单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7701 - 7720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7701 | 2024-10-01 |
scVGATAE: A Variational Graph Attentional Autoencoder Model for Clustering Single-Cell RNA-seq Data
2024-Sep-11, Biology
DOI:10.3390/biology13090713
PMID:39336140
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研究论文 | 提出了一种名为scVGATAE的无监督聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞亚群识别 | 引入了一种结合图注意力网络的变分图自编码器模型，通过网络去噪构建可靠的细胞图，并自适应确定模型训练迭代次数 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的无监督聚类方法，以提高单细胞RNA测序数据中细胞亚群识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器（VGAE） | 单细胞RNA测序数据 | 九个公共数据集 |
| 7702 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Hezuo Pig Testis Cells
2024-Sep-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25189786
PMID:39337274
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了合作猪睾丸细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了合作猪睾丸细胞的转录组特征，揭示了不同细胞类型在精子发生过程中的动态变化 | 研究仅限于4个月大的成熟合作猪，未涵盖不同年龄段的合作猪 | 探究合作猪睾丸细胞在精子发生过程中的转录组变化 | 合作猪睾丸中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16,082个细胞 |
| 7703 | 2024-10-01 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Dynamic Cellular Processes in Corneal Epithelium During Wound Healing in Cynomolgus Monkeys
2024-Sep-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.11.43
PMID:39330987
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴角膜上皮细胞在伤口愈合过程中的细胞活动和转录变化 | 首次全面探索了非人灵长类动物角膜细胞在伤口愈合过程中的详细转录组特征 | NA | 揭示角膜伤口愈合过程中的动态调控机制 | 食蟹猴角膜上皮细胞在不同愈合阶段的细胞活动和转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 食蟹猴角膜边缘组织在未受伤、1天和3天愈合阶段的样本 |
| 7704 | 2024-10-01 |
ICOS-expressing Regulatory T Cells Influence the Composition of Antitumor CTL Populations
2024-Sep-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300154
PMID:38995175
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研究论文 | 研究探讨了ICOS在抗肿瘤T细胞反应和肿瘤进展中的作用，发现ICOS在调节性T细胞中的特异性敲除可以减少肿瘤负担并增加CD8+ CTLs的数量 | 首次揭示了ICOS在调节性T细胞中对CTL成熟过程的抑制作用，并提出了ICOS激动剂抗体在低调节性T细胞肿瘤中的潜在治疗效果 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，结果可能不完全适用于人类 | 探讨ICOS在抗肿瘤T细胞反应中的作用及其对肿瘤进展的影响 | ICOS在调节性T细胞和所有T细胞中的特异性敲除对肿瘤进展的影响 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 实验小鼠模型 |
| 7705 | 2024-10-01 |
IFIT3 mediates TBK1 phosphorylation to promote activation of pDCs and exacerbate systemic sclerosis in mice
2024-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1800
PMID:39305055
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研究论文 | 研究IFIT3/TBK1信号通路在激活浆细胞样树突状细胞（pDCs）及其在系统性硬化症（SSc）发展中的作用 | 揭示了IFIT3作为TBK1的上游调节因子，通过干预IFIT3/TBK1信号通路抑制pDC激活和纤维母细胞功能，为SSc提供了新的治疗靶点 | NA | 评估IFIT3/TBK1信号通路在激活pDCs和系统性硬化症（SSc）发展中的作用 | 浆细胞样树突状细胞（pDCs）和系统性硬化症（SSc） | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和高通量转录组RNA测序 | NA | RNA | 构建了IFIT3-/-小鼠模型 |
| 7706 | 2024-10-01 |
Imprinting as Basis for Complex Evolutionary Novelties in Eutherians
2024-Aug-31, Biology
DOI:10.3390/biology13090682
PMID:39336109
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综述 | 本文综述了基因组印记在真兽类进化中的作用及其对复杂进化新奇性的影响 | 提出基因组印记不仅是基因剂量控制的机制，还增加了细胞多样性和可塑性，并促进了进化新奇性如胎盘和真兽类大脑的进化扩展 | NA | 探讨基因组印记在真兽类进化中的作用及其对复杂进化新奇性的影响 | 基因组印记及其在真兽类中的表现 | NA | NA | 单细胞转录组分析和表观遗传研究 | NA | NA | NA |
| 7707 | 2024-10-01 |
Type I Interferonopathy among Non-Elderly Female Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19
2024-Aug-28, Viruses
DOI:10.3390/v16091369
PMID:39339845
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研究论文 | 研究探讨了非老年女性COVID-19后遗症患者中可能的免疫机制 | 发现了与不受控制的I型干扰素信号激活相关的CD14STAT2单核细胞亚群 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及临床干预或治疗效果 | 探索COVID-19后遗症在非老年女性患者中的免疫机制 | 非老年女性COVID-19后遗症患者及其免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 非老年女性COVID-19后遗症患者及急性感染患者的血液样本，以及年龄和性别匹配的非后遗症患者和健康对照 |
| 7708 | 2024-10-01 |
Factors Affecting Cell Viability during the Enzymatic Dissociation of Human Endocrine Tumor Tissues
2024-Aug-27, Biology
DOI:10.3390/biology13090665
PMID:39336093
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研究论文 | 研究了酶解法分离人内分泌肿瘤组织过程中影响细胞活力的因素 | 探讨了不同酶解参数对不同类型肿瘤细胞活力的影响，强调了优化组织消化协议的重要性 | 未详细说明具体的优化方法和实验结果 | 研究酶解法分离人内分泌肿瘤组织过程中影响细胞活力的因素 | 人内分泌肿瘤组织及其细胞 | 数字病理学 | 内分泌肿瘤 | 酶解法 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 7709 | 2024-10-01 |
Helicobacter pylori CagA Promotes the Formation of Gallstones by Increasing the Permeability of Gallbladder Epithelial Cells
2024 May-Jun, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.13100
PMID:38873839
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研究论文 | 研究了幽门螺杆菌CagA通过增加胆囊上皮细胞的通透性促进胆结石形成的作用 | 首次发现幽门螺杆菌CagA是导致胆结石形成的关键致病因素 | 研究主要基于小鼠模型和少量患者样本，需要进一步的人体研究验证 | 探索导致慢性炎症和胆结石形成的关键致病菌及其机制 | 胆结石患者和小鼠模型的胆囊上皮细胞 | NA | 胆结石 | 单细胞转录组测序、bulk转录组测序、16S rRNA测序 | NA | 转录组数据、微生物组数据 | 6名胆结石患者和6名肝移植供体的胆囊黏膜样本，以及胆结石小鼠模型 |
| 7710 | 2024-10-01 |
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03475-7
PMID:37382633
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响 | 首次探讨了在CAR T细胞制造过程中敲除CD70对T细胞扩增、存活和抗肿瘤效果的影响 | 研究仅限于实验室环境，尚未在临床上验证其效果 | 探讨CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响，为CAR T细胞治疗T细胞癌症提供指导 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞的制造和抗肿瘤能力 | 细胞治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞 |
| 7711 | 2024-10-01 |
Identification of an antigen-presenting cells/T/NK cells-related gene signature to predict prognosis and CTSL to predict immunotherapeutic response for lung adenocarcinoma: an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03485-5
PMID:37458771
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研究论文 | 本研究旨在通过综合分析bulk和单细胞RNA测序数据，识别与抗原呈递细胞（APC）/T/NK细胞相关的基因特征（ATNKGS）和潜在的免疫细胞相关基因（IRGs），以实现肺癌腺癌（LUAD）患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 本研究首次构建了一个包含16个基因的ATNKGS，用于预测LUAD患者的总体生存率，并揭示了CTSL在免疫治疗反应预测中的重要作用 | 本研究主要基于公共数据集和外部免疫治疗队列进行验证，未来需要更多的临床试验数据来进一步验证这些发现 | 识别与APC/T/NK细胞相关的基因特征和潜在的免疫细胞相关基因，以实现LUAD患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 肺癌腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | 1108名患者 |
| 7712 | 2024-10-01 |
Female Gene Networks Are Expressed in Myofibroblast-Like Smooth Muscle Cells in Vulnerable Atherosclerotic Plaques
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319325
PMID:37589136
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研究论文 | 研究探讨了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达 | 首次揭示了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达，并识别了两个主要的平滑肌细胞基因调控网络 | 研究主要集中在人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型上，可能无法完全代表所有动脉粥样硬化情况 | 探讨女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的作用 | 人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类颈动脉斑块样本和Apoe-/-小鼠模型 |
| 7713 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用，能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型，并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序，可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7714 | 2024-10-01 |
Effects of 3-HAA on HCC by Regulating the Heterogeneous Macrophages-A scRNA-Seq Analysis
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202207074
PMID:37013458
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研究论文 | 研究3-HAA对肝细胞癌（HCC）的免疫调节作用及其对异质性巨噬细胞的影响 | 首次通过scRNA-Seq分析揭示了3-HAA在HCC中的免疫调节作用及其对巨噬细胞亚群的影响 | 研究仅限于实验模型，尚未在临床环境中验证 | 探讨3-HAA在肝细胞癌中的免疫调节作用 | 3-HAA对HCC模型中巨噬细胞亚群的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及HCC模型的多个细胞亚群 |
| 7715 | 2024-10-01 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535410
PMID:37066368
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研究论文 | 研究了与结直肠癌相关的关键病原体如何促进致癌重编程 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了Fn和ETBF在结直肠癌模型小鼠中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨关键病原体在结直肠癌中的作用及其对上皮细胞和局部免疫细胞的影响 | 结直肠癌患者肠道微生物群中的Fn和ETBF | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和结直肠癌模型小鼠 |
| 7716 | 2024-10-01 |
A method for low-coverage single-gamete sequence analysis demonstrates adherence to Mendel's first law across a large sample of human sperm
2022-12-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76383
PMID:36475543
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研究论文 | 开发了一种名为rhapsodi的方法，用于分析低覆盖率的单配子测序数据，并验证了人类精子样本中孟德尔第一定律的遵守情况 | 提出了rhapsodi方法，利用稀疏的配子基因型数据进行二倍体基因组分型、缺失基因型推断和减数分裂重组断点的发现 | 研究主要集中在人类精子样本，可能不适用于其他物种或组织类型 | 验证孟德尔分离定律在人类精子中的遵守情况，并开发新的方法来分析低覆盖率的单配子测序数据 | 人类精子样本中的基因型数据和减数分裂重组事件 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因型数据 | 41,189个精子细胞，来自25名捐赠者 |
| 7717 | 2024-10-01 |
Single cell analysis of spondyloarthritis regulatory T cells identifies distinct synovial gene expression patterns and clonal fates
2021-12-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02931-3
PMID:34907325
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研究论文 | 研究分析了强直性脊柱炎和银屑病关节炎患者的外周血和滑液中的调节性T细胞的单细胞转录组 | 首次详细描述了炎症部位调节性T细胞的亚群特征，并发现了具有细胞毒性标志物的CD8+调节性T细胞亚群和IL-10及LAG-3表达的Th17样调节性T细胞亚群 | 研究样本仅限于少数患者，可能影响结果的普适性 | 探讨炎症部位调节性T细胞的表型和功能特征 | 强直性脊柱炎和银屑病关节炎患者的调节性T细胞 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 16,000多个调节性T细胞样本，来自5名患者 |
| 7718 | 2024-10-01 |
Single-cell classification using graph convolutional networks
2021-Jul-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04278-2
PMID:34238220
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研究论文 | 本文提出了一种名为sigGCN的多模态端到端深度学习模型，用于细胞分类，结合了图卷积网络（GCN）和神经网络来利用基因相互作用网络 | 本文的创新点在于将基因相互作用网络与基因表达数据结合，通过图卷积网络方法提取有效特征，从而提高细胞分类的性能 | NA | 研究目的是通过结合基因相互作用网络和基因表达数据，提高细胞分类的准确性 | 研究对象是单细胞RNA测序（scRNAseq）数据中的细胞分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | NA |
| 7719 | 2024-10-01 |
μCB-seq: microfluidic cell barcoding and sequencing for high-resolution imaging and sequencing of single cells
2020-11-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d0lc00169d
PMID:32931539
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研究论文 | 本文介绍了一种名为μCB-seq的微流控细胞条形码和测序平台，用于高分辨率成像和单细胞测序 | μCB-seq通过一种新的制造方法，在微流控设备的可寻址反应室中预加载带有已知条形码序列的引物，从而实现了单细胞的高分辨率成像和测序 | NA | 结合单细胞RNA测序和光学成像，提供全面的单细胞分析，整合基因表达谱和细胞状态表征 | 单细胞 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像和文本 | NA |
| 7720 | 2024-10-01 |
A Single-Cell RNA Expression Map of Human Coronavirus Entry Factors
2020-May-27, SSRN
DOI:10.2139/ssrn.3611279
PMID:32714119
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据分析了人类冠状病毒进入因子在不同健康人体组织中的表达情况 | 首次构建了人类冠状病毒进入因子在多种健康人体组织中的单细胞RNA表达图谱，揭示了SARS-CoV-2在不同器官中的潜在感染路径 | 研究主要基于健康人体组织的单细胞RNA测序数据，未涉及疾病状态下的组织样本 | 预测人类冠状病毒的宿主嗜性，并分析其在不同人体组织中的潜在感染路径 | 人类冠状病毒进入因子在不同健康人体组织中的表达情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 28个SCARFs，涵盖多种健康人体组织 |