42098282
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研究论文 | 优化从小鼠和人类肾脏中分离和纯化T淋巴细胞的方案，以提高细胞产量和存活率，并应用于肾脏疾病研究 | 首次系统评估不同组织破碎、酶消化和Percoll梯度离心条件，优化出机械剪切结合0.2% IV型胶原酶和0.02% DNase I消化45分钟，再经33-80% Percoll梯度离心的高效方案 | 该方案主要基于小鼠和人类肾脏组织，对不同物种或病理条件下的适用性需进一步验证；单细胞测序分析仅使用公共数据库数据，未进行独立验证 | 建立优化的肾脏T淋巴细胞分离纯化方案，支持肾脏免疫反应的深入研究 | 小鼠和人类肾脏组织中的T淋巴细胞，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞和双阴性T细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 小鼠肾脏组织（缺血再灌注损伤、肾纤维化、顺铂诱导急性肾损伤模型）及正常人类肾脏组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA-seq数据作为补充参考 |
| 767 | 2026-05-09 |
NSUN6-Mediated m5C Modification of OAS2 Is Implicated in Neuronal PANoptosis during Perioperative Neurocognitive Disorders
2026-May-07, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05770-7
PMID:42098355
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研究论文 | 该研究通过多组学技术揭示NSUN6介导的OAS2 m5C修饰在围术期神经认知障碍神经元PANoptosis中的作用 | 首次发现PANoptosis在围术期神经认知障碍中的角色，并揭示NSUN6通过OAS2的m5C修饰调控神经元PANoptosis的新机制 | 未提及具体局限性 | 探究PANoptosis在围术期神经认知障碍中的作用及潜在机制 | 围术期神经认知障碍小鼠模型及神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序, meRIP-seq, RNA-seq, 免疫荧光, TUNEL染色 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 768 | 2026-05-09 |
Early transcriptional divergence underlies cell fate bias in bovine embryos
2026-May-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10198-9
PMID:42098360
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究牛胚胎从2细胞到8细胞阶段的转录不对称性 | 发现牛胚胎早期卵裂中姐妹卵裂球在压实前就出现渐进性转录差异，且与卵裂球大小相关 | 未提及具体限制 | 探究早期胚胎细胞谱系偏差的分子基础 | 牛胚胎的2细胞至8细胞阶段卵裂球 | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牛胚胎从2细胞到8细胞阶段的多个胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2026-05-09 |
A three-dimensional spatial transcriptome atlas reconstructs early organogenesis in primate Carnegie stages 9 and 10 embryos
2026-May-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-026-01956-2
PMID:42098384
|
研究论文 | 构建了食蟹猴胚胎在卡内基阶段9和10的三维空间转录组图谱，揭示了早期器官发生的关键形态发生事件 | 首次提供高分辨率三维空间转录组图谱，解析早期灵长类胚胎发育中跨胚层的空间谱系域和区域特异性基因表达调控景观 | 受限于样本数量和时间点覆盖，可能未完全捕捉早期器官发生的动态变化 | 阐明灵长类早期器官发生的空间转录组程序 | 食蟹猴胚胎（卡内基阶段9和10） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 多个食蟹猴胚胎（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 高分辨率空间转录组学用于三维重建 |
| 770 | 2026-05-09 |
Integrated multi-omics and single-cell analyses identify metabolic heterogeneity and therapeutic vulnerabilities in medullary thyroid cancer
2026-May-07, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03467-1
PMID:42098434
|
研究论文 | 通过整合多组学和单细胞分析，揭示甲状腺髓样癌的代谢异质性与治疗脆弱性 | 首次提出基于代谢的甲状腺髓样癌亚型分类系统，并发现CHSY1通过糖胺聚糖合成促进上皮间质转化的机制 | 样本量相对有限，代谢亚型的临床验证需要更多独立队列支持 | 解析甲状腺髓样癌的代谢异质性并探索精准管理策略 | 甲状腺髓样癌患者的RNA测序样本（101例）和代谢组学样本（51例） | 机器学习 | 甲状腺髓样癌 | RNA-seq, 非靶向代谢组学, 单细胞RNA-seq, 深度学习 | 聚类分析, 深度学习的预后模型 | 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞RNA测序数据 | RNA-seq 101例, 代谢组学 51例, 免疫组化 47例, 多重免疫荧光 12例, 单细胞RNA-seq 7例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-05-09 |
Integrated analyses reveal a potential role for PFKFB4 in M2 macrophage polarization and hepatocellular carcinoma progression
2026-May-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04326-y
PMID:42098724
|
研究论文 | 综合分析揭示PFKFB4在M2巨噬细胞极化和肝细胞癌进展中的潜在作用 | 首次通过单细胞转录组学、生物信息学、体外功能实验和体内验证的综合分析，阐明PFKFB4在肝细胞癌中通过激活MEK/ERK信号通路促进肿瘤进展，并通过肿瘤细胞介导的M2巨噬细胞极化影响免疫调节，揭示了其在代谢和免疫调控中的双重作用 | 未在更大样本队列或不同肝癌亚型中验证PFKFB4的表达和功能，且其调控MEK/ERK及M2极化的详细分子机制需进一步探索 | 探索PFKFB4在肝细胞癌进展中的作用及其对巨噬细胞极化的影响 | 肝细胞癌细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学, 生物信息学, 体外功能实验, 体内验证 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2026-05-09 |
Super-enhancer-driven LncRNA MIR205HG promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via glycolysis reprogramming
2026-May-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08202-1
PMID:42098726
|
研究论文 | 鉴定并表征了超级增强子驱动的长链非编码RNA MIR205HG通过糖酵解重编程促进食管鳞状细胞癌进展的机制 | 首次发现并阐明了超级增强子驱动的lncRNA MIR205HG通过与PTBP3相互作用作为分子支架促进HIF-1α翻译，进而上调HK2和LDHA表达增强糖酵解，从而驱动食管鳞癌进展的分子机制 | 未明确说明研究局限性 | 探索超级增强子相关长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌中的分子机制及功能 | 食管鳞状细胞癌组织和细胞系 | 分子生物学 | 食管癌 | ChIP-Seq, HiChIP-Seq, ChIP-qPCR, 双荧光素酶报告基因检测, CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据, 蛋白表达数据, 临床生存数据 | 未明确说明样本数量 | Illumina | ChIP-seq, HiChIP-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于ChIP-seq和HiChIP-seq测序的平台 |
| 773 | 2026-05-09 |
Single-cell profiling uncovers a hypoxia-vascular-immune axis underlying poor immunotherapy response in acral versus cutaneous melanoma
2026-May-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08201-2
PMID:42098765
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤在肿瘤微环境上的差异，特别是围绕缺氧-血管-免疫轴解释肢端黑色素瘤免疫治疗反应差的机制 | 首次系统性地解析了肢端黑色素瘤中血管间质成分（特别是周细胞）对免疫治疗抵抗的贡献，并发现了新的免疫抑制轴（NECTIN2-TIGIT）关联缺氧环境 | 主要依赖转录组数据分析，缺乏大规模功能验证实验和临床前瞻性验证 | 研究肢端黑色素瘤与皮肤黑色素瘤在肿瘤微环境（尤其血管-间质成分）上的差异，解释肢端黑色素瘤免疫治疗反应差的机制 | 肢端黑色素瘤、皮肤黑色素瘤和正常皮肤组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、qPCR、Western blot | NA | 单细胞转录组、空间转录组、批量RNA测序 | 31例肢端黑色素瘤、13例皮肤黑色素瘤和35例正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 774 | 2026-05-09 |
A pyroptosis-related molecular signature stratifies prognosis and highlights GSDMB-mediated malignancy in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-May-07, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00824-1
PMID:42098854
|
研究论文 | 基于细胞焦亡相关基因构建肝内胆管癌预后分子分型，揭示GSDMB通过TGF-β信号轴促进肿瘤恶性进展的机制 | 首次整合多组学数据（转录组、单细胞转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组、空间转录组和基因组突变）系统阐明细胞焦亡在肝内胆管癌中的临床和生物学意义，并发现TGF-β-GSDMB-CDH3信号轴驱动肿瘤侵袭性 | 研究主要基于队列数据分析和体外实验，未进行体内动物模型验证，且GSDMB下游的具体分子机制仍需进一步探索 | 阐明细胞焦亡在肝内胆管癌中的预后分层价值和分子调控机制 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织及细胞样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 空间转录组学, 基因组突变分析 | 回归分析模型（LASSO-Cox） | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、基因组数据 | 165236个单细胞来自肝内胆管癌组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2026-05-09 |
Single-cell and machine learning-integrated bulk RNA-seq analysis reveals TKT as an oxidative stress-associated diagnostic biomarker in acute myocardial infarction
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00978-z
PMID:42098867
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研究论文 | 通过单细胞和机器学习的批量RNA测序整合分析，揭示TKT作为急性心肌梗死中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统分析急性心肌梗死中氧化应激相关基因的动态表达谱，并利用六种机器学习算法共识筛选出TKT作为稳健的诊断标志物 | 未在独立大规模队列或不同人群中进行外部验证；TKT的功能机制尚未在体内动物模型中验证 | 识别急性心肌梗死中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 急性心肌梗死患者的心肌组织和外周免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、西方 blot、伪时间轨迹推断、细胞间通信网络构建 | LASSO、随机森林、Boruta、贝叶斯模型、LVQ、Treebag | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 多个队列的批量RNA测序数据集和单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2026-05-09 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 整合单细胞多组学和机器学习揭示透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性格局，并基于高triaptosis上皮亚群构建稳健的四基因预后标志，实现对预后分层、免疫治疗指导和化疗反应预测的强效模型 | NA | 阐明triaptosis在透明细胞肾细胞癌中的异质性及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌组织的单细胞转录组、空间转录组和批量转录组数据 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 | 机器学习模型、预后标志 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium空间转录组学 |
| 777 | 2026-05-09 |
A bone-derived hormone permits rapid visual escape via GPR37 receptor in a subpopulation of VTA GABAergic neurons
2026-May-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.048
PMID:41679312
|
研究论文 | 揭示了骨源性激素骨钙素通过GPR37受体增强VTA GABA能神经元亚群兴奋性，从而促进快速视觉逃逸的分子机制 | 首次发现骨源性激素骨钙素通过GPR37-cAMP-THIK-1通路调控中脑腹侧被盖区GABA能神经元亚群的兴奋性，建立骨-脑代谢轴与快速逃逸行为之间的新联系 | 未明确解释骨钙素信号如何特异性调控共释放神经元亚群，且实验仅在小鼠模型中进行 | 阐明骨源性激素骨钙素调节快速视觉逃逸行为的神经机制 | 小鼠中脑腹侧被盖区GABA能神经元亚群 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、电生理学 | NA | 转录组数据、电生理数据 | 小鼠模型（具体数量未详） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 778 | 2026-05-09 |
Hepatocyte-targeted Bap1 reduction in the liver primes an inflammatory transcriptional response
2026-May-06, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag047
PMID:41712409
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研究论文 | 利用AAV8介导的CRISPR/CAS9基因组编辑技术，构建小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型，结合空间转录组学和免疫组化分析Bap1缺失对肝脏免疫应答的影响 | 首次在体内系统中通过肝细胞特异性Bap1敲除模型，结合单细胞分辨率空间转录组学与免疫组化定量分析，揭示了Bap1缺失如何改变肝脏损伤后的免疫细胞募集和炎症环境 | 仅在小鼠模型中验证，未在人类样本中确认；未探讨Bap1缺失在不同损伤类型下的具体机制 | 研究Bap1在肝脏正常功能中的调节作用，及其缺失后对肝脏免疫应答和损伤反应的影响 | 小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型 | 数字病理学 | 肝癌 | AAV8介导的CRISPR/CAS9基因组编辑, 空间转录组学, 免疫组化, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型（具体样本量未提及） | 10x Genomics, NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Visium, NA | 单细胞分辨率空间转录组学 |
| 779 | 2026-05-09 |
Periodontitis induces skeletal muscle atrophy by increasing circulating levels of activin A
2026-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72766-1
PMID:42091891
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研究论文 | 本研究揭示牙周炎通过增加循环中activin A的水平导致骨骼肌萎缩 | 首次发现牙周炎通过gingiva中activin A的高表达进入循环系统，从而诱导骨骼肌萎缩，并提出了通过局部注射siInhba来预防这种萎缩的新策略 | 未提及明显的局限性 | 探究牙周炎对骨骼肌的影响及其中介机制 | 雄性小鼠及人类牙周炎患者 | 机器学习 | 牙周炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类牙周炎组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2026-05-09 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling of POU5F1 in Lung Adenocarcinoma: Dynamics, spatial niche, and prognosis via multi-algorithm ML
2026-May-06, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102800
PMID:42097097
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学以及多算法机器学习，系统研究POU5F1在肺腺癌中的动态变化、空间微环境及预后价值 | 首次综合运用因果推断、单细胞和空间转录组学、RNA速度分析及多算法机器学习，全面解析POU5F1在肺腺癌中的功能机制，并构建基于POU5F1相关差异表达基因的高性能预后模型 | 文中未明确说明局限性 | 阐明POU5F1在肺腺癌中的系统性功能和机制，并评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌细胞及组织样本 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA速度分析, 孟德尔随机化, 机器学习 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达 |