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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7721 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics and Mendelian randomization analysis reveal SPP1+ tumor-associated macrophage-driven prognostic signature for hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1594610
PMID:40376263
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和孟德尔随机化分析,开发了基于SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的肝细胞癌预后预测模型 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合,识别SPP1+肿瘤相关巨噬细胞相关基因并构建预后预测模型 | 研究结果需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 开发肝细胞癌患者的生存预后预测模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, LASSO回归 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7722 | 2025-10-06 |
Tumor-microenvironment and molecular biology of classic Hodgkin lymphoma in children, adolescents, and young adults
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1515250
PMID:40376590
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综述 | 总结儿童、青少年和年轻成人经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤微环境特征及分子生物学研究进展 | 揭示了不同年龄段cHL患者肿瘤微环境组成和功能的年龄相关差异,并开发了年龄特异性预后指标 | NA | 解析cHL肿瘤微环境的作用机制及年龄相关差异,推动生物标志物驱动的靶向治疗发展 | 儿童、青少年和年轻成人经典霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤生物学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞测序,多重空间成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7723 | 2025-10-06 |
Identifying Fibrogenic Cells Following Salivary Gland Obstructive Injury
2023-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.09.531751
PMID:36945483
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1谱系追踪技术系统分析唾液腺纤维化过程中的细胞动态变化 | 研究仅使用小鼠模型,Gli1信号通路在纤维化中的作用相对有限 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 胚胎期16天和成年小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7724 | 2025-10-06 |
Identifying fibrogenic cells following salivary gland obstructive injury
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1190386
PMID:37287453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1-CreER谱系追踪技术,系统分析唾液腺损伤后纤维化反应中的基质细胞异质性和Gli1信号的作用 | Gli1信号和Gli1细胞对机械损伤诱导的唾液腺纤维化改变贡献较小,且仅少数基质细胞亚群表达典型纤维化标志物 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺和胚胎期E16小鼠 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | Gli1-CreER; ROSA26tdTomato谱系追踪小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 雌性小鼠颌下唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7725 | 2025-10-06 |
Comprehensive characterization of the molecular feature of T cells in laryngeal cancer: evidence from integrated single-cell and bulk RNA sequencing data using multiple machine learning approaches
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2477287
PMID:40179028
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,结合多种机器学习方法,全面表征喉癌中T细胞的分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统研究喉癌中T细胞相关分子特征,并开发了基于10种机器学习方法的TCRG分类器 | 样本量有限(仅3例喉癌组织),需要更大规模验证 | 阐明喉癌中T细胞相关分子的临床相关性并开发预后预测模型 | 喉癌组织和匹配的癌旁正常组织 | 生物信息学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习 | 多种机器学习方法(10种) | RNA测序数据 | 3例喉癌组织及匹配癌旁组织,TCGA和GEO数据库数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
7726 | 2025-05-17 |
miR142 silencing alleviates retinal inflammation by impairing mitochondrial function and reprogramming metabolism of CD4+ T cells via targeting MTFR1
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114727
PMID:40334625
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研究论文 | 研究miR-142在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其通过靶向MTFR1调控CD4+ T细胞线粒体功能和代谢重编程的机制 | 揭示了miR-142通过靶向MTFR1调控T细胞线粒体功能和代谢重编程的新机制,为自身免疫性葡萄膜炎的治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明miR-142在葡萄膜炎发病中的作用及其分子机制 | 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | 分子免疫学 | 葡萄膜炎 | 流式细胞术、单细胞测序、Seahorse能量代谢分析、线粒体染色、电子显微镜分析、荧光素酶报告基因检测、Western blot | miR-142基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 葡萄膜炎患者外周血单核细胞和EAU小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
7727 | 2025-05-17 |
Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808
PMID:40339488
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研究论文 | 本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制,发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖 | 首次揭示CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞过度增殖的机制 | 研究主要基于体外细胞和小鼠模型,临床样本验证有限 | 探究CTSC在银屑病中的作用及分子机制 | 银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | scRNA-seq、siRNA敲降 | IMQ诱导的小鼠银屑病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞 | NA | NA | NA | NA |
7728 | 2025-05-17 |
TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799
PMID:40339499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的异质性和分化谱,并探讨了TGF-β1通过自噬信号调控TAMs表型转换的机制 | 首次在原发性肝癌中鉴定出四种不同的TAMs亚群,并发现TGF-β1通过自噬信号驱动TAMs表型转换的新机制 | 样本量相对较小(19例患者),且需要进一步验证TGF-β1调控TAMs分化的具体分子机制 | 探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制 | 原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Ingenuity通路分析(IPA) | NA | 单细胞转录组数据 | 19例原发性肝癌患者的单细胞数据,TCGA数据库中428例患者的生存数据 | NA | NA | NA | NA |
7729 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis identifies subclusters and signature with N-glycosylation in endometrial cancer
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03802-z
PMID:39589706
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定子宫内膜癌中N-糖基化相关的亚群和特征 | 首次在子宫内膜癌中通过单细胞RNA测序结合非负矩阵分解识别N-糖基化相关细胞亚型,并整合多种机器学习算法构建预后特征 | 样本量较小(仅5例患者),数据来源于公共数据库缺乏实验验证 | 阐明N-糖基化相关基因在子宫内膜癌细胞异质性、预后和免疫治疗反应中的作用 | 子宫内膜癌患者细胞 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,非负矩阵分解,机器学习算法 | 非负矩阵分解,集成机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 5例子宫内膜癌患者,30,233个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7730 | 2025-10-06 |
EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS
2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002529
PMID:39617402
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研究论文 | 通过整合基因组和转录组分析探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力 | 首次通过整合GWAS和eQTL数据识别脓毒症相关基因,并利用单细胞RNA测序揭示BEND7在血小板中的特异性表达及其与免疫细胞的相互作用机制 | 需要进一步实验验证BEND7的功能机制,样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 探索脓毒症的遗传基础并识别潜在的免疫调节生物标志物 | 脓毒症相关基因和血小板 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基于汇总数据的孟德尔随机化,全基因组关联研究,表达数量性状位点分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus的转录组数据集和独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7731 | 2025-10-06 |
Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03756-2
PMID:39621240
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌中的单细胞测序数据,揭示了中性粒细胞RNA甲基化模式与肿瘤微环境异质性的关系 | 首次发现中性粒细胞中TRPM3特异性表达可能调控RNA修饰,并建立了新型中性粒细胞RNA甲基化评分系统 | 研究基于单细胞测序数据的生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索中性粒细胞RNA甲基化在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, LASSO Cox回归, 共识聚类 | 预后评分模型, nomogram | 单细胞测序数据, lncRNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7732 | 2025-05-17 |
Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia
2025-Jun, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2025.102524
PMID:40311558
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review | 本文综述了急性髓系白血病(AML)中CAR T细胞靶点识别的新方法 | 介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象,以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点 | NA | 提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用,为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径 | 急性髓系白血病(AML) | 肿瘤免疫治疗 | 急性髓系白血病 | 结构表面组学,AI驱动的单细胞RNA测序,细胞表面捕获技术 | NA | RNA测序数据,蛋白质构象数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7733 | 2025-05-17 |
Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution
2025-Jun, Cardiology research
IF:1.4Q3
DOI:10.14740/cr2055
PMID:40370624
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压(PAH)内皮细胞中自噬相关基因的表达特征,并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征,并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物 | 研究主要基于体外模型和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用 | 肺动脉高压患者的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7734 | 2025-05-17 |
Deficiency of NPR-C triggers high salt-induced thoracic aortic dissection by impairing mitochondrial homeostasis
2025-May-16, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf085
PMID:40377018
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研究论文 | 本研究探讨了NPR-C在胸主动脉夹层(TAD)发病中的作用及其分子机制 | 揭示了NPR-C通过调节线粒体稳态在TAD中的保护作用,并提出了NPR-C激活和亚精胺(SPD)补充作为新的TAD预防和治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究NPR-C在TAD发病中的作用及潜在治疗策略 | 人类TAD患者和小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | RNA测序、单细胞测序 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 人类TAD患者样本和BAPN处理的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
7735 | 2025-10-06 |
Acute kidney injury triggers hypoxemia by lung intravascular neutrophil retention that reduces capillary blood flow
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI186705
PMID:40048367
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研究论文 | 本研究揭示了急性肾损伤通过肺血管内中性粒细胞滞留导致低氧血症的机制 | 发现AKI诱导的远程肺部炎症中中性粒细胞在肺泡毛细血管内滞留而不外渗,通过减少肺毛细血管血流导致低氧血症 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证需要进一步研究 | 探究急性肾损伤引发低氧血症的细胞机制 | 小鼠和人类的中性粒细胞、单核细胞和肺泡巨噬细胞 | 病理生理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7736 | 2025-05-17 |
CD49d promotes T-cell senescence in chronic lymphocytic leukaemia
2025-May-15, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.20135
PMID:40375447
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research paper | 该研究探讨了CD49d在慢性淋巴细胞白血病(CLL)中对T细胞衰老的影响 | 揭示了CD49d在CLL患者T细胞衰老中的新作用,并提出了针对CD49d依赖性衰老途径可能逆转T细胞功能障碍的治疗策略 | 研究未涉及CD49d如何具体调控T细胞衰老的分子机制 | 探究CD49d对CLL患者T细胞生物学的影响 | CLL患者和健康捐赠者的CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据和基因表达数据 | 未明确提及样本数量,但包括CLL患者和健康捐赠者的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
7737 | 2025-05-17 |
Deciphering the Immunomodulatory Function of GSN+ Inflammatory Cancer-Associated Fibroblasts in Renal Cell Carcinoma Immunotherapy: Insights From Pan-Cancer Single-Cell Landscape and Spatial Transcriptomics Analysis
2025-May-15, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70062
PMID:40375605
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析,探讨了GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在肾细胞癌免疫治疗中的免疫调节功能 | 首次利用泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析GSN iCAFs的亚型及其在ICI治疗中的空间分布特征,并开发了预测ICI反应的Caf.Sig模型 | 研究主要基于体外和动物模型实验,临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的作用机制 | 泛癌患者样本和肾透明细胞癌(ccRCC)样本 | 癌症免疫治疗 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学测序(ST-seq)、机器学习 | Caf.Sig模型 | RNA测序数据 | 泛癌患者样本和ccRCC样本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
7738 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal analysis of lung immune dynamics in lethal Coccidioides posadasii infection
2025-May-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02562-24
PMID:39611685
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析致死性球孢子菌感染中肺部免疫反应的时空动态 | 首次在致死性球孢子菌感染模型中结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示了单核来源表达巨噬细胞在组织重塑和纤维化中的关键作用 | 研究聚焦于致死性感染模型,可能无法完全代表所有临床感染情况 | 深入理解致死性球孢子菌感染中的肺部免疫反应机制 | 球孢子菌感染小鼠模型的肺部免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
7739 | 2025-10-06 |
Tumor-colonizing Pseudoalteromonas elyakovii metabolically reprograms the tumor microenvironment and promotes breast ductal carcinoma
2025-May-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03873-24
PMID:40192290
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤内微生物群与乳腺癌发展的关系,重点关注Pseudoalteromonas elyakovii在肿瘤微环境代谢重编程中的作用 | 首次发现Pseudoalteromonas elyakovii能够代谢重编程肿瘤微环境并促进乳腺导管癌进展 | 样本量相对有限(102例),且研究聚焦于特定类型的乳腺癌 | 探究肿瘤内微生物群在乳腺癌发生发展中的作用机制 | 乳腺导管癌患者肿瘤样本及肿瘤内微生物 | 肿瘤微生物组学 | 乳腺癌 | 双免疫荧光染色、SweAMI探针杂交、scRNA-seq、qRT-PCR | NA | 微生物组数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 102例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7740 | 2025-05-17 |
Comprehensive single-cell transcriptomic reveals different destinies of melanocytes and dynamic changes of immune microenvironment in a psychological stress-induced leukoderma and leukotrichia mouse model
2025-May-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01236-z
PMID:40361040
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research paper | 通过单细胞转录组学分析心理压力诱导的白癜风和白毛小鼠模型中黑色素细胞的不同命运及免疫微环境的动态变化 | 发现了两种具有不同命运的黑色素细胞簇以及CXCL16-CXCR6轴激活的促炎微环境,为压力诱导的白癜风发病机制提供了新见解 | 研究仅基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究心理压力诱导的白癜风和白毛的发病机制 | C57BL/6 J小鼠模型中的黑色素细胞和免疫微环境 | digital pathology | vitiligo | single-cell RNA sequencing, immunohistochemistry | chronic unpredictable mild stimulation (CUMS) mouse model | RNA-seq data, immunohistochemistry data | C57BL/6 J小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |