单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7681 - 7700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7681 | 2025-10-06 |
Macrophage sensitivity to bexmarilimab-induced reprogramming is shaped by the tumor microenvironment
2025-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011292
PMID:40379271
|
研究论文 | 本研究探索了肿瘤微环境对bexmarilimab诱导的巨噬细胞重编程敏感性的影响 | 首次利用乳腺癌患者来源的外植体培养模型，结合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了肿瘤微环境炎症状态是bexmarilimab治疗反应的主要决定因素 | 研究基于体外模型，需要进一步临床验证 | 探索肿瘤微环境对巨噬细胞重编程治疗敏感性的影响机制 | 乳腺癌患者来源的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 多重细胞因子分析 | 患者来源外植体培养模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞因子数据 | 乳腺癌患者肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7682 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of bone marrow reveals the immune response mechanisms of lymphocytes under avian leukosis virus subgroup J infection
2025-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104995
PMID:40121758
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析禽白血病病毒J亚型感染下鸡骨髓淋巴细胞的免疫应答机制 | 首次在单细胞水平揭示ALV-J感染下骨髓淋巴细胞各亚群的免疫应答特征，发现Rho家族GTP酶信号通路在病毒感染细胞中的激活 | 仅分析了骨髓淋巴细胞，未涉及其他免疫器官；样本量有限 | 探究ALV-J感染下骨髓淋巴细胞的免疫应答机制 | 鸡骨髓淋巴细胞 | 单细胞测序 | 禽白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7683 | 2025-10-06 |
Neural ensembles that encode nocifensive mechanical and heat pain in mouse spinal cord
2025-May, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01921-6
PMID:40128392
|
研究论文 | 本研究通过遗传捕获、活性操纵和单细胞RNA测序技术，识别了小鼠脊髓中编码机械性和热痛的不同神经集群 | 首次在成年小鼠脊髓中识别出分别编码机械性和热痛的特异性神经集群，并发现多模态Gal抑制神经元在疼痛传导中的门控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索脊髓神经回路如何区分不同性质的有害信息 | 成年小鼠脊髓神经回路 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 遗传捕获、活性操纵、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 成年小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7684 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics profiling uncovers the immune heterogeneity in HIV-infected immunological non-responders
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105667
PMID:40184908
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示HIV感染免疫无应答者的免疫异质性 | 开发了scGeneANOVA差异基因分析工具和VILDA病毒转录本检测工具，首次在单细胞水平系统揭示INRs的干扰素信号通路失调机制 | 样本量相对有限，研究仅基于外周血单个核细胞，未涉及组织驻留免疫细胞 | 探究HIV感染免疫无应答者免疫重建失败的机制 | HIV感染免疫无应答者(INRs)、免疫应答者(IRs)和健康对照(HCs)的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | 混合模型差异基因分析工具(scGeneANOVA) | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | INRs、IRs和HCs的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | NA |
| 7685 | 2025-10-06 |
Bifunctional chemokine-nanobody fusion protein enhances neutrophil recruitment to impede Acanthamoeba immune evasion
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105685
PMID:40222104
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示棘阿米巴角膜炎的免疫逃避机制，并开发了双功能纳米抗体-趋化因子融合蛋白增强中性粒细胞招募 | 首次发现棘阿米巴通过抑制CXCL通路减少中性粒细胞招募的免疫逃避机制，并创新性地开发了具有双重功能的抗体-趋化因子融合蛋白 | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证 | 研究棘阿米巴角膜炎的免疫景观，开发免疫治疗新方法 | 角膜炎患者角膜组织（棘阿米巴、真菌和细菌性角膜炎各3例） | 数字病理学 | 角膜炎 | 单细胞转录组测序，生物信息学分析，CellChat分析，纳米抗体筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9例患者角膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7686 | 2025-10-06 |
CKAP5 deficiency induces premature ovarian insufficiency
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105718
PMID:40252251
|
研究论文 | 本研究揭示了CKAP5基因缺陷通过影响自噬和DNA损伤修复导致早发性卵巢功能不全的机制 | 首次发现CKAP5是卵巢衰老的关键枢纽基因，并阐明其通过ATG7促进自噬和通过ATM支持DNA损伤修复的双重调控机制 | 样本量相对有限，需要更大规模的人群验证CKAP5变异与POI的关联 | 阐明CKAP5在卵巢功能和生育能力调控中的作用 | 人类颗粒细胞、POI患者、Ckap5杂合敲除小鼠 | 生殖医学 | 早发性卵巢功能不全 | bulk RNA测序, 单细胞转录组分析, 下一代测序, 基因负荷分析 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据, 转录组数据 | POI患者和对照个体的下一代测序队列，杂合Ckap5敲除小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 7687 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics of tertiary lymphoid organ-like structures in human atherosclerotic plaques
2025-May, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00639-9
PMID:40295810
|
研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组技术揭示了人类动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官样结构的存在特征及其临床意义 | 首次构建人类动脉粥样硬化斑块的空间分辨单细胞转录组图谱，发现斑块三级淋巴器官并揭示其与脑血管事件的关联机制 | 研究样本量有限，斑块三级淋巴器官在疾病中的具体作用机制仍需进一步验证 | 探索人类动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官的结构特征和免疫功能 | 人类动脉粥样硬化斑块组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7688 | 2025-10-06 |
Cell Type Resolved Expression of Duplicate Genes Retained From Whole Genome Duplication in Atlantic salmon
2025-Apr-30, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf076
PMID:40305003
|
研究论文 | 利用单细胞转录组技术研究大西洋鲑鱼肝脏组织中全基因组复制保留的重复基因在不同细胞类型中的表达模式 | 首次在单细胞水平上分析鲑鱼全基因组复制保留的重复基因在不同细胞类型中的表达差异和细菌感染响应 | 仅研究肝脏组织，未涉及其他组织类型；统计功效可能受限 | 探究全基因组复制事件后重复基因在不同细胞类型中的表达模式和功能演化 | 大西洋鲑鱼肝脏组织中的重复基因对 | 单细胞生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7689 | 2025-10-06 |
Disruption of GPSM1/CSF1 signaling reprograms tumor-associated macrophages to overcome anti-PD-1 resistance in colorectal cancer
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010826
PMID:40010765
|
研究论文 | 本研究揭示了GPSM1通过调控肿瘤相关巨噬细胞极化介导结直肠癌抗PD-1耐药的新机制 | 首次发现GPSM1/USP9X/MEIS3信号轴通过驱动巨噬细胞M2极化导致抗PD-1耐药，并鉴定出鲁索替尼作为潜在治疗候选药物 | 研究主要基于临床样本和动物模型，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索GPSM1在结直肠癌抗PD-1耐药中的作用机制及潜在治疗策略 | 结直肠癌患者肿瘤样本、C57BL/6小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,质谱流式,流式细胞术,ChIP-PCR,质谱分析,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 抗PD-1耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7690 | 2025-10-06 |
Infants display reduced NK cell responses in RSV and increased inflammatory responses in SARS-CoV-2 infections
2025-Jan-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5640872/v1
PMID:39877087
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术比较了婴儿对RSV和SARS-CoV-2感染的免疫反应差异 | 首次在婴儿群体中同时使用单细胞转录组学、表观基因组学和细胞因子分析系统比较两种呼吸道病毒的免疫反应特征 | 样本量相对有限（RSV 19例，SARS-CoV-2 30例，健康对照17例），且研究对象仅限于婴儿群体 | 探究RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中引发不同临床严重程度的免疫机制 | 婴儿血液样本（中位年龄2.3个月） | 免疫学 | 呼吸道感染 | 单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，细胞因子分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，表观基因组数据，细胞因子数据 | RSV感染19例，SARS-CoV-2感染30例，健康对照17例 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 7691 | 2025-10-06 |
Spatio-temporal transcriptomics of chromothriptic SHH-medulloblastoma identifies multiple genetic clones that resist treatment and drive relapse
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54709-w
PMID:39609432
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析染色体碎裂型SHH髓母细胞瘤，揭示了其空间异质性特征和治疗抵抗机制 | 首次应用空间转录组学技术系统分析染色体碎裂型髓母细胞瘤的空间异质性，识别出多个遗传克隆在治疗抵抗和复发中的作用 | 样本量相对有限（13例肿瘤和11个PDX样本），需要更大规模研究验证发现 | 探索染色体碎裂型髓母细胞瘤的分子特征和侵袭性决定因素 | 染色体碎裂型和非染色体碎裂型髓母细胞瘤患者样本及患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 13例髓母细胞瘤样本和11个患者来源异种移植样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7692 | 2025-10-06 |
C/EBPβ-dependent autophagy inhibition hinders NK cell function in cancer
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54355-2
PMID:39609420
|
研究论文 | 本研究揭示自噬是NK细胞抗肿瘤功能的核心调节因子，并发现C/EBPβ依赖的自噬抑制会阻碍NK细胞在癌症中的功能 | 首次发现自噬作为NK细胞内的检查点，并通过CXCL12-CXCR4-C/EBPβ信号轴阐明其调控机制 | 研究主要基于前列腺癌模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索癌症如何导致NK细胞功能失调及克服免疫治疗抵抗的机制 | 肿瘤浸润NK细胞、人类前列腺癌患者样本、多种小鼠癌症模型 | 免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据 | 晚期人类前列腺癌患者样本及多种小鼠癌症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7693 | 2025-10-06 |
Transcription factors ASCL1 and OLIG2 drive glioblastoma initiation and co-regulate tumor cell types and migration
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54750-9
PMID:39609428
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤发生发展中的协同调控作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤形成中具有冗余功能，并共同调控肿瘤细胞类型和迁移能力 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤发生和异质性调控中的作用机制 | 小鼠脑室下区祖细胞和胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7694 | 2025-10-06 |
Spatial Pathomics Toolkit for Quantitative Analysis of Podocyte Nuclei with Histology and Spatial Transcriptomics Data in Renal Pathology
2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
DOI:10.1117/12.3006318
PMID:40375953
|
研究论文 | 开发并应用空间病理组学工具包(SPT)对肾病理中的足细胞核进行定量分析 | 提出首个整合组织学和空间转录组学数据的足细胞空间病理组学分析工具包 | 未提及具体样本量限制或验证范围 | 开发定量分析工具以促进肾病理中细胞空间病理组学研究 | 肾小球足细胞核 | 数字病理 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, 病理图像分析 | 实例对象分割模型 | 全切片图像(WSI), 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7695 | 2025-10-06 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
|
研究论文 | 本研究揭示bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤起始、迁移和细胞类型调控中的核心作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中功能冗余地启动肿瘤形成，并通过动态水平和相互结合调控肿瘤细胞类型与迁移程度 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤异质性和细胞层级调控中的作用机制 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞和胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7696 | 2025-10-06 |
Faecalibacterium prausnitzii prevents age-related heart failure by suppressing ferroptosis in cardiomyocytes through butyrate-mediated LCN2 regulation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2505119
PMID:40364435
|
研究论文 | 本研究揭示了普拉梭菌通过丁酸盐介导的LCN2调控抑制心肌细胞铁死亡，从而预防年龄相关性心力衰竭的机制 | 首次发现年龄相关肠道菌群失调通过铁死亡途径驱动心力衰竭，并阐明普拉梭菌及其代谢产物丁酸盐的保护作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类中的直接证据仍需进一步验证 | 探索年龄相关肠道菌群改变与老年人心力衰竭之间的潜在联系 | 老年个体、心力衰竭患者、大鼠模型、心肌细胞 | 微生物组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 16S rRNA测序, PCR, 基因编辑 | 动物模型 | 基因表达数据, 微生物组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 7697 | 2025-10-06 |
Intratumoral Fusobacterium nucleatum Recruits Tumor-Associated Neutrophils to Promote Gastric Cancer Progression and Immune Evasion
2025-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2580
PMID:39992708
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内具核梭杆菌通过招募肿瘤相关中性粒细胞促进胃癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次发现具核梭杆菌通过激活IL17/NF-κB/RelB信号通路招募肿瘤相关中性粒细胞，并促进其分化为促肿瘤亚型 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究肿瘤内微生物群在胃癌恶性进展中对肿瘤免疫微环境的影响 | 胃癌组织和具核梭杆菌感染的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16S rRNA扩增子测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据,组织样本 | 人类胃癌组织样本和小鼠模型 | NA | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7698 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040
PMID:40029262
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化 | 首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤转录异质性、克隆进化及免疫抑制微环境，并鉴定出TSPAN8作为潜在治疗靶点 | 样本量较小（7名未治疗患者），循环肿瘤细胞分析使用独立队列 | 深入理解尤文肉瘤肿瘤异质性并探索新的治疗策略 | 尤文肉瘤患者原发肿瘤、肿瘤微环境和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，拷贝数分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 7名未治疗尤文肉瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7699 | 2025-10-06 |
IGFBP3 enhances adipose-derived stem cell function in soft tissue injury repair via ITGB1 and ERK pathway activation
2025-May-15, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10024-8
PMID:40369223
|
研究论文 | 本研究揭示了IGFBP3通过增强ITGB1表达和激活ERK通路促进脂肪来源干细胞修复软组织损伤的分子机制 | 首次结合单细胞多组学技术和3D生物打印模型系统阐明IGFBP3在ADSCs修复软组织损伤中的功能机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究IGFBP3蛋白在脂肪来源干细胞修复软组织损伤中的分子机制 | 脂肪来源干细胞(ADSCs)和软组织损伤模型 | 组织工程与再生医学 | 软组织损伤 | 单细胞RNA测序, 3D生物打印, 慢病毒转染, 傅里叶变换红外光谱, X射线衍射, SEM, TEM | 动物模型, 3D生物打印模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠软组织损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 3D生物打印 | NA | NA |
| 7700 | 2025-10-06 |
scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia
2025-May-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97958
PMID:40371706
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示支持细胞在非梗阻性无精子症中介导精子发生障碍的阶段特异性通讯机制 | 识别了12种生殖细胞亚型和8种支持细胞亚型，发现三种新型支持细胞亚型表型，揭示了生殖细胞与支持细胞亚型间阶段特异性匹配的相互作用模式 | 样本量相对有限，研究主要聚焦于睾丸组织，未涉及其他生殖系统组织 | 探究非梗阻性无精子症中精子发生障碍的细胞类型特异性异常机制 | 梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |