单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 7721 - 7740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7721 | 2024-10-04 |
Epigenetic and Transcriptomic Programming of HSC Quiescence Signaling in Large for Gestational Age Neonates
2022-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137323
PMID:35806330
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研究论文 | 本文研究了过度胎儿生长对人类造血干细胞（HSC）静止信号的表观遗传和转录调控的影响 | 首次通过综合分析单细胞表观基因组学和单细胞转录组学，揭示了DNA甲基化变化与HSC功能改变之间的功能联系 | NA | 探讨过度胎儿生长对HSC静止信号的表观遗传和转录调控的影响 | 人类造血干细胞（HSC）及其在过度胎儿生长中的表观遗传和转录调控 | 表观遗传学 | NA | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 来自过度胎儿生长新生儿的造血干细胞（HSC） |
| 7722 | 2024-10-04 |
Common clonal origin of conventional T cells and induced regulatory T cells in breast cancer patients
2021-02-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21297-y
PMID:33602930
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研究论文 | 研究分析了乳腺癌患者中常规T细胞和诱导调节T细胞的克隆起源 | 首次揭示了乳腺癌患者中调节T细胞可能源自抗原经验丰富的常规T细胞通过肿瘤内激活转化为次级诱导调节T细胞 | NA | 探讨乳腺癌患者中调节T细胞的克隆起源及其形成机制 | 乳腺癌患者中的常规T细胞和诱导调节T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | T细胞受体和单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | NA |
| 7723 | 2024-10-04 |
Atlas of Musculoskeletal Stem Cells with the Soft and Hard Tissue Differentiation Architecture
2020-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202000938
PMID:33304744
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研究论文 | 研究通过高吞吐量单细胞RNA测序分析了E10.5、E12.5和E15.5小鼠肢体的细胞，揭示了肌肉骨骼干细胞（MSSC）及其在软硬组织分化中的架构 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了肌肉骨骼干细胞的身份及其在软硬组织分化中的架构，并验证了Scx基因在MSSC自我更新和增殖潜力中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类样本中验证结果 | 揭示肌肉骨骼干细胞在肢体发育中的分子机制和细胞程序 | E10.5、E12.5和E15.5小鼠肢体的肌肉骨骼干细胞及其分化架构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | E10.5、E12.5和E15.5小鼠肢体的细胞样本 |
| 7724 | 2024-10-04 |
Delineation of a molecularly distinct terminally differentiated memory CD8 T cell population
2020-10-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008571117
PMID:32978300
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研究论文 | 本文描述了一种分子上独特的终末分化记忆CD8 T细胞群体的特征 | 本文首次识别并描述了一种终末分化效应记忆CD8 T细胞群体（terminal-Tem），该群体在功能和转录上与传统的效应记忆细胞（Tem）不同 | 本文主要基于小鼠和健康人类个体的研究，未来需要在更多样本和不同疾病状态下验证terminal-Tem的存在和功能 | 研究目的是识别和描述一种新的终末分化记忆CD8 T细胞群体，并探讨其对免疫记忆和免疫治疗的影响 | 研究对象是终末分化效应记忆CD8 T细胞（terminal-Tem）及其与传统效应记忆细胞（Tem）的区别 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）和质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠和健康人类个体的血液样本 |
| 7725 | 2024-10-04 |
Data denoising with transfer learning in single-cell transcriptomics
2019-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0537-1
PMID:31471617
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研究论文 | 本文展示了在单细胞转录组学数据中使用迁移学习进行数据去噪的方法 | 通过结合深度自编码器和贝叶斯模型，SAVER-X能够跨不同实验室、不同条件和不同物种的数据提取可迁移的基因间关系，从而提高新目标数据集的质量 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的质量 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | NA |
| 7726 | 2024-10-02 |
Bulk and single-cell transcriptomics identify gene signatures of stem cell-derived NK cell donors with superior cytolytic activity
2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200870
PMID:39346765
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研究论文 | 研究通过批量和单细胞转录组学分析，识别出具有优越细胞毒性活性的干细胞衍生NK细胞供体的基因特征 | 首次通过批量和单细胞RNA测序，揭示了不同NK细胞供体在分化过程中的转录组特征差异，并定义了能够预测供体细胞毒性潜力的多因素基因表达特征 | 研究仅限于脐带血干细胞衍生的NK细胞，未涵盖其他来源的NK细胞 | 识别具有优越抗肿瘤活性的NK细胞供体，以支持有效的NK细胞疗法开发 | 脐带血干细胞衍生的NK细胞 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个脐带血干细胞衍生的NK细胞批次 |
| 7727 | 2024-10-02 |
Gene Regulatory Network Analysis of Decidual Stromal Cells and Natural Killer Cells
2024-Oct, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01653-1
PMID:39090334
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研究论文 | 本文分析了蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞的基因调控网络，揭示了这些细胞在妊娠早期分化过程中的关键转录因子 | 首次对蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞亚群进行了基因调控网络分析，并发现了新的蜕膜化驱动转录因子 | 研究基于第一孕期终止妊娠的单细胞转录组数据，可能无法完全代表正常妊娠过程 | 探讨蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞在妊娠早期的分化机制及其与妊娠障碍的关系 | 蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞 | NA | 妊娠障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 第一孕期终止妊娠的样本 |
| 7728 | 2024-10-02 |
Intraocular Immune Response in Human Uveitis: Time to Look Beyond Animal Models
2024-Oct, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.04.026
PMID:38703799
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综述 | 本文综述了当前和未来研究人类葡萄膜炎眼内免疫反应的方法 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）提供了单细胞分辨率，允许无偏差的免疫谱分析，发现新的细胞亚群 | 当前技术成本高且劳动密集，且受限于眼内液体中细胞产量低 | 探讨人类葡萄膜炎眼内免疫反应的研究方法 | 人类葡萄膜炎患者的眼部组织和液体 | NA | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、流式细胞术 | NA | 组织、液体 | NA |
| 7729 | 2024-10-02 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the regulatory functions of islet exocrine cells after short-time obesogenic diet
2024-Oct, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03883-4
PMID:38806892
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了高脂饮食诱导的早期肥胖中胰岛外分泌细胞亚型的调控功能 | 首次揭示了高脂饮食诱导的早期肥胖中胰岛外分泌细胞亚型的功能变化及其对胰岛素抵抗的影响 | 研究仅基于已发表的单细胞RNA测序数据，缺乏实验验证 | 探讨高脂饮食诱导的早期肥胖中胰岛外分泌细胞亚型的功能及其调控机制 | 高脂饮食诱导的早期肥胖中的胰岛外分泌细胞亚型 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个细胞簇 |
| 7730 | 2024-10-02 |
Potential different immune phenotypes of macrophages in oral lichen planus by integrating immunofluorescence double staining and single-cell RNA sequencing
2024-Oct, Journal of dental sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.jds.2024.03.002
PMID:39347036
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研究论文 | 本研究通过免疫荧光双染色和单细胞RNA测序技术，探讨了口腔扁平苔藓中巨噬细胞的不同免疫表型及其基因特征 | 结合免疫荧光双染色和单细胞RNA测序技术，首次全面揭示了口腔扁平苔藓中巨噬细胞的基因特征及其在炎症微环境中的作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 研究口腔扁平苔藓中巨噬细胞的表型及其基因特征 | 口腔扁平苔藓中的巨噬细胞 | NA | 口腔扁平苔藓 | 免疫荧光双染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11例口腔扁平苔藓组织样本和5例健康对照 |
| 7731 | 2024-10-02 |
Apigenin ameliorates lupus nephritis by inhibiting SAT3 signaling in CD8+ T cells
2024-Sep-30, Food & function
IF:5.1Q1
DOI:10.1039/d4fo02773f
PMID:39283308
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研究论文 | 研究了芹菜素通过抑制CD8+ T细胞中的SAT3信号通路改善狼疮性肾炎的效果 | 首次揭示了芹菜素通过抑制STAT3/IL-17信号通路减少CD8 T细胞招募巨噬细胞，从而改善狼疮性肾炎 | 研究仅在MRL/lpr小鼠模型和LN患者单细胞测序数据上进行，需要进一步在人体临床试验中验证 | 探讨芹菜素对狼疮性肾炎的治疗效果及其潜在机制 | 芹菜素对MRL/lpr小鼠和LN患者CD8+ T细胞的影响 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | MRL/lpr小鼠模型和LN患者单细胞测序数据 |
| 7732 | 2024-10-02 |
Exploring tumor microenvironment in molecular subtyping and prognostic signatures in ovarian cancer and identification of SH2D1A as a key regulator of ovarian cancer carcinogenesis
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38014
PMID:39347397
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研究论文 | 研究探讨了卵巢癌中的肿瘤微环境（TME）在分子分型和预后标志物中的作用，并识别出SH2D1A作为卵巢癌致癌的关键调节因子 | 首次通过共识聚类和机器学习技术构建了基于TME的卵巢癌预后模型，并发现SH2D1A在卵巢癌中的重要作用 | 研究主要基于体外实验和公共数据库数据，缺乏临床验证 | 探讨肿瘤微环境在卵巢癌分子分型和预后中的作用，并识别关键调节因子 | 卵巢癌肿瘤微环境、SH2D1A基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 使用了来自TCGA-OV、GSE26712、GSE102073、ICGC、EMTAB8107、GSE118828、GSE130000和GSE154600等多个数据集的样本 |
| 7733 | 2024-10-02 |
Full-length single-cell BCR sequencing paired with RNA sequencing reveals convergent responses to pneumococcal vaccination
2024-Sep-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06823-0
PMID:39341987
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研究论文 | 本文介绍了一种从3'-barcoded单细胞RNA测序库中恢复配对的全长B细胞受体（BCR）可变区序列的方法，并应用于研究肺炎链球菌疫苗接种后的B细胞反应 | 开发了一种新的方法（B3E-seq），可以从广泛使用的3'-barcoded单细胞RNA测序库中恢复配对的全长BCR可变区序列 | NA | 研究肺炎链球菌疫苗接种后B细胞的反应 | B细胞受体（BCR）和单细胞RNA测序 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 五只婴儿恒河猴 |
| 7734 | 2024-10-02 |
Metabolic and Immunological Implications of MME+CAF-Mediated Hypoxia Signaling in Pancreatic Cancer Progression: Therapeutic Insights and Translational Opportunities
2024-Sep-28, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-024-00254-1
PMID:39342097
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，识别了胰腺癌中表达MME的CAF亚群（MMECAF），并探讨了其在胰腺癌进展中的代谢和免疫学作用 | 首次识别并验证了MMECAF亚群在胰腺癌微环境中的独特作用，并开发了针对MMECAF的抑制剂IOX2，结合化疗和免疫疗法，显示出良好的抗肿瘤效果 | 研究主要集中在体外和动物实验，尚未进行临床试验验证其疗效 | 探讨MMECAF在胰腺癌进展中的作用，并开发新的治疗策略 | 胰腺癌中的MMECAF亚群及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及胰腺癌患者的样本，具体数量未明确提及 |
| 7735 | 2024-10-02 |
Single-cell transcriptomics reveals e-cigarette vapor-induced airway epithelial remodeling and injury
2024-Sep-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02962-4
PMID:39342154
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研究论文 | 研究揭示了电子烟蒸汽引起的气道上皮重塑和损伤 | 首次通过单细胞转录组学分析了电子烟蒸汽提取物对人类支气管上皮细胞分化的影响，并发现Notch信号通路在其中的作用 | 研究仅限于特定的细胞类型和样本，可能无法全面代表所有电子烟使用者的影响 | 探讨电子烟使用对人类支气管上皮细胞的影响及其潜在机制 | 健康非吸烟者和慢性阻塞性肺病吸烟者的支气管上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序、免疫染色、HE染色、qPCR和ELISA | NA | RNA | 健康非吸烟者、吸烟者和电子烟使用者的血清和痰液样本 |
| 7736 | 2024-10-02 |
Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis
2024-Sep-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97662
PMID:39324575
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研究论文 | 研究肌肉驻留间充质前体细胞通过GDNF-BDNF轴感知和修复周围神经损伤的机制 | 揭示了肌肉驻留间充质前体细胞（FAPs）在周围神经再生中的新作用及其响应神经损伤的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探讨肌肉驻留间充质前体细胞在周围神经损伤修复中的作用及其分子机制 | 肌肉驻留间充质前体细胞（FAPs）及其在周围神经损伤后的响应和修复作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 7737 | 2024-10-02 |
Plasma exosomes from individuals with type 2 diabetes drive breast cancer aggression in patient-derived organoids
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.13.612950
PMID:39345362
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研究论文 | 研究探讨了来自2型糖尿病患者的血浆外泌体如何促进乳腺癌患者来源的类器官的侵袭性 | 首次在乳腺癌患者来源的类器官中保留了原生肿瘤浸润淋巴细胞，并使用单细胞RNA测序分析了外泌体信号对类器官的影响 | NA | 研究2型糖尿病患者的血浆外泌体对乳腺癌侵袭性的影响 | 乳腺癌患者来源的类器官和外泌体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自2型糖尿病患者和非糖尿病患者的血浆外泌体样本 |
| 7738 | 2024-10-02 |
Deconvolution from bulk gene expression by leveraging sample-wise and gene-wise similarities and single-cell RNA-Seq data
2024-Sep-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10728-x
PMID:39294558
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研究论文 | 提出了一种新的去卷积算法DSSC，通过利用基因间和样本间的相似性以及单细胞RNA-Seq数据，同时推断异质样本的细胞类型特异性基因表达和细胞类型比例 | DSSC算法能够同时推断细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达，并且在模拟和实验数据中表现出色 | NA | 开发更准确的去卷积方法以推断细胞类型丰度和细胞类型特异性基因表达 | 异质样本的细胞类型特异性基因表达和细胞类型比例 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 去卷积算法 | 基因表达数据 | NA |
| 7739 | 2024-10-02 |
Anti-CTLA-4 m2a Antibody Exacerbates Cardiac Injury in Experimental Autoimmune Myocarditis Mice By Promoting Ccl5-Neutrophil Infiltration
2024-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400486
PMID:38978328
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研究论文 | 研究探讨了抗CTLA-4 m2a抗体在实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型中加重心脏损伤的机制 | 首次揭示了抗CTLA-4 m2a抗体通过促进Ccl5-中性粒细胞浸润加重心脏损伤的机制 | 研究仅限于实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型，尚未在临床患者中验证 | 阐明抗CTLA-4 m2a抗体在实验性自身免疫性心肌炎小鼠中加重心脏损伤的机制 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 转录组数据 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠 |
| 7740 | 2024-10-02 |
Complement Factor C1q Mediates Vascular Endothelial Dysfunction in STZ-Induced Diabetic Mice
2024-Sep-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0981
PMID:38869460
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研究论文 | 研究探讨了补体因子C1q在STZ诱导的糖尿病小鼠血管内皮功能障碍中的作用 | 首次揭示了C1qa在糖尿病相关内皮功能障碍中的关键作用，并通过AAV-Tie2-shRNA-C1qa抑制C1qa表达，改善了血管功能 | 研究仅限于STZ诱导的糖尿病小鼠模型，未探讨其他糖尿病模型或人类样本 | 比较正常和STZ诱导的糖尿病小鼠主动脉的细胞和分子特性，揭示内皮功能障碍的潜在机制 | 正常和STZ诱导的糖尿病小鼠的主动脉细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 32,573个细胞 |