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当前共找到 37592 篇文献，本页显示第 7621 - 7640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7621 | 2025-10-29 |
In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations
2025-Oct-27, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70153
PMID:41146557
|
研究论文 | 开发了能够可靠代表肿瘤中观察到的癌症相关成纤维细胞表型的共培养模型，并利用单细胞转录组学分析CAF亚型异质性 | 建立了能够模拟肿瘤微环境中CAF表型的可转化共培养模型系统，并首次系统评估了CRISPR扰动对不同CAF亚型的特异性影响 | 研究主要基于胰腺癌患者的CAF细胞系，模型系统的可转化性仍需进一步验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚型异质性及其对CRISPR扰动的特异性响应 | 胰腺癌患者来源的原代CAF和永生化肿瘤细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | 共培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | 胰腺癌患者来源的CAF细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7622 | 2025-10-29 |
Deciphering lactate/lactylation networks in AML: integrated scRNA-seq and transcriptomics reveal functions and prognostic model
2025-Oct-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14938-8
PMID:41139200
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组学数据，揭示乳酸/乳酸化网络在急性髓系白血病中的功能并构建预后模型 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统研究乳酸代谢和组蛋白乳酸化在AML中的预后价值，并构建了基于机器学习的7基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能实验验证机制 | 探索乳酸/乳酸化相关基因在急性髓系白血病中的预后价值和分子机制 | 急性髓系白血病患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 10种机器学习算法构建的预后模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7623 | 2025-10-29 |
ARHGAP11A, a member of Rho GTPase activating protein family, as a prognostic biomarker linked to DNA damage response across pan-cancer
2025-Oct-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15106-8
PMID:41136949
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，发现ARHGAP11A作为RhoGAP家族成员在泛癌中过表达，与DNA损伤反应和免疫调节相关，是潜在的预后标志物 | 首次在泛癌水平系统分析RhoGAP家族基因，鉴定ARHGAP11A为最显著过表达成员，并揭示其与DNA损伤反应和免疫调节的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能机制研究 | 探究RhoGAP家族基因在癌症中的作用，特别关注ARHGAP11A的生物学功能和临床意义 | 33种癌症类型的10,000多个样本，包括肿瘤组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序，Western blotting，集落形成实验 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，临床数据 | 超过10,000个样本，涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7624 | 2025-10-29 |
Whole-genome sequencing reveals individual and cohort level insights into chromosome 9p syndromes
2025-Oct-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01563-0
PMID:41137173
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析100名9号染色体综合征患者，揭示了个体和队列水平的基因组特征 | 首个大规模9号染色体综合征全基因组测序研究，开发了DiamondsDenovo计算工具和机器学习预测模型 | 样本量相对有限，仅针对9号染色体特定区域 | 深入解析9号染色体缺失和重复综合征的基因组结构特征 | 100名来自9号染色体综合征家庭的个体 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组序列数据 | 100名个体 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7625 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2025-Oct-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
PMID:41125832
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序构建结肠衰老的细胞和空间图谱 | 开发了cSplotch计算框架，利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息，学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型，人类结肠衰老的适用性需要进一步验证 | 研究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织, 约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7626 | 2025-10-29 |
Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons
2025-Oct-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69061
PMID:41144432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞分选技术揭示了神经元膜蛋白酶体在特定感觉神经元亚型中的表达及其在痛觉调节中的关键作用 | 首次在特定外周体感神经元亚群中发现并表征了神经元膜蛋白酶体（NMP），证明其选择性抑制可降低机械和疼痛敏感性而不引起神经病变 | 研究主要基于小鼠模型，在体实验仅限于爪部皮肤，人类相关性尚需进一步验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在体感神经元中的细胞亚型特异性表达及其在感觉信号传导中的功能 | 小鼠体感神经元，特别是MrgprA3和Cysltr2神经元亚群 | 神经科学 | 疼痛疾病 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，抗体标记 | NA | 单细胞转录组数据，细胞分选数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7627 | 2025-10-29 |
Identification of a PRDM1-regulated T cell network to regulate atherosclerotic plaque inflammation
