单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7681 - 7700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7681 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
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研究论文 | 开发了一种深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数，并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型，用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 |
| 7682 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
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综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差，适用于更丰富的样本，为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7683 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段，未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 |
| 7684 | 2024-10-02 |
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205097
PMID:36596693
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研究论文 | 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 | 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒，通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 | NA | 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制，并开发新的治疗方法 | 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单核细胞 |
| 7685 | 2024-10-02 |
Macrophage HIF-1α Is an Independent Prognostic Indicator in Kidney Cancer
2020-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3890
PMID:32586940
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞中的HIF-1α在肾癌中的独立预后作用 | 首次全面评估了HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性，并发现巨噬细胞中的HIF-1α与肿瘤进展和抗血管生成治疗的耐药性相关 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的临床相关性 | 评估HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织 | NA | 肾癌 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq），RNA原位杂交（RNA-ISH），免疫组化（IHC） | NA | 组织 | 380名患者的肿瘤组织，72名患者的验证样本，57名接受抗血管生成治疗的患者 |
| 7686 | 2024-10-01 |
Exposure to BaA inhibits trophoblast cell invasion and induces miscarriage by regulating the DEC1/ARHGAP5 axis and promoting ubiquitination-mediated degradation of MMP2
2024-Nov-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135594
PMID:39191013
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研究论文 | 研究探讨了苯并[a]蒽暴露通过调节DEC1/ARHGAP5轴和促进MMP2的泛素化降解，抑制滋养层细胞侵袭并导致流产的机制 | 首次揭示了苯并[a]蒽通过调节DEC1/ARHGAP5轴和MID1/MMP2途径导致流产的具体分子机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨苯并[a]蒽暴露导致复发性流产的分子机制 | 滋养层细胞和流产模型小鼠 | NA | 生殖系统疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 包括来自复发性流产女性的绒毛组织和苯并[a]蒽暴露的滋养层细胞 |
| 7687 | 2024-10-01 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-Oct, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，比较了在自身免疫介导的神经炎症模型中，反应性室管膜细胞和星形胶质细胞的转录组特征 | 揭示了在多种神经炎症背景下，室管膜细胞和星形胶质细胞反应性状态的保守基因特征 | 尚未探索驱动室管膜细胞反应性的机制及其下游功能后果 | 研究室管膜细胞在神经炎症中的反应性状态及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞在神经炎症中的反应性转录组特征 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7688 | 2024-10-01 |
Exploring the heterogeneity of interstitial cells of Cajal and their properties in gastrointestinal mesenchymal tumors applying single-cell RNA sequencing analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01372-8
PMID:39331193
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析探索胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性及其特性 | 揭示了胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性和干细胞特性，并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 研究胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的特性和分子机制 | 胃肠间质瘤中的间质细胞Cajal | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 34,861个细胞 |
| 7689 | 2024-10-01 |
Exploring copper metabolism-induced cell death in gastric cancer: a single-cell RNA sequencing study and prognostic model development
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01374-6
PMID:39331287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索胃癌中铜代谢诱导的细胞死亡，并开发基于铜代谢相关基因表达的预后模型 | 首次在单细胞水平上研究铜代谢在胃癌中的作用，并开发了基于铜代谢相关基因的预后模型 | NA | 研究胃癌中铜代谢的作用，并开发预后模型 | 胃癌组织和正常组织的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和随机生存森林 | RNA | NA |
| 7690 | 2024-10-01 |
Identification of immune patterns in idiopathic pulmonary fibrosis patients driven by PLA2G7-positive macrophages using an integrated machine learning survival framework
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73625-z
PMID:39333367
|
研究论文 | 本研究通过集成机器学习生存框架，识别特发性肺纤维化患者中由PLA2G7阳性巨噬细胞驱动的免疫模式 | 首次通过免疫相关风险评分（IRS）识别PLA2G7作为特发性肺纤维化的新型生物标志物，并验证了塞来昔布与PLA2G7的有效结合 | NA | 识别特发性肺纤维化患者中的新免疫模式和生物标志物，以改善早期诊断和干预 | 特发性肺纤维化患者及其免疫微环境 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞测序 | 集成机器学习框架 | 基因数据 | NA |
| 7691 | 2024-10-01 |
Deciphering the role of sphingolipid metabolism in the immune microenvironment and prognosis of esophageal cancer via single-cell sequencing and bulk data analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01379-1
PMID:39333432
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和批量数据分析，揭示了鞘脂代谢在食管癌免疫微环境和预后中的作用 | 结合单细胞和转录组数据，提供了与鞘脂代谢相关的可靠预后模型，并为食管鳞状细胞癌的免疫治疗和药物治疗提供了遗传学层面的指导 | NA | 探讨鞘脂代谢在食管鳞状细胞癌中的作用及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌的鞘脂代谢相关基因及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO和TCGA的数据，分析了97个基因在食管鳞状细胞癌上皮细胞中的表达 |
| 7692 | 2024-10-01 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-Sep-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
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研究论文 | 介绍了一种合成的热稳定RNase抑制剂用于单细胞RNA测序 | 合成的RNase抑制剂SEQURNA在单细胞RNA测序中表现出与普遍使用的蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs）相等或更优的质量，并提供了更高的可重复性和通量，支持新的实验流程，包括在整个热循环过程中保留RNase抑制 | NA | 改进单细胞RNA测序中的RNA完整性保护 | 单细胞RNA测序中的RNA完整性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7693 | 2024-10-01 |
Construction of store-operated calcium entry-related gene signature for predicting prognosis and indicates immune microenvironment infiltration in stomach adenocarcinomas
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73324-9
PMID:39333689
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研究论文 | 研究构建了与存储操作钙进入相关的基因签名，用于预测胃腺癌的预后并指示免疫微环境浸润 | 首次系统研究了存储操作钙进入（SOCE）在胃腺癌（STAD）中的预后和免疫学价值 | NA | 开发一个风险模型，探索SOCE签名与临床特征、预后、肿瘤微环境（TME）以及对免疫治疗、化疗和靶向药物反应的相关性 | 胃腺癌（STAD）患者的SOCE相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA、GEO（GSE84437和GSE159929）、cBioPortal和TIMER数据库中的数据 |
| 7694 | 2024-10-01 |
scGAA: a general gated axial-attention model for accurate cell-type annotation of single-cell RNA-seq data
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73356-1
PMID:39333739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGAA的新型细胞类型注释模型，用于单细胞RNA测序数据的准确注释 | 提出了基于transformer框架的轴向注意力机制，将传统的自注意力机制分解为水平和垂直注意力，显著提高了计算效率，并集成了门控单元以增强基因间关系的捕捉 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释模型，以应对单细胞RNA测序数据的高维度和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | transformer | 基因表达数据 | NA |
| 7695 | 2024-10-01 |
Oncogenic ACSM6 impairs CD8+ T cell-based immune response in bladder cancer
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00657-y
PMID:39334304
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研究论文 | 研究了致癌基因ACSM6在膀胱癌中对CD8+ T细胞免疫反应的影响 | 发现ACSM6通过抑制CD8 T细胞的趋化性和肿瘤杀伤能力，导致非炎症性免疫微环境，从而影响膀胱癌的免疫治疗效果 | NA | 探讨ACSM6在膀胱癌免疫治疗中的作用及其作为预测膀胱癌进展的生物标志物的潜力 | 膀胱癌中的ACSM6表达及其对CD8+ T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7696 | 2024-10-01 |
Single-cell sequencing to multi-omics: technologies and applications
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00643-4
PMID:39334490
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在多组学中的应用 | 介绍了单细胞多组学技术的发展及其在生物学研究和临床应用中的最新进展 | 讨论了单细胞多组学技术的局限性和面临的挑战 | 探讨单细胞测序技术在多组学中的应用及其在生物学研究和临床中的潜力 | 单细胞RNA测序及其与其他多组学的结合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 7697 | 2024-10-01 |
Functional heterogeneity of cancer-associated fibroblasts with distinct neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00656-z
PMID:39334513
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研究论文 | 研究了食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞在术前治疗后的显著变化，并发现了与不良治疗反应相关的功能性成纤维细胞亚群 | 研究样本来自单一临床试验，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自术前抗PD1联合治疗临床试验的食管鳞状细胞癌样本 |
| 7698 | 2024-10-01 |
YTHDF1 in periaqueductal gray inhibitory neurons contributes to morphine withdrawal responses in mice
2024-Sep-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03634-2
PMID:39304892
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研究论文 | 本文研究了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的作用，及其对小鼠吗啡戒断反应的影响 | 首次揭示了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达上调与吗啡戒断反应的关系，并探讨了其通过调节NF-κB表达和磷酸化来调控吗啡戒断反应的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨YTHDF1在其他脑区或人类中的作用 | 探讨YTHDF1在吗啡戒断反应中的作用及其机制 | YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达及其对吗啡戒断反应的影响 | NA | NA | 腺相关病毒转染、单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57/BL6小鼠或转基因小鼠 |
| 7699 | 2024-10-01 |
Berberine Targets PKM2 to Activate the t-PA-Induced Fibrinolytic System and Improves Thrombosis
2024-Sep-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph17091219
PMID:39338381
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研究论文 | 研究探讨了小檗碱通过靶向PKM2激活t-PA诱导的纤溶系统，从而改善血栓形成的作用 | 首次揭示了小檗碱通过调节PKM2表达来影响纤溶系统中t-PA的表达，从而改善血栓形成 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步在临床试验中验证其效果 | 探讨小檗碱治疗动脉血栓的潜在机制 | 小檗碱对血栓形成的影响及其分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 质谱分析和单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质表达数据 | 使用大鼠作为实验对象，具体样本数量未明确提及 |
| 7700 | 2024-10-01 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 研究探讨了TRPC3通道在阿尔茨海默病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了TRPC3在阿尔茨海默病发病机制中的独特作用，并验证了其作为治疗靶点的有效性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨TRPC3在阿尔茨海默病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | TRPC3通道在阿尔茨海默病中的表达和功能 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、钙成像 | NA | RNA序列数据 | 包括阿尔茨海默病患者和小鼠模型的样本 |