单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27366 篇文献,本页显示第 7661 - 7680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
7661 2024-10-02
Metabolic and Immunological Implications of MME+CAF-Mediated Hypoxia Signaling in Pancreatic Cancer Progression: Therapeutic Insights and Translational Opportunities
2024-Sep-28, Biological procedures online IF:3.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,识别了胰腺癌中表达MME的CAF亚群(MMECAF),并探讨了其在胰腺癌进展中的代谢和免疫学作用 首次识别并验证了MMECAF亚群在胰腺癌微环境中的独特作用,并开发了针对MMECAF的抑制剂IOX2,结合化疗和免疫疗法,显示出良好的抗肿瘤效果 研究主要集中在体外和动物实验,尚未进行临床试验验证其疗效 探讨MMECAF在胰腺癌进展中的作用,并开发新的治疗策略 胰腺癌中的MMECAF亚群及其在肿瘤微环境中的作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 涉及胰腺癌患者的样本,具体数量未明确提及
7662 2024-10-02
Single-cell transcriptomics reveals e-cigarette vapor-induced airway epithelial remodeling and injury
2024-Sep-28, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 研究揭示了电子烟蒸汽引起的气道上皮重塑和损伤 首次通过单细胞转录组学分析了电子烟蒸汽提取物对人类支气管上皮细胞分化的影响,并发现Notch信号通路在其中的作用 研究仅限于特定的细胞类型和样本,可能无法全面代表所有电子烟使用者的影响 探讨电子烟使用对人类支气管上皮细胞的影响及其潜在机制 健康非吸烟者和慢性阻塞性肺病吸烟者的支气管上皮细胞 单细胞转录组学 慢性阻塞性肺病 单细胞RNA测序、免疫染色、HE染色、qPCR和ELISA NA RNA 健康非吸烟者、吸烟者和电子烟使用者的血清和痰液样本
7663 2024-10-02
Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis
2024-Sep-26, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究肌肉驻留间充质前体细胞通过GDNF-BDNF轴感知和修复周围神经损伤的机制 揭示了肌肉驻留间充质前体细胞(FAPs)在周围神经再生中的新作用及其响应神经损伤的分子机制 研究主要基于小鼠模型,临床相关性需进一步验证 探讨肌肉驻留间充质前体细胞在周围神经损伤修复中的作用及其分子机制 肌肉驻留间充质前体细胞(FAPs)及其在周围神经损伤后的响应和修复作用 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 小鼠模型
7664 2024-10-02
Plasma exosomes from individuals with type 2 diabetes drive breast cancer aggression in patient-derived organoids
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了来自2型糖尿病患者的血浆外泌体如何促进乳腺癌患者来源的类器官的侵袭性 首次在乳腺癌患者来源的类器官中保留了原生肿瘤浸润淋巴细胞,并使用单细胞RNA测序分析了外泌体信号对类器官的影响 NA 研究2型糖尿病患者的血浆外泌体对乳腺癌侵袭性的影响 乳腺癌患者来源的类器官和外泌体 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 来自2型糖尿病患者和非糖尿病患者的血浆外泌体样本
7665 2024-10-02
Deconvolution from bulk gene expression by leveraging sample-wise and gene-wise similarities and single-cell RNA-Seq data
2024-Sep-18, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 提出了一种新的去卷积算法DSSC,通过利用基因间和样本间的相似性以及单细胞RNA-Seq数据,同时推断异质样本的细胞类型特异性基因表达和细胞类型比例 DSSC算法能够同时推断细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达,并且在模拟和实验数据中表现出色 NA 开发更准确的去卷积方法以推断细胞类型丰度和细胞类型特异性基因表达 异质样本的细胞类型特异性基因表达和细胞类型比例 生物信息学 NA RNA-seq 去卷积算法 基因表达数据 NA
7666 2024-10-02
Anti-CTLA-4 m2a Antibody Exacerbates Cardiac Injury in Experimental Autoimmune Myocarditis Mice By Promoting Ccl5-Neutrophil Infiltration
2024-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究探讨了抗CTLA-4 m2a抗体在实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型中加重心脏损伤的机制 首次揭示了抗CTLA-4 m2a抗体通过促进Ccl5-中性粒细胞浸润加重心脏损伤的机制 研究仅限于实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型,尚未在临床患者中验证 阐明抗CTLA-4 m2a抗体在实验性自身免疫性心肌炎小鼠中加重心脏损伤的机制 实验性自身免疫性心肌炎小鼠 心血管疾病 心血管疾病 空间转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 转录组数据 实验性自身免疫性心肌炎小鼠
7667 2024-10-02
Complement Factor C1q Mediates Vascular Endothelial Dysfunction in STZ-Induced Diabetic Mice
2024-Sep-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 研究探讨了补体因子C1q在STZ诱导的糖尿病小鼠血管内皮功能障碍中的作用 首次揭示了C1qa在糖尿病相关内皮功能障碍中的关键作用,并通过AAV-Tie2-shRNA-C1qa抑制C1qa表达,改善了血管功能 研究仅限于STZ诱导的糖尿病小鼠模型,未探讨其他糖尿病模型或人类样本 比较正常和STZ诱导的糖尿病小鼠主动脉的细胞和分子特性,揭示内皮功能障碍的潜在机制 正常和STZ诱导的糖尿病小鼠的主动脉细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 32,573个细胞
7668 2024-10-02
ASIC1/RIP1 accelerates atherosclerosis via disrupting lipophagy
2024-Sep, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 研究探讨了ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其通过干扰脂噬机制的潜在机制 揭示了ASIC1与RIP1相互作用抑制脂噬,从而促进动脉粥样硬化的关键作用 NA 研究ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其机制 ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其与RIP1的相互作用 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA RNA 人类动脉粥样硬化病变区域和ApoE-/-小鼠模型
7669 2024-10-02
The Role of Activator Protein-1 Complex in Diabetes-Associated Atherosclerosis: Insights From Single-Cell RNA Sequencing
2024-Sep-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 研究了激活蛋白-1复合物在糖尿病相关动脉粥样硬化中的作用,通过单细胞RNA测序揭示了其在动脉粥样硬化病理中的新靶点 首次通过单细胞RNA测序识别出激活蛋白-1复合物作为糖尿病相关动脉粥样硬化的新靶点,并验证了其抑制剂T-5224在糖尿病Apoe-/-小鼠模型中的治疗效果 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床试验中验证 探索糖尿病相关动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞
7670 2024-10-02
Pan-cancer integrative analyses dissect the remodeling of endothelial cells in human cancers
2024-Sep, National science review IF:16.3Q1
研究论文 本文通过整合575名癌症患者的单细胞RNA测序数据,分析了19种实体肿瘤类型中肿瘤内皮细胞(TECs)的表型多样性 揭示了TECs在泛癌视角下的组成和功能异质性,并发现了两种主要亚型:tip细胞和veins细胞,它们在空间组织模式和功能上表现出显著差异 NA 深入理解肿瘤内皮细胞的异质性及其在抗血管生成疗法和免疫疗法中的作用 肿瘤内皮细胞(TECs)及其在不同癌症类型中的表型多样性 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 575名癌症患者
7671 2024-10-02
StableMate: a statistical method to select stable predictors in omics data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文介绍了一种名为StableMate的统计方法,用于在组学数据中选择稳定的预测因子 StableMate通过跨异质数据集的变量选择过程,解决了组学数据复杂性和变异性导致的关联缺乏可重复性和可解释性的问题 NA 开发一种能够在不同环境中选择稳定预测因子的统计方法,以提高生物学关联的可重复性和可解释性 乳腺癌RNA测序数据、结肠癌宏基因组数据和胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据 生物信息学 癌症 回归分析 回归框架 组学数据 NA
7672 2024-10-02
Arrestin beta-2 deficiency exacerbates periodontal inflammation by mediating activating transcription factor 6 activation and abnormal remodelling of the extracellular matrix
2024-06, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 研究了arrestin beta-2 (ARRB2)在牙周炎进展中的具体作用及其机制 揭示了ARRB2通过抑制ATF6信号通路介导的细胞外基质重塑对牙周组织的保护作用 NA 探讨ARRB2在牙周炎进展中的作用及其机制 牙周炎患者和健康对照者的牙周组织 NA 牙周炎 单细胞RNA测序、实时定量聚合酶链反应、Western blotting、免疫组织化学染色 NA RNA NA
7673 2024-10-02
Macrophages Promote Atherosclerosis Development by Inhibiting CD8T Cell Apoptosis
2024, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 研究探讨了巨噬细胞通过抑制CD8T细胞凋亡促进动脉粥样硬化发展的机制 首次揭示了巨噬细胞通过C1q-C1qbp轴抑制CD8T细胞凋亡,从而促进动脉粥样硬化发展的机制 研究主要基于小鼠模型,需进一步在人体中验证 探讨巨噬细胞与CD8T细胞相互作用在动脉粥样硬化发展中的作用 巨噬细胞和CD8T细胞 心血管疾病 心血管疾病 scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, ChIP-qPCR, 蛋白质印迹, 抗体阻断实验 NA 基因表达数据, 蛋白质数据 小鼠模型
7674 2024-10-02
HPV-driven heterogeneity in cervical cancer: study on the role of epithelial cells and myofibroblasts in the tumor progression based on single-cell RNA sequencing analysis
2024, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了人乳头瘤病毒(HPV)感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响,特别是上皮细胞和肌成纤维细胞在肿瘤进展中的作用 首次系统分析了HPV阳性及阴性宫颈癌样本中单细胞RNA测序数据,揭示了HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响及其分子机制 研究样本仅来自Gene Expression Omnibus数据库,可能存在数据偏差;未涉及临床验证 探索HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响,为优化宫颈癌的预防筛查和个性化治疗提供新的分子基础 HPV阳性及阴性宫颈癌样本中的单细胞RNA测序数据 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 12,431个细胞
7675 2024-10-02
DSP-0509, a TLR7 agonist, exerted synergistic anti-tumor immunity combined with various immune therapies through modulating diverse immune cells in cancer microenvironment
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 研究了TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用 首次合成了可系统注射的TLR7激动剂DSP-0509,并研究了其与IDO1抑制剂、抗PD-1抗体和AXL抑制剂联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证其疗效 探讨TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用,以增强抗肿瘤免疫效果 TLR7激动剂DSP-0509、IDO1抑制剂、抗PD-1抗体、AXL抑制剂以及肿瘤微环境中的免疫细胞 免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠肿瘤模型
7676 2024-10-02
Transcriptional bursting dynamics in gene expression
2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了基因表达中的转录爆发动力学机制,并比较了不同基因表达模型的优缺点 提供了关于转录爆发的关键指标的详细总结,并探讨了跨物种的转录爆发时间动态及其分子机制 缺乏一个全面的定量模型来研究转录爆发 指导研究人员选择最适合其研究背景的基因表达模型,并深入理解细胞过程、细胞命运决定和癌症诊断 基因表达模型、转录爆发动力学、细胞表型多样性 NA NA 单细胞测序、多组学整合 NA 基因表达数据 NA
7677 2024-10-02
Unraveling the role of ADAMs in clinical heterogeneity and the immune microenvironment of hepatocellular carcinoma: insights from single-cell, spatial transcriptomics, and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了ADAM基因家族在肝细胞癌临床异质性和免疫微环境中的作用,通过单细胞、空间转录组学和批量RNA测序技术揭示了ADAM家族基因的分子特征及其对HCC发展和预后的影响 首次报道了ADAM家族信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的有害影响和预后意义 NA 探讨ADAM基因家族在肝细胞癌中的作用及其对临床预后的影响 肝细胞癌中的ADAM基因家族及其在肿瘤微环境中的作用 数字病理学 肝癌 单细胞测序、空间转录组学、批量RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 NA
7678 2024-10-02
A telencephalon cell type atlas for goldfish reveals diversity in the evolution of spatial structure and cell types
2023-11-03, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统比较了金鱼端脑的细胞类型,揭示了其分子神经解剖学的分区 首次构建了金鱼端脑的细胞类型图谱,发现了神经元基因表达的多样性和模块化特征,并提出了金鱼端脑中存在海马结构的可能性 NA 研究金鱼端脑的细胞类型多样性及其在进化中的空间结构变化 金鱼端脑的细胞类型及其分子特征 神经科学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 金鱼端脑的多个细胞样本
7679 2024-10-02
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 空间转录组学技术(SRT)能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系,弥补了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在空间信息上的不足 NA 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用,开发更有效的临床治疗策略 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 数字病理学 癌症 下一代测序(NGS) NA 转录组数据 NA
7680 2024-10-02
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs,并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 NA 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
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