单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29362 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-06-24 |
A spatial transcriptomic atlas of acute neonatal lung injury across development and disease severity
2025-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.02.656433
PMID:40502191
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research paper | 利用基于成像的空间转录组学分析了17个不同发育和损伤阶段的人类婴儿肺组织的基因表达模式，创建了一个包含约120万个细胞的空间转录组图谱 | 首次创建了人类婴儿肺发育和损伤的空间转录组图谱，揭示了组织结构和分子空间关系在发育过程中的协调及疾病中的破坏 | 样本量相对有限（17例），且主要关注急性新生儿肺损伤 | 阐明肺器官发育过程中细胞转变的时序和调控机制 | 17个不同发育和损伤阶段的人类婴儿肺组织 | 空间转录组学 | 新生儿肺损伤 | 成像基空间转录组学 | 计算聚类方法 | 空间转录组数据 | 17例人类婴儿肺组织，约120万个细胞 |
| 742 | 2025-06-24 |
New Anti-Fibrotic Strategies for Keloids: Insights From Single-Cell Multi-Omics
2025-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13818
PMID:39902627
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究瘢痕疙瘩的细胞异质性和分子机制，发现两种成纤维细胞亚群在纤维化过程中的不同作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定瘢痕疙瘩中POSTN阳性间充质成纤维细胞和IGFBP2阳性成纤维细胞的差异及其在纤维化中的相反作用 | 样本量较小（仅3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本），需要更大规模的研究验证 | 探索瘢痕疙瘩的发病机制并开发新型抗纤维化治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 单细胞多组学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学分析、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本 |
| 743 | 2025-06-24 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-06, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫系统多层次异质性中的应用 | 利用scRNA-seq和ST技术系统性地研究了皮肤免疫功能的分子和细胞特征，揭示了细胞类型在维持稳态和疾病中的相互作用 | NA | 探讨皮肤免疫系统的多层次异质性及其在疾病中的作用 | 皮肤免疫细胞及其空间组织 | 生物医学 | 皮肤疾病 | scRNA-seq, ST | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA |
| 744 | 2025-06-24 |
Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08945-9
PMID:40307543
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研究论文 | 该研究探讨了通过抑制基质机械感知来抑制心脏纤维化的新策略 | 发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械传感器，可通过药物抑制模拟基质软化效果，并与TGFβ抑制协同抑制纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织，人类临床应用的可行性尚需验证 | 探索治疗心血管纤维化的新方法 | 心脏成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型和工程化心脏组织 | 基因表达数据 | 公共人类和小鼠单细胞测序数据集 |
| 745 | 2025-06-24 |
Low-dose interleukin-2 induces clonal expansion of BACH2-repressed effector regulatory T cells following acute coronary syndrome
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00652-y
PMID:40461772
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研究论文 | 研究低剂量白细胞介素-2（IL-2）在急性冠状动脉综合征患者中诱导BACH2抑制的效应调节性T细胞克隆扩增的机制 | 结合单细胞转录组学和T细胞受体分析，揭示IL-2在急性冠状动脉综合征患者中克隆扩增效应T细胞的作用，并发现BACH2作为T效应程序的抑制因子 | 研究未涉及IL-2治疗对其他免疫细胞类型的影响，且样本量有限 | 探索IL-2在心血管疾病中的免疫调节作用及其治疗潜力 | 急性冠状动脉综合征患者的T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、T细胞受体分析 | NA | 转录组数据、T细胞受体序列 | 急性冠状动脉综合征患者样本 |
| 746 | 2025-06-24 |
scExploreR: a flexible platform for democratized analysis of multimodal single-cell data by non-programmers
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656649
PMID:40501593
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research paper | 介绍了一个名为scExploreR的灵活平台，旨在为非程序员提供多模式单细胞数据的民主化分析 | scExploreR作为一个打包的R Shiny应用，支持本地运行或服务器部署，提供广泛的绘图定制选项，并能无缝处理多模式数据 | 虽然scExploreR为非程序员提供了分析单细胞数据的工具，但对于复杂的分析任务，编程经验可能仍是必要的 | 开发一个平台，使非程序员能够直接探索和分析单细胞数据，弥合生物学和计算科学之间的沟通鸿沟 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | R Shiny | 单细胞数据 | NA |
| 747 | 2025-06-24 |
Chevreul: An R Bioconductor Package for Exploratory Analysis of Full-Length Single Cell Sequencing
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656486
PMID:40501968
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研究论文 | 介绍了一个名为Chevreul的开源R Bioconductor包和交互式R Shiny应用，用于处理和可视化单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | Chevreul区别于其他scRNA-seq分析包的特点在于其易用性、分析全长RNA测序数据的能力以及对批次校正的支持 | 现有分析工具未提供专门的异构体水平分析或可变剪接检测工具 | 开发一个便于研究人员无需编程经验即可分析全长scRNA-seq数据的工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 748 | 2025-06-24 |
NKG7 is a Stable Marker of Cytotoxicity Across Immune Contexts and Within the Tumor Microenvironment
2025-Jun, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202551885
PMID:40538191
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研究论文 | 该研究通过大规模单细胞RNA测序图谱，全面分析了免疫亚群和组织中的细胞毒性，发现NKG7是细胞毒性的稳定标记物 | 发现NKG7作为细胞毒性的新标记物，其表达与细胞毒性活动高度相关（r = 0.97），且比传统标记物如颗粒酶B和穿孔素更可靠 | 其他人类颗粒酶和细胞毒性成分的作用尚未充分探索 | 评估NKG7作为细胞毒性标记物的表达模式和功能 | 免疫亚群和组织中的细胞毒性 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 大规模公开可用的单细胞RNA测序图谱 |
| 749 | 2025-06-24 |
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656393
PMID:40502193
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研究论文 | 通过多组学分析，研究唐氏综合症患者肝脏代谢的变化及其与饮食的关系 | 首次在唐氏综合症患者和小鼠模型中发现了胆汁酸代谢的改变及肝脏功能障碍的蛋白质特征，并探讨了饮食脂肪对基因表达和肝脏病理的影响 | 研究样本量虽然较大（超过400人），但未明确说明样本的具体来源和多样性 | 探讨唐氏综合症患者肝脏代谢的变化及其潜在机制 | 唐氏综合症患者和小鼠模型 | 代谢组学 | 唐氏综合症 | 多组学分析、RNA测序、单细胞转录组学 | Dp16小鼠模型 | 血浆、RNA测序数据 | 超过400人的血浆样本及小鼠模型 |
| 750 | 2025-06-24 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了白色和棕色前脂肪细胞，揭示了它们共有的纤维-脂肪祖细胞群 | 发现了棕色脂肪组织中存在纤维-脂肪祖细胞样细胞（FAPLs），扩展了祖细胞群的已知范围 | 研究仅基于体外培养的细胞模型，可能无法完全反映体内情况 | 研究脂肪组织异质性及其在生理和病理生理学中的功能 | 白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 |
| 751 | 2025-06-24 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
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研究论文 | 本研究首次识别了颞下颌关节（TMJ）中的滑膜淋巴系统，并揭示了其在关节炎和疼痛中的作用 | 首次发现TMJ中的滑膜淋巴系统，并证明淋巴功能障碍会驱动TMJ关节炎和疼痛 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探索TMJ关节炎中淋巴系统的调控和功能 | 颞下颌关节（TMJ）的淋巴系统 | 生物医学研究 | 关节炎 | 基因报告小鼠、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据、影像数据 | 基因报告小鼠和人类组织 |
| 752 | 2025-06-24 |
Eriodictyol from Scutellariae Barbata alleviates inflammation and necrosis via ZBP1-dependent signaling in acute pancreatitis
2025-May-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156926
PMID:40544733
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研究论文 | 本研究探讨了黄芩中活性成分圣草酚通过ZBP1依赖性信号通路缓解急性胰腺炎的炎症和坏死 | 首次揭示了圣草酚通过靶向ZBP1依赖性信号通路减轻急性胰腺炎的炎症和坏死 | 研究未涉及圣草酚在人体中的安全性和有效性验证 | 探究黄芩及其活性成分圣草酚对急性胰腺炎的治疗机制 | 急性胰腺炎模型动物及266-6细胞 | 药理学 | 急性胰腺炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、分子对接、动态分子模拟、细胞热位移分析、药物亲和响应靶标稳定性分析、mtDNA分析 | NA | RNA-seq数据、蛋白质相互作用网络数据 | 未明确说明样本数量 |
| 753 | 2025-06-24 |
sciLaMA: A Single-Cell Representation Learning Framework to Leverage Prior Knowledge from Large Language Models
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.28.635153
PMID:40501921
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研究论文 | 提出了一种名为sciLaMA的单细胞表示学习框架，通过整合多模态大型语言模型的静态基因嵌入与scRNA-seq表格数据，提升单细胞数据分析的性能 | sciLaMA通过结合多模态大型语言模型的基因嵌入与单细胞RNA测序数据，解决了现有方法在整合外部生物知识方面的不足，同时保持了计算效率 | NA | 开发一个高效且统一的单细胞数据分析框架，用于提升下游任务的性能，如批次效应校正、细胞聚类和基因模块识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 配对变分自编码器（paired-VAE） | 表格基因表达数据 | NA |
| 754 | 2025-06-24 |
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656468
PMID:40502104
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研究论文 | 介绍了一种名为MIC-Drop-seq的新技术，用于在斑马鱼胚胎中进行大规模单细胞表型分析 | 结合了高通量基因破坏和多重单细胞RNA测序技术，实现了在脊椎动物发育中大规模基因功能图谱的绘制 | 技术目前仅应用于斑马鱼胚胎，尚未在其他生物体或更复杂的系统中验证 | 开发一种可扩展的平台，用于在脊椎动物发育中以细胞分辨率绘制基因功能 | 斑马鱼胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、多重混合CRISPR液滴技术 | NA | 基因表达数据 | 1000个斑马鱼胚胎，靶向50个转录调节因子 |
| 755 | 2025-06-24 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655632
PMID:40501660
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research paper | 该研究通过多模式单细胞测序和刺激实验，定义了人类巨噬细胞在不同组织中的特征 | 揭示了人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性基因和蛋白质特征，这些特征与小鼠巨噬细胞具有同源性 | 研究样本来源于器官捐赠者，可能无法完全代表所有人群的巨噬细胞特征 | 研究人类巨噬细胞在不同组织中的转录特征及其在稳态和激活状态下的变化 | 人类巨噬细胞，包括来自肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结的样本 | 免疫学 | NA | 多模式单细胞测序，刺激实验 | NA | 单细胞测序数据 | 来自多个器官捐赠者的肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结样本 |
| 756 | 2025-06-24 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
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研究论文 | 利用空间转录组学技术对小鼠肾脏冷缺血损伤进行时空转录组分析，揭示特定区域的分子变化 | 首次使用空间转录组学技术全面表征冷缺血损伤的时空转录组变化，并开发了计算工作流程以识别特定区域的病理生理变化 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类 | 揭示冷缺血损伤对肾脏移植预后的分子机制 | 小鼠肾脏 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠肾脏样本（冷缺血损伤0-48小时） |
| 757 | 2025-06-24 |
miR-190 is a Key Regulator in Establishing Cell Polarity and Specification in the Drosophila Nervous System
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656688
PMID:40501908
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研究论文 | 本文发现miR-190在果蝇神经系统细胞极性和分化中的关键调控作用 | 首次揭示miR-190通过调控Par复合体和基底决定因子的定位来影响神经母细胞极性和命运决定 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究miR-190在神经母细胞不对称分裂和细胞命运决定中的分子机制 | 果蝇胚胎神经母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、qPCR | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | NA |
| 758 | 2025-06-24 |
Multitissue single-cell analysis reveals differential cellular and molecular sensitivity between fructose and high-fat high-sucrose diets
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115690
PMID:40349341
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研究论文 | 通过多组织单细胞分析揭示了果糖和高脂高糖饮食在细胞和分子敏感性上的差异 | 首次在单细胞水平上比较了高脂高糖饮食与果糖饮食对不同组织细胞类型的影响，并发现mt-Rnr2作为共同调节因子可减轻饮食诱导的代谢综合征 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 阐明不同饮食条件下各组织和细胞类型在代谢综合征中的作用 | 小鼠的下丘脑、肝脏、脂肪组织和小肠 | 单细胞组学 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠组织样本（具体数量未明确说明） |
| 759 | 2025-06-24 |
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100076
PMID:40453149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）中非恶性B细胞和肿瘤细胞共有的克隆特征 | 首次在T-PLL中发现非恶性B细胞和克隆性T细胞共有的突变特征，并揭示了诊断与复发间克隆演变的多样性模式 | 样本量较小（16例患者），且仅对19个基因进行了测序 | 阐明T-PLL的克隆起源和进化动力学 | 16名T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 | 基因组学 | 白血病 | 靶向NGS、液滴数字PCR、单细胞多组学分析（Mission Bio Tapestri Platform） | NA | 基因组DNA数据 | 16名T-PLL患者的配对诊断和复发样本 |
| 760 | 2025-06-24 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.650107
PMID:40492199
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研究论文 | 介绍了一个名为SCassist的R包，利用大型语言模型（LLM）来简化和增强单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析流程 | 首次将大型语言模型（LLM）集成到scRNA-seq数据分析的关键步骤中，提供智能化的参数推荐和结果解释 | 未提及模型在特定数据集上的性能评估或与其他工具的对比结果 | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，降低技术门槛 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | LLM（包括Gemini、GPT和Llama3） | 单细胞RNA测序数据 | NA |