2025-Oct-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01541-6
PMID:41039608
|
研究论文 | 本研究通过网络分析方法识别了调控动脉粥样硬化斑块炎症的PRDM1调节T细胞网络 | 首次采用加权基因共表达网络分析和贝叶斯网络推断相结合的方法，识别了区分高低风险斑块的PRDM1调控T细胞网络 | 样本量相对有限（人类斑块样本n=43），且PRDM1靶向药物尚未开发 | 探索人类动脉粥样硬化斑块从低风险向高风险转变过程中的免疫基因调控机制 | 人类颈动脉斑块（稳定型和不稳定型）和Ldlr基因敲除小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 贝叶斯网络推断, 单细胞RNA测序, 计算机药物重定位 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本43例（稳定型16例，不稳定型27例），Ldlr基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7628 | 2025-10-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Granzyme K+ CD8+ T Cells as a Target for Mitigating Plaque Instability Following Radiation
2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.040632
PMID:40913272
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了颗粒酶K+ CD8+ T细胞在放疗后斑块不稳定性中的关键作用 | 首次发现颗粒酶K+ CD8+ T细胞亚群在放疗诱导的动脉粥样硬化病变进展中的致病功能，并确定GZMB作为放射性心血管损伤的介质 | 研究基于动物模型（兔和小鼠），结果需要在人体中进一步验证 | 探究放疗诱导斑块不稳定性的机制及影像学特征变化 | 兔颈动脉斑块模型和ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化病变 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，光学相干断层扫描-血管内超声双模成像，生物信息学分析，病理染色，流式细胞术，基因敲除，抗体清除 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据 | 兔模型和小鼠模型（ApoE-/-小鼠在未照射、早期照射和晚期照射三个阶段） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7629 | 2025-10-29 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Dynamic Cell Populations and Immune Infiltration in Moyamoya Disease
2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.041168
PMID:40913267
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了烟雾病病理动脉中的细胞组成和免疫浸润动态 | 首次构建烟雾病浅表颞动脉的单细胞转录组图谱，发现自然杀伤T细胞在促进血管细胞增殖和迁移中的关键作用 | 样本量较小（2例患者和3例对照），仅使用浅表颞动脉样本 | 全面绘制烟雾病病理动脉的细胞组成和分子改变 | 烟雾病患者和健康对照者的浅表颞动脉样本 | 单细胞生物学 | 烟雾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5个样本（2例患者，3例对照），共26,371个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7630 | 2025-10-29 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Pericarotid Lymph Nodes Indicating Stability of Carotid Atherosclerotic Plaques
2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039777
PMID:40932121
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析探索颈动脉周围淋巴结与动脉粥样硬化斑块稳定性之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示颈动脉周围淋巴结与动脉粥样硬化斑块稳定性的关联，并发现淋巴结肿大可作为斑块不稳定的潜在生物标志物 | 样本仅来自严重颈动脉狭窄患者，结果可能不适用于早期或轻度病例 | 研究淋巴结功能与动脉粥样硬化的关系，特别关注斑块稳定性 | 106例接受颈动脉内膜切除术的严重颈内动脉狭窄患者及其颈动脉周围淋巴结 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序，T/B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 106例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7631 | 2025-10-29 |
Thymic DC2 are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2025-Jun-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659520
PMID:40666966
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺DC2细胞的异质性并鉴定出新型过渡性树突状细胞群体 | 发现传统认为的'DC2'实际上包含4个不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1过渡性树突状细胞这一新型胸腺细胞群体 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺中这些细胞群体的存在和功能需要进一步验证 | 解析胸腺髓系细胞的起源、发育和稳态维持机制 | 胸腺髓系细胞，特别是树突状细胞DC2亚群 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序，谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7632 | 2025-10-29 |
Whole-Genome Sequencing Reveals Individual and Cohort Level Insights into Chromosome 9p Syndromes
2025-Mar-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.28.25324850
PMID:40196253
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研究论文 | 通过全基因组测序对100名9p相关综合征患者进行基因组分析，揭示了染色体9p综合征的个体和队列水平特征 | 首个大规模全基因组测序研究9p相关综合征，识别了两个新的晚复制区域，建立了基于机器学习的9p缺失综合征预测模型 | 样本量相对有限，需要进一步扩大研究队列 | 深入理解染色体9p缺失和重复综合征的基因组结构和发病机制 | 100名来自9p相关综合征家庭的个体，包括85名无关先证者 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序，空间转录组学，机器学习 | 机器学习模型 | 基因组序列数据，基因表达数据 | 100名个体（85名无关先证者） | NA | 全基因组测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 7633 | 2025-10-29 |
Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis
2025-02-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604
PMID:39982975
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研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化症患者颈深淋巴结的免疫景观，揭示EB病毒在疾病发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞转录组与表位索引技术，发现多发性硬化症患者颈深淋巴结中EB病毒特征性B细胞异常 | 样本量有限，仅针对新诊断未治疗患者，需要更大规模研究验证 | 探究EB病毒感染与多发性硬化症发病机制的关联 | 多发性硬化症患者的颈深淋巴结组织和唾液样本 | 单细胞测序分析 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 细胞转录组与表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表位数据, DNA数据 | 新诊断未治疗的多发性硬化症患者（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7634 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7635 | 2025-10-29 |
Identification of a distinctive gene signature in granulomatous myositis
2025-Jan-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.12.27.24319708
PMID:40568658
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的特异性基因特征 | 首次系统识别了肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征，发现CHIT1基因表达与疾病严重程度密切相关 | 样本量相对有限（38例GM患者），需要更大规模研究验证 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本，包括肉芽肿性肌炎患者、其他肌病患者和健康对照 | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA测序数据，空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 722例肌肉活检（包括38例GM患者） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7636 | 2025-10-28 |
EpiFoundation: A Foundation Model for Single-Cell ATAC-seq via Peak-to-Gene Alignment
2025-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636688
PMID:39975086
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研究论文 | 本文提出了首个专门针对单细胞ATAC-seq数据的预训练基础模型EpiFoundation，通过峰值到基因对齐解决数据稀疏性问题 | 开发了创新的跨模态预训练方法，专门处理非零峰值集以提高信息密度，并利用基因表达信息监督预训练过程 | NA | 开发专门针对单细胞ATAC-seq数据的基础模型，解决高维稀疏数据的表示学习问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞表示学习 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 基础模型 | 表观基因组数据, 基因表达数据 | 超过100,000个单细胞，包含配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7637 | 2025-10-28 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals unique transcription patterns, immune responses and early morphological alterations
2025-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究HIV和结核分枝杆菌共感染的早期空间转录组特征 | 首次在HIV和结核分枝杆菌共感染模型中应用空间转录组技术揭示早期免疫细胞浸润模式和转录特征 | 研究仅观察感染后三周的早期变化，未涵盖疾病全程发展 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期免疫细胞浸润的表型和功能变化 | 人源化小鼠模型的肺组织 | 空间转录组学 | HIV和结核分枝杆菌共感染 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 人源化小鼠感染模型（单感染和共感染组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7638 | 2025-10-28 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
|
研究论文 | 开发了一种名为STAMP的新型单细胞分析方法，通过成像平台实现转录组和蛋白质组的多模态分析 | 通过成像而非测序进行单细胞分析，消除了测序成本，支持RNA、蛋白质和H&E的多模态分析，同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服单细胞RNA测序在可扩展性、高成本和细胞破坏方面的限制 | 外周血单核细胞、细胞系和干细胞 | 数字病理学 | NA | 转录组成像、蛋白质组成像、多模态分析 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 10,962,092个高质量细胞/细胞核和6,030,429,954个转录本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 成像平台，支持多模态（RNA、蛋白质和H&E）分析 |
| 7639 | 2025-10-28 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
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研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计原理的空间分子数据分析方法VIMA，用于识别与疾病相关的空间特征 | 将变分自编码器与多重检验控制相结合，通过定义数据依赖的'微生态位'来发现传统方法难以识别的疾病相关空间结构 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法，识别与疾病相关的关键空间结构 | 空间分子数据中的组织斑块和微生态位 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎,溃疡性结肠炎,痴呆 | 免疫荧光显微镜,CODEX,空间转录组学 | 变分自编码器 | 空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学,免疫荧光,CODEX | NA | NA |
| 7640 | 2025-10-28 |
CROPseq-multi: a universal solution for multiplexed perturbation in high-content pooled CRISPR screens
2025-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
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研究论文 | 开发了一种名为CROPseq-multi的多重CRISPR筛选系统，用于在高质量集合筛选中实现通用多重扰动 | 开发了具有多功能读出兼容性的CROPseq-inspired慢病毒系统，支持单个和组合扰动，在条形码识别和扰动性能方面表现优异 | NA | 开发兼容多种筛选方法的多重CRISPR扰动系统 | CRISPR筛选系统和遗传扰动技术 | 基因编辑技术 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序，光学集合筛选 | NA | 基因表达数据，条形码序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，光学集合筛选 | NA | NA |