单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 7721 - 7740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7721 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomic atlas of distinct early immune responses induced by SARS-CoV-2 Proto or its variants in rhesus monkey
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.432
PMID:38020713
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2原型及其变种在恒河猴模型中诱导的早期免疫反应的单细胞转录组图谱 | 首次在非人灵长类动物模型中系统分析了SARS-CoV-2原型及其变种诱导的早期免疫反应的动态变化 | 研究仅限于恒河猴模型，结果可能不完全适用于人类 | 揭示SARS-CoV-2及其变种在感染早期诱导的免疫反应动态变化 | SARS-CoV-2原型及其Alpha、Beta和Delta变种在恒河猴中的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 恒河猴模型中的外周血单核细胞 |
| 7722 | 2024-10-14 |
Exploration of the molecular mechanism of intercellular communication in paediatric neuroblastoma by single-cell sequencing
2023-11-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-47796-0
PMID:37990103
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序构建了一个与神经母细胞瘤患者预后相关的细胞间通讯相关基因模型，以实现精准管理 | 开发了一个基于21个基因的预测模型，用于神经母细胞瘤的预后评估 | 需要进一步的外部验证和临床试验来确认模型的有效性和适用性 | 构建和验证一个基于细胞间通讯相关基因的预后模型，以预测神经母细胞瘤患者的预后 | 神经母细胞瘤患者的单细胞数据和转录组数据 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞测序 | Lasso回归 | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库的神经母细胞瘤患者单细胞数据 |
| 7723 | 2024-10-14 |
Functional genomics in Spiralia
2023-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad036
PMID:37981859
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综述 | 本文综述了螺旋动物基因表达调控的五个方面，旨在揭示动物基因组功能中的祖先和衍生特征 | 本文填补了螺旋动物基因组功能研究的知识空白，特别是染色质可及性、DNA甲基化、组蛋白翻译后修饰和基因组结构方面的研究 | 目前对螺旋动物基因表达调控的研究仍处于初级阶段，尤其是染色质可及性、DNA甲基化和组蛋白翻译后修饰等方面的研究 | 揭示动物基因组功能中的祖先和衍生特征，并探讨其对社会的潜在影响 | 螺旋动物的基因表达调控机制 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 7724 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomics refuels the exploration of spiralian biology
2023-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad038
PMID:37609674
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在螺旋动物生物学研究中的应用 | 介绍了单细胞转录组学这一新兴技术在螺旋动物分类和基因表达特征分析中的创新应用 | 讨论了将该技术应用于海洋生物的方法学挑战和需求 | 探讨单细胞转录组学在螺旋动物生物学和进化研究中的潜力 | 螺旋动物的细胞类型分类和基因表达特征 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个螺旋动物分类群的样本 |
| 7725 | 2024-10-14 |
Single-cell RNAseq analysis of spinal locomotor circuitry in larval zebrafish
2023-Nov-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89338
PMID:37975797
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼幼体脊髓运动回路的分子基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了运动神经元类型在游泳行为中的功能差异的分子基础 | NA | 识别控制特定行为的专业化回路中的神经元类型 | 斑马鱼幼体的脊髓运动回路 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7726 | 2024-10-14 |
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532873
PMID:36993334
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研究论文 | 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序技术，在鼠脑中进行逆行标记和跨突触标记，以解析神经解剖结构 | 本文首次将条形码狂犬病毒与单细胞RNA测序和原位测序结合，用于鼠脑中的逆行标记和跨突触标记，提供了大规模映射神经元类型突触连接的潜在途径 | 本文仅在鼠脑中进行了实验，尚未在其他物种或更大规模上验证其方法的有效性 | 本文旨在通过结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序技术，解析神经解剖结构，以理解神经回路的结构和功能 | 本文的研究对象是鼠脑中的神经元类型及其连接 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和原位测序 | NA | RNA | 96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞使用单细胞RNA测序，4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞使用原位测序 |
| 7727 | 2024-10-14 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.13.557622
PMID:37745354
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研究论文 | 研究探讨了COVID-19后慢性组织后遗症的机制，特别是免疫细胞与上皮祖细胞之间的异常相互作用 | 首次揭示了肺驻留CD8 T细胞与巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探究COVID-19后慢性组织后遗症的细胞和分子机制 | COVID-19后遗症患者和相关小鼠模型 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 空间转录组学和成像技术 | NA | 转录组数据和图像 | 三个独立临床队列的PASC患者和相关小鼠模型 |
| 7728 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomics provide insight into metastasis-related subsets of breast cancer
2023-10-19, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01728-y
PMID:37858183
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，深入探讨了乳腺癌转移相关的特殊或罕见细胞亚群 | 结合空间转录组分析，实时可视化肿瘤微环境中恶性与非恶性细胞的异质性，并系统总结了这些细胞亚群的功能、分子特征及相应的治疗策略 | NA | 深入研究乳腺癌转移相关的特殊或罕见细胞亚群，为乳腺癌转移的机制研究提供依据，并为个性化精准治疗提供新线索 | 乳腺癌转移相关的特殊或罕见细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7729 | 2024-10-14 |
Dual spatially resolved transcriptomics for human host-pathogen colocalization studies in FFPE tissue sections
2023-10-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03080-y
PMID:37858234
|
研究论文 | 本文介绍了一种空间转录组学方法，用于在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织切片中同时捕获宿主和病原体转录组的空间基因表达信息 | 本文提出了一种新的空间转录组学方法，能够在FFPE样本中同时无偏检测宿主和病原体的转录组 | NA | 研究宿主与病原体相互作用的空间转录组学方法 | COVID-19患者的肺样本 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者的肺样本 |
| 7730 | 2024-10-14 |
Predicting gene regulatory links from single-cell RNA-seq data using graph neural networks
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad414
PMID:37985457
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络的框架GNNLink，用于从单细胞RNA测序数据中预测基因调控关系 | 本文的创新点在于将基因调控网络推断问题转化为图链接预测任务，并利用图卷积网络捕捉基因间的相互依赖关系 | 本文未详细讨论GNNLink在处理大规模数据集时的计算效率问题 | 本文的研究目的是从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 基因表达数据 | 本文使用了七个单细胞RNA测序数据集进行实验 |
| 7731 | 2024-10-14 |
A parathyroid hormone/salt-inducible kinase signaling axis controls renal vitamin D activation and organismal calcium homeostasis
2023-05-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163627
PMID:36862513
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研究论文 | 本文研究了甲状旁腺激素（PTH）和盐诱导激酶（SIK）信号轴在肾脏维生素D激活和机体钙稳态中的作用 | 首次揭示了SIK在PTH信号下游调控肾脏1,25-维生素D生成的机制 | NA | 探讨PTH依赖的维生素D激活的信号机制 | 甲状旁腺激素（PTH）、盐诱导激酶（SIK）、维生素D基因模块 | NA | 慢性肾脏病-矿物质骨病（CKD-MBD） | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括小鼠、人胚胎干细胞衍生的肾脏类器官和慢性肾脏病-矿物质骨病（CKD-MBD）模型 |
| 7732 | 2024-10-14 |
Unveiling the novel immune and molecular signatures of ovarian cancer: insights and innovations from single-cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288027
PMID:38022625
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在卵巢癌中的应用，揭示了其免疫和分子特征 | 单细胞测序技术能够提供比传统批量测序更详细的基因、转录组、蛋白质、表观基因组和代谢信息 | NA | 探讨单细胞测序技术在卵巢癌中的应用及其对诊断、治疗和预后指标开发的指导作用 | 卵巢癌的免疫和分子机制 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 基因、转录组、蛋白质、表观基因组和代谢数据 | NA |
| 7733 | 2024-10-14 |
Single cell functional genomics reveals plasticity of subcutaneous white adipose tissue (WAT) during early postnatal development
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101307
PMID:34298199
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠皮下白色脂肪组织（iWAT）在出生后早期发育阶段的细胞复杂性和可塑性 | 首次通过单细胞转录组学（scRNA-seq）和表观基因组学（snATAC-seq）技术，详细描述了小鼠皮下白色脂肪组织在出生后早期发育阶段的细胞亚型及其动态变化 | NA | 研究小鼠皮下白色脂肪组织在出生后早期发育阶段的细胞复杂性和可塑性 | 小鼠皮下白色脂肪组织（iWAT）的脂肪基质细胞（ASC）和脂肪细胞核 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq）和表观基因组学（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 小鼠皮下白色脂肪组织在出生后第6天、第18天和第56天的样本 |
| 7734 | 2024-10-14 |
A single-cell and single-nucleus RNA-Seq toolbox for fresh and frozen human tumors
2020-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0844-1
PMID:32405060
|
研究论文 | 本文开发了一个用于新鲜和冷冻人类肿瘤的单细胞和单核RNA测序工具箱 | 本文首次系统地开发了一个工具箱，用于同时处理新鲜和冷冻临床肿瘤样本的单细胞和单核RNA测序 | 本文主要集中在工具箱的开发和初步验证，未涉及其在实际临床应用中的长期效果 | 开发和验证一个用于新鲜和冷冻人类肿瘤的单细胞和单核RNA测序的系统工具箱 | 新鲜和冷冻的人类肿瘤样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单核RNA测序（snRNA-Seq） | NA | RNA | 216,490个细胞和核，来自40个样本，涵盖23个标本，涉及8种肿瘤类型 |
| 7735 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing revealed the microglia-activated cell distribution in gray matter heterotopia
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101235
PMID:39391749
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7736 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment associated with gastric cancer
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101218
PMID:39391750
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7737 | 2024-10-13 |
Landscape of epithelial cell subpopulations in the human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38091
PMID:39391485
|
研究论文 | 研究揭示了人食管鳞状细胞癌微环境中上皮细胞亚群的景观及其在食管鳞状细胞癌发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率下获得了食管鳞状细胞癌的上皮细胞图谱，并揭示了上皮细胞在癌症进展中的作用及其对NK/T细胞的免疫抑制信号 | NA | 探索上皮细胞亚群在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞亚群及其在癌症发展中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及食管鳞状细胞癌及其邻近组织的11个主要细胞亚群和4个上皮细胞亚群 |
| 7738 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
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研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞，来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 |
| 7739 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较，揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种，且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异，以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 |
| 7740 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群，并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞（GCB）识别为B细胞特异性预后生物标志物，填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 |