单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7621 - 7640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7621 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing on Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Identified Multi-Ciliary Cells in Breast Cancer
2025-01-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14030197
PMID:39936988
|
研究论文 | 本研究评估了FFPE和FF样本用于单细胞RNA测序的适用性，并在乳腺癌中识别出多纤毛细胞亚群 | 首次在乳腺癌中通过单细胞RNA测序识别并验证了肿瘤性多纤毛细胞亚群的存在 | 研究样本量较小，仅包括一例浸润性导管癌和一例浸润性小叶癌 | 评估FFPE和FF样本用于单细胞RNA测序的适用性，并分析乳腺癌细胞异质性 | 乳腺癌组织样本，包括FFPE和匹配的FF样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，荧光原位杂交，电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 2例乳腺癌患者（1例IDC，1例ILC），扩展验证包含214例ER阳性浸润性癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7622 | 2025-10-06 |
Smooth Muscle Cells and Fibroblasts in the Proximal Thoracic Aorta Exhibit Minor Differences Between Embryonic Origins in Angiotensin II-driven Transcriptional Alterations
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.610985
PMID:39896657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析血管紧张素II诱导的胸主动脉近端平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组变化 | 首次在血管紧张素II诱导的主动脉病变前病理阶段，比较了不同胚胎起源（第二心场和心脏神经嵴）的平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组差异 | 研究仅关注了病变前病理阶段（3天灌注），未观察长期效应；样本量有限 | 探究不同胚胎起源的胸主动脉近端细胞在血管紧张素II诱导的转录改变中的差异 | 小鼠胸主动脉近端的平滑肌细胞和成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | Mef2c-Cre R26R mT/mG小鼠，基线组和3天血管紧张素II灌注组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7623 | 2025-10-06 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
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研究论文 | 通过构建包含2000多万个细胞的单细胞转录组图谱，系统揭示哺乳动物衰老过程中的细胞群体动态变化 | 开发了PanSci单细胞转录组图谱，首次在哺乳动物中系统描绘了不同生命阶段、性别和基因型的细胞群体动态变化 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明衰老相关的细胞群体动态变化规律 | 623个小鼠组织的2000多万个细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过2000万个细胞，来自623个小鼠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7624 | 2025-10-06 |
Cholecystokinin (CCK) Is a Mediator Between Nutritional Intake and Gonadal Development in Teleosts
2025-01-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020078
PMID:39851506
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研究论文 | 本研究揭示了胆囊收缩素(CCK)作为营养摄入与硬骨鱼性腺发育之间的中介分子 | 首次发现CCK通过下丘脑-垂体-性腺轴调控鱼类生殖过程，并证实CCK可作为营养传感器 | 研究主要基于草鱼模型，结果在其他硬骨鱼中的普适性需要进一步验证 | 探究营养摄入影响性腺发育的分子机制 | 草鱼的下丘脑-垂体-性腺轴组织及原代培养细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 原代细胞培养, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 细胞培养数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7625 | 2025-10-06 |
Comprehensive Analysis Identifies THEMIS2 as a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Glioblastoma
2025-01-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020066
PMID:39851494
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研究论文 | 首次发现THEMIS2作为胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的关键调控因子 | 首次揭示THEMIS2在胶质母细胞瘤免疫微环境中的关键作用及其与肿瘤相关巨噬细胞免疫抑制功能的关联 | NA | 探索胶质母细胞瘤免疫逃逸机制并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7626 | 2025-10-06 |
Skeletal stem/progenitor cell-derived rather than osteoblast-derived IGF2 supports the development and homeostasis of skeletal system via STAT3
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112605
PMID:40384861
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研究论文 | 本研究揭示了骨骼干细胞/祖细胞来源的IGF2通过STAT3信号通路维持骨骼系统发育和稳态的机制 | 首次发现SSPCs而非成骨细胞来源的IGF2通过STAT3信号调控骨骼发育，为Silver-Russell综合征骨骼畸形提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究IGF2在骨骼系统发育和稳态维持中的细胞来源和作用机制 | 小鼠模型、骨髓间充质干细胞、骨骼干细胞/祖细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多种细胞特异性Igf2敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7627 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of adult primate neocortex reveals the regulatory dynamics of neural plasticity
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/ZEOR5569
PMID:40385068
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析成年灵长类新皮质基因表达动态，揭示神经可塑性的调控机制 | 首次在成年灵长类新皮质中发现抑制性神经元的基因表达轨迹与发育期相似，并识别出与神经可塑性相关的关键驱动基因 | 研究仅聚焦于初级视觉皮层的特定抑制神经元亚型，未涵盖其他脑区或神经元类型 | 探究成年灵长类新皮质基因表达动态及其分子基础 | 食蟹猴初级视觉皮层的抑制性神经元（源自内侧神经节隆起） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA velocity, scVelo算法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7628 | 2025-10-06 |
Intra-tumoural RAMP1+ B cells promote resistance to neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2025, Immunotherapy advances
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/immadv/ltaf012
PMID:40385640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现RAMP1+ B细胞在食管鳞癌中对新辅助免疫治疗产生耐药性，并揭示了其通过CGRP-RAMP轴抑制CD8+ T细胞活性的机制 | 首次在食管鳞癌中发现RAMP1+ B细胞亚群介导免疫治疗耐药，并证明靶向CGRP-RAMP轴可增强抗PD-1疗法效果 | 研究主要基于体外实验，需要进一步临床验证 | 研究B细胞亚群及其分化上游信号在食管鳞癌免疫治疗耐药中的作用 | 食管鳞癌患者肿瘤样本 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具有不同免疫治疗反应的食管鳞癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7629 | 2025-10-06 |
Targeting Tumor Differentiation Grade-related Genes Prognostic Signature Including COL5A1 Based on Single-cell RNA-seq in Gastric Cancer
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.107509
PMID:40386054
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序技术鉴定胃癌肿瘤分化等级相关基因预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序结合WGCNA分析构建包含COL5A1的胃癌分化等级相关基因预后特征 | 基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立胃癌肿瘤分化等级相关的基因预后标志物 | 胃癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，HE染色，Kaplan-Meier生存分析 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，临床数据 | GEO数据库中的胃癌单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7630 | 2025-10-06 |
IL7-IL7R Interaction Mediates Fibroblast-Driven Macrophage-to-Osteoclast Differentiation in Periodontitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S524284
PMID:40386183
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证发现IL7R+巨噬细胞是牙周炎中潜在的破骨细胞前体，并揭示了成纤维细胞通过IL7-IL7R信号轴驱动巨噬细胞向破骨细胞分化的新机制 | 首次鉴定出IL7R+巨噬细胞作为牙周炎中具有显著破骨分化潜能的特定亚群，并揭示成纤维细胞通过分泌IL7激活该信号通路的新机制 | NA | 鉴定牙周炎中具有破骨细胞生成潜能的巨噬细胞亚群及其调控机制 | 人类和小鼠牙周炎样本中的巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, ELISA, TRAP染色, micro-CT, qPCR, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7631 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Explore Purine Metabolism-Related Prognostic Risk Model and Tumor Immune Microenvironment Modulation in Ovarian Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5530325
PMID:40386292
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学探索嘌呤代谢相关预后风险模型及其在卵巢癌肿瘤免疫微环境调控中的作用 | 首次构建基于12个嘌呤代谢相关基因的预后风险模型，并发现NME6+上皮细胞作为卵巢癌保护性因子 | 使用公共数据集，样本来源可能受限；需要进一步实验验证 | 探索嘌呤代谢在卵巢癌预后评估和免疫微环境调控中的作用机制 | 卵巢癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR | LASSO回归, 多元回归分析 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 来自不同公共数据集的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7632 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54145-w
PMID:39592577
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义 | 首次系统性地描绘TNBC的空间组织结构，识别出9种空间原型，并发现与免疫治疗反应相关的基因特征 | 样本量相对有限（92例患者），需要在更大队列中进一步验证 | 探索三阴性乳腺癌的肿瘤空间结构和微环境特征 | 92例三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 逐步聚类分析 | 空间转录组数据、组织形态学数据 | 92例TNBC患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7633 | 2025-10-06 |
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54581-8
PMID:39580490
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于分析金黄色葡萄球菌生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应 | 开发了首个针对细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，能够在单细胞分辨率下探索生物膜动态和免疫压力响应 | 方法目前主要应用于金黄色葡萄球菌，在其他细菌物种中的适用性有待验证 | 研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异响应 | 金黄色葡萄球菌生物膜 | 单细胞测序技术 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | BaSSSh-seq（细菌单细胞RNA测序方法） |
| 7634 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics unveils molecular signatures of neuronal vulnerability in a mouse model of prion disease that overlap with Alzheimer's disease
2024-11-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54579-2
PMID:39580485
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了朊病毒病小鼠模型中神经元易损性的分子特征及其与阿尔茨海默病的重叠 | 首次通过单细胞转录组学系统识别朊病毒易损神经元亚群，并发现与阿尔茨海默病共享的易损性相关转录本 | 研究仅使用雌性小鼠模型，未涉及其他性别或更广泛的神经退行性疾病模型 | 探究特定神经元对错误折叠蛋白所致功能障碍和死亡更敏感的分子机制 | 朊病毒感染雌性小鼠的活体神经元 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 朊病毒感染雌性小鼠的神经元样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7635 | 2025-10-06 |
Immunotherapy that improves response to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54295-x
PMID:39578450
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中肿瘤浸润免疫细胞，发现可增强新辅助化疗反应的潜在靶点 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中通过单细胞RNA测序鉴定出STAB1和FOXP3作为化疗增敏的免疫治疗靶点，并开发了相应的靶向治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索提高高级别浆液性卵巢癌对新辅助化疗反应的免疫治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌患者和小鼠模型的肿瘤浸润免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 体外抑制实验, 反义寡核苷酸技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 患者样本64,097个细胞，小鼠模型69,781个细胞，使用三种不同的HGSOC同系小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7636 | 2025-10-06 |
Lenalidomide-induced pure red cell aplasia is associated with elevated expression of MHC-I molecules on erythrocytes
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54571-w
PMID:39578482
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研究论文 | 本研究揭示了来那度胺治疗多发性骨髓瘤时诱发纯红细胞再生障碍的机制 | 首次发现来那度胺通过上调红细胞MHC-I分子表达，激活CD8 T细胞导致红细胞生成障碍 | 研究基于单个病例，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探究来那度胺治疗诱发纯红细胞再生障碍的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者骨髓样本 | 血液肿瘤学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析，体外功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，体外实验数据 | 1例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7637 | 2025-10-06 |
A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma
2024-11-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53802-4
PMID:39567523
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研究论文 | 本研究通过组织学引导和空间转录组学分析肝母细胞瘤，揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt激活协同促进肿瘤细胞增殖的机制 | 发现胚胎胆道转录因子SOX4和生长因子FGF19在肝母细胞瘤增殖异质性中的关键作用，揭示了非遗传性表观遗传机制在肿瘤进化中的功能 | 研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型，需要进一步在体内验证这些发现 | 探究肝母细胞瘤中组织学和增殖异质性的分子机制 | 肝母细胞瘤患者肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官 | 空间转录组学 | 肝母细胞瘤 | 组织学引导的空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像 | 肝母细胞瘤患者样本和肿瘤类器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7638 | 2025-10-06 |
Subcellular Level Spatial Transcriptomics with PHOTON
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612328
PMID:39314454
|
研究论文 | 介绍PHOTON方法实现亚细胞分辨率空间转录组分析 | 结合高分辨率成像与高通量测序，实现亚细胞水平空间转录组分析 | NA | 开发亚细胞分辨率空间转录组分析方法 | 卵巢颗粒细胞、核仁、应激颗粒中的RNA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率成像、高通量测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | PHOTON | PHOTON（纳米尺度转录组光选法） |
| 7639 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.016
PMID:38848718
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研究论文 | 本研究利用空间增强分辨率组学测序和单细胞RNA测序技术，绘制了水稻种子萌发过程中胚胎细胞的时空转录组图谱 | 开发了基于深度学习的自动细胞分割模型，发现了两种先前未报道的盾片细胞类型，并提供了探索胚胎细胞在种子萌发中作用的新方法 | NA | 阐明不同胚胎细胞在调控种子活力和幼苗建成中的复杂生物学功能 | 水稻胚胎细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 原位杂交 | 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 吸水后6、24、36和48小时的水稻胚胎样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7640 | 2025-10-06 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学和高分辨率活体成像技术，揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层迁移的分子机制 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组和活体成像技术系统研究AVE迁移，发现转录状态与细胞位置的紧密关联及信号素信号的关键作用 | 研究仅针对小鼠胚胎模型，结果在其他物种中的普适性有待验证 | 阐明前内脏内胚层独特迁移行为和功能的分子基础 | 小鼠胚胎前内脏内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 基因表达数据, 蛋白质磷酸化数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |