单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27241 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-04-15 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-Apr-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
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review | 本文综述了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其预后标志物Snail1的作用 | 揭示了Snail1在CAFs中的表达与恶性肿瘤的关联，并提出了一个未描述的与Snail1相关的基因特征 | 主要基于患者样本和小鼠模型的研究，可能不完全反映人类肿瘤的全部复杂性 | 探讨CAFs的异质性及其在乳腺癌预后中的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的CAFs | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | NA |
| 742 | 2025-04-15 |
The crucial role of neutrophil extracellular traps and IL-17 signaling in indomethacin-induced gastric injury in mice
2025-Apr-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95880-4
PMID:40204883
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）和IL-17信号在吲哚美辛诱导的小鼠胃损伤中的关键作用 | 揭示了NETs形成在吲哚美辛诱导胃损伤中的关键作用，并发现IL-17信号可能是NETs形成的关键细胞内机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 探究吲哚美辛诱导胃损伤的分子机制 | 小鼠胃黏膜损伤模型 | 病理学 | 胃溃疡 | 蛋白质组学分析、ELISA、免疫荧光、TEM、Western blot、实时PCR、scRNA-seq | 小鼠胃损伤模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明小鼠数量，但涉及体外实验使用200µL、400µL和600µL吲哚美辛处理 |
| 743 | 2025-04-15 |
Development of a fully human glioblastoma-in-brain-spheroid model for accelerated translational research
2025-Apr-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.055
PMID:40188875
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研究论文 | 开发了一种全人源胶质母细胞瘤-脑球体模型hGliCS，用于加速转化研究 | 结合患者来源的GBM细胞和诱导多能干细胞来源的成熟人类皮质神经元，克服了现有模型系统的关键限制 | NA | 研究胶质母细胞瘤生物学和肿瘤-神经元相互作用 | 胶质母细胞瘤细胞和人类皮质神经元 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | hGliCS模型 | 基因表达数据 | NA |
| 744 | 2025-04-15 |
Identification of BHLHE40-Expressing CD4+ T Cells Producing GM-CSF in Rheumatoid Arthritis
2025-Apr, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70219
PMID:40223427
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research paper | 该研究探讨了BHLHE40和CSF2在类风湿性关节炎(RA)患者CD4+ T细胞中的表达及其与疾病的关系 | 首次在IL-1富集的炎症部位研究了BHLHE40和CSF2在CD4+ T细胞中的表达，并发现这些基因在RA患者滑膜液中的表达显著增加 | 研究主要依赖于已有的公开数据库数据，缺乏实验验证 | 研究BHLHE40和CSF2基因在RA发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和健康对照者的外周血和滑膜液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, RNA-seq, 微阵列数据分析 | NA | 基因表达数据 | 来自RA患者和健康对照者的外周血和滑膜液样本 |
| 745 | 2025-04-15 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-Mar-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 本研究通过多模态模板结合X射线荧光显微镜和空间转录组学，揭示了小鼠海马区金属离子含量与金属组基因表达的相关性 | 首次将元素映射与空间转录组学结合，揭示了海马区金属离子富集与特定转录本区域富集的分子基础 | 研究仅局限于小鼠海马区，未涉及其他脑区或物种 | 探究大脑金属稳态的分子机制及其对神经功能的影响 | 小鼠海马区及其亚区域的金属离子含量和基因表达 | 神经科学 | 神经发育障碍 | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 元素映射数据, 转录组数据 | 小鼠海马区样本 |
| 746 | 2025-04-15 |
Multi-Manifolds fusing hyperbolic graph network balanced by pareto optimization for identifying spatial domains of spatial transcriptomics
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf162
PMID:40220278
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research paper | 提出了一种基于多流形融合的双曲图网络方法MManiST，用于空间转录组学中的空间域识别 | 首次在空间转录组学中引入多流形融合和双曲神经网络，通过Pareto优化平衡多种重建损失 | 未明确说明方法在计算效率方面的表现 | 开发更有效的空间转录组学空间域识别方法 | 空间转录组学数据 | computational biology | NA | spatial transcriptomics | hyperbolic graph network, attention mechanism | spatial transcriptomics data | multiple benchmark datasets |
| 747 | 2025-04-15 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-Mar-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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研究论文 | 探讨TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用 | 揭示了TGF-β通过YAP/TAZ调控FAPs向肌成纤维细胞分化的新机制，并提出YAP/TAZ作为肌肉纤维增殖性疾病的潜在治疗靶点 | 对FAPs分化为肌成纤维细胞的核调控因子理解尚处于初级阶段 | 研究TGF-β信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 骨骼肌纤维化过程中的FAPs分化和YAP/TAZ活性 | 分子生物学 | 肌肉萎缩症 | 空间转录组学分析、原代培养 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和原代培养的FAPs |
| 748 | 2025-04-15 |
Distinct single-cell transcriptional profile in CD4+ T-lymphocytes among obese children with asthma
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00270.2024
PMID:39868576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示了肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的独特转录特征，发现了与IL-7受体和Rho转录信号通路相关的新机制 | 样本量较小（仅8名参与者），需要在更大规模队列中验证发现 | 探究肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的分子特征及其与疾病严重程度的关系 | 肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 8名匹配的哮喘儿童（肥胖与正常体重各半） |
| 749 | 2025-04-15 |
In silico integrative scRNA analysis of human colonic epithelium indicates four tuft cell subtypes
2025-Feb-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00182.2024
PMID:39589317
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研究论文 | 本研究整合分析了四个公开可用的人类单细胞RNA测序数据集，揭示了人类结肠中簇细胞异质性的复杂景观，并识别出四种簇细胞亚型 | 首次通过整合scRNA-seq数据识别出人类结肠中四种具有不同基因表达特征的簇细胞亚型，并揭示了这些亚型在健康人群和炎症性肠病患者之间的差异 | 研究基于计算分析，需要后续实验验证这些簇细胞亚型的生物学功能 | 探索人类结肠簇细胞的异质性及其在肠道健康和疾病中的潜在作用 | 人类结肠组织中的簇细胞 | 单细胞组学 | 炎症性肠病(IBD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个公开数据集的人类结肠样本 |
| 750 | 2025-04-15 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
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研究论文 | 本文研究了BRD4抑制如何通过改变心脏巨噬细胞的表型，从而在心力衰竭模型中发挥保护作用 | 揭示了BRD4抑制通过调控巨噬细胞的MHC-II表达和NF-κB信号通路，促进心脏修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏疾病的适用性尚需进一步验证 | 探索BET抑制剂JQ1改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞和成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 小鼠缺血/再灌注损伤模型 | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 |
| 751 | 2025-04-15 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
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研究论文 | 研究mTOR信号在TGF-β处理后的人类肺成纤维细胞及肺纤维化中调节多种代谢途径的作用 | 揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调节氨基酸稳态、糖酵解酶和线粒体电子传递链亚基等新的代谢途径 | 研究主要基于体外实验和公开的单细胞RNA-seq数据集，未涉及动物模型验证 | 探讨mTOR和ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的作用及其在肺纤维化中的潜在治疗靶点 | 人类肺成纤维细胞和肺纤维化患者的肺组织 | 代谢重编程 | 肺纤维化 | RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 人类肺成纤维细胞及公开的单细胞RNA-seq数据集中的患者肺组织样本 |
| 752 | 2025-04-15 |
Cohesin rad21 mutation dysregulates erythropoiesis and granulopoiesis output within the whole kidney marrow of adult zebrafish
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00657.2024
PMID:39548947
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研究论文 | 研究cohesin复合体亚基rad21突变对成年斑马鱼肾脏骨髓中红细胞生成和粒细胞生成的影响 | 首次在成年斑马鱼模型中揭示了cohesin亚基rad21杂合突变对造血过程的转录调控紊乱和细胞输出改变 | 未观察到明显的造血细胞形态学异常，突变对造血系统的长期影响尚不明确 | 探究cohesin基因突变对造血系统发育和功能的影响 | 携带rad21杂合突变的成年斑马鱼肾脏骨髓造血系统 | 发育生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 斑马鱼遗传模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本量的突变型和野生型斑马鱼 |
| 753 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptomics reveal distinctive patterns of fibroblast activation in heart failure with preserved ejection fraction
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01074-w
PMID:39311911
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了保留射血分数心力衰竭（HFpEF）中成纤维细胞激活的独特模式 | 发现了HFpEF特有的成纤维细胞激活特征，包括代谢、缺氧和炎症转录因子及通路的诱导，以及Angiopoietin-like 4（Angptl4）的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究HFpEF中成纤维细胞激活的分子机制 | 小鼠和人类心肌组织中的间质细胞，特别是成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNAseq（单细胞RNA测序） | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类心肌组织样本 |
| 754 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01087-5
PMID:39508863
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research paper | 该研究通过构建一个包含超过21万个内皮细胞的图谱，揭示了人类不同组织中内皮细胞的转录组、表型、代谢和转录调控的显著差异 | 揭示了毛细血管内皮细胞比其他类型内皮细胞具有更高的异质性，并发现内皮细胞的衰老特性更多由体细胞位置而非组织类型决定 | NA | 探究人类不同组织中内皮细胞的异质性及其与特定疾病的关联 | 人类24个组织中38个区域的超过21万个内皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过21万个内皮细胞，来自24个人类组织的38个区域 |
| 755 | 2025-04-15 |
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae098
PMID:40162103
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研究论文 | 评估FFPE乳腺组织中细胞类型去卷积方法的应用，特别是在良性乳腺疾病中的效果 | 构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据，测试了多种去卷积方法，并发现深度学习为基础的Scaden方法在FFPE伪影影响下表现最佳 | FFPE伪影显著影响了去卷积方法的性能，误差范围在0.04至0.17之间 | 优化从FFPE样本中定义单个细胞类型组成的策略 | 良性乳腺疾病的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 深度学习 (Scaden) | RNA-seq数据 | 62个良性乳腺疾病RNA-seq样本 |
| 756 | 2025-04-15 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveals heterogeneity of serine-glycine-one-carbon metabolism with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities in HNSCC
2024-06-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00310-2
PMID:38886346
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research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢的异质性及其对预后和治疗脆弱性的影响 | 首次在HNSCC中系统分析了SGOC代谢的异质性，并构建了4-SGOC基因预后特征，同时提出IMPDH1作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平和代谢组学的验证 | 阐明HNSCC中代谢异质性的生物学作用并推动精准肿瘤学发展 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | digital pathology | head and neck squamous cell carcinoma | scRNA-seq, bulk transcriptomes, LASSO-COX regression analysis | NA | RNA sequencing data | 未明确提及具体样本数量 |
| 757 | 2025-04-15 |
Single cell analysis unveils B cell-dominated immune subtypes in HNSCC for enhanced prognostic and therapeutic stratification
2024-04-16, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00292-1
PMID:38622125
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中B细胞主导的免疫亚型，为预后和治疗分层提供了新视角 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了HNSCC中TIL-Bs的基因表达模式，并建立了基于B细胞的肿瘤分类方法 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制 | 探索HNSCC中肿瘤浸润B细胞（TIL-Bs）在免疫微环境中的作用及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | digital pathology | head and neck squamous cell carcinoma | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 来自GEO和TCGA数据库的HNSCC样本 |
| 758 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptomics reveals cell atlas and identifies cycling tumor cells responsible for recurrence in ameloblastoma
2024-02-29, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00281-4
PMID:38424060
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research paper | 通过单细胞转录组学揭示成釉细胞瘤的细胞图谱，并识别导致复发的循环肿瘤细胞 | 首次在单细胞分辨率下揭示了成釉细胞瘤的细胞景观和复发机制，并发现EZH2介导的程序主导了循环肿瘤细胞的干性和复发 | 研究样本可能有限，且未涉及其他潜在的治疗靶点 | 探究成釉细胞瘤的肿瘤起始和复发机制 | 成釉细胞瘤的肿瘤细胞亚群 | digital pathology | ameloblastoma | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | 成釉细胞瘤患者来源的类器官 |
| 759 | 2025-04-15 |
Tim4 deficiency reduces CD301b+ macrophage and aggravates periodontitis bone loss
2024-02-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00270-z
PMID:38418808
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研究论文 | 本研究探讨了Tim4缺乏如何减少CD301b+巨噬细胞并加剧牙周炎骨丢失 | 首次揭示了Tim4作为CD301b巨噬细胞的上游调控因子，通过p38 MAPK信号通路调节CD301b巨噬细胞表型 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究Tim4在牙周炎中对CD301b巨噬细胞的调控机制 | CD301b巨噬细胞及其上游调控因子Tim4 | 免疫学 | 牙周炎 | 高通量RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 小鼠模型 | RNA测序数据、流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 760 | 2025-04-15 |
PRX1-positive mesenchymal stem cells drive molar morphogenesis
2024-02-19, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00277-0
PMID:38369512
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析和谱系追踪模型，揭示了PRX1阳性间充质细胞在小鼠磨牙形态发生中的关键作用 | 发现了PRX1阳性间充质细胞通过Wnt5a-WNT信号通路调控牙齿形态的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类牙齿发育中验证 | 探究调控牙齿形态的关键因素 | 小鼠磨牙发育过程中的PRX1阳性间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |