单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 38610 篇文献,本页显示第 741 - 760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
741 2026-04-13
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了长链非编码RNA MIR181A1HG通过诱骗Foxp1转录因子并激活NLRP3炎症小体,从而驱动血管炎症和动脉粥样硬化发生的关键作用 首次明确了MIR181A1HG在动脉粥样硬化血管炎症中的核心驱动作用,并阐明了其通过诱骗Foxp1(独立于miR-181a1/b1簇)激活NLRP3炎症小体的新分子机制 研究主要聚焦于内皮细胞中的机制,尽管排除了髓系细胞的作用,但其他细胞类型(如平滑肌细胞)中MIR181A1HG的功能尚未完全探索 探究长链非编码RNA MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用及分子机制 人及小鼠的动脉粥样硬化病变组织、内皮细胞、MIR181A1HG-/-ApoE-/-基因敲除小鼠 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因实验、染色质免疫共沉淀、功能获得与缺失研究、RNA-蛋白质相互作用分析 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 涉及人及小鼠的动脉粥样硬化病变样本,并使用MIR181A1HG-/-ApoE-/-基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
742 2026-04-13
Single-cell RNA sequencing combined with proteomics of infected macrophages reveals prothymosin-α as a target for treatment of apical periodontitis
2024-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序结合蛋白质组学,揭示了感染巨噬细胞中prothymosin-α(PTMA)的上调,并验证了其作为根尖周炎治疗靶点的潜力 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析根尖周炎中单核/巨噬细胞的异质性,并鉴定出PTMA作为新的治疗靶点 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,尚未进行人体临床试验 阐明单核/巨噬细胞在慢性根尖周炎进展中的作用,并寻找新的治疗靶点 慢性根尖周炎患者的根尖周病变组织、健康对照牙周组织、THP-1来源的巨噬细胞、小鼠和大鼠的根尖周炎模型 单细胞组学 口腔疾病 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光染色, 实时定量PCR NA 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 未明确说明具体样本数量,涉及患者组织样本、细胞系及动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
743 2026-04-13
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,探讨了早期引入浓缩饲料如何通过过量丁酸积累阻断角质细胞分化,从而诱导瘤胃上皮角化不全 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了瘤胃上皮细胞异质性和分化轨迹,并建立了瘤胃器官样模型来验证丁酸在角化不全中的作用 研究仅基于新生羔羊模型,结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同年龄阶段 阐明瘤胃上皮角化过程及导致角化不全的关键瘤胃代谢物 24只14日龄羔羊的瘤胃组织和瘤胃液样本 单细胞组学 瘤胃上皮角化不全 单细胞RNA测序, 代谢组学, 免疫荧光, 实时定量PCR NA 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 24只羔羊分为三组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
744 2026-04-12
Oxidative stress in neurodegeneration: from a simple insult to a dynamic regulator
2026-Dec-31, Redox report : communications in free radical research IF:5.2Q1
综述 本文综述了氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,将其重新定义为一种复杂的动态调控系统,并探讨了其分子机制及先进的抗氧化干预技术策略 将氧化应激重新定义为神经退行性疾病中一个复杂的动态调控系统,而非单一事件,并整合了亚细胞器靶向、纳米载体递送以及单细胞/空间组学等先进技术策略,为开发靶向和个性化治疗提供了新视角 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行分析和整合,未报告新的原始实验数据或临床研究结果 评估氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,探索其动态调控特征、信号通路、分子机制以及先进的抗氧化干预技术策略 神经退行性疾病中的氧化应激过程及其调控 NA 神经退行性疾病 单细胞氧化还原组学,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞组学,空间转录组学 NA NA
745 2026-04-12
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNF-α promotes glioblastoma proliferation and migration via CP-mediated KLF10 upregulation
2026-Apr-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
746 2026-04-12
Tumor-infiltrating platelets recruit neutrophils to promote tumor growth through the 5-HIAA-GPR35-ERK1/2 axis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-10, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文揭示了肝细胞癌中肿瘤浸润血小板通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2轴招募中性粒细胞促进肿瘤生长的机制 首次发现血小板来源的5-HIAA通过GPR35受体激活ERK1/2通路,从而招募中性粒细胞促进肝癌生长 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限 探究肝细胞癌中肿瘤相关中性粒细胞与血小板相互作用的分子机制 肝细胞癌患者样本、Hepa1-6小鼠模型、血小板、中性粒细胞、肝癌细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 多重免疫组化、Transwell迁移实验、代谢组学分析、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA 图像数据、测序数据、实验数据 患者来源的HCC样本、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
747 2026-04-12
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Apr-10, Trends in plant science IF:17.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
748 2026-04-12
Comprehensive guide for optimizing octopus immune cell preparation to enhance single cell RNA sequencing success
2026-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究为普通章鱼免疫细胞(血细胞)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了一套优化的细胞制备方案 首次为章鱼免疫细胞建立了scRNA-seq的方法学框架,开发了海洋抗凝集溶液(MAS)以维持细胞活性和结构完整性,并验证了其与10x Genomics平台的兼容性 研究聚焦于方法学优化,初步测序深度较浅,对免疫细胞多样性和功能的详细分析有待后续研究 优化章鱼免疫细胞的制备流程,以实现高质量的单细胞RNA测序,从而深入理解章鱼免疫系统 普通章鱼(Octopus vulgaris)的循环血细胞和白体驻留血细胞(WBH) 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及章鱼血细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics化学(用于GEM生成、逆转录和cDNA文库构建)
749 2026-04-12
Cellular heterogeneity in hypertrophic burn scars in response to carbon dioxide laser therapy
2026-Apr-10, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析烧伤后增生性疤痕在二氧化碳激光治疗前后的细胞异质性,揭示了治疗反应差异的分子机制 首次应用单细胞RNA测序技术探究二氧化碳激光治疗增生性疤痕的细胞机制,并识别出与良好治疗反应相关的再生性成纤维细胞亚群 样本量较小,且疤痕年龄分组基于6年阈值可能不够精确 探究二氧化碳激光治疗减轻增生性疤痕的细胞机制 烧伤幸存者的增生性疤痕组织 数字病理学 烧伤疤痕 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 烧伤幸存者的皮肤活检样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
750 2026-04-12
Hexokinase 3 promoted cytokine production of monocytes by targeting metabolic reprogramming and histone lactylation in sepsis
2026-Apr-10, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了己糖激酶3(HK3)通过促进单核细胞糖酵解和乳酸积累,进而通过组蛋白H3K18乳酸化依赖的方式激活IL-6和TNF-α基因,驱动脓毒症中单核细胞过度炎症反应的作用机制 首次将HK3确立为脓毒症的关键代谢检查点和诊断生物标志物,并阐明了其通过代谢重编程和组蛋白乳酸化驱动单核细胞炎症因子分泌的分子机制 研究主要基于LPS诱导的单核细胞脓毒症模型和公共数据库分析,缺乏在体动物模型或更大规模临床队列的验证 阐明脓毒症发病过程中免疫细胞糖酵解的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 脓毒症患者外周血样本、LPS诱导的单核细胞脓毒症模型 生物信息学与分子生物学 脓毒症 单细胞RNA测序、GEO数据库分析、ROC曲线分析、免疫细胞浸润分析 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 基于公共GEO数据库的脓毒症患者外周血样本数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
751 2026-04-12
Super-enhancer-driven recruitment of C/EBPβ by SULT1B1 is implicated in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression
2026-Apr-10, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了超级增强子驱动的H3K27ac/C/EBPβ/SULT1B1调控轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)进展中的关键作用 首次在MASLD中鉴定出SULT1B1作为核心超级增强子相关基因,并阐明C/EBPβ通过H3K27ac修饰促进其转录的分子机制,同时通过单细胞分析将该调控轴定位于肝细胞 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本验证相对有限,且JQ1介导的超级增强子抑制在体内的长期疗效和安全性尚未评估 阐明超级增强子在MASLD发病机制中的调控作用 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 表观遗传学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 ChIP-Seq, RNA-Seq, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 组蛋白修饰分析 NA 基因组学数据, 转录组学数据, 表观基因组学数据 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq NA NA
752 2026-04-12
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Apr-09, HGG advances
研究论文 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架,并应用于人类细胞图谱数据集 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性,并揭示现有数据集中祖先代表性的不平衡问题 评估主要基于模拟数据和现有数据集,未涵盖所有可能的祖先群体和测序技术 评估和改进单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法,以促进遗传多样性研究和减少分析偏差 单细胞转录组测序数据中的遗传多态性 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 ADMIXTURE等群体遗传学工具 测序reads中的遗传变异数据 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
753 2026-04-12
Dimethyl fumarate attenuates subcutaneous adipose tissue inflammation in psoriasis
2026-Apr-09, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
研究论文 本研究探讨了富马酸二甲酯对银屑病患者皮下脂肪组织炎症的调节作用 首次整合临床数据、空间转录组学分析和体外实验,系统揭示了银屑病皮下脂肪组织的炎症特征及富马酸二甲酯的治疗作用 样本量较小(6名临床患者,其中4名进行RNA测序),缺乏长期随访数据 探究银屑病皮下脂肪组织的炎症特征及富马酸二甲酯的治疗机制 银屑病患者的皮下脂肪组织、小鼠3T3-L1脂肪细胞、人间充质干细胞分化的脂肪细胞 数字病理学 银屑病 空间转录组学、bulk RNA测序、体外细胞模型 NA 转录组数据、临床评估数据 6名中重度斑块型银屑病患者,4名患者的治疗前后脂肪组织活检样本 NA 空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
754 2026-04-12
CIPHER-seq enables intracellular multimodal profiling of cytokine responses in single immune cells
2026-Apr-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CIPHER-seq的新方法,用于在单个免疫细胞中同时量化细胞内蛋白质和转录组,以解决单细胞RNA测序在预测蛋白质丰度方面的不足 开发了CIPHER-seq技术,首次实现了在单细胞水平上同时分析细胞内蛋白质和转录组,提供了五层分析能力,并在免疫细胞回收方面与商业协议相匹配,同时显著减少了线粒体应激信号 NA 开发一种能够同时量化细胞内蛋白质和转录组的技术,以改善单细胞RNA测序在预测蛋白质丰度方面的局限性 刺激后的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞多组学 NA 单细胞RNA测序,细胞内蛋白质分析 NA RNA序列数据,蛋白质丰度数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 NA NA
755 2026-04-12
Nanoplastics Enhance F-53B Uptake and Synergistically Induce Colonic Inflammation via Activation of the B Cell Receptor Pathway
2026-Apr-08, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
研究论文 本研究探讨了纳米塑料(NPs)和微塑料(MPs)作为载体增强F-53B的摄入,并通过激活B细胞受体(BCR)信号通路协同诱导结肠炎症的机制 揭示了NPs相较于MPs具有更高的生物利用度,能吸附并增强F-53B的细胞内水平,并通过单细胞RNA测序首次阐明NPs与F-53B共暴露通过激活肠道B细胞的BCR-NF-κB通路促进炎症的分子机制 研究主要基于小鼠模型和Caco-2细胞系,在人体中的直接相关性尚需进一步验证;NPs和F-53B的长期暴露效应及与其他环境污染物的相互作用未涉及 评估纳米塑料和微塑料作为载体对持久性有机污染物F-53B的生物分布、肠道毒性及协同炎症效应的健康风险 20 nm纳米塑料(NPs)、2 μm微塑料(MPs)、6:2氯化多氟醚磺酸(F-53B)、Caco-2细胞系、小鼠 环境毒理学 结肠炎/肠道炎症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外细胞毒性实验、体内生物分布分析、细胞因子表达检测 NA 基因表达数据、细胞毒性数据、组织病理学数据 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和Caco-2细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
756 2026-04-12
An Artificial Intelligence Optimized Hepatic Differentiation Unveils NR5A2 and AP-1 Transcriptional Regulation in Hepatic Maturation
2026-Apr-08, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究开发了一种基于机器学习的AI工具,利用肝祖细胞的相差图像优化肝细胞分化,揭示了NR5A2和AP-1转录因子在肝细胞成熟中的关键调控作用 首次结合AI算法和计算基因组学优化肝细胞分化协议,无需免疫染色或谱系追踪即可提高成功率,并发现NR5A2和AP-1在肝细胞成熟中的新调控机制 未明确说明AI工具的具体算法细节或在不同细胞系中的普适性验证 优化人类多能干细胞向肝细胞样细胞的分化协议,并研究肝细胞分化的基因调控机制 人类多能干细胞(hPSCs)、肝祖细胞(HPCs)和肝细胞样细胞(HLCs) 机器学习 肝病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、表观基因组学 机器学习模型(具体未指定) 图像(相差图像)、转录组数据、表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
757 2026-04-12
Structure-preserving multivariate hypothesis testing for mass spectrometry imaging and single-cell data
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为block-SAM的结构保持多变量假设检验方法,用于处理质谱成像和单细胞RNA测序数据,以减少假阳性发现 提出block-SAM方法,考虑像素或细胞的嵌套样本结构,避免传统方法因忽略此结构而导致的样本量膨胀和假阳性增加问题 未明确讨论方法在极端数据分布或小样本情况下的性能,且主要针对特定数据类型(MSI和scRNA-seq) 开发一种统计方法,以更准确地识别质谱成像和单细胞RNA测序数据中的差异特征,同时保留空间或细胞分辨率 质谱成像数据和单细胞RNA测序数据,包括肾脏、肺、卵巢肿瘤的DESI-MSI数据以及转移性肾细胞癌的scRNA-seq数据 生物信息学 肾癌、肺癌、卵巢癌 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) block-SAM(一种多变量假设检验方法) 图像数据(质谱成像)、基因表达数据(单细胞RNA测序) 未明确指定具体样本数量,但涉及多个肿瘤数据集和患者比较 NA 质谱成像(DESI-MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
758 2026-04-12
AutoGERN: single-cell RNA-seq gene regulatory network inference via explicit link modeling and adaptive architectures
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了AutoGERN,一种专为单细胞RNA测序数据设计的图神经网络框架,用于推断基因调控网络 AutoGERN通过显式建模调控信息在消息传递空间中的表达,学习链接嵌入,并采用自适应架构搜索以适应不同数据集分布 未在摘要中明确提及 开发一个能够从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的图神经网络框架 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图神经网络 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
759 2026-04-12
Targeted inhibition of microglial C5aR1 by PMX205 mitigates post-ischemic stroke neuroinflammation and promotes functional recovery
2026-Apr-06, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,发现并验证了靶向抑制小胶质细胞C5aR1可减轻缺血性卒中后的神经炎症并促进功能恢复 利用单细胞RNA测序识别缺血性卒中后小胶质细胞的关键调控因子C5aR1,并通过分子对接和体内实验验证其靶向抑制剂PMX205的治疗潜力 研究主要基于动物模型,其结论向临床转化的有效性仍需进一步验证 识别缺血性卒中后神经炎症的关键调控因子,并开发潜在的治疗靶点 小鼠缺血性卒中模型中的小胶质细胞 神经科学,生物信息学 缺血性卒中 单细胞RNA测序,免疫荧光,定量免疫印迹,分子对接,ELISA,TTC染色,TUNEL/Nissl染色,行为学测试 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据,行为学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
760 2026-04-12
UBTF-HSP90A-MIF stress circuit drives lenvatinib resistance and immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-05, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了肝细胞癌中UBTF/HSP90A/MIF调控环路介导乐伐替尼耐药和免疫排斥的分子机制 首次阐明UBTF/HSP90A/MIF应激环路在肝细胞癌乐伐替尼耐药和免疫微环境重塑中的核心作用,并验证MIF作为预测生物标志物和治疗靶点的潜力 研究主要基于临床前模型,临床验证队列样本量有限,需进一步大规模临床试验验证 阐明肝细胞癌中乐伐替尼-PD-1联合治疗的适应性耐药和免疫排斥机制 肝细胞癌细胞系、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及临床患者队列 肿瘤生物学 肝细胞癌 RNA测序、启动子下拉实验、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测、邻近连接分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、多重免疫组化 NA 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据、临床数据 配对乐伐替尼敏感和耐药HCC模型、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及独立临床队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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