单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7641 - 7660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7641 | 2025-10-06 |
Subcellular Level Spatial Transcriptomics with PHOTON
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612328
PMID:39314454
|
研究论文 | 介绍PHOTON方法实现亚细胞分辨率空间转录组分析 | 结合高分辨率成像与高通量测序，实现亚细胞水平空间转录组分析 | NA | 开发亚细胞分辨率空间转录组分析方法 | 卵巢颗粒细胞、核仁、应激颗粒中的RNA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率成像、高通量测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | PHOTON | PHOTON（纳米尺度转录组光选法） |
| 7642 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.016
PMID:38848718
|
研究论文 | 本研究利用空间增强分辨率组学测序和单细胞RNA测序技术，绘制了水稻种子萌发过程中胚胎细胞的时空转录组图谱 | 开发了基于深度学习的自动细胞分割模型，发现了两种先前未报道的盾片细胞类型，并提供了探索胚胎细胞在种子萌发中作用的新方法 | NA | 阐明不同胚胎细胞在调控种子活力和幼苗建成中的复杂生物学功能 | 水稻胚胎细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 原位杂交 | 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 吸水后6、24、36和48小时的水稻胚胎样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7643 | 2025-10-06 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学和高分辨率活体成像技术，揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层迁移的分子机制 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组和活体成像技术系统研究AVE迁移，发现转录状态与细胞位置的紧密关联及信号素信号的关键作用 | 研究仅针对小鼠胚胎模型，结果在其他物种中的普适性有待验证 | 阐明前内脏内胚层独特迁移行为和功能的分子基础 | 小鼠胚胎前内脏内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 基因表达数据, 蛋白质磷酸化数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7644 | 2025-10-06 |
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601229
PMID:38979200
|
研究论文 | 开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于研究生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应性 | 首次开发了适用于细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，能够捕获生物膜内广泛的转录异质性并分析不同免疫细胞群的特异性反应 | 方法验证主要集中于生物膜与浮游生长的比较，尚未在其他细菌系统或更复杂环境中广泛测试 | 研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异反应 | 细菌生物膜中的亚群细胞 | 单细胞测序技术 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | BaSSSh-seq | 优化的细菌单细胞RNA测序平台 |
| 7645 | 2025-10-06 |
Deep Transcriptomics Reveals Cell-Specific Isoforms of Pan-Neuronal Genes
2024-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.16.594572
PMID:38826410
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究神经元特异性剪接模式 | 开发新算法识别细胞特异性表达模式，发现神经元特异性异构体和调控RNA结合蛋白，并建立用户友好的空间转录组可视化平台 | 单细胞RNA-Seq方法的捕获效率和灵敏度限制 | 研究神经系统神经元特异性剪接模式和调控机制 | 神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | CeNGEN联盟生成的深度细胞特异性转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7646 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling reveals a potent role of quercetin in promoting hair regeneration
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac062
PMID:37285263
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了槲皮素通过激活HIF-1α促进毛囊再生和血管新生的分子机制 | 首次构建毛发再生过程中的动态单细胞转录组图谱，发现槲皮素通过激活内皮细胞HIF-1α促进毛囊分化和血管新生 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探究槲皮素促进毛发再生的分子机制和治疗潜力 | 小鼠毛囊、毛囊角质形成细胞、真皮内皮细胞 | 单细胞生物学 | 脱发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7647 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics analysis of metabolic heterogeneity in zebrafish exposed to microcystin-LR and its disinfection byproducts
2025-Jul-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123599
PMID:40209558
|
研究论文 | 本研究采用空间多组学技术分析斑马鱼暴露于微囊藻毒素-LR及其消毒副产物后的代谢异质性 | 首次将空间多组学技术应用于环境污染物研究，整合代谢组学、空间代谢组学和空间转录组学，揭示污染物在器官层面的空间分布特征 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向其他物种的推广需要进一步验证 | 探究微囊藻毒素-LR及其消毒副产物对斑马鱼的生物效应和空间代谢异质性 | 斑马鱼 | 空间多组学 | 环境毒理学 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 7648 | 2025-10-06 |
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001085
PMID:39250463
|
研究论文 | 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-连环蛋白促进肝癌干细胞特性 | 首次发现HKDC1在肝癌恶性细胞中特异性高表达，并阐明其通过结合GSK3β稳定β-连环蛋白促进肝癌转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在大型临床队列中验证 | 探究HKDC1在肝癌转移中的分子机制 | 肝癌细胞、肝癌小鼠模型、肝癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 肝癌 | RNA原位杂交、单细胞RNA-seq、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | 2种肝癌小鼠模型及其来源的类器官，肝癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7649 | 2025-10-06 |
TREM2 macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001098
PMID:39292863
|
研究论文 | 本研究揭示了TREM2+巨噬细胞介导减重手术改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的修复机制 | 首次证明减重手术通过TREM2+巨噬细胞以体重非依赖方式改善MASH，并阐明其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究减重手术改善MASH的免疫调节机制 | 小鼠模型及肝脏脂质相关巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7650 | 2025-05-20 |
Integration of Bulk RNA and Single-Cell Analyses Reveal Distinct Expression Patterns of Anoikis-Related Genes and the Immunosuppressive Role of NQO1+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501310R
PMID:40386974
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA和单细胞RNA测序分析，探讨了anoikis相关基因（ARGs）在肝细胞癌（HCC）中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 建立了一个包含11个ARGs的anoikis相关基因风险评分模型（ARGRS），并通过单细胞RNA测序评估了ARGs在HCC中的异质性，同时揭示了NQO1+巨噬细胞的免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨ARGs在HCC中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 肝细胞癌（HCC）患者和NQO1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7651 | 2025-10-06 |
Cutaneous granulomas: mechanisms, cellular interactions and therapeutic insights
2025-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf096
PMID:40080709
|
综述 | 本文系统综述皮肤肉芽肿的形成机制、细胞相互作用及治疗前景 | 重点关注TREM2+巨噬细胞在肉芽肿形成中的作用及单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性 | 肉芽肿形成的精确过程及其功能意义仍不明确 | 探讨肉芽肿的本质及其在皮肤疾病中的形成机制 | 皮肤肉芽肿及相关疾病（结节病、环状肉芽肿、结核、麻风等） | NA | 皮肤肉芽肿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7652 | 2025-05-20 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2025-May-18, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据，揭示了胆道闭锁(BA)肝脏中疤痕相关巨噬细胞(SAMs)和胆道上皮细胞(BECs)的相互作用如何加剧肝纤维化 | 首次发现SAMs通过调节BECs的上皮-间质转化(EMT)促进肝纤维化进展，并识别出BA诊断的生物标志物 | 样本量较小(仅8例组织样本)，且缺乏长期随访数据验证治疗效果 | 探究BA肝脏微环境变化及其在肝纤维化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 胆道闭锁 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 8例肝脏组织(2例正常组织，2例胆总管囊肿组织，4例BA组织) | NA | NA | NA | NA |
| 7653 | 2025-10-06 |
New insights into tumor microenvironment and HPV integrations in cervical cancer pathogenesis revealed by single-cell transcriptome data
2025-May-17, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf027
PMID:40151001
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析宫颈癌肿瘤微环境和HPV整合事件 | 开发了从单细胞RNA测序数据识别HPV整合事件的方法，发现了新的HPV重复整合基因 | 样本量相对有限，仅分析了特定疾病阶段的患者 | 研究宫颈癌发病机制中细胞异质性与HPV整合的关联 | 正常患者和三个疾病阶段（HSIL、MIC、CSCC）的宫颈组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常患者和三个疾病阶段患者的宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7654 | 2025-10-06 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
|
研究论文 | 开发了可通过聚焦超声激活的声遗传学EchoBack-CAR T细胞，用于实体瘤治疗 | 通过筛选超敏感热休克启动子库并结合CAR信号正反馈回路，实现了聚焦超声刺激下的长效CAR表达 | NA | 开发更安全有效的CAR-T细胞疗法治疗实体瘤 | 胶质母细胞瘤和前列腺癌 | 细胞工程 | 胶质母细胞瘤,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7655 | 2025-10-06 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Rorγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞形成中的关键作用 | 首次通过特异性删除Rorc基因的顺式调控元件构建了RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型，并证实了RORγt树突状细胞（而非ILC3s）在外周Treg诱导中的特异性功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类系统中验证；对RORγt树突状细胞的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究RORγt阳性抗原呈递细胞在肠道免疫耐受建立中的作用机制 | 基因工程小鼠模型、RORγt阳性树突状细胞、外周调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7656 | 2025-10-06 |
Histone HIST1 genes and tumor-infiltrating lymphocytes in a child with γδ T cell acute lymphoblastic leukemia by single-cell sequencing
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf022
PMID:39973604
|
病例报告 | 通过单细胞测序技术研究儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病中HIST1组蛋白基因与肿瘤浸润淋巴细胞的关系 | 首次在γδ T-ALL中发现HIST1组蛋白基因与疾病的相关性，并揭示γδ T细胞对抗该白血病的潜在效应功能 | 单一样本病例研究，结果需要更大样本量验证 | 探索γδ T-ALL的生物学特征和潜在治疗靶点 | 儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞测序 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例儿童患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7657 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms between atherosclerosis and hashimoto's thyroiditis based on microarray and single-cell sequencing analysis
2025-01-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85112-0
PMID:39805933
|
研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞测序分析探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病机制 | 首次结合WGCNA、生物信息学分析和单细胞测序技术系统揭示AS与HT的共享致病机制，鉴定出PTPRC和TYROBP作为关键生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证；样本来源和数量可能存在限制 | 探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病分子机制 | 动脉粥样硬化和桥本甲状腺炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病,自身免疫性疾病 | 微阵列测序,单细胞测序分析,生物信息学分析 | WGCNA, Limma, CIBERSORT, cytoHubba | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集，包含119个候选基因 | NA | 单细胞测序,微阵列分析 | NA | NA |
| 7658 | 2025-10-06 |
Magnetic soft microrobots for erectile dysfunction therapy
2024-Dec-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2407809121
PMID:39556757
|
研究论文 | 开发了一种用于治疗勃起功能障碍的磁性软微机器人，可提高间充质基质细胞的保留率和存活率 | 设计了包含磁性纳米粒子链的超软水凝胶微球，具有活性氧清除功能，能够适应狭窄血管形状 | NA | 提高勃起功能障碍治疗的细胞治疗效果 | 大鼠和比格犬勃起功能障碍模型 | 生物医学工程 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7659 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54337-4
PMID:39604360
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 | 首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物，并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞 | 研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞，未涉及成人原代组织 | 鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物 | 人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和干细胞来源的窦房结细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7660 | 2025-10-06 |
Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54710-3
PMID:39592630
|
研究论文 | 本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术，揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联 | 首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制 | 未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |