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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7701 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immunological link between house dust mite allergy and childhood asthma
2025-May-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01538-6
PMID:40368964
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示儿童尘螨过敏与哮喘之间的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下系统分析尘螨过敏哮喘儿童的免疫特征,识别出HLA-DR和HLA-DP作为主要标志性受体 | 样本量较小(仅8名儿童),缺乏外部验证队列 | 探索儿童尘螨过敏哮喘的免疫学特征并寻找诊断标志物 | 8名4-11岁医生确诊哮喘儿童的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归,机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 8名哮喘儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7702 | 2025-10-06 |
The surface protein Gbp of Fusobacterium nucleatum inhibits osteogenic differentiation by inactivating the Wnt/β-catenin pathway via binding to Annexin A2
2025-May-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06569-1
PMID:40369630
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研究论文 | 本研究揭示了具核梭杆菌表面蛋白Gbp通过结合Annexin A2抑制Wnt/β-catenin通路从而阻碍成骨分化的分子机制 | 首次发现具核梭杆菌效应蛋白Gbp通过结合宿主蛋白ANXA2破坏ANXA2/GSK3β复合物进而抑制Wnt/β-catenin通路的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 阐明牙周炎中成骨细胞功能障碍的细胞和分子机制 | 人牙龈组织、小鼠实验性牙周炎模型、原代成骨细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,转录组分析,GSEA,PPI网络 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 牙周炎患者和健康对照的人牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7703 | 2025-10-06 |
Disrupting lipid homeostasis with CAV2 in OSCC triggers apoptosis, lipolysis, and mitochondrial dysfunction by transcriptional repression of PPARγ
2025-May-14, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01399-6
PMID:40369665
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研究论文 | 本研究探讨CAV2通过转录抑制PPARγ破坏口腔鳞癌脂质稳态并诱导细胞凋亡、脂解和线粒体功能障碍的机制 | 首次揭示CAV2通过PPARγ/NCOR1轴调控口腔鳞癌脂质稳态的新机制,并发现PPARγ反向激动剂T0070907可增强CAV2敲低效应 | 研究主要基于细胞系和裸鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明CAV2在口腔鳞癌脂质代谢异常和恶性进展中的作用机制 | 口腔鳞癌细胞系和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序,RNA测序,脂质组学,分子对接,Seahorse能量代谢分析 | 基因敲低模型 | 转录组数据,脂质组数据,功能实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7704 | 2025-10-06 |
A Cold-Active Protease Tissue Dissociation Protocol for the Preservation of the Tendon Fibroblast Transcriptome
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5293
PMID:40364987
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研究论文 | 开发了一种使用冷活性蛋白酶在4°C下解离组织的方案,以更好地保存肌腱成纤维细胞的转录组 | 首次证明冷活性蛋白酶解离能减少肌腱细胞转录应激并更好地保留细胞类型特异性基因表达 | 仅在小鼠肌腱和韧带组织中验证,未在其他组织类型中测试 | 开发能更好保存组织原生转录组的组织解离方法 | 斑马鱼肌腱和韧带组织中的肌腱成纤维细胞 | 单细胞测序 | NA | bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
7705 | 2025-10-06 |
Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of cervical cancer
2025-May-02, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae046
PMID:39402008
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综述 | 本综述聚焦人乳头瘤病毒在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用,特别关注筛查和疾病干预的最新进展 | 整合HPV检测与现有筛查方法提高灵敏度与特异性,探索HPV相关生物标志物用于个性化干预,开发预防性和治疗性HPV疫苗及三级预防策略 | 未提及具体研究方法的局限性,作为综述文章缺乏原始数据支持 | 探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的作用机制及临床应用 | 人乳头瘤病毒及其相关宫颈癌 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序分析,类器官模型开发 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7706 | 2025-10-06 |
High-Viability Circulating Tumor Cells Sorting From Whole Blood at Single Cell Level Using Laser-Induced Forward Transfer-Assisted Microfiltration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414195
PMID:39868845
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研究论文 | 开发了一种激光诱导正向转移辅助微过滤系统,用于从全血中高效分离和回收高活性循环肿瘤细胞 | 采用激光诱导正向转移技术结合双阶梯微过滤器,实现高捕获效率和单细胞高存活率回收 | NA | 开发高效分离循环肿瘤细胞的技术方法 | 循环肿瘤细胞 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7707 | 2025-10-06 |
Dissecting the Spatial and Single-Cell Transcriptomic Architecture of Cancer Stem Cell Niche Driving Tumor Progression in Gastric Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413019
PMID:39950944
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组测序解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录特征及其在肿瘤进展中的作用 | 首次结合空间转录组和单细胞RNA测序技术揭示胃癌干细胞微环境的细胞组成和信号通路,发现iCAFs来源的AREG通过SOX9和ERBB2轴促进肿瘤干性和耐药性 | 样本量相对有限(32例),缺乏功能性验证实验 | 解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录特征及其在肿瘤进展中的作用机制 | 人类胃黏膜组织(不同恶性阶段) | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 32例人类胃黏膜组织 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7708 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal Transcriptomic Profiling Reveals the Dynamic Immunological Landscape of Alveolar Echinococcosis
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405914
PMID:39985260
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研究论文 | 本研究通过整合多种转录组技术揭示了多房棘球蚴感染过程中的时空免疫景观动态变化 | 首次构建了多房棘球蚴感染灶的高分辨率空间图谱,揭示了中性粒细胞、Spp1巨噬细胞和成纤维细胞在疾病进展中的功能作用 | 研究仅使用小鼠肝脏样本,未涉及人类临床样本验证 | 揭示宿主对多房棘球蚴的免疫应答机制 | 多房棘球蚴感染的小鼠肝脏组织 | 空间转录组学 | 多房棘球蚴病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 感染后多个时间点(最长15个月)的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
7709 | 2025-10-06 |
PLXDC1+ Tumor-Associated Pancreatic Stellate Cells Promote Desmoplastic and Immunosuppressive Niche in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415756
PMID:40091495
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的异质性及其在形成促纤维增生和免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次系统鉴定胰腺星状细胞亚群并发现PLXDC1+肿瘤相关胰腺星状细胞在免疫抑制微环境形成中的核心作用 | 研究样本量有限,需要进一步验证PLXDC1+胰腺星状细胞作为治疗靶点的临床价值 | 探究胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌进展和治疗抵抗中的详细功能 | 胰腺星状细胞和胰腺导管腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序, ATAC-seq, 单细胞转录组, 空间转录组, 原位测序 | NA | 基因组, 转录组, 表观基因组数据 | 来自癌旁正常组织和PDAC组织的分选胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组, ATAC-seq | NA | NA |
7710 | 2025-10-06 |
DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells
2025-May, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00215-5
PMID:40119174
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研究论文 | 本研究通过分析COVID-19患者鼻细胞的DNA甲基化和单细胞转录组,揭示了急性期DNA甲基化变化与长期转录调控异常之间的关联 | 首次将急性COVID-19期间的DNA甲基化变化与长达12个月的长期转录失调联系起来,并发现纤毛功能基因的持续抑制现象 | 样本量相对较小(急性期n=19,随访样本更少),且仅关注上呼吸道上皮细胞 | 探究SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制 | COVID-19患者和对照组的鼻上皮细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | DNA甲基化测序,单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据,单细胞转录组数据 | 急性期:COVID-19患者19例(单细胞RNA-seq 14例),对照组14例(单细胞RNA-seq 10例);随访:感染后3个月7例,12个月5例;验证队列:感染后6个月15例 | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA |
7711 | 2025-10-06 |
Single-cell transcription reveals hepatocyte-to-cholangiocyte reprogramming and biliary gene profile in biliary atresia
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000710
PMID:40366121
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示胆道闭锁中肝细胞向胆管细胞的重编程过程及胆道基因特征 | 首次在胆道闭锁中发现肝细胞向胆管细胞的重编程现象,并识别出特异性胆道标志物和转录因子 | 样本量较小(4例BA患者和3例正常对照) | 解析胆道闭锁中胆管反应的细胞来源和功能 | 胆道闭锁患者的肝组织上皮细胞 | 单细胞测序 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 4例胆道闭锁患者和3例正常对照肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7712 | 2025-10-06 |
Development and validation of tryptophan metabolism-related risk model and molecular subtypes for predicting postoperative biochemical recurrence in prostate cancer
2025-Apr-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-39
PMID:40376539
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研究论文 | 开发并验证了基于色氨酸代谢的风险模型和分子亚型,用于预测前列腺癌患者术后生化复发 | 首次将色氨酸代谢相关基因与前列腺癌术后生化复发预测相结合,建立了风险评分模型和分子亚型分类系统 | 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证模型普适性 | 预测前列腺癌患者根治性前列腺切除术后生化复发风险 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 差异表达分析、单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归、一致性聚类、免疫组化、单细胞测序 | Cox回归风险模型、聚类分析 | 基因表达数据、临床数据 | TCGA-PRAD数据集421例前列腺癌患者,高风险组211例,Cluster 1亚型261例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7713 | 2025-10-06 |
Cold-Induced DHRS4 Promotes Thermogenesis via Enhanced Fatty Acid β-Oxidation in Porcine Subcutaneous Adipocytes
2025-Apr-22, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15091190
PMID:40362005
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了猪皮下脂肪细胞中冷诱导DHRS4通过增强脂肪酸β-氧化促进产热的新机制 | 首次在缺乏经典棕色脂肪组织的大型哺乳动物(猪)中发现DHRS4作为表观遗传-代谢开关调控冷适应机制 | 研究主要聚焦于猪模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究大型哺乳动物脂肪组织在冷应激下的代谢重编程表观遗传机制 | 猪皮下脂肪组织 | 表观遗传学 | 代谢适应 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 冷暴露猪模型的皮下脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
7714 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell analysis reveals transcriptional and epigenetic regulatory features of human developmental dysplasia of the hip
2025-Mar-26, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.02.788
PMID:40154730
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和染色质可及性分析揭示人类发育性髋关节发育不良的转录和表观遗传调控特征 | 首次在DDH软骨中发现具有独特分子特征的炎症性软骨细胞群体,并重建了软骨细胞的分化轨迹 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证发现 | 理解DDH发展中的特定软骨细胞组成,识别有效的生物标志物,阐明驱动DDH进展的基因调控元件 | 人类发育性髋关节发育不良患者的软骨组织 | 数字病理学 | 发育性髋关节发育不良 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学检测 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
7715 | 2025-10-06 |
Continuous replenishment of the dysfunctional CD8 T cell axis is associated with response to chemoimmunotherapy in advanced breast cancer
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101973
PMID:39983715
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析晚期乳腺癌患者对化疗免疫联合治疗的免疫应答机制 | 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序揭示化疗免疫治疗应答患者的CD8 T细胞动态变化特征 | 样本量较小(27例患者),仅针对三阴性乳腺癌 | 探究肿瘤免疫微环境如何影响晚期乳腺癌患者对化疗免疫联合治疗的应答 | 27例转移性三阴性乳腺癌患者的40份活检样本 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 27例患者的40份活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
7716 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage Dynamics During MASH in Leptin-Deficient Rats
2025-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020096
PMID:39851524
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示瘦素缺陷大鼠MASH模型中肝脏巨噬细胞的动态变化 | 首次在大鼠MASH模型中系统研究肝脏巨噬细胞的异质性和动态变化,发现独特的M1向M2表型转换特征 | 研究仅针对瘦素缺陷大鼠模型,结果在人类和其他物种中的普适性需要进一步验证 | 解析代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中巨噬细胞的动态变化和细胞间通讯 | 瘦素缺陷大鼠的肝脏组织 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16周龄瘦素缺陷大鼠肝脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7717 | 2025-10-06 |
Immune Gene Expression Profiling in Individuals with Turner Syndrome, Graves' Disease, and a Healthy Female by Single-Cell RNA Sequencing: A Comparative Study
2025-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020093
PMID:39851522
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较特纳综合征患者、健康女性和Graves病患者的免疫基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析特纳综合征患者抗原特异性CD4(+) T细胞的免疫基因表达谱,并与健康对照和自身免疫疾病患者进行比较 | 样本量较小(仅3个个体),需要更大规模研究验证结果 | 探究特纳综合征患者免疫相关基因表达特征及其与自身免疫疾病的差异 | 特纳综合征患者、健康女性、Graves病女性患者 | 单细胞基因组学 | 特纳综合征, Graves病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个个体(1名TS患者,1名健康女性,1名Graves病患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7718 | 2025-10-06 |
Temporal evolution of fibroblast responses following salivary gland ductal ligation injury
2025, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2025.1581376
PMID:40375832
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析唾液腺导管结扎损伤后成纤维细胞的时序性反应 | 首次在唾液腺损伤模型中鉴定出三种独特的成纤维细胞亚群及其动态响应模式,并确定主要损伤响应性纤维化细胞类型 | 研究仅关注7天内的时间进程,未探讨长期慢性纤维化过程 | 阐明成纤维细胞在唾液腺损伤响应中的时序性变化机制 | 小鼠唾液腺导管结扎损伤模型中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 唾液腺疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的唾液腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7719 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing reveals the characteristics of glutathione metabolism and protective role of GSTA4 gene in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571431
PMID:40375987
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,揭示了胰腺癌中谷胱甘肽代谢特征及GSTA4基因的保护作用 | 首次在胰腺癌中系统分析谷胱甘肽代谢相关基因的预后价值,并通过实验验证GSTA4基因的抑癌功能 | 研究主要基于回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探究谷胱甘肽代谢相关基因在胰腺癌中的预后意义并识别关键分子靶点 | 胰腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外功能实验 | 预后分子分类器 | 转录组数据 | 930例胰腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
7720 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell sequencing and transcriptome analysis to unravel the mechanistic role of sialylation-related genes in sepsis-induced acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1528769
PMID:40375981
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析,揭示了唾液酸化相关基因在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征中的机制作用 | 首次系统鉴定CD19和GPR65作为脓毒症诱导ARDS的关键唾液酸化相关基因,并通过单细胞RNA测序确定CD14单核细胞为关键细胞类型 | 研究基于公共数据库数据,临床样本验证规模有限,机制研究仍需进一步实验验证 | 探讨唾液酸化相关基因在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征中的分子机制 | 脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, 机器学习 | 列线图模型, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE32707, GSE66890, GSE151263)和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |