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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7641 | 2025-10-06 |
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001085
PMID:39250463
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研究论文 | 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-连环蛋白促进肝癌干细胞特性 | 首次发现HKDC1在肝癌恶性细胞中特异性高表达,并阐明其通过结合GSK3β稳定β-连环蛋白促进肝癌转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在大型临床队列中验证 | 探究HKDC1在肝癌转移中的分子机制 | 肝癌细胞、肝癌小鼠模型、肝癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 肝癌 | RNA原位杂交、单细胞RNA-seq、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | 2种肝癌小鼠模型及其来源的类器官,肝癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7642 | 2025-10-06 |
TREM2 macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001098
PMID:39292863
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研究论文 | 本研究揭示了TREM2+巨噬细胞介导减重手术改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的修复机制 | 首次证明减重手术通过TREM2+巨噬细胞以体重非依赖方式改善MASH,并阐明其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究减重手术改善MASH的免疫调节机制 | 小鼠模型及肝脏脂质相关巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7643 | 2025-05-20 |
Integration of Bulk RNA and Single-Cell Analyses Reveal Distinct Expression Patterns of Anoikis-Related Genes and the Immunosuppressive Role of NQO1+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501310R
PMID:40386974
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA和单细胞RNA测序分析,探讨了anoikis相关基因(ARGs)在肝细胞癌(HCC)中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 建立了一个包含11个ARGs的anoikis相关基因风险评分模型(ARGRS),并通过单细胞RNA测序评估了ARGs在HCC中的异质性,同时揭示了NQO1+巨噬细胞的免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探讨ARGs在HCC中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 肝细胞癌(HCC)患者和NQO1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7644 | 2025-10-06 |
Cutaneous granulomas: mechanisms, cellular interactions and therapeutic insights
2025-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf096
PMID:40080709
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综述 | 本文系统综述皮肤肉芽肿的形成机制、细胞相互作用及治疗前景 | 重点关注TREM2+巨噬细胞在肉芽肿形成中的作用及单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性 | 肉芽肿形成的精确过程及其功能意义仍不明确 | 探讨肉芽肿的本质及其在皮肤疾病中的形成机制 | 皮肤肉芽肿及相关疾病(结节病、环状肉芽肿、结核、麻风等) | NA | 皮肤肉芽肿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7645 | 2025-05-20 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2025-May-18, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁(BA)肝脏中疤痕相关巨噬细胞(SAMs)和胆道上皮细胞(BECs)的相互作用如何加剧肝纤维化 | 首次发现SAMs通过调节BECs的上皮-间质转化(EMT)促进肝纤维化进展,并识别出BA诊断的生物标志物 | 样本量较小(仅8例组织样本),且缺乏长期随访数据验证治疗效果 | 探究BA肝脏微环境变化及其在肝纤维化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 胆道闭锁 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 8例肝脏组织(2例正常组织,2例胆总管囊肿组织,4例BA组织) | NA | NA | NA | NA |
7646 | 2025-10-06 |
New insights into tumor microenvironment and HPV integrations in cervical cancer pathogenesis revealed by single-cell transcriptome data
2025-May-17, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf027
PMID:40151001
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析宫颈癌肿瘤微环境和HPV整合事件 | 开发了从单细胞RNA测序数据识别HPV整合事件的方法,发现了新的HPV重复整合基因 | 样本量相对有限,仅分析了特定疾病阶段的患者 | 研究宫颈癌发病机制中细胞异质性与HPV整合的关联 | 正常患者和三个疾病阶段(HSIL、MIC、CSCC)的宫颈组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常患者和三个疾病阶段患者的宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7647 | 2025-10-06 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
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研究论文 | 开发了可通过聚焦超声激活的声遗传学EchoBack-CAR T细胞,用于实体瘤治疗 | 通过筛选超敏感热休克启动子库并结合CAR信号正反馈回路,实现了聚焦超声刺激下的长效CAR表达 | NA | 开发更安全有效的CAR-T细胞疗法治疗实体瘤 | 胶质母细胞瘤和前列腺癌 | 细胞工程 | 胶质母细胞瘤,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7648 | 2025-10-06 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Rorγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞形成中的关键作用 | 首次通过特异性删除Rorc基因的顺式调控元件构建了RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型,并证实了RORγt树突状细胞(而非ILC3s)在外周Treg诱导中的特异性功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类系统中验证;对RORγt树突状细胞的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究RORγt阳性抗原呈递细胞在肠道免疫耐受建立中的作用机制 | 基因工程小鼠模型、RORγt阳性树突状细胞、外周调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7649 | 2025-10-06 |
Histone HIST1 genes and tumor-infiltrating lymphocytes in a child with γδ T cell acute lymphoblastic leukemia by single-cell sequencing
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf022
PMID:39973604
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病例报告 | 通过单细胞测序技术研究儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病中HIST1组蛋白基因与肿瘤浸润淋巴细胞的关系 | 首次在γδ T-ALL中发现HIST1组蛋白基因与疾病的相关性,并揭示γδ T细胞对抗该白血病的潜在效应功能 | 单一样本病例研究,结果需要更大样本量验证 | 探索γδ T-ALL的生物学特征和潜在治疗靶点 | 儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞测序 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例儿童患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7650 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms between atherosclerosis and hashimoto's thyroiditis based on microarray and single-cell sequencing analysis
2025-01-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85112-0
PMID:39805933
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞测序分析探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病机制 | 首次结合WGCNA、生物信息学分析和单细胞测序技术系统揭示AS与HT的共享致病机制,鉴定出PTPRC和TYROBP作为关键生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病分子机制 | 动脉粥样硬化和桥本甲状腺炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病,自身免疫性疾病 | 微阵列测序,单细胞测序分析,生物信息学分析 | WGCNA, Limma, CIBERSORT, cytoHubba | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包含119个候选基因 | NA | 单细胞测序,微阵列分析 | NA | NA |
7651 | 2025-10-06 |
Magnetic soft microrobots for erectile dysfunction therapy
2024-Dec-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2407809121
PMID:39556757
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研究论文 | 开发了一种用于治疗勃起功能障碍的磁性软微机器人,可提高间充质基质细胞的保留率和存活率 | 设计了包含磁性纳米粒子链的超软水凝胶微球,具有活性氧清除功能,能够适应狭窄血管形状 | NA | 提高勃起功能障碍治疗的细胞治疗效果 | 大鼠和比格犬勃起功能障碍模型 | 生物医学工程 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7652 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54337-4
PMID:39604360
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 | 首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物,并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞 | 研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞,未涉及成人原代组织 | 鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物 | 人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和干细胞来源的窦房结细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7653 | 2025-10-06 |
Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54710-3
PMID:39592630
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研究论文 | 本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术,揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联 | 首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制 | 未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
7654 | 2025-10-06 |
HLA-A+ tertiary lymphoid structures with reactivated tumor infiltrating lymphocytes are associated with a positive immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02712-9
PMID:38762674
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研究论文 | 本研究探索了食管鳞状细胞癌中HLA-A阳性三级淋巴结构与免疫检查点阻断治疗反应的关系 | 首次发现HLA-A阳性三级淋巴结构及其驻留的肿瘤浸润淋巴细胞与食管鳞癌免疫治疗反应相关 | 样本量相对有限(42例初治组织和60例患者),需要更大规模研究验证 | 识别食管鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,数字空间分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 42例初治ESCC肿瘤组织和60例ESCC患者 | NanoString | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NanoString GeoMx数字空间分析仪 | NanoString GeoMx数字空间分析仪用于系统评估肿瘤微环境 |
7655 | 2025-10-06 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
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研究论文 | 本文揭示了单细胞RNA测序数据中激活型KIR基因表达被低估的原因是标准比对流程对KIR转录本的错误分配 | 首次系统性地识别并验证了单细胞RNA测序标准流程中KIR转录本错误分配的问题及其对激活型KIR表达量化的影响 | NA | 探究单细胞RNA测序数据中KIR基因表达量化的准确性问题 | 杀伤性免疫球蛋白样受体(KIR)转录本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7656 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing of stria vascularis cells in the adult Slc26a4-/- mouse
2023-06-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01549-0
PMID:37322474
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年Slc26a4-/-小鼠耳蜗血管纹细胞,揭示了pendrin表达细胞中pH调节因子的变化 | 首次在单细胞水平鉴定pendrin表达细胞和Kcnj10表达细胞,发现纺锤细胞中细胞外外泌体相关基因下调及膜联蛋白A1表达增加 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床应用需进一步验证 | 鉴定pendrin表达细胞中的pH调节因子,阐明耳蜗内淋巴pH失调的细胞致病机制 | 野生型和Slc26a4-/-小鼠的耳蜗血管纹细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 野生型和Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7657 | 2025-10-06 |
TransAnno-Net: A Deep Learning Framework for Accurate Cell Type Annotation of Mouse Lung Tissue Using Self-supervised Pretraining
2025-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108809
PMID:40315689
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研究论文 | 提出一种基于自监督预训练和Transformer架构的深度学习框架,用于小鼠肺组织单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 采用自监督预训练策略,利用大量未标记数据预训练模型,仅需少量标记数据进行微调,显著降低标注成本并提高模型效率和可迁移性 | 主要针对小鼠肺组织数据,在其他组织或物种中的适用性需要进一步验证 | 开发高效准确的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 小鼠肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 约100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7658 | 2025-10-06 |
DNA hypermethylation of PLTP mediated by DNMT3B aggravates vascular dysfunction in diabetic retinopathy via the AKT/GSK3β signaling pathway
2025-May-17, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01874-4
PMID:40380281
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研究论文 | 本研究揭示DNMT3B介导的PLTP基因DNA高甲基化通过AKT/GSK3β信号通路加重糖尿病视网膜病变中的血管功能障碍 | 首次发现DNMT3B介导的PLTP启动子高甲基化在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的关键作用机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 阐明PLTP在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的作用及DNA甲基化调控机制 | 人视网膜微血管内皮细胞和高糖处理的糖尿病小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序,转录组测序,免疫共沉淀,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白互作数据 | 细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
7659 | 2025-10-06 |
Anti-BCL2 therapy eliminates giant congenital melanocytic nevus by senolytic and immune induction
2025-May-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02247-2
PMID:40374605
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研究论文 | 本研究通过抗BCL2疗法成功消除巨大先天性黑色素细胞痣,揭示了衰老细胞清除和免疫诱导的双重作用机制 | 首次发现BCL2在GCMN的衰老细胞和增殖细胞中表达,并证明BCL2抑制剂通过衰老细胞清除和激活中性粒细胞免疫反应的双重机制治疗GCMN | 研究主要基于动物模型,需要进一步临床试验验证 | 开发治疗巨大先天性黑色素细胞痣的有效疗法 | 巨大先天性黑色素细胞痣患者样本、患者来源异种移植模型、转基因小鼠模型 | 疾病治疗研究 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、免疫染色、体外细胞毒性实验 | 患者来源异种移植模型、转基因动物模型 | 基因表达数据、组织学图像、细胞功能数据 | 多种基因突变的GCMN患者样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7660 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to identify the role of Aggrephagy-related genes in tumor microenvironment and key tumorigenesis factors of GB from the perspective of single-cell sequencing
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02431-4
PMID:40377747
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的作用及其与肿瘤发生的关系 | 首次从单细胞测序角度系统研究聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤中的作用,发现TUBA1C和UBB作为潜在治疗靶点 | NA | 揭示聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境和肿瘤发生中的关键作用 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞亚型 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序,非负矩阵分解,分子对接分析 | 非负矩阵分解 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |