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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7701 | 2025-10-06 |
Spatial Pathomics Toolkit for Quantitative Analysis of Podocyte Nuclei with Histology and Spatial Transcriptomics Data in Renal Pathology
2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
DOI:10.1117/12.3006318
PMID:40375953
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研究论文 | 开发并应用空间病理组学工具包(SPT)对肾病理中的足细胞核进行定量分析 | 提出首个整合组织学和空间转录组学数据的足细胞空间病理组学分析工具包 | 未提及具体样本量限制或验证范围 | 开发定量分析工具以促进肾病理中细胞空间病理组学研究 | 肾小球足细胞核 | 数字病理 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, 病理图像分析 | 实例对象分割模型 | 全切片图像(WSI), 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
7702 | 2025-10-06 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
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研究论文 | 本研究揭示bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤起始、迁移和细胞类型调控中的核心作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中功能冗余地启动肿瘤形成,并通过动态水平和相互结合调控肿瘤细胞类型与迁移程度 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤异质性和细胞层级调控中的作用机制 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞和胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7703 | 2025-10-06 |
Faecalibacterium prausnitzii prevents age-related heart failure by suppressing ferroptosis in cardiomyocytes through butyrate-mediated LCN2 regulation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2505119
PMID:40364435
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研究论文 | 本研究揭示了普拉梭菌通过丁酸盐介导的LCN2调控抑制心肌细胞铁死亡,从而预防年龄相关性心力衰竭的机制 | 首次发现年龄相关肠道菌群失调通过铁死亡途径驱动心力衰竭,并阐明普拉梭菌及其代谢产物丁酸盐的保护作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类中的直接证据仍需进一步验证 | 探索年龄相关肠道菌群改变与老年人心力衰竭之间的潜在联系 | 老年个体、心力衰竭患者、大鼠模型、心肌细胞 | 微生物组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 16S rRNA测序, PCR, 基因编辑 | 动物模型 | 基因表达数据, 微生物组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
7704 | 2025-10-06 |
Intratumoral Fusobacterium nucleatum Recruits Tumor-Associated Neutrophils to Promote Gastric Cancer Progression and Immune Evasion
2025-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2580
PMID:39992708
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内具核梭杆菌通过招募肿瘤相关中性粒细胞促进胃癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次发现具核梭杆菌通过激活IL17/NF-κB/RelB信号通路招募肿瘤相关中性粒细胞,并促进其分化为促肿瘤亚型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究肿瘤内微生物群在胃癌恶性进展中对肿瘤免疫微环境的影响 | 胃癌组织和具核梭杆菌感染的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16S rRNA扩增子测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据,组织样本 | 人类胃癌组织样本和小鼠模型 | NA | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
7705 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040
PMID:40029262
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化 | 首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤转录异质性、克隆进化及免疫抑制微环境,并鉴定出TSPAN8作为潜在治疗靶点 | 样本量较小(7名未治疗患者),循环肿瘤细胞分析使用独立队列 | 深入理解尤文肉瘤肿瘤异质性并探索新的治疗策略 | 尤文肉瘤患者原发肿瘤、肿瘤微环境和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,拷贝数分析 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 7名未治疗尤文肉瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7706 | 2025-10-06 |
IGFBP3 enhances adipose-derived stem cell function in soft tissue injury repair via ITGB1 and ERK pathway activation
2025-May-15, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10024-8
PMID:40369223
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研究论文 | 本研究揭示了IGFBP3通过增强ITGB1表达和激活ERK通路促进脂肪来源干细胞修复软组织损伤的分子机制 | 首次结合单细胞多组学技术和3D生物打印模型系统阐明IGFBP3在ADSCs修复软组织损伤中的功能机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究IGFBP3蛋白在脂肪来源干细胞修复软组织损伤中的分子机制 | 脂肪来源干细胞(ADSCs)和软组织损伤模型 | 组织工程与再生医学 | 软组织损伤 | 单细胞RNA测序, 3D生物打印, 慢病毒转染, 傅里叶变换红外光谱, X射线衍射, SEM, TEM | 动物模型, 3D生物打印模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠软组织损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 3D生物打印 | NA | NA |
7707 | 2025-10-06 |
scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia
2025-May-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97958
PMID:40371706
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示支持细胞在非梗阻性无精子症中介导精子发生障碍的阶段特异性通讯机制 | 识别了12种生殖细胞亚型和8种支持细胞亚型,发现三种新型支持细胞亚型表型,揭示了生殖细胞与支持细胞亚型间阶段特异性匹配的相互作用模式 | 样本量相对有限,研究主要聚焦于睾丸组织,未涉及其他生殖系统组织 | 探究非梗阻性无精子症中精子发生障碍的细胞类型特异性异常机制 | 梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
7708 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immunological link between house dust mite allergy and childhood asthma
2025-May-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01538-6
PMID:40368964
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示儿童尘螨过敏与哮喘之间的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下系统分析尘螨过敏哮喘儿童的免疫特征,识别出HLA-DR和HLA-DP作为主要标志性受体 | 样本量较小(仅8名儿童),缺乏外部验证队列 | 探索儿童尘螨过敏哮喘的免疫学特征并寻找诊断标志物 | 8名4-11岁医生确诊哮喘儿童的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归,机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 8名哮喘儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7709 | 2025-10-06 |
The surface protein Gbp of Fusobacterium nucleatum inhibits osteogenic differentiation by inactivating the Wnt/β-catenin pathway via binding to Annexin A2
2025-May-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06569-1
PMID:40369630
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研究论文 | 本研究揭示了具核梭杆菌表面蛋白Gbp通过结合Annexin A2抑制Wnt/β-catenin通路从而阻碍成骨分化的分子机制 | 首次发现具核梭杆菌效应蛋白Gbp通过结合宿主蛋白ANXA2破坏ANXA2/GSK3β复合物进而抑制Wnt/β-catenin通路的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 阐明牙周炎中成骨细胞功能障碍的细胞和分子机制 | 人牙龈组织、小鼠实验性牙周炎模型、原代成骨细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,转录组分析,GSEA,PPI网络 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 牙周炎患者和健康对照的人牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7710 | 2025-10-06 |
Disrupting lipid homeostasis with CAV2 in OSCC triggers apoptosis, lipolysis, and mitochondrial dysfunction by transcriptional repression of PPARγ
2025-May-14, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01399-6
PMID:40369665
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研究论文 | 本研究探讨CAV2通过转录抑制PPARγ破坏口腔鳞癌脂质稳态并诱导细胞凋亡、脂解和线粒体功能障碍的机制 | 首次揭示CAV2通过PPARγ/NCOR1轴调控口腔鳞癌脂质稳态的新机制,并发现PPARγ反向激动剂T0070907可增强CAV2敲低效应 | 研究主要基于细胞系和裸鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明CAV2在口腔鳞癌脂质代谢异常和恶性进展中的作用机制 | 口腔鳞癌细胞系和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序,RNA测序,脂质组学,分子对接,Seahorse能量代谢分析 | 基因敲低模型 | 转录组数据,脂质组数据,功能实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7711 | 2025-10-06 |
A Cold-Active Protease Tissue Dissociation Protocol for the Preservation of the Tendon Fibroblast Transcriptome
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5293
PMID:40364987
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研究论文 | 开发了一种使用冷活性蛋白酶在4°C下解离组织的方案,以更好地保存肌腱成纤维细胞的转录组 | 首次证明冷活性蛋白酶解离能减少肌腱细胞转录应激并更好地保留细胞类型特异性基因表达 | 仅在小鼠肌腱和韧带组织中验证,未在其他组织类型中测试 | 开发能更好保存组织原生转录组的组织解离方法 | 斑马鱼肌腱和韧带组织中的肌腱成纤维细胞 | 单细胞测序 | NA | bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
7712 | 2025-10-06 |
Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of cervical cancer
2025-May-02, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae046
PMID:39402008
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综述 | 本综述聚焦人乳头瘤病毒在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用,特别关注筛查和疾病干预的最新进展 | 整合HPV检测与现有筛查方法提高灵敏度与特异性,探索HPV相关生物标志物用于个性化干预,开发预防性和治疗性HPV疫苗及三级预防策略 | 未提及具体研究方法的局限性,作为综述文章缺乏原始数据支持 | 探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的作用机制及临床应用 | 人乳头瘤病毒及其相关宫颈癌 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序分析,类器官模型开发 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7713 | 2025-10-06 |
High-Viability Circulating Tumor Cells Sorting From Whole Blood at Single Cell Level Using Laser-Induced Forward Transfer-Assisted Microfiltration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414195
PMID:39868845
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研究论文 | 开发了一种激光诱导正向转移辅助微过滤系统,用于从全血中高效分离和回收高活性循环肿瘤细胞 | 采用激光诱导正向转移技术结合双阶梯微过滤器,实现高捕获效率和单细胞高存活率回收 | NA | 开发高效分离循环肿瘤细胞的技术方法 | 循环肿瘤细胞 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7714 | 2025-10-06 |
Dissecting the Spatial and Single-Cell Transcriptomic Architecture of Cancer Stem Cell Niche Driving Tumor Progression in Gastric Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413019
PMID:39950944
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组测序解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录特征及其在肿瘤进展中的作用 | 首次结合空间转录组和单细胞RNA测序技术揭示胃癌干细胞微环境的细胞组成和信号通路,发现iCAFs来源的AREG通过SOX9和ERBB2轴促进肿瘤干性和耐药性 | 样本量相对有限(32例),缺乏功能性验证实验 | 解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录特征及其在肿瘤进展中的作用机制 | 人类胃黏膜组织(不同恶性阶段) | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 32例人类胃黏膜组织 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7715 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal Transcriptomic Profiling Reveals the Dynamic Immunological Landscape of Alveolar Echinococcosis
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405914
PMID:39985260
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研究论文 | 本研究通过整合多种转录组技术揭示了多房棘球蚴感染过程中的时空免疫景观动态变化 | 首次构建了多房棘球蚴感染灶的高分辨率空间图谱,揭示了中性粒细胞、Spp1巨噬细胞和成纤维细胞在疾病进展中的功能作用 | 研究仅使用小鼠肝脏样本,未涉及人类临床样本验证 | 揭示宿主对多房棘球蚴的免疫应答机制 | 多房棘球蚴感染的小鼠肝脏组织 | 空间转录组学 | 多房棘球蚴病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 感染后多个时间点(最长15个月)的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
7716 | 2025-10-06 |
PLXDC1+ Tumor-Associated Pancreatic Stellate Cells Promote Desmoplastic and Immunosuppressive Niche in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415756
PMID:40091495
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的异质性及其在形成促纤维增生和免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次系统鉴定胰腺星状细胞亚群并发现PLXDC1+肿瘤相关胰腺星状细胞在免疫抑制微环境形成中的核心作用 | 研究样本量有限,需要进一步验证PLXDC1+胰腺星状细胞作为治疗靶点的临床价值 | 探究胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌进展和治疗抵抗中的详细功能 | 胰腺星状细胞和胰腺导管腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序, ATAC-seq, 单细胞转录组, 空间转录组, 原位测序 | NA | 基因组, 转录组, 表观基因组数据 | 来自癌旁正常组织和PDAC组织的分选胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组, ATAC-seq | NA | NA |
7717 | 2025-10-06 |
DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells
2025-May, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00215-5
PMID:40119174
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研究论文 | 本研究通过分析COVID-19患者鼻细胞的DNA甲基化和单细胞转录组,揭示了急性期DNA甲基化变化与长期转录调控异常之间的关联 | 首次将急性COVID-19期间的DNA甲基化变化与长达12个月的长期转录失调联系起来,并发现纤毛功能基因的持续抑制现象 | 样本量相对较小(急性期n=19,随访样本更少),且仅关注上呼吸道上皮细胞 | 探究SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制 | COVID-19患者和对照组的鼻上皮细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | DNA甲基化测序,单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据,单细胞转录组数据 | 急性期:COVID-19患者19例(单细胞RNA-seq 14例),对照组14例(单细胞RNA-seq 10例);随访:感染后3个月7例,12个月5例;验证队列:感染后6个月15例 | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA |
7718 | 2025-10-06 |
Single-cell transcription reveals hepatocyte-to-cholangiocyte reprogramming and biliary gene profile in biliary atresia
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000710
PMID:40366121
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示胆道闭锁中肝细胞向胆管细胞的重编程过程及胆道基因特征 | 首次在胆道闭锁中发现肝细胞向胆管细胞的重编程现象,并识别出特异性胆道标志物和转录因子 | 样本量较小(4例BA患者和3例正常对照) | 解析胆道闭锁中胆管反应的细胞来源和功能 | 胆道闭锁患者的肝组织上皮细胞 | 单细胞测序 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 4例胆道闭锁患者和3例正常对照肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7719 | 2025-10-06 |
Development and validation of tryptophan metabolism-related risk model and molecular subtypes for predicting postoperative biochemical recurrence in prostate cancer
2025-Apr-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-39
PMID:40376539
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研究论文 | 开发并验证了基于色氨酸代谢的风险模型和分子亚型,用于预测前列腺癌患者术后生化复发 | 首次将色氨酸代谢相关基因与前列腺癌术后生化复发预测相结合,建立了风险评分模型和分子亚型分类系统 | 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证模型普适性 | 预测前列腺癌患者根治性前列腺切除术后生化复发风险 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 差异表达分析、单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归、一致性聚类、免疫组化、单细胞测序 | Cox回归风险模型、聚类分析 | 基因表达数据、临床数据 | TCGA-PRAD数据集421例前列腺癌患者,高风险组211例,Cluster 1亚型261例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7720 | 2025-10-06 |
Cold-Induced DHRS4 Promotes Thermogenesis via Enhanced Fatty Acid β-Oxidation in Porcine Subcutaneous Adipocytes
2025-Apr-22, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15091190
PMID:40362005
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了猪皮下脂肪细胞中冷诱导DHRS4通过增强脂肪酸β-氧化促进产热的新机制 | 首次在缺乏经典棕色脂肪组织的大型哺乳动物(猪)中发现DHRS4作为表观遗传-代谢开关调控冷适应机制 | 研究主要聚焦于猪模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究大型哺乳动物脂肪组织在冷应激下的代谢重编程表观遗传机制 | 猪皮下脂肪组织 | 表观遗传学 | 代谢适应 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 冷暴露猪模型的皮下脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |