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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7661 | 2025-10-06 |
Deciphering the interaction between the expression of LRP2 served as a mitochondrial metabolism-related gene and prognosis in colon cancer integrating multi-omics analysis
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02568-2
PMID:40377809
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨线粒体代谢相关基因LRP2在结肠癌中的表达及其预后价值 | 首次将LRP2鉴定为结肠癌中线粒体代谢相关关键基因,并系统验证其与预后、病理分期和药物敏感性的关联 | 研究样本量有限,机制研究深度不足,需要更多实验验证LRP2的具体作用机制 | 探索LRP2在结肠癌中的表达特征及其临床预后价值 | 结肠腺癌患者样本和结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞测序,转录组学,免疫组化,细胞增殖检测 | Cox回归分析,共识聚类 | 基因表达数据,临床数据,细胞实验数据 | TCGA数据库结肠癌样本和GEO数据库验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7662 | 2025-10-06 |
Sialyltransferase gene signature as a predictor of prognosis and therapeutic response in kidney renal clear cell carcinoma
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02566-4
PMID:40377806
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研究论文 | 本研究基于唾液酸转移酶相关基因构建了一个预测肾透明细胞癌预后和治疗反应的预后模型 | 首次基于唾液酸转移酶相关基因构建KIRC预后模型,并通过单细胞RNA测序分析揭示了唾液酸化在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发基于唾液酸转移酶相关基因的预后模型,预测KIRC患者的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | TCGA和ICGC数据库中的KIRC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7663 | 2025-10-06 |
The critical role of BMP signaling in gastric epithelial cell differentiation revealed by organoids
2025-May-16, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00237-x
PMID:40377813
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研究论文 | 本研究通过胃类器官模型揭示了BMP信号在胃上皮细胞分化中的关键作用 | 发现BMP4信号刺激pit细胞和壁细胞分化,鉴定Zbtb7b为pit细胞分化的新调控因子,并揭示小鼠与人类在壁细胞和主细胞分化要求上的差异 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体内验证 | 阐明胃上皮细胞分化的分子调控机制 | 小鼠和人类胃类器官 | 发育生物学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序,信号通路调控,类器官培养 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7664 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 induced immune perturbations in infants vary with disease severity and differ from adults' responses
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59411-z
PMID:40379618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了SARS-CoV-2感染婴儿与成人不同的免疫反应特征 | 首次系统研究重症COVID-19住院婴儿的免疫反应,发现婴儿T细胞和B细胞中干扰素刺激基因特征显著增强 | 样本量有限(26名感染婴儿),仅关注住院病例 | 解析SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应特征及其与疾病严重程度的关系 | SARS-CoV-2感染婴儿(n=26)和匹配对照组(n=14) | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 40名婴儿(26名感染者,14名对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7665 | 2025-10-06 |
Advances in spatial transcriptomics and its application in the musculoskeletal system
2025-May-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00429-w
PMID:40379648
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综述 | 总结空间转录组学技术进展及其在肌肉骨骼系统研究中的应用 | 系统梳理空间转录组学在肌肉骨骼系统研究中的最新应用,强调其在解析组织空间结构和细胞互作方面的独特优势 | NA | 探讨空间转录组学技术在肌肉骨骼系统研究中的应用现状与前景 | 肌肉骨骼系统 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
7666 | 2025-10-06 |
USP2 inhibition unleashes CD47-restrained phagocytosis and enhances anti-tumor immunity
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59621-5
PMID:40379682
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研究论文 | 本研究揭示USP2通过去泛素化稳定CD47蛋白,抑制USP2可促进CD47降解并重塑肿瘤微环境,从而增强抗PD-1免疫治疗效果 | 首次发现USP2通过去泛素化机制调控CD47稳定性,并证明靶向USP2-CD47轴可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性仍需进一步验证 | 探索CD47的调控机制并开发更有效的联合免疫疗法 | 肿瘤细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞等免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7667 | 2025-10-06 |
A novel LncRNA risk model for disulfidptosis-related prognosis prediction and response to chemotherapy in acute myeloid leukemia
2025-May-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01730-8
PMID:40379722
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研究论文 | 本研究构建了一个基于双硫死亡相关lncRNA的风险模型,用于预测急性髓系白血病患者的预后和化疗反应 | 首次将双硫死亡机制与AML预后预测相结合,建立了基于六个特异性DRLs的预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡与AML的关联,开发预后预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Cox回归分析,LASSO回归 | Cox比例风险模型,LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 从GEO数据库获取的AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7668 | 2025-10-06 |
M2-ApoBDs as a therapeutic strategy for systemic lupus erythematosus: targeted macrophage reprogramming and treg differentiation
2025-May-16, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03437-4
PMID:40380199
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研究论文 | 本研究探索通过M2巨噬细胞来源的凋亡小体靶向调控巨噬细胞重编程和Treg细胞分化治疗系统性红斑狼疮 | 首次发现M2-ApoBDs能选择性靶向脾脏并被脾巨噬细胞吞噬,通过单细胞RNA测序揭示其可触发M2巨噬细胞转录变化并促进Treg细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体验证疗效和安全性 | 开发系统性红斑狼疮的有效靶向治疗策略 | 系统性红斑狼疮小鼠模型、巨噬细胞、Treg细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、免疫学实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | SLE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7669 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal dynamic changes of meningeal microenvironment influence meningeal lymphatic function following subarachnoid hemorrhage: from inflammatory response to tissue remodeling
2025-May-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03460-0
PMID:40380229
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了蛛网膜下腔出血后脑膜微环境从炎症反应到组织重塑的时空动态变化及其对脑膜淋巴管功能的影响 | 首次系统揭示蛛网膜下腔出血后脑膜微环境的时空动态变化规律,发现胎盘生长因子(PGF)是促进脑膜淋巴管早期修复的关键因子 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究蛛网膜下腔出血后脑膜转录反应及微环境对脑膜淋巴管功能的动态影响 | 小鼠蛛网膜下腔出血模型中的脑膜组织 | 生物信息学 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
7670 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis deciphers the inflammatory microenvironment characterized by CXCL9+ fibroblasts and ACKR1+ endothelial cells in immune-related myocarditis
2025-May-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06551-x
PMID:40380233
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示免疫相关心肌炎中由CXCL9+成纤维细胞和ACKR1+内皮细胞特征的炎症微环境 | 首次在单细胞水平解析免疫相关心肌炎的炎症微环境,发现CXCL9+成纤维细胞和ACKR1+内皮细胞的关键作用 | 样本量有限,仅基于一例患者样本进行分析 | 阐明免疫相关心肌炎的病理机制并寻找潜在治疗靶点 | 免疫检查点抑制剂引发的免疫相关心肌炎患者心脏组织 | 单细胞转录组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例免疫相关心肌炎患者心内膜活检样本+正常供体心脏样本+小鼠模型数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7671 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals metabolic remodeling and functional specialization in the immune microenvironment of bone tumors
2025-May-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06346-0
PMID:40380260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示骨肿瘤免疫微环境中免疫细胞的代谢重塑和功能特化 | 首次在骨肿瘤微环境中系统揭示免疫细胞代谢重塑与功能特化的关系,发现FN1作为免疫协调的关键调节因子 | 样本量有限(13例),仅包含特定类型骨肿瘤 | 研究骨肿瘤微环境中免疫细胞的代谢重塑和功能特化机制 | 骨肿瘤(尤文氏肉瘤、骨肉瘤、骨巨细胞瘤)的免疫细胞 | 单细胞组学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例骨肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7672 | 2025-10-06 |
Novel exosome-associated LncRNA model predicts colorectal cancer prognosis and drug response
2025-May-16, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00445-0
PMID:40380258
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研究论文 | 基于外泌体相关lncRNA构建结直肠癌预后预测模型并验证MIR4713HG的生物学功能 | 首次基于外泌体相关lncRNA构建结直肠癌预后预测模型,并深入揭示了MIR4713HG在肿瘤发生发展中的关键作用 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 开发结直肠癌预后预测模型并探索外泌体相关lncRNA的生物学功能 | 结直肠癌患者基因表达数据和临床数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 多变量Cox回归, SVM-REF算法 | 风险评分模型, 列线图模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-CRC队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
7673 | 2025-10-06 |
Resident CD24 +LCN2 + LPCs aggravate fibrosis and inflammatory progression via the recruitment of TPPP3 +COL10A1 + macrophages in NASH
2025-May-16, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025081
PMID:40380802
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研究论文 | 本研究揭示了驻留CD24+LCN2+肝祖细胞通过招募TPPP3+COL10A1+巨噬细胞加重NASH纤维化和炎症进展的机制 | 首次在人类NASH中鉴定出驻留CD24+LCN2+肝祖细胞群体,并发现其通过促进促炎性巨噬细胞亚型活化驱动纤维化进展 | 研究主要基于单细胞测序数据和计算分析,需要更多功能实验验证机制 | 探究NASH中肝祖细胞的分子表型及其调控机制 | 非酒精性脂肪性肝炎患者、NASH小鼠模型和人类NASH肝脏样本 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序, CellChat, NicheNet, RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | 临床NASH样本、NASH小鼠模型和人类NASH肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7674 | 2025-10-06 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2025-May-15, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
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研究论文 | 本文揭示了O-GlcNAc修饰通过稳定WTAP蛋白促进胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制 | 首次发现WTAP蛋白稳定性受O-GlcNAc修饰和去泛素化协同调控,并阐明其通过m6A依赖方式调控LOXL2促进肿瘤免疫微环境形成的双通路机制 | NA | 探究m6A甲基转移酶WTAP在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境形成中的作用机制 | 间质胶质母细胞瘤干细胞和髓系来源巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 质谱分析, RNA免疫沉淀, 共免疫沉淀 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
7675 | 2025-10-06 |
Channel synapse mediates neurotransmission of airway protective chemoreflexes
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.007
PMID:40187347
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研究论文 | 本研究发现了咽喉部Pou2f3化学感应细胞通过通道突触介导气道保护性化学反射的神经传递机制 | 首次在体内发现通道突触介导神经传递,识别了咽喉部Pou2f3化学感应细胞亚类作为气道保护性反射的化学感应终末器官 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 阐明气道保护性化学反射的神经机制 | 小鼠咽喉部化学感应细胞和迷走神经元 | 神经科学 | 呼吸道疾病 | 单细胞转录组学, 光遗传学, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7676 | 2025-10-06 |
Targeting Setdb1 in T cells induces transplant tolerance without compromising antitumor immunity
2025-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58841-z
PMID:40374612
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研究论文 | 本研究发现在T细胞中靶向Setdb1可诱导移植耐受而不损害抗肿瘤免疫力 | 首次揭示Setdb1缺失可在不削弱抗肿瘤免疫的情况下特异性抑制移植排斥反应,并发现胸腺中新型Treg细胞亚群 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床验证 | 探索在维持抗肿瘤免疫力同时实现移植耐受的新策略 | 小鼠T细胞,特别是调节性T细胞(Treg) | 免疫学 | 移植排斥,肿瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7677 | 2025-10-06 |
scRDEN: single-cell dynamic gene rank differential expression network and robust trajectory inference
2025-May-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01969-1
PMID:40374885
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研究论文 | 提出scRDEN方法用于单细胞动态基因排序差异表达网络构建和稳健的轨迹推断 | 将不稳定的基因表达值转换为相对稳定的基因-基因相互作用,提取差异表达顺序,并整合不同降维方法的表达特征 | NA | 深入理解细胞命运决定的异质性,分析动态调控变化并准确推断分化轨迹 | 人和小鼠细胞分化过程中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | scRDEN网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 五个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7678 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of acetylation-related gene NAT10 in colon cancer progression and immune evasion: implications for overcoming drug resistance
2025-May-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02617-w
PMID:40374962
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乙酰化相关基因NAT10在结肠癌进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法系统研究NAT10在结肠癌中的致病机制和免疫逃逸特性 | 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 阐明乙酰化相关基因在结肠癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 结肠癌患者样本中的上皮细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 全基因组关联分析 | 细胞-细胞相互作用模型, 生存分析模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 来自GSE132465、UCSC Xena、GeneCards和TCGA等公共数据库的结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
7679 | 2025-10-06 |
Atf3 + senescent chondrocytes mediate meniscus degeneration in aging
2025-May-15, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03566-z
PMID:40375324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了Atf3+衰老软骨细胞在衰老半月板退行性变中的关键作用及其通过ANGPTL4信号通路介导的机制 | 首次在衰老半月板中鉴定出Atf3+衰老软骨细胞这一关键致病细胞群,并发现其通过ANGPTL4-SDC4轴介导的信号通路驱动半月板退行性变 | 研究仅使用大鼠模型,样本量相对有限,需要进一步在人类组织中验证 | 阐明衰老半月板的细胞和分子机制,识别关键致病细胞群和信号通路 | 年轻(12周)和老年(24个月)大鼠的半月板组织 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织学分析, 流式细胞术 | Seurat, Monocle 2, CellChat | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 年轻和老年大鼠半月板组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7680 | 2025-10-06 |
Characterization and prognostic of CD8 + TIM3 + CD101 + T cells in glioblastoma multiforme
2025-May-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01390-1
PMID:40375334
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研究论文 | 本研究通过分析多形性胶质母细胞瘤中的CD8+TIM3+CD101+T细胞特征,建立了预后模型并探索了治疗策略 | 首次系统表征GBM中CCT细胞的基因表达特征,构建了包含22个基因特征的预后模型,并揭示了CD8+TIM3+CD101-T细胞向CCT细胞的分化轨迹 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 研究多形性胶质母细胞瘤中CCT细胞的分子特征及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 多形性胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,全基因组表达谱分析,功能富集分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据,单核苷酸突变数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |