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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7681 | 2025-10-06 |
Novel exosome-associated LncRNA model predicts colorectal cancer prognosis and drug response
2025-May-16, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00445-0
PMID:40380258
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研究论文 | 基于外泌体相关lncRNA构建结直肠癌预后预测模型并验证MIR4713HG的生物学功能 | 首次基于外泌体相关lncRNA构建结直肠癌预后预测模型,并深入揭示了MIR4713HG在肿瘤发生发展中的关键作用 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 开发结直肠癌预后预测模型并探索外泌体相关lncRNA的生物学功能 | 结直肠癌患者基因表达数据和临床数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 多变量Cox回归, SVM-REF算法 | 风险评分模型, 列线图模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-CRC队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
7682 | 2025-10-06 |
Resident CD24 +LCN2 + LPCs aggravate fibrosis and inflammatory progression via the recruitment of TPPP3 +COL10A1 + macrophages in NASH
2025-May-16, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025081
PMID:40380802
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研究论文 | 本研究揭示了驻留CD24+LCN2+肝祖细胞通过招募TPPP3+COL10A1+巨噬细胞加重NASH纤维化和炎症进展的机制 | 首次在人类NASH中鉴定出驻留CD24+LCN2+肝祖细胞群体,并发现其通过促进促炎性巨噬细胞亚型活化驱动纤维化进展 | 研究主要基于单细胞测序数据和计算分析,需要更多功能实验验证机制 | 探究NASH中肝祖细胞的分子表型及其调控机制 | 非酒精性脂肪性肝炎患者、NASH小鼠模型和人类NASH肝脏样本 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序, CellChat, NicheNet, RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | 临床NASH样本、NASH小鼠模型和人类NASH肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7683 | 2025-10-06 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2025-May-15, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
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研究论文 | 本文揭示了O-GlcNAc修饰通过稳定WTAP蛋白促进胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制 | 首次发现WTAP蛋白稳定性受O-GlcNAc修饰和去泛素化协同调控,并阐明其通过m6A依赖方式调控LOXL2促进肿瘤免疫微环境形成的双通路机制 | NA | 探究m6A甲基转移酶WTAP在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境形成中的作用机制 | 间质胶质母细胞瘤干细胞和髓系来源巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 质谱分析, RNA免疫沉淀, 共免疫沉淀 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
7684 | 2025-10-06 |
Channel synapse mediates neurotransmission of airway protective chemoreflexes
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.007
PMID:40187347
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研究论文 | 本研究发现了咽喉部Pou2f3化学感应细胞通过通道突触介导气道保护性化学反射的神经传递机制 | 首次在体内发现通道突触介导神经传递,识别了咽喉部Pou2f3化学感应细胞亚类作为气道保护性反射的化学感应终末器官 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 阐明气道保护性化学反射的神经机制 | 小鼠咽喉部化学感应细胞和迷走神经元 | 神经科学 | 呼吸道疾病 | 单细胞转录组学, 光遗传学, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7685 | 2025-10-06 |
Targeting Setdb1 in T cells induces transplant tolerance without compromising antitumor immunity
2025-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58841-z
PMID:40374612
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研究论文 | 本研究发现在T细胞中靶向Setdb1可诱导移植耐受而不损害抗肿瘤免疫力 | 首次揭示Setdb1缺失可在不削弱抗肿瘤免疫的情况下特异性抑制移植排斥反应,并发现胸腺中新型Treg细胞亚群 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床验证 | 探索在维持抗肿瘤免疫力同时实现移植耐受的新策略 | 小鼠T细胞,特别是调节性T细胞(Treg) | 免疫学 | 移植排斥,肿瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7686 | 2025-10-06 |
scRDEN: single-cell dynamic gene rank differential expression network and robust trajectory inference
2025-May-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01969-1
PMID:40374885
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研究论文 | 提出scRDEN方法用于单细胞动态基因排序差异表达网络构建和稳健的轨迹推断 | 将不稳定的基因表达值转换为相对稳定的基因-基因相互作用,提取差异表达顺序,并整合不同降维方法的表达特征 | NA | 深入理解细胞命运决定的异质性,分析动态调控变化并准确推断分化轨迹 | 人和小鼠细胞分化过程中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | scRDEN网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 五个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7687 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of acetylation-related gene NAT10 in colon cancer progression and immune evasion: implications for overcoming drug resistance
2025-May-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02617-w
PMID:40374962
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乙酰化相关基因NAT10在结肠癌进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法系统研究NAT10在结肠癌中的致病机制和免疫逃逸特性 | 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 阐明乙酰化相关基因在结肠癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 结肠癌患者样本中的上皮细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 全基因组关联分析 | 细胞-细胞相互作用模型, 生存分析模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 来自GSE132465、UCSC Xena、GeneCards和TCGA等公共数据库的结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
7688 | 2025-10-06 |
Atf3 + senescent chondrocytes mediate meniscus degeneration in aging
2025-May-15, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03566-z
PMID:40375324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了Atf3+衰老软骨细胞在衰老半月板退行性变中的关键作用及其通过ANGPTL4信号通路介导的机制 | 首次在衰老半月板中鉴定出Atf3+衰老软骨细胞这一关键致病细胞群,并发现其通过ANGPTL4-SDC4轴介导的信号通路驱动半月板退行性变 | 研究仅使用大鼠模型,样本量相对有限,需要进一步在人类组织中验证 | 阐明衰老半月板的细胞和分子机制,识别关键致病细胞群和信号通路 | 年轻(12周)和老年(24个月)大鼠的半月板组织 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织学分析, 流式细胞术 | Seurat, Monocle 2, CellChat | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 年轻和老年大鼠半月板组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7689 | 2025-10-06 |
Characterization and prognostic of CD8 + TIM3 + CD101 + T cells in glioblastoma multiforme
2025-May-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01390-1
PMID:40375334
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研究论文 | 本研究通过分析多形性胶质母细胞瘤中的CD8+TIM3+CD101+T细胞特征,建立了预后模型并探索了治疗策略 | 首次系统表征GBM中CCT细胞的基因表达特征,构建了包含22个基因特征的预后模型,并揭示了CD8+TIM3+CD101-T细胞向CCT细胞的分化轨迹 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 研究多形性胶质母细胞瘤中CCT细胞的分子特征及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 多形性胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,全基因组表达谱分析,功能富集分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据,单核苷酸突变数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
7690 | 2025-10-06 |
Macrophage sensitivity to bexmarilimab-induced reprogramming is shaped by the tumor microenvironment
2025-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011292
PMID:40379271
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研究论文 | 本研究探索了肿瘤微环境对bexmarilimab诱导的巨噬细胞重编程敏感性的影响 | 首次利用乳腺癌患者来源的外植体培养模型,结合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了肿瘤微环境炎症状态是bexmarilimab治疗反应的主要决定因素 | 研究基于体外模型,需要进一步临床验证 | 探索肿瘤微环境对巨噬细胞重编程治疗敏感性的影响机制 | 乳腺癌患者来源的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 多重细胞因子分析 | 患者来源外植体培养模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞因子数据 | 乳腺癌患者肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
7691 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of bone marrow reveals the immune response mechanisms of lymphocytes under avian leukosis virus subgroup J infection
2025-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104995
PMID:40121758
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析禽白血病病毒J亚型感染下鸡骨髓淋巴细胞的免疫应答机制 | 首次在单细胞水平揭示ALV-J感染下骨髓淋巴细胞各亚群的免疫应答特征,发现Rho家族GTP酶信号通路在病毒感染细胞中的激活 | 仅分析了骨髓淋巴细胞,未涉及其他免疫器官;样本量有限 | 探究ALV-J感染下骨髓淋巴细胞的免疫应答机制 | 鸡骨髓淋巴细胞 | 单细胞测序 | 禽白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7692 | 2025-10-06 |
Neural ensembles that encode nocifensive mechanical and heat pain in mouse spinal cord
2025-May, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01921-6
PMID:40128392
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研究论文 | 本研究通过遗传捕获、活性操纵和单细胞RNA测序技术,识别了小鼠脊髓中编码机械性和热痛的不同神经集群 | 首次在成年小鼠脊髓中识别出分别编码机械性和热痛的特异性神经集群,并发现多模态Gal抑制神经元在疼痛传导中的门控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探索脊髓神经回路如何区分不同性质的有害信息 | 成年小鼠脊髓神经回路 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 遗传捕获、活性操纵、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 成年小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7693 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics profiling uncovers the immune heterogeneity in HIV-infected immunological non-responders
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105667
PMID:40184908
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示HIV感染免疫无应答者的免疫异质性 | 开发了scGeneANOVA差异基因分析工具和VILDA病毒转录本检测工具,首次在单细胞水平系统揭示INRs的干扰素信号通路失调机制 | 样本量相对有限,研究仅基于外周血单个核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞 | 探究HIV感染免疫无应答者免疫重建失败的机制 | HIV感染免疫无应答者(INRs)、免疫应答者(IRs)和健康对照(HCs)的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | 混合模型差异基因分析工具(scGeneANOVA) | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | INRs、IRs和HCs的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | NA |
7694 | 2025-10-06 |
Bifunctional chemokine-nanobody fusion protein enhances neutrophil recruitment to impede Acanthamoeba immune evasion
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105685
PMID:40222104
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示棘阿米巴角膜炎的免疫逃避机制,并开发了双功能纳米抗体-趋化因子融合蛋白增强中性粒细胞招募 | 首次发现棘阿米巴通过抑制CXCL通路减少中性粒细胞招募的免疫逃避机制,并创新性地开发了具有双重功能的抗体-趋化因子融合蛋白 | 样本量较小(仅9例患者),需要更大规模研究验证 | 研究棘阿米巴角膜炎的免疫景观,开发免疫治疗新方法 | 角膜炎患者角膜组织(棘阿米巴、真菌和细菌性角膜炎各3例) | 数字病理学 | 角膜炎 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析,CellChat分析,纳米抗体筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9例患者角膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7695 | 2025-10-06 |
CKAP5 deficiency induces premature ovarian insufficiency
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105718
PMID:40252251
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研究论文 | 本研究揭示了CKAP5基因缺陷通过影响自噬和DNA损伤修复导致早发性卵巢功能不全的机制 | 首次发现CKAP5是卵巢衰老的关键枢纽基因,并阐明其通过ATG7促进自噬和通过ATM支持DNA损伤修复的双重调控机制 | 样本量相对有限,需要更大规模的人群验证CKAP5变异与POI的关联 | 阐明CKAP5在卵巢功能和生育能力调控中的作用 | 人类颗粒细胞、POI患者、Ckap5杂合敲除小鼠 | 生殖医学 | 早发性卵巢功能不全 | bulk RNA测序, 单细胞转录组分析, 下一代测序, 基因负荷分析 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据, 转录组数据 | POI患者和对照个体的下一代测序队列,杂合Ckap5敲除小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组分析 | NA | NA |
7696 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics of tertiary lymphoid organ-like structures in human atherosclerotic plaques
2025-May, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00639-9
PMID:40295810
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组技术揭示了人类动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官样结构的存在特征及其临床意义 | 首次构建人类动脉粥样硬化斑块的空间分辨单细胞转录组图谱,发现斑块三级淋巴器官并揭示其与脑血管事件的关联机制 | 研究样本量有限,斑块三级淋巴器官在疾病中的具体作用机制仍需进一步验证 | 探索人类动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官的结构特征和免疫功能 | 人类动脉粥样硬化斑块组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
7697 | 2025-10-06 |
Cell Type Resolved Expression of Duplicate Genes Retained From Whole Genome Duplication in Atlantic salmon
2025-Apr-30, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf076
PMID:40305003
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研究论文 | 利用单细胞转录组技术研究大西洋鲑鱼肝脏组织中全基因组复制保留的重复基因在不同细胞类型中的表达模式 | 首次在单细胞水平上分析鲑鱼全基因组复制保留的重复基因在不同细胞类型中的表达差异和细菌感染响应 | 仅研究肝脏组织,未涉及其他组织类型;统计功效可能受限 | 探究全基因组复制事件后重复基因在不同细胞类型中的表达模式和功能演化 | 大西洋鲑鱼肝脏组织中的重复基因对 | 单细胞生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7698 | 2025-10-06 |
Disruption of GPSM1/CSF1 signaling reprograms tumor-associated macrophages to overcome anti-PD-1 resistance in colorectal cancer
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010826
PMID:40010765
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研究论文 | 本研究揭示了GPSM1通过调控肿瘤相关巨噬细胞极化介导结直肠癌抗PD-1耐药的新机制 | 首次发现GPSM1/USP9X/MEIS3信号轴通过驱动巨噬细胞M2极化导致抗PD-1耐药,并鉴定出鲁索替尼作为潜在治疗候选药物 | 研究主要基于临床样本和动物模型,尚未进行大规模临床试验验证 | 探索GPSM1在结直肠癌抗PD-1耐药中的作用机制及潜在治疗策略 | 结直肠癌患者肿瘤样本、C57BL/6小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,质谱流式,流式细胞术,ChIP-PCR,质谱分析,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 抗PD-1耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7699 | 2025-10-06 |
Infants display reduced NK cell responses in RSV and increased inflammatory responses in SARS-CoV-2 infections
2025-Jan-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5640872/v1
PMID:39877087
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术比较了婴儿对RSV和SARS-CoV-2感染的免疫反应差异 | 首次在婴儿群体中同时使用单细胞转录组学、表观基因组学和细胞因子分析系统比较两种呼吸道病毒的免疫反应特征 | 样本量相对有限(RSV 19例,SARS-CoV-2 30例,健康对照17例),且研究对象仅限于婴儿群体 | 探究RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中引发不同临床严重程度的免疫机制 | 婴儿血液样本(中位年龄2.3个月) | 免疫学 | 呼吸道感染 | 单细胞转录组学,单细胞表观基因组学,细胞因子分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,细胞因子数据 | RSV感染19例,SARS-CoV-2感染30例,健康对照17例 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
7700 | 2025-10-06 |
Spatio-temporal transcriptomics of chromothriptic SHH-medulloblastoma identifies multiple genetic clones that resist treatment and drive relapse
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54709-w
PMID:39609432
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析染色体碎裂型SHH髓母细胞瘤,揭示了其空间异质性特征和治疗抵抗机制 | 首次应用空间转录组学技术系统分析染色体碎裂型髓母细胞瘤的空间异质性,识别出多个遗传克隆在治疗抵抗和复发中的作用 | 样本量相对有限(13例肿瘤和11个PDX样本),需要更大规模研究验证发现 | 探索染色体碎裂型髓母细胞瘤的分子特征和侵袭性决定因素 | 染色体碎裂型和非染色体碎裂型髓母细胞瘤患者样本及患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 13例髓母细胞瘤样本和11个患者来源异种移植样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |