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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7661 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54337-4
PMID:39604360
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 | 首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物,并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞 | 研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞,未涉及成人原代组织 | 鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物 | 人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和干细胞来源的窦房结细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7662 | 2025-10-06 |
Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54710-3
PMID:39592630
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研究论文 | 本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术,揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联 | 首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制 | 未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
7663 | 2025-10-06 |
HLA-A+ tertiary lymphoid structures with reactivated tumor infiltrating lymphocytes are associated with a positive immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02712-9
PMID:38762674
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研究论文 | 本研究探索了食管鳞状细胞癌中HLA-A阳性三级淋巴结构与免疫检查点阻断治疗反应的关系 | 首次发现HLA-A阳性三级淋巴结构及其驻留的肿瘤浸润淋巴细胞与食管鳞癌免疫治疗反应相关 | 样本量相对有限(42例初治组织和60例患者),需要更大规模研究验证 | 识别食管鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,数字空间分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 42例初治ESCC肿瘤组织和60例ESCC患者 | NanoString | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NanoString GeoMx数字空间分析仪 | NanoString GeoMx数字空间分析仪用于系统评估肿瘤微环境 |
7664 | 2025-10-06 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
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研究论文 | 本文揭示了单细胞RNA测序数据中激活型KIR基因表达被低估的原因是标准比对流程对KIR转录本的错误分配 | 首次系统性地识别并验证了单细胞RNA测序标准流程中KIR转录本错误分配的问题及其对激活型KIR表达量化的影响 | NA | 探究单细胞RNA测序数据中KIR基因表达量化的准确性问题 | 杀伤性免疫球蛋白样受体(KIR)转录本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7665 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing of stria vascularis cells in the adult Slc26a4-/- mouse
2023-06-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01549-0
PMID:37322474
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年Slc26a4-/-小鼠耳蜗血管纹细胞,揭示了pendrin表达细胞中pH调节因子的变化 | 首次在单细胞水平鉴定pendrin表达细胞和Kcnj10表达细胞,发现纺锤细胞中细胞外外泌体相关基因下调及膜联蛋白A1表达增加 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床应用需进一步验证 | 鉴定pendrin表达细胞中的pH调节因子,阐明耳蜗内淋巴pH失调的细胞致病机制 | 野生型和Slc26a4-/-小鼠的耳蜗血管纹细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 野生型和Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7666 | 2025-10-06 |
TransAnno-Net: A Deep Learning Framework for Accurate Cell Type Annotation of Mouse Lung Tissue Using Self-supervised Pretraining
2025-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108809
PMID:40315689
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研究论文 | 提出一种基于自监督预训练和Transformer架构的深度学习框架,用于小鼠肺组织单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 采用自监督预训练策略,利用大量未标记数据预训练模型,仅需少量标记数据进行微调,显著降低标注成本并提高模型效率和可迁移性 | 主要针对小鼠肺组织数据,在其他组织或物种中的适用性需要进一步验证 | 开发高效准确的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 小鼠肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 约100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7667 | 2025-10-06 |
DNA hypermethylation of PLTP mediated by DNMT3B aggravates vascular dysfunction in diabetic retinopathy via the AKT/GSK3β signaling pathway
2025-May-17, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01874-4
PMID:40380281
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研究论文 | 本研究揭示DNMT3B介导的PLTP基因DNA高甲基化通过AKT/GSK3β信号通路加重糖尿病视网膜病变中的血管功能障碍 | 首次发现DNMT3B介导的PLTP启动子高甲基化在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的关键作用机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 阐明PLTP在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的作用及DNA甲基化调控机制 | 人视网膜微血管内皮细胞和高糖处理的糖尿病小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序,转录组测序,免疫共沉淀,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白互作数据 | 细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
7668 | 2025-10-06 |
Anti-BCL2 therapy eliminates giant congenital melanocytic nevus by senolytic and immune induction
2025-May-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02247-2
PMID:40374605
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研究论文 | 本研究通过抗BCL2疗法成功消除巨大先天性黑色素细胞痣,揭示了衰老细胞清除和免疫诱导的双重作用机制 | 首次发现BCL2在GCMN的衰老细胞和增殖细胞中表达,并证明BCL2抑制剂通过衰老细胞清除和激活中性粒细胞免疫反应的双重机制治疗GCMN | 研究主要基于动物模型,需要进一步临床试验验证 | 开发治疗巨大先天性黑色素细胞痣的有效疗法 | 巨大先天性黑色素细胞痣患者样本、患者来源异种移植模型、转基因小鼠模型 | 疾病治疗研究 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、免疫染色、体外细胞毒性实验 | 患者来源异种移植模型、转基因动物模型 | 基因表达数据、组织学图像、细胞功能数据 | 多种基因突变的GCMN患者样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7669 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to identify the role of Aggrephagy-related genes in tumor microenvironment and key tumorigenesis factors of GB from the perspective of single-cell sequencing
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02431-4
PMID:40377747
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的作用及其与肿瘤发生的关系 | 首次从单细胞测序角度系统研究聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤中的作用,发现TUBA1C和UBB作为潜在治疗靶点 | NA | 揭示聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境和肿瘤发生中的关键作用 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞亚型 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序,非负矩阵分解,分子对接分析 | 非负矩阵分解 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7670 | 2025-10-06 |
Deciphering the interaction between the expression of LRP2 served as a mitochondrial metabolism-related gene and prognosis in colon cancer integrating multi-omics analysis
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02568-2
PMID:40377809
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨线粒体代谢相关基因LRP2在结肠癌中的表达及其预后价值 | 首次将LRP2鉴定为结肠癌中线粒体代谢相关关键基因,并系统验证其与预后、病理分期和药物敏感性的关联 | 研究样本量有限,机制研究深度不足,需要更多实验验证LRP2的具体作用机制 | 探索LRP2在结肠癌中的表达特征及其临床预后价值 | 结肠腺癌患者样本和结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞测序,转录组学,免疫组化,细胞增殖检测 | Cox回归分析,共识聚类 | 基因表达数据,临床数据,细胞实验数据 | TCGA数据库结肠癌样本和GEO数据库验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7671 | 2025-10-06 |
Sialyltransferase gene signature as a predictor of prognosis and therapeutic response in kidney renal clear cell carcinoma
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02566-4
PMID:40377806
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研究论文 | 本研究基于唾液酸转移酶相关基因构建了一个预测肾透明细胞癌预后和治疗反应的预后模型 | 首次基于唾液酸转移酶相关基因构建KIRC预后模型,并通过单细胞RNA测序分析揭示了唾液酸化在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发基于唾液酸转移酶相关基因的预后模型,预测KIRC患者的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | TCGA和ICGC数据库中的KIRC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7672 | 2025-10-06 |
The critical role of BMP signaling in gastric epithelial cell differentiation revealed by organoids
2025-May-16, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00237-x
PMID:40377813
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研究论文 | 本研究通过胃类器官模型揭示了BMP信号在胃上皮细胞分化中的关键作用 | 发现BMP4信号刺激pit细胞和壁细胞分化,鉴定Zbtb7b为pit细胞分化的新调控因子,并揭示小鼠与人类在壁细胞和主细胞分化要求上的差异 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体内验证 | 阐明胃上皮细胞分化的分子调控机制 | 小鼠和人类胃类器官 | 发育生物学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序,信号通路调控,类器官培养 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7673 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 induced immune perturbations in infants vary with disease severity and differ from adults' responses
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59411-z
PMID:40379618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了SARS-CoV-2感染婴儿与成人不同的免疫反应特征 | 首次系统研究重症COVID-19住院婴儿的免疫反应,发现婴儿T细胞和B细胞中干扰素刺激基因特征显著增强 | 样本量有限(26名感染婴儿),仅关注住院病例 | 解析SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应特征及其与疾病严重程度的关系 | SARS-CoV-2感染婴儿(n=26)和匹配对照组(n=14) | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 40名婴儿(26名感染者,14名对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7674 | 2025-10-06 |
Advances in spatial transcriptomics and its application in the musculoskeletal system
2025-May-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00429-w
PMID:40379648
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综述 | 总结空间转录组学技术进展及其在肌肉骨骼系统研究中的应用 | 系统梳理空间转录组学在肌肉骨骼系统研究中的最新应用,强调其在解析组织空间结构和细胞互作方面的独特优势 | NA | 探讨空间转录组学技术在肌肉骨骼系统研究中的应用现状与前景 | 肌肉骨骼系统 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
7675 | 2025-10-06 |
USP2 inhibition unleashes CD47-restrained phagocytosis and enhances anti-tumor immunity
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59621-5
PMID:40379682
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研究论文 | 本研究揭示USP2通过去泛素化稳定CD47蛋白,抑制USP2可促进CD47降解并重塑肿瘤微环境,从而增强抗PD-1免疫治疗效果 | 首次发现USP2通过去泛素化机制调控CD47稳定性,并证明靶向USP2-CD47轴可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性仍需进一步验证 | 探索CD47的调控机制并开发更有效的联合免疫疗法 | 肿瘤细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞等免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7676 | 2025-10-06 |
A novel LncRNA risk model for disulfidptosis-related prognosis prediction and response to chemotherapy in acute myeloid leukemia
2025-May-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01730-8
PMID:40379722
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研究论文 | 本研究构建了一个基于双硫死亡相关lncRNA的风险模型,用于预测急性髓系白血病患者的预后和化疗反应 | 首次将双硫死亡机制与AML预后预测相结合,建立了基于六个特异性DRLs的预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡与AML的关联,开发预后预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Cox回归分析,LASSO回归 | Cox比例风险模型,LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 从GEO数据库获取的AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7677 | 2025-10-06 |
M2-ApoBDs as a therapeutic strategy for systemic lupus erythematosus: targeted macrophage reprogramming and treg differentiation
2025-May-16, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03437-4
PMID:40380199
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研究论文 | 本研究探索通过M2巨噬细胞来源的凋亡小体靶向调控巨噬细胞重编程和Treg细胞分化治疗系统性红斑狼疮 | 首次发现M2-ApoBDs能选择性靶向脾脏并被脾巨噬细胞吞噬,通过单细胞RNA测序揭示其可触发M2巨噬细胞转录变化并促进Treg细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体验证疗效和安全性 | 开发系统性红斑狼疮的有效靶向治疗策略 | 系统性红斑狼疮小鼠模型、巨噬细胞、Treg细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、免疫学实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | SLE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7678 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal dynamic changes of meningeal microenvironment influence meningeal lymphatic function following subarachnoid hemorrhage: from inflammatory response to tissue remodeling
2025-May-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03460-0
PMID:40380229
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了蛛网膜下腔出血后脑膜微环境从炎症反应到组织重塑的时空动态变化及其对脑膜淋巴管功能的影响 | 首次系统揭示蛛网膜下腔出血后脑膜微环境的时空动态变化规律,发现胎盘生长因子(PGF)是促进脑膜淋巴管早期修复的关键因子 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究蛛网膜下腔出血后脑膜转录反应及微环境对脑膜淋巴管功能的动态影响 | 小鼠蛛网膜下腔出血模型中的脑膜组织 | 生物信息学 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
7679 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis deciphers the inflammatory microenvironment characterized by CXCL9+ fibroblasts and ACKR1+ endothelial cells in immune-related myocarditis
2025-May-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06551-x
PMID:40380233
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示免疫相关心肌炎中由CXCL9+成纤维细胞和ACKR1+内皮细胞特征的炎症微环境 | 首次在单细胞水平解析免疫相关心肌炎的炎症微环境,发现CXCL9+成纤维细胞和ACKR1+内皮细胞的关键作用 | 样本量有限,仅基于一例患者样本进行分析 | 阐明免疫相关心肌炎的病理机制并寻找潜在治疗靶点 | 免疫检查点抑制剂引发的免疫相关心肌炎患者心脏组织 | 单细胞转录组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例免疫相关心肌炎患者心内膜活检样本+正常供体心脏样本+小鼠模型数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7680 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals metabolic remodeling and functional specialization in the immune microenvironment of bone tumors
2025-May-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06346-0
PMID:40380260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示骨肿瘤免疫微环境中免疫细胞的代谢重塑和功能特化 | 首次在骨肿瘤微环境中系统揭示免疫细胞代谢重塑与功能特化的关系,发现FN1作为免疫协调的关键调节因子 | 样本量有限(13例),仅包含特定类型骨肿瘤 | 研究骨肿瘤微环境中免疫细胞的代谢重塑和功能特化机制 | 骨肿瘤(尤文氏肉瘤、骨肉瘤、骨巨细胞瘤)的免疫细胞 | 单细胞组学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例骨肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |