单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29390 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-06-26 |
A CD8+ T Cell Infiltration-Driven Prognostic Signature for Gastric Cancer: Bridging Tumor Immunity and Clinical Outcomes
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6629479
PMID:40547199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，揭示了胃癌中CD8+ T细胞的异质性及其与临床预后的关系 | 首次系统解析了胃癌微环境中CD8+ T细胞的功能亚群，并鉴定了一个由SELL、CD79B和RAMP2组成的三基因预后标志物 | 样本量相对较小（23例胃癌组织），且需要进一步的前瞻性临床验证 | 探究胃癌微环境中CD8+ T细胞异质性及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 | 胃癌组织中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 无监督聚类、伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 23例胃癌组织（来自GEO数据库）和TCGA-STAD数据集 |
| 742 | 2025-06-26 |
Interrogation of macrophage-related prognostic signatures reveals a potential immune-mediated therapy strategy by histone deacetylase inhibition in glioma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1554845
PMID:40548122
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研究论文 | 该研究通过分析胶质瘤相关巨噬细胞（GAMs）的基因特征，构建了一个预后模型，并筛选出Vorinostat作为潜在的治疗药物 | 结合单细胞RNA测序和WGCNA分析，识别了14个与GAMs相关的预后基因，并验证了Vorinostat在胶质瘤微环境中的抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅使用了胶质瘤细胞-巨噬细胞共培养模型，未进行体内实验 | 探索胶质瘤相关巨噬细胞的分子机制，寻找潜在的治疗靶点和药物 | 胶质瘤相关巨噬细胞（GAMs） | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, WGCNA, Cox回归分析, LASSO回归分析 | 预后模型 | 基因表达数据 | NA |
| 743 | 2025-06-26 |
Development of a machine learning-derived dendritic cell signature for prognostic stratification in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621370
PMID:40552290
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研究论文 | 开发了一种基于机器学习的树突状细胞特征，用于肺腺癌的预后分层 | 首次构建了树突状细胞相关特征（DCRS），并验证其在多个外部队列中的预后性能，同时揭示了PLEK2在肺腺癌中的功能作用 | 研究依赖于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探索树突状细胞在肺腺癌中的转录多样性和预后价值 | 肺腺癌（LUAD）患者和正常组织的树突状细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、伪时间分析 | Lasso-Cox、RSF、CoxBoost、Stepwise-Cox | RNA测序数据 | 七个外部队列的临床样本和肺腺癌细胞系 |
| 744 | 2025-06-26 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
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研究论文 | 研究机械张力如何通过细胞培养基底刚度影响人类原发性肺成纤维细胞的衰老标志物和分泌表型 | 揭示了机械张力对细胞衰老及其分泌表型的影响，特别是在高刚度条件下观察到的独特分泌蛋白谱和转录组特征 | 研究主要基于体外细胞培养模型，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨物理刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型(SASP)的影响 | 人类原发性肺成纤维细胞(IMR-90) | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析, 转录组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 人类原发性肺成纤维细胞在不同刚度基底(2 kPa, 50 kPa, ~3 GPa)上的培养 |
| 745 | 2025-06-26 |
scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614685
PMID:39386549
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研究论文 | 介绍了一种基于transformer的深度学习模型scEMB，用于从大规模单细胞转录组数据中学习基因的上下文表示 | scEMB采用创新的分箱策略整合多平台数据，有效保留基因表达层次和细胞类型特异性，并在下游任务中表现优于现有模型 | 未明确提及具体局限性 | 从复杂基因表达数据中提取有生物学意义的见解，加速精准医学和治疗开发的发现 | 大规模单细胞转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组技术 | transformer | 单细胞转录组数据 | 超过3000万个单细胞转录组 |
| 746 | 2025-06-26 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
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研究论文 | 提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | scHD4E仅使用四种顶级方法进行集成学习，相比现有方法scDEA（使用12种方法）表现更优 | 未提及具体局限性 | 开发更准确稳定的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 集成学习 | 基因表达数据 | 六个真实scRNA-seq数据集和五个实验数据集 |
| 747 | 2025-06-26 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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综述 | 本文总结了2023年EMBO研讨会'发育代谢：能量、物质和信息的流动'中的关键讨论，强调了现代发育生物学面临的挑战与机遇 | 探讨了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等新技术如何为发育代谢领域带来全新的研究方向 | NA | 探索发育代谢领域的新机遇与技术进展 | 细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢通讯以及基因与代谢物在时空上的相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序、计算模型 | NA | 代谢数据、基因表达数据 | NA |
| 748 | 2025-06-26 |
Single-cell landscape analysis unravels molecular programming of the human B cell compartment in chronic GVHD
2023-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169732
PMID:37129971
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示人类B细胞区室在慢性移植物抗宿主病中的分子编程 | 首次在allo-HCT患者中通过scRNA-Seq揭示了B细胞区室的分子编程，并识别了与cGVHD相关的潜在致病性非典型B细胞 | 研究样本可能不足以代表所有cGVHD患者，且未深入探讨发现的分子机制如何具体导致疾病 | 理解异基因造血干细胞移植后B细胞在慢性移植物抗宿主病中的分子编程 | 来自异基因造血干细胞移植患者的纯化B细胞 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大量来自患者的纯化B细胞 |
| 749 | 2025-06-26 |
Single-cell transcriptome analysis reveals three sequential phases of gene expression during zebrafish sensory hair cell regeneration
2022-03-28, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.03.001
PMID:35316618
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了斑马鱼感觉毛细胞再生过程中基因表达的三个连续阶段 | 首次在斑马鱼感觉毛细胞再生过程中发现了三个顺序激活的基因模块，并提供了前所未有的时空分辨率 | 研究结果主要基于斑马鱼模型，可能不完全适用于哺乳动物 | 理解感觉毛细胞再生的分子机制，并为哺乳动物毛细胞再生提供潜在策略 | 斑马鱼感觉毛细胞 | 单细胞转录组学 | 听力缺陷 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 750 | 2025-06-26 |
CRISPR/Cas9-based genetic screen of SCNT-reprogramming resistant genes identifies critical genes for male germ cell development in mice
2021-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94851-9
PMID:34326397
|
研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因筛选技术，研究小鼠体细胞核移植重编程抗性基因（SRRGs）在雄性生殖细胞发育中的关键作用 | 首次利用CRISPR技术系统性筛选SRRGs基因，并发现Cox7b2、Gm773和Tuba3a/3b对精子生成的关键调控作用 | 研究仅针对小鼠模型，人类生殖医学的转化应用仍需进一步验证 | 揭示SRRGs基因在雄性生殖细胞发育中的分子机制 | C57BL/6N小鼠的五个未表征SRRGs基因（Cox8c、Cox7b2、Tuba3a/3b、Faiml和Gm773） | 生殖生物学 | 男性不育症 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | C57BL/6N小鼠（具体数量未明确说明） |
| 751 | 2025-06-24 |
Kidney diseases and single-cell sequencing research: a bibliometric analysis from 2015 to 2024
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2521457
PMID:40545992
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2015年至2024年间单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肾脏疾病研究中的应用 | 揭示了scRNA-seq技术在肾脏疾病研究中的快速发展和应用趋势，包括疾病进展机制、基因调控表达等新兴研究方向 | 研究仅基于Web of Science Core Collection数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 评估scRNA-seq在肾脏疾病研究中的应用现状和未来趋势 | 2015年至2024年间发表的关于scRNA-seq在肾脏疾病研究中应用的文献 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | scRNA-seq | NA | 文本 | 1,210篇出版物 |
| 752 | 2025-06-24 |
Sex-specific neurotoxicity induced by long-term bisphenol A exposure: Single-cell sequencing reveals dual mechanisms involving hippocampal gliosis and neuronal apoptosis
2025-Aug-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.179810
PMID:40505511
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研究论文 | 本研究探讨了长期暴露于双酚A（BPA）对成年小鼠行为记忆和神经系统的影响，揭示了性别特异性的神经毒性机制 | 首次结合单细胞测序技术，揭示了BPA暴露引起的性别特异性神经毒性机制，包括雌性小鼠海马胶质增生和雄性小鼠海马齿状回颗粒神经元凋亡 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类外推需谨慎 | 探究长期BPA暴露对神经系统的影响及其性别特异性机制 | 成年小鼠 | 神经毒理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 行为数据、形态学数据、单细胞测序数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 753 | 2025-06-24 |
Mucosal Macrophages Govern Intestinal Regeneration in Response to Injury
2025-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.01.252
PMID:40086603
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研究论文 | 本研究揭示了黏膜巨噬细胞在肠道损伤后再生过程中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞通过分泌neuregulin 1和osteopontin分子诱导肠道上皮细胞胎儿样重编程和增殖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明辐射性肠炎后肠道再生的分子机制 | 肠道巨噬细胞与肠道干细胞 | 分子生物学 | 辐射性肠炎 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、器官共培养系统 | 小鼠辐射损伤模型、人类肠道类器官模型 | 基因表达数据、细胞成像数据 | 未明确说明具体样本数量（小鼠模型和人类类器官） |
| 754 | 2025-06-24 |
Targeting FGFR Attenuates Tumor Growth in an Anal Squamous Cell Carcinoma Patient Derived Xenograft Model
2025-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23919
PMID:40256931
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研究论文 | 通过患者来源的异种移植模型和单细胞RNA测序，研究发现FGFR抑制能有效减缓肛门鳞状细胞癌的肿瘤生长 | 首次在肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型中验证FGFR抑制剂的治疗效果，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤细胞的异质性 | 研究仅基于一个转移性肛门鳞状细胞癌样本，样本量较小 | 寻找肛门鳞状细胞癌的可操作治疗靶点 | 肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型 | 肿瘤学 | 肛门鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 傅里叶变换红外光谱 | 患者来源的异种移植模型(PDX) | 基因表达数据, 光谱数据 | 1例转移性肛门鳞状细胞癌样本 |
| 755 | 2025-05-14 |
Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq
2025-Jul, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00853-y
PMID:40355601
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 756 | 2025-06-22 |
Deciphering Macrophage-Fibroblast Cross Talk in Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis: Insights From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0337
PMID:40540667
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 757 | 2025-06-24 |
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500965R
PMID:40540299
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研究论文 | 通过多组学分析解析异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 | 识别了异位骨化中的关键细胞亚群和分子（Ppib和Tagln），并构建了它们的调控网络和空间分布 | NA | 阐明异位骨化（HO）的关键生物分子网络 | 异位骨化中的迁移体相关细胞亚群 | 多组学分析 | 异位骨化 | 单细胞转录组、批量转录组、空间转录组、hdWGCNA、机器学习 | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 |
| 758 | 2025-06-24 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和实验分析，揭示了巨噬细胞铁死亡在慢性阻塞性肺疾病（COPD）发展中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞铁死亡是COPD发展的关键事件，并揭示了相关基因表达的变化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限 | 探究COPD发病机制中巨噬细胞铁死亡的作用 | 巨噬细胞和COPD患者及小鼠模型 | 生物医学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、免疫荧光、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting | 小鼠COPD模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞测序数据，RAW264.7细胞系和BMDM细胞系，COPD小鼠模型 |
| 759 | 2025-06-24 |
Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2025-Jun-24, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002506
PMID:40434736
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research paper | 本研究探讨了SPHK1在结直肠癌（CRC）进展中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次通过生物信息学和实验分析全面评估SPHK1在CRC中的功能及其与免疫浸润和肿瘤微环境的关系 | 研究样本量有限（90例CRC组织），且部分机制尚未完全阐明 | 探究SPHK1在CRC进展中的分子机制及其临床意义 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学与肿瘤学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化（MR）、多重荧光免疫组化 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、免疫组化数据 | 90例CRC组织及对应正常组织 |
| 760 | 2025-06-24 |
Imbalances in adrenal hormones and their effects on bone metabolism
2025-Jun-21, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ25-0117
PMID:40545362
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综述 | 本文综述了肾上腺激素失衡对骨代谢的影响，重点关注自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症和嗜铬细胞瘤/副神经节瘤这三种病理状况 | 利用最新的类固醇分析和单细胞转录组分析技术，揭示了肾上腺皮质腺瘤中多种类固醇激素共同影响骨代谢，而非单一激素作用 | 主要基于现有文献进行综述，缺乏新的实验数据支持 | 探讨肾上腺激素失衡对骨代谢的影响机制 | 肾上腺激素及其对骨代谢的影响 | 内分泌学 | 骨质疏松症 | 类固醇分析、单细胞转录组分析 | NA | 文献数据 | NA |