单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
7641 2024-10-05
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
review 本文通过挖掘单细胞和单核RNA测序数据库,发现肾小球壁上皮细胞中存在完整的视黄酸合成途径 首次在肾小球壁上皮细胞中发现ALDH1A2介导的视黄酸合成途径,并探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 需要进一步的实验验证和临床研究来证实ALDH1A2在肾脏中的具体作用 探讨ALDH1A2在肾脏生理和病理中的作用 肾小球壁上皮细胞 digital pathology NA 单细胞RNA测序 NA RNA 包括小鼠和人类肾脏的单细胞和单核RNA测序数据
7642 2024-10-05
Discovery of GJC1 as a prognostic biomarker in glioma cells: insights into its cell-cycle relationship and differential expression in non-neuronal cells
2024, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了GJC1作为胶质瘤细胞中的预后生物标志物的潜力及其与细胞周期的关系 发现GJC1在胶质瘤中具有独立的预后价值,并揭示了其在非神经细胞中的差异表达 研究主要基于回顾性分析,未来需要进一步的实验验证 研究GJC1在胶质瘤中的预后价值及其与细胞周期的关系 胶质瘤细胞及其与GJC1表达的关系 数字病理学 脑肿瘤 RNA-seq, 单细胞测序 NA 基因表达数据 使用了中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库的数据
7643 2024-10-05
Cellular Heterogeneity of Activated Primary Human Macrophages and Associated Drug-Gene Networks: From Biology to Precision Therapeutics
2023-11-07, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 研究了干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞的细胞异质性及其相关的药物-基因网络,旨在从生物学到精准治疗 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,鉴定了两种主要的巨噬细胞亚群,并结合细胞签名药物库识别了一种新型化合物,该化合物能够靶向治疗动脉粥样硬化 NA 探索巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的作用,并开发新的免疫治疗方法 干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢物消耗分析、免疫测定、功能测试 NA RNA序列数据 人类原代巨噬细胞、人类颈动脉粥样硬化斑块、小鼠动脉粥样硬化模型
7644 2024-10-05
Adrenomedullin has a pivotal role in trophoblast differentiation: A promising nanotechnology-based therapeutic target for early-onset preeclampsia
2023-11-03, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 研究探讨了肾上腺髓质素(ADM)在滋养层细胞分化中的关键作用,并提出了一种基于纳米技术的早期子痫前期的潜在治疗靶点 首次揭示了ADM在滋养层细胞分化中的重要作用,并提出了一种基于纳米技术的治疗策略 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体中进行验证 探讨ADM在早期子痫前期中的作用及其作为治疗靶点的潜力 滋养层细胞、早期子痫前期患者、妊娠小鼠 生物医学 妊娠相关疾病 单细胞测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 人类绒毛膜滋养层细胞、滋养层干细胞、滋养层类器官、妊娠小鼠
7645 2024-10-05
Multi-scale characterisation of homologous recombination deficiency in breast cancer
2023-11-02, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文研究了乳腺癌中同源重组缺陷的多尺度特征,开发了基于插入缺失事件的分类方法和转录组特征,以提高同源重组缺陷的分类准确性 本文创新性地利用插入缺失事件和转录组特征来提高同源重组缺陷的分类准确性,并展示了其在单细胞转录组数据中的应用 本文未详细讨论所开发方法在其他癌症类型中的适用性 研究乳腺癌中同源重组缺陷的多尺度特征,并开发新的分类方法 乳腺癌中的同源重组缺陷及其与BRCA1/2缺陷状态的关系 数字病理学 乳腺癌 外显子测序、单细胞RNA测序 多重弹性网络回归模型 基因表达数据 涉及多个乳腺癌样本,包括单细胞RNA测序数据
7646 2024-10-05
Neutrophils resist ferroptosis and promote breast cancer metastasis through aconitate decarboxylase 1
2023-10-03, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 研究揭示了中性粒细胞通过aconitate脱羧酶1(Acod1)抵抗铁死亡并促进乳腺癌转移的机制 首次发现Acod1在中性粒细胞中的高表达及其在抵抗铁死亡和促进乳腺癌转移中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行大规模验证 探讨中性粒细胞在乳腺癌转移中的作用及其潜在治疗靶点 肿瘤浸润中性粒细胞(TINs)和循环中性粒细胞 癌症研究 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠乳腺肿瘤模型中的TINs和循环中性粒细胞
7647 2024-10-05
Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 hours
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了高血糖对人类胰腺胰岛基因表达的影响 首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同葡萄糖浓度下人类胰腺胰岛基因表达的动态变化 样本量较小,仅来自两个捐赠者 探索高血糖对人类胰腺胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病的关系 人类胰腺胰岛细胞 基因组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个捐赠者的胰腺胰岛细胞
7648 2024-10-05
NOTCH3 drives meningioma tumorigenesis and resistance to radiotherapy
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究报告NOTCH3在驱动脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用 发现NOTCH3+脑膜瘤壁细胞在人类、狗和鼠中保守,并揭示了NOTCH3在肿瘤起始、细胞增殖、血管生成和放射治疗抵抗中的作用 研究主要基于小鼠遗传和异种移植模型,需要在临床试验中进一步验证 探讨NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用及其潜在治疗价值 脑膜瘤及其对放射治疗的抵抗性 数字病理学 脑膜瘤 单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术 NA 单细胞转录组数据 涉及人类、狗和鼠的脑膜瘤样本
7649 2024-10-05
Spatiotemporal single-cell transcriptomic profiling reveals inflammatory cell states in a mouse model of diffuse alveolar damage
2023-Jun, Exploration (Beijing, China)
研究论文 本文通过结合单细胞和空间转录组学技术,系统分析了在小鼠弥漫性肺泡损伤模型中,由蓖麻毒素气溶胶吸入引起的嗜中性粒细胞炎症的细胞状态 本文揭示了稳态下的成纤维细胞向超炎症状态的转变,并发现激活的成纤维细胞与嗜中性粒细胞之间的CXCL1-CXCR2趋化因子轴在进一步招募嗜中性粒细胞中的作用 NA 研究弥漫性肺泡损伤过程中炎症细胞状态的变化 小鼠弥漫性肺泡损伤模型中的炎症细胞状态 数字病理学 肺部疾病 单细胞和空间转录组学 NA 转录组数据 小鼠模型
7650 2024-10-05
Repurposable drugs for SARS-CoV-2 and influenza sepsis with scRNA-seq data targeting post-transcription modifications
2021-Dec, Precision clinical medicine IF:5.1Q1
研究论文 本文通过整合基因表达扰动数据和单细胞RNA测序数据,识别出可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物 本文采用系统生物学方法,结合FDA批准药物和临床前小分子化合物的基因表达扰动数据,以及COVID-19患者的单细胞RNA测序数据,识别出281种可能有效对抗SARS-CoV-2感染的药物,并实验验证了其中两种药物对流感病毒复制和宿主细胞细胞因子及其调节因子转录和翻译的抑制作用 本文主要基于现有数据和已批准药物进行筛选,未涉及新药开发 识别可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物 SARS-CoV-2和流感病毒感染及其并发症 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 轻度和重度COVID-19患者的数据(GEO: GSE145926)
7651 2024-10-04
Implications of accumulation of clonally expanded and senescent CD4+GNLY+ T cells in immunological non-responders of HIV-1 infection
2024-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1
研究论文 研究探讨了HIV-1感染免疫无应答者中CD4+GNLY+ T细胞的积累及其与免疫重建的关系 首次揭示了CD4GNLY T细胞在HIV-1感染免疫无应答者中的高克隆扩增和衰老特征,并探讨了其与免疫重建的关系 研究样本量较小,可能影响结果的普适性 阐明CD4GNLY T细胞的特征及其与HIV-1感染免疫无应答者免疫重建的关系 HIV-1感染免疫无应答者中的CD4GNLY T细胞 免疫学 HIV感染 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验 NA 单细胞RNA数据、TCR数据、流式细胞数据、血浆细胞因子数据 HIV-1感染免疫无应答者的血液样本
7652 2024-10-04
Integrating cellular experiments, single-cell sequencing, and machine learning to identify endoplasmic reticulum stress biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究整合细胞实验、单细胞测序和机器学习技术,识别特发性肺纤维化中的内质网应激相关生物标志物 首次将内质网应激与特发性肺纤维化的生物标志物识别相结合,并开发了具有强预测能力的诊断和预后模型 NA 揭示特发性肺纤维化中的内质网应激相关生物标志物 特发性肺纤维化患者肺组织中的内质网应激相关基因和细胞类型 机器学习 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析 机器学习算法 基因表达数据 多个数据集和体外实验样本
7653 2024-10-04
The concept of onychodermis containing onychofibroblasts has histological (microanatomical), immunohistochemical as well as molecular basis
2024-Nov, Journal of cutaneous pathology IF:1.6Q3
研究论文 本文探讨了包含onychofibroblasts的onychodermis的概念,并提供了其组织学、免疫组织化学和分子基础的证据 首次通过单细胞RNA测序和原位杂交技术,揭示了onychofibroblasts在onychodermis中表达的关键基因,这些基因与指甲形成和相关疾病有关 NA 研究onychodermis和onychofibroblasts在指甲发育和病理中的作用 onychodermis和onychofibroblasts的组织学、免疫组织化学和分子特征 NA NA 单细胞RNA测序、原位杂交 NA 基因表达数据 NA
7654 2024-10-04
Gastroduodenal injury and repair mechanisms
2024-Nov-01, Current opinion in gastroenterology IF:2.6Q2
综述 本文综述了胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 重点介绍了黏膜保护的新机制,包括腺病毒疗法、植物提取物和RNA技术在黏膜再生中的应用 缺乏对急性浅表性损伤修复机制的深入研究 探讨胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 胃十二指肠黏膜损伤及其修复机制 NA NA RNA测序 NA NA NA
7655 2024-10-04
Novel Long Noncoding RNA HEAT4 Affects Monocyte Subtypes, Reducing Inflammation and Promoting Vascular Healing
2024-Oct, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 研究了新型长非编码RNA HEAT4在单核细胞亚型中的作用,减少炎症并促进血管愈合 发现了人类特异性的长非编码RNA HEAT4,其在心血管免疫学中的作用机制,包括在单核细胞亚型转换中的作用 研究主要集中在体外和动物模型中,需要进一步在人体中验证其效果 探讨长非编码RNA在心血管疾病中的免疫调节作用 长非编码RNA HEAT4及其在单核细胞亚型转换中的作用 心血管疾病 心血管疾病 单细胞测序 NA RNA 包括心力衰竭、急性心肌梗死和心源性休克患者的血液样本,以及NOD.CB17-Prkdc scid/Rj小鼠的血管损伤模型
7656 2024-10-04
Effector MoSDT1 enhances Magnaporthe oryzae virulence and plays a dual role in regulating rice defense
2024-Oct-01, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 研究了C2H2锌效应子MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重作用 首次揭示了MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重调节作用,并通过RNA-seq、scRNA-seq和ChIP-seq技术深入分析了其调控机制 研究主要集中在MoSDT1的过表达和敲除菌株上,未涉及其在自然环境中的表现 探讨MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的作用机制 稻瘟病菌MoSDT1效应子和水稻防御反应 NA NA RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq NA 基因表达数据 包括MoSDT1过表达菌株和两个敲除菌株
7657 2024-10-04
IRG1/ACOD1 promotes neutrophil reverse migration and alleviates local inflammation
2024-Oct-01, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 研究探讨了IRG1/ACOD1在多形核中性粒细胞(PMN)反向迁移及其在炎症缓解中的作用 首次揭示了IRG1/ACOD1通过调节PMN表面ICAM-1表达,促进PMN从炎症部位反向迁移,从而缓解局部炎症 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究PMN反向迁移的机制及其在炎症中的作用 多形核中性粒细胞(PMN)及其在炎症中的反向迁移 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
7658 2024-10-04
Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia
2024-Oct-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
研究论文 研究通过使用CD73小分子抑制剂AB-680预防性治疗K-Ras突变型胰腺上皮内瘤变(PanIN),增强免疫监视 首次在K-Ras突变型胰腺上皮内瘤变模型中验证了CD73抑制剂AB-680的预防性治疗效果,显著减少PanIN形成并改变免疫微环境 研究仅在基因工程小鼠模型中进行,尚未在人体试验中验证 探讨CD73抑制剂在预防胰腺导管腺癌(PDAC)前体病变PanIN中的作用 K-Ras突变型胰腺上皮内瘤变(PanIN)及其免疫微环境 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 使用KrasG12D; PdxCre1(KC)基因工程小鼠模型,样本量为多只小鼠
7659 2024-10-04
The temporal protein signature analyses of developing human deciduous molar tooth germ
2024-Oct, Proteomics IF:3.4Q2
研究论文 研究分析了人类乳牙牙胚在胚胎阶段的时间依赖性蛋白质组变化 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了713种差异表达蛋白及其在牙发育中的五种时间表达模式,并筛选出24种潜在的牙发育驱动蛋白 NA 探讨人类乳牙牙胚发育过程中的蛋白质表达变化及其潜在机制 人类乳牙牙胚在胚胎阶段的蛋白质表达 发育生物学 NA 蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 蛋白质、RNA 胚胎阶段的人类乳牙牙胚样本
7660 2024-10-04
Engineered extracellular vesicles enable high-efficient delivery of intracellular therapeutic proteins
2024-Oct-01, Protein & cell IF:13.6Q1
研究论文 本文报道了一种基于外泌体的细胞内递送方法(IDEA),能够高效地包装和递送天然蛋白质,无需使用支架 IDEA方法避免了传统支架策略对货物稳定性和功能的损害,实现了高效的蛋白质递送 NA 开发一种高效的细胞内递送系统,用于扩展基于蛋白质的疗法 外泌体作为下一代递送载体,以及cGAS作为免疫传感器 生物技术 NA scRNA-seq NA RNA 多个同基因肿瘤模型
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