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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7641 | 2025-10-06 |
Deep Transcriptomics Reveals Cell-Specific Isoforms of Pan-Neuronal Genes
2024-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.16.594572
PMID:38826410
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究神经元特异性剪接模式 | 开发新算法识别细胞特异性表达模式,发现神经元特异性异构体和调控RNA结合蛋白,并建立用户友好的空间转录组可视化平台 | 单细胞RNA-Seq方法的捕获效率和灵敏度限制 | 研究神经系统神经元特异性剪接模式和调控机制 | 神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | CeNGEN联盟生成的深度细胞特异性转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
7642 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling reveals a potent role of quercetin in promoting hair regeneration
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac062
PMID:37285263
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了槲皮素通过激活HIF-1α促进毛囊再生和血管新生的分子机制 | 首次构建毛发再生过程中的动态单细胞转录组图谱,发现槲皮素通过激活内皮细胞HIF-1α促进毛囊分化和血管新生 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 探究槲皮素促进毛发再生的分子机制和治疗潜力 | 小鼠毛囊、毛囊角质形成细胞、真皮内皮细胞 | 单细胞生物学 | 脱发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7643 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics analysis of metabolic heterogeneity in zebrafish exposed to microcystin-LR and its disinfection byproducts
2025-Jul-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123599
PMID:40209558
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研究论文 | 本研究采用空间多组学技术分析斑马鱼暴露于微囊藻毒素-LR及其消毒副产物后的代谢异质性 | 首次将空间多组学技术应用于环境污染物研究,整合代谢组学、空间代谢组学和空间转录组学,揭示污染物在器官层面的空间分布特征 | 研究仅针对斑马鱼模型,结果向其他物种的推广需要进一步验证 | 探究微囊藻毒素-LR及其消毒副产物对斑马鱼的生物效应和空间代谢异质性 | 斑马鱼 | 空间多组学 | 环境毒理学 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
7644 | 2025-10-06 |
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001085
PMID:39250463
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研究论文 | 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-连环蛋白促进肝癌干细胞特性 | 首次发现HKDC1在肝癌恶性细胞中特异性高表达,并阐明其通过结合GSK3β稳定β-连环蛋白促进肝癌转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在大型临床队列中验证 | 探究HKDC1在肝癌转移中的分子机制 | 肝癌细胞、肝癌小鼠模型、肝癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 肝癌 | RNA原位杂交、单细胞RNA-seq、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | 2种肝癌小鼠模型及其来源的类器官,肝癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7645 | 2025-10-06 |
TREM2 macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001098
PMID:39292863
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研究论文 | 本研究揭示了TREM2+巨噬细胞介导减重手术改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的修复机制 | 首次证明减重手术通过TREM2+巨噬细胞以体重非依赖方式改善MASH,并阐明其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究减重手术改善MASH的免疫调节机制 | 小鼠模型及肝脏脂质相关巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7646 | 2025-05-20 |
Comprehensive immunogenomic landscape analysis unveils CD33 + myeloid cell-driven immunomodulatory signatures in melanoma development
2025-Jun, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155981
PMID:40300524
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研究论文 | 通过免疫基因组学分析揭示了CD33+髓系细胞在黑色素瘤发展中的免疫调节作用 | 揭示了CD33+髓系细胞通过补体级联成分和趋化因子信号通路在黑色素瘤发病机制中的关键作用 | 研究主要基于基因组关联研究和单细胞RNA测序数据,需要进一步的实验验证 | 探讨免疫细胞亚群与癌症发展之间的因果关系 | 黑色素瘤样本中的髓系细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | Mendelian Randomization分析、单细胞RNA测序、计算反卷积分析 | NA | 基因组关联研究数据、单细胞RNA测序数据 | 612种免疫细胞特征和91种癌症类型的基因组关联研究数据,以及黑色素瘤样本的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
7647 | 2025-05-20 |
Single-cell transcriptomics reveal the effects of chemoimmunotherapy on hypopharyngeal cancer and its tumor microenvironment
2025-Jun, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了化学免疫疗法对下咽癌及其肿瘤微环境的影响 | 揭示了肿瘤微环境异质性与治疗反应的关系,并发现S100A2基因在肿瘤细胞中的高表达与化学免疫疗法效果相关 | 研究样本量有限,且需要进一步验证S100A2基因的功能机制 | 探索化学免疫疗法对下咽癌的治疗效果及其分子机制 | 下咽癌患者的活检样本 | 数字病理学 | 下咽癌 | 单细胞转录组学, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量的下咽癌患者活检样本 | NA | NA | NA | NA |
7648 | 2025-05-20 |
Integration of Bulk RNA and Single-Cell Analyses Reveal Distinct Expression Patterns of Anoikis-Related Genes and the Immunosuppressive Role of NQO1+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501310R
PMID:40386974
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA和单细胞RNA测序分析,探讨了anoikis相关基因(ARGs)在肝细胞癌(HCC)中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 建立了一个包含11个ARGs的anoikis相关基因风险评分模型(ARGRS),并通过单细胞RNA测序评估了ARGs在HCC中的异质性,同时揭示了NQO1+巨噬细胞的免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探讨ARGs在HCC中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 肝细胞癌(HCC)患者和NQO1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7649 | 2025-10-06 |
Cutaneous granulomas: mechanisms, cellular interactions and therapeutic insights
2025-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf096
PMID:40080709
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综述 | 本文系统综述皮肤肉芽肿的形成机制、细胞相互作用及治疗前景 | 重点关注TREM2+巨噬细胞在肉芽肿形成中的作用及单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性 | 肉芽肿形成的精确过程及其功能意义仍不明确 | 探讨肉芽肿的本质及其在皮肤疾病中的形成机制 | 皮肤肉芽肿及相关疾病(结节病、环状肉芽肿、结核、麻风等) | NA | 皮肤肉芽肿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7650 | 2025-05-20 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2025-May-18, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁(BA)肝脏中疤痕相关巨噬细胞(SAMs)和胆道上皮细胞(BECs)的相互作用如何加剧肝纤维化 | 首次发现SAMs通过调节BECs的上皮-间质转化(EMT)促进肝纤维化进展,并识别出BA诊断的生物标志物 | 样本量较小(仅8例组织样本),且缺乏长期随访数据验证治疗效果 | 探究BA肝脏微环境变化及其在肝纤维化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 胆道闭锁 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 8例肝脏组织(2例正常组织,2例胆总管囊肿组织,4例BA组织) | NA | NA | NA | NA |
7651 | 2025-10-06 |
New insights into tumor microenvironment and HPV integrations in cervical cancer pathogenesis revealed by single-cell transcriptome data
2025-May-17, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf027
PMID:40151001
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析宫颈癌肿瘤微环境和HPV整合事件 | 开发了从单细胞RNA测序数据识别HPV整合事件的方法,发现了新的HPV重复整合基因 | 样本量相对有限,仅分析了特定疾病阶段的患者 | 研究宫颈癌发病机制中细胞异质性与HPV整合的关联 | 正常患者和三个疾病阶段(HSIL、MIC、CSCC)的宫颈组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常患者和三个疾病阶段患者的宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7652 | 2025-10-06 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
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研究论文 | 开发了可通过聚焦超声激活的声遗传学EchoBack-CAR T细胞,用于实体瘤治疗 | 通过筛选超敏感热休克启动子库并结合CAR信号正反馈回路,实现了聚焦超声刺激下的长效CAR表达 | NA | 开发更安全有效的CAR-T细胞疗法治疗实体瘤 | 胶质母细胞瘤和前列腺癌 | 细胞工程 | 胶质母细胞瘤,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7653 | 2025-10-06 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Rorγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞形成中的关键作用 | 首次通过特异性删除Rorc基因的顺式调控元件构建了RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型,并证实了RORγt树突状细胞(而非ILC3s)在外周Treg诱导中的特异性功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类系统中验证;对RORγt树突状细胞的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究RORγt阳性抗原呈递细胞在肠道免疫耐受建立中的作用机制 | 基因工程小鼠模型、RORγt阳性树突状细胞、外周调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7654 | 2025-05-20 |
Transcriptomic and proteomic characterization of cell and protein biomarkers of checkpoint inhibitor-induced liver injury
2025-May-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04033-z
PMID:40317333
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研究论文 | 本研究通过多组学方法分析了免疫检查点抑制剂引起的肝损伤(ChILI)患者的血液样本,揭示了T细胞克隆性、基因表达和蛋白质的变化 | 首次通过转录组学和蛋白质组学方法全面分析了ChILI患者的血液样本,发现了与ChILI发病相关的T细胞克隆性增加、PD-L1表达变化等新机制 | 样本量可能有限,且未明确说明具体样本数量,研究结果需要在更大规模的队列中验证 | 研究免疫检查点抑制剂引起的肝损伤的免疫和分子机制,并寻找潜在的生物标志物 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,特别是发生ChILI的患者 | 生物医学 | 肝损伤 | 转录组测序、单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学、T细胞受体库分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括ChILI患者组和对照组 | NA | NA | NA | NA |
7655 | 2025-05-20 |
Blockade of TIGAR prevents CD8+ T cell dysfunction and elicits anti-AML immunity
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04042-y
PMID:40285889
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研究论文 | 本研究探讨了通过阻断TIGAR来预防CD8+ T细胞功能障碍并激发抗急性髓性白血病(AML)免疫力的机制 | 首次揭示了TIGAR沉默如何增强T细胞功能并改善AML预后,以及TIGAR抑制与2-DG联合使用的治疗效果 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 研究TIGAR沉默是否能消除AML细胞并恢复功能失调的T细胞 | AML小鼠模型和TIGAR基因敲除小鼠 | 免疫学 | 急性髓性白血病(AML) | 单细胞RNA测序分析 | TIGAR基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据和细胞功能数据 | 未明确提及具体样本数量,但使用了C57BL/6J背景的小鼠和C1498细胞 | NA | NA | NA | NA |
7656 | 2025-05-20 |
Dynamics of tertiary lymphoid structures and immune cross talk in early versus advanced colorectal cancer: potential implications for immunotherapy
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04027-x
PMID:40287532
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和大块RNA转录数据分析,探讨了早期和晚期结直肠癌中三级淋巴结构(TLS)和肿瘤微环境(TME)的动态变化及其对免疫治疗的潜在影响 | 揭示了CD8+ Tex细胞上的CXCL13表达以及CD4+ Tfh和BGC细胞之间的CD40-CD40L相互作用可能是TLS功能的关键调节因子,进而影响免疫治疗的反应 | 研究基于三个内部队列,可能需要更大样本量验证 | 探讨早期和晚期结直肠癌中TLS和TME的差异及其对免疫治疗的影响 | 早期和晚期结直肠癌患者 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,大块RNA转录数据分析 | NA | RNA测序数据,病理组织数据 | 三个内部队列 | NA | NA | NA | NA |
7657 | 2025-10-06 |
Histone HIST1 genes and tumor-infiltrating lymphocytes in a child with γδ T cell acute lymphoblastic leukemia by single-cell sequencing
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf022
PMID:39973604
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病例报告 | 通过单细胞测序技术研究儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病中HIST1组蛋白基因与肿瘤浸润淋巴细胞的关系 | 首次在γδ T-ALL中发现HIST1组蛋白基因与疾病的相关性,并揭示γδ T细胞对抗该白血病的潜在效应功能 | 单一样本病例研究,结果需要更大样本量验证 | 探索γδ T-ALL的生物学特征和潜在治疗靶点 | 儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞测序 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例儿童患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7658 | 2025-05-20 |
Prognostic nutrition index reveals LAG3 in cytotoxic CD8+ T cells and MHC class II in gastric cancer cells
2025-Apr-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04037-9
PMID:40252096
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研究论文 | 探讨预后营养指数(PNI)与胃癌细胞中LAG3和MHC class II表达的关系 | 首次揭示了PNI与LAG3在细胞毒性CD8阳性T细胞中的表达以及MHC class II在胃癌细胞中的表达之间的关联 | 研究为回顾性分析,样本量有限(单细胞RNA测序仅38例,多重免疫荧光染色59例) | 评估营养指数对胃癌患者预后的影响及其与免疫检查点分子表达的关联 | 796例接受根治性胃切除术的胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 临床数据、RNA测序数据、免疫荧光图像 | 796例胃癌患者(临床数据),38例胃癌组织(单细胞RNA测序),59例胃癌组织(多重免疫荧光染色) | NA | NA | NA | NA |
7659 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms between atherosclerosis and hashimoto's thyroiditis based on microarray and single-cell sequencing analysis
2025-01-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85112-0
PMID:39805933
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞测序分析探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病机制 | 首次结合WGCNA、生物信息学分析和单细胞测序技术系统揭示AS与HT的共享致病机制,鉴定出PTPRC和TYROBP作为关键生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病分子机制 | 动脉粥样硬化和桥本甲状腺炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病,自身免疫性疾病 | 微阵列测序,单细胞测序分析,生物信息学分析 | WGCNA, Limma, CIBERSORT, cytoHubba | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包含119个候选基因 | NA | 单细胞测序,微阵列分析 | NA | NA |
7660 | 2025-10-06 |
Magnetic soft microrobots for erectile dysfunction therapy
2024-Dec-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2407809121
PMID:39556757
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研究论文 | 开发了一种用于治疗勃起功能障碍的磁性软微机器人,可提高间充质基质细胞的保留率和存活率 | 设计了包含磁性纳米粒子链的超软水凝胶微球,具有活性氧清除功能,能够适应狭窄血管形状 | NA | 提高勃起功能障碍治疗的细胞治疗效果 | 大鼠和比格犬勃起功能障碍模型 | 生物医学工程 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |