单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 7741 - 7760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7741 | 2024-10-02 |
ASIC1/RIP1 accelerates atherosclerosis via disrupting lipophagy
2024-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.11.004
PMID:37931656
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研究论文 | 研究探讨了ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其通过干扰脂噬机制的潜在机制 | 揭示了ASIC1与RIP1相互作用抑制脂噬，从而促进动脉粥样硬化的关键作用 | NA | 研究ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其与RIP1的相互作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 人类动脉粥样硬化病变区域和ApoE-/-小鼠模型 |
| 7742 | 2024-10-02 |
The Role of Activator Protein-1 Complex in Diabetes-Associated Atherosclerosis: Insights From Single-Cell RNA Sequencing
2024-Sep-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0167
PMID:38905153
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研究论文 | 研究了激活蛋白-1复合物在糖尿病相关动脉粥样硬化中的作用，通过单细胞RNA测序揭示了其在动脉粥样硬化病理中的新靶点 | 首次通过单细胞RNA测序识别出激活蛋白-1复合物作为糖尿病相关动脉粥样硬化的新靶点，并验证了其抑制剂T-5224在糖尿病Apoe-/-小鼠模型中的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床试验中验证 | 探索糖尿病相关动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 |
| 7743 | 2024-10-02 |
Pan-cancer integrative analyses dissect the remodeling of endothelial cells in human cancers
2024-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae231
PMID:39345334
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研究论文 | 本文通过整合575名癌症患者的单细胞RNA测序数据，分析了19种实体肿瘤类型中肿瘤内皮细胞（TECs）的表型多样性 | 揭示了TECs在泛癌视角下的组成和功能异质性，并发现了两种主要亚型：tip细胞和veins细胞，它们在空间组织模式和功能上表现出显著差异 | NA | 深入理解肿瘤内皮细胞的异质性及其在抗血管生成疗法和免疫疗法中的作用 | 肿瘤内皮细胞（TECs）及其在不同癌症类型中的表型多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 575名癌症患者 |
| 7744 | 2024-10-02 |
StableMate: a statistical method to select stable predictors in omics data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae130
PMID:39345755
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研究论文 | 本文介绍了一种名为StableMate的统计方法，用于在组学数据中选择稳定的预测因子 | StableMate通过跨异质数据集的变量选择过程，解决了组学数据复杂性和变异性导致的关联缺乏可重复性和可解释性的问题 | NA | 开发一种能够在不同环境中选择稳定预测因子的统计方法，以提高生物学关联的可重复性和可解释性 | 乳腺癌RNA测序数据、结肠癌宏基因组数据和胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 回归分析 | 回归框架 | 组学数据 | NA |
| 7745 | 2024-10-02 |
Arrestin beta-2 deficiency exacerbates periodontal inflammation by mediating activating transcription factor 6 activation and abnormal remodelling of the extracellular matrix
2024-06, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13952
PMID:38267365
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研究论文 | 研究了arrestin beta-2 (ARRB2)在牙周炎进展中的具体作用及其机制 | 揭示了ARRB2通过抑制ATF6信号通路介导的细胞外基质重塑对牙周组织的保护作用 | NA | 探讨ARRB2在牙周炎进展中的作用及其机制 | 牙周炎患者和健康对照者的牙周组织 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、实时定量聚合酶链反应、Western blotting、免疫组织化学染色 | NA | RNA | NA |
| 7746 | 2024-10-02 |
Macrophages Promote Atherosclerosis Development by Inhibiting CD8T Cell Apoptosis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2024/1929766
PMID:39345351
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞通过抑制CD8T细胞凋亡促进动脉粥样硬化发展的机制 | 首次揭示了巨噬细胞通过C1q-C1qbp轴抑制CD8T细胞凋亡，从而促进动脉粥样硬化发展的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步在人体中验证 | 探讨巨噬细胞与CD8T细胞相互作用在动脉粥样硬化发展中的作用 | 巨噬细胞和CD8T细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, ChIP-qPCR, 蛋白质印迹, 抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠模型 |
| 7747 | 2024-10-02 |
HPV-driven heterogeneity in cervical cancer: study on the role of epithelial cells and myofibroblasts in the tumor progression based on single-cell RNA sequencing analysis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18158
PMID:39346086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了人乳头瘤病毒（HPV）感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响，特别是上皮细胞和肌成纤维细胞在肿瘤进展中的作用 | 首次系统分析了HPV阳性及阴性宫颈癌样本中单细胞RNA测序数据，揭示了HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响及其分子机制 | 研究样本仅来自Gene Expression Omnibus数据库，可能存在数据偏差；未涉及临床验证 | 探索HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响，为优化宫颈癌的预防筛查和个性化治疗提供新的分子基础 | HPV阳性及阴性宫颈癌样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12,431个细胞 |
| 7748 | 2024-10-02 |
DSP-0509, a TLR7 agonist, exerted synergistic anti-tumor immunity combined with various immune therapies through modulating diverse immune cells in cancer microenvironment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1410373
PMID:39346737
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研究论文 | 研究了TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用 | 首次合成了可系统注射的TLR7激动剂DSP-0509，并研究了其与IDO1抑制剂、抗PD-1抗体和AXL抑制剂联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效 | 探讨TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用，以增强抗肿瘤免疫效果 | TLR7激动剂DSP-0509、IDO1抑制剂、抗PD-1抗体、AXL抑制剂以及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤模型 |
| 7749 | 2024-10-02 |
Transcriptional bursting dynamics in gene expression
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1451461
PMID:39346775
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综述 | 本文综述了基因表达中的转录爆发动力学机制，并比较了不同基因表达模型的优缺点 | 提供了关于转录爆发的关键指标的详细总结，并探讨了跨物种的转录爆发时间动态及其分子机制 | 缺乏一个全面的定量模型来研究转录爆发 | 指导研究人员选择最适合其研究背景的基因表达模型，并深入理解细胞过程、细胞命运决定和癌症诊断 | 基因表达模型、转录爆发动力学、细胞表型多样性 | NA | NA | 单细胞测序、多组学整合 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7750 | 2024-10-02 |
Unraveling the role of ADAMs in clinical heterogeneity and the immune microenvironment of hepatocellular carcinoma: insights from single-cell, spatial transcriptomics, and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1461424
PMID:39346916
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研究论文 | 本研究探讨了ADAM基因家族在肝细胞癌临床异质性和免疫微环境中的作用，通过单细胞、空间转录组学和批量RNA测序技术揭示了ADAM家族基因的分子特征及其对HCC发展和预后的影响 | 首次报道了ADAM家族信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的有害影响和预后意义 | NA | 探讨ADAM基因家族在肝细胞癌中的作用及其对临床预后的影响 | 肝细胞癌中的ADAM基因家族及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA |
| 7751 | 2024-10-02 |
A telencephalon cell type atlas for goldfish reveals diversity in the evolution of spatial structure and cell types
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7693
PMID:37910612
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统比较了金鱼端脑的细胞类型，揭示了其分子神经解剖学的分区 | 首次构建了金鱼端脑的细胞类型图谱，发现了神经元基因表达的多样性和模块化特征，并提出了金鱼端脑中存在海马结构的可能性 | NA | 研究金鱼端脑的细胞类型多样性及其在进化中的空间结构变化 | 金鱼端脑的细胞类型及其分子特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 金鱼端脑的多个细胞样本 |
| 7752 | 2024-10-02 |
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302558
PMID:37632718
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 | 空间转录组学技术（SRT）能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系，弥补了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在空间信息上的不足 | NA | 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用，开发更有效的临床治疗策略 | 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 7753 | 2024-10-02 |
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303291
PMID:37553778
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研究论文 | 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs，并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 | NA | 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7754 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
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研究论文 | 开发了一种深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数，并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型，用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 |
| 7755 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
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综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差，适用于更丰富的样本，为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7756 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段，未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 |
| 7757 | 2024-10-02 |
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205097
PMID:36596693
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研究论文 | 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 | 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒，通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 | NA | 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制，并开发新的治疗方法 | 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单核细胞 |
| 7758 | 2024-10-02 |
Macrophage HIF-1α Is an Independent Prognostic Indicator in Kidney Cancer
2020-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3890
PMID:32586940
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞中的HIF-1α在肾癌中的独立预后作用 | 首次全面评估了HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性，并发现巨噬细胞中的HIF-1α与肿瘤进展和抗血管生成治疗的耐药性相关 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的临床相关性 | 评估HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织 | NA | 肾癌 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq），RNA原位杂交（RNA-ISH），免疫组化（IHC） | NA | 组织 | 380名患者的肿瘤组织，72名患者的验证样本，57名接受抗血管生成治疗的患者 |
| 7759 | 2024-10-01 |
Exposure to BaA inhibits trophoblast cell invasion and induces miscarriage by regulating the DEC1/ARHGAP5 axis and promoting ubiquitination-mediated degradation of MMP2
2024-Nov-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135594
PMID:39191013
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研究论文 | 研究探讨了苯并[a]蒽暴露通过调节DEC1/ARHGAP5轴和促进MMP2的泛素化降解，抑制滋养层细胞侵袭并导致流产的机制 | 首次揭示了苯并[a]蒽通过调节DEC1/ARHGAP5轴和MID1/MMP2途径导致流产的具体分子机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨苯并[a]蒽暴露导致复发性流产的分子机制 | 滋养层细胞和流产模型小鼠 | NA | 生殖系统疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 包括来自复发性流产女性的绒毛组织和苯并[a]蒽暴露的滋养层细胞 |
| 7760 | 2024-10-01 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-Oct, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，比较了在自身免疫介导的神经炎症模型中，反应性室管膜细胞和星形胶质细胞的转录组特征 | 揭示了在多种神经炎症背景下，室管膜细胞和星形胶质细胞反应性状态的保守基因特征 | 尚未探索驱动室管膜细胞反应性的机制及其下游功能后果 | 研究室管膜细胞在神经炎症中的反应性状态及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞在神经炎症中的反应性转录组特征 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